More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_1