More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_3294 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_0803  DNA recombination protein RecA precursor  72.44 
 
 		 1177 aa  933    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.106303  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3294  recA protein  100 
 
 		 729 aa  1485    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.088639  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12750  DNA recombination protein RecA  57.8 
 
 		 790 aa  362  9e-99  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000250397  normal  0.0414269 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1118  recA protein  86.27 
 
 		 365 aa  360  4e-98  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.145639  normal  0.0819488 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2216  RecA protein  84.39 
 
 		 366 aa  359  8e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.139784 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23200  protein RecA  84.8 
 
 		 359 aa  356  1e-96  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.930258  normal  0.114189 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1462  recombinase A  85.29 
 
 		 352 aa  354  2.9999999999999997e-96  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000631927 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1460  recombinase A  84.31 
 
 		 351 aa  354  2.9999999999999997e-96  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00992179  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1419  recA protein  84.24 
 
 		 347 aa  353  5.9999999999999994e-96  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2202  recA protein  83.33 
 
 		 347 aa  353  8e-96  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1545  recA protein  85.29 
 
 		 346 aa  352  1e-95  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.259692  normal  0.07485 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1219  recombinase A  82.93 
 
 		 347 aa  352  1e-95  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0979767  normal  0.281308 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1785  recA protein  83.82 
 
 		 350 aa  352  1e-95  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6708  recombinase A  82.93 
 
 		 345 aa  351  2e-95  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.141706  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3525  recombinase A  84.39 
 
 		 345 aa  350  4e-95  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.551254  normal  0.0703421 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1242  recA protein  83.82 
 
 		 376 aa  350  4e-95  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2341  recA protein  81.46 
 
 		 350 aa  350  4e-95  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2147  recombinase A  84.24 
 
 		 347 aa  350  7e-95  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2193  recombinase A  84.24 
 
 		 347 aa  350  7e-95  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0979046 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2134  recombinase A  84.24 
 
 		 347 aa  350  7e-95  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00345325 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10530  protein RecA  81.86 
 
 		 368 aa  349  1e-94  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.419207  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2420  recombinase A  83.25 
 
 		 350 aa  348  2e-94  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.157742  normal  0.0782537 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27820  protein RecA  83.33 
 
 		 345 aa  347  3e-94  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0461192 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3975  recombinase A  83.25 
 
 		 350 aa  347  4e-94  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1041  recA protein  84.08 
 
 		 364 aa  347  4e-94  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1492  recA protein  83.33 
 
 		 345 aa  347  4e-94  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.211084  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3994  recA protein  83.41 
 
 		 352 aa  347  5e-94  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0864938  normal  0.282621 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07230  protein RecA  82.67 
 
 		 351 aa  346  7e-94  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.533016  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0666  recA protein  80.49 
 
 		 378 aa  345  1e-93  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.386455  normal  0.202905 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2448  recA protein  83.08 
 
 		 350 aa  344  2.9999999999999997e-93  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.276179  normal  0.953449 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3919  recA protein  80.49 
 
 		 344 aa  339  9.999999999999999e-92  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1425  recombinase A  79.9 
 
 		 348 aa  337  5e-91  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.976211  normal  0.0337506 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17690  RecA protein  80.1 
 
 		 367 aa  336  1e-90  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.72475  normal  0.370795 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1389  recombinase A  79.9 
 
 		 348 aa  336  1e-90  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.384565  normal  0.0556082 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1581  recA protein  79.23 
 
 		 383 aa  335  2e-90  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1492  recA protein  83.82 
 
 		 348 aa  334  3e-90  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.148956 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1021  RecA protein  80.9 
 
 		 379 aa  333  7.000000000000001e-90  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0284  recombinase A  79.4 
 
 		 418 aa  330  6e-89  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0864352  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4183  recA protein  79.1 
 
 		 349 aa  326  9e-88  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.888096  normal  0.191355 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1473  RecA protein  76.62 
 
 		 364 aa  322  9.999999999999999e-87  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0213351  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3103  recA protein  76 
 
 		 343 aa  315  1.9999999999999998e-84  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000175278  normal  0.820651 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3106  recA protein  74.63 
 
 		 346 aa  315  1.9999999999999998e-84  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000524014  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0676  recA protein  75 
 
 		 347 aa  315  1.9999999999999998e-84  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00169949  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2431  recombinase A  74.63 
 
 		 343 aa  314  2.9999999999999996e-84  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.173685  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0628  recA protein  77.27 
 
 		 346 aa  314  3.9999999999999997e-84  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.067585  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1473  recA protein  76 
 
 		 355 aa  314  4.999999999999999e-84  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.000000112388  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0513  recA protein  76.62 
 
 		 350 aa  313  7.999999999999999e-84  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.213728 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1275  recombinase A  78 
 
 		 356 aa  312  2e-83  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.138864  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1627  recombinase A  75 
 
 		 341 aa  311  2.9999999999999997e-83  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00182901  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3521  recA protein (recombinase A), N-terminal region  73.13 
 
 		 208 aa  310  4e-83  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000289981  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3792  RecA protein  73.13 
 
 		 208 aa  310  4e-83  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000169081 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1034  recombinase A  75.12 
 
 		 343 aa  310  4e-83  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0682579  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3539  recA protein (recombinase A), N-terminal region  73.13 
 
 		 208 aa  310  6.999999999999999e-83  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000000558928  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3827  protein RecA  73.13 
 
 		 208 aa  310  6.999999999999999e-83  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000195249  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1079  recA protein  75.25 
 
 		 348 aa  310  8e-83  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3814  recombinase A  73.13 
 
 		 343 aa  309  1.0000000000000001e-82  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000388705  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3629  recombinase A  73.13 
 
 		 343 aa  309  1.0000000000000001e-82  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000256078  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5903  recA protein  74.41 
 
 		 379 aa  309  1.0000000000000001e-82  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0512  recombinase A  75.61 
 
 		 357 aa  309  1.0000000000000001e-82  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.759794  normal  0.922847 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3878  recombinase A  73.13 
 
 		 343 aa  308  2.0000000000000002e-82  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000422739  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3550  recombinase A  72.64 
 
 		 343 aa  308  2.0000000000000002e-82  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000225228  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1421  recombinase A  73.13 
 
 		 343 aa  308  2.0000000000000002e-82  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000173809  normal  0.454678 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1725  recombinase A  75.62 
 
 		 360 aa  308  2.0000000000000002e-82  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.971685  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1610  recA protein  72.28 
 
 		 390 aa  308  2.0000000000000002e-82  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.651077 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1050  recA protein  73.5 
 
 		 349 aa  308  3e-82  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000195685  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0074  recA protein  73.76 
 
 		 344 aa  307  4.0000000000000004e-82  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1267  recA protein  73.53 
 
 		 358 aa  307  4.0000000000000004e-82  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.165392  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2405  recombinase A  72.68 
 
 		 341 aa  307  4.0000000000000004e-82  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0843  recA protein  73.13 
 
 		 345 aa  307  5.0000000000000004e-82  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3161  recombinase A  73.76 
 
 		 336 aa  307  5.0000000000000004e-82  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2439  recA protein  71.22 
 
 		 347 aa  306  6e-82  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000566681  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1423  recA protein  72.91 
 
 		 344 aa  306  7e-82  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.716578  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0145  recombinase A  75.25 
 
 		 338 aa  305  1.0000000000000001e-81  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11890  recA protein  69.61 
 
 		 357 aa  305  1.0000000000000001e-81  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000128048  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0198  recombinase A  74.38 
 
 		 339 aa  305  2.0000000000000002e-81  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0327556 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1162  recA protein  71.5 
 
 		 356 aa  304  4.0000000000000003e-81  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.501327  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1616  recA protein  73.13 
 
 		 348 aa  303  7.000000000000001e-81  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.445296  normal  0.968936 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1371  recombinase A  72.14 
 
 		 347 aa  303  8.000000000000001e-81  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.150356  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1345  recombinase A  72.14 
 
 		 347 aa  303  8.000000000000001e-81  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0958775  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1765  recombinase A  72.77 
 
 		 348 aa  303  9e-81  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0653  recA protein  69.65 
 
 		 346 aa  302  1e-80  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1765  recombinase A  72.77 
 
 		 348 aa  302  1e-80  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4194  recombinase A  73 
 
 		 358 aa  302  1e-80  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1006  recA protein  73.63 
 
 		 359 aa  303  1e-80  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1231  recombinase A  72.77 
 
 		 355 aa  303  1e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000000176903 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1629  recombinase A  72.77 
 
 		 355 aa  302  2e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.849206  normal  0.20246 
 
 
-
 
NC_004310  BR1202  recombinase A  73.27 
 
 		 361 aa  301  2e-80  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4033  recA protein  74.13 
 
 		 354 aa  301  2e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1378  recombinase A  74.13 
 
 		 354 aa  301  2e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0217782  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1175  recombinase A  72.77 
 
 		 352 aa  302  2e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.214888 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1165  recombinase A  73.63 
 
 		 424 aa  301  2e-80  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.165606  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4088  recombinase A  72.77 
 
 		 355 aa  302  2e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1986  recombinase A  73.76 
 
 		 361 aa  302  2e-80  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1833  recA protein  73.04 
 
 		 363 aa  301  3e-80  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0352919  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4134  recA protein  70.79 
 
 		 345 aa  301  4e-80  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00773385  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4030  recombinase A  72.28 
 
 		 355 aa  300  5e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.104307  unclonable  0.0000000000000597568 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0932  recA protein  63.1 
 
 		 345 aa  300  5e-80  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1050  recA protein  63.1 
 
 		 345 aa  300  5e-80  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0444945 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1958  recombinase A  73.76 
 
 		 362 aa  300  6e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.212458 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3015  recombinase A  72.64 
 
 		 347 aa  300  6e-80  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.514179  hitchhiker  0.000000000000973321 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>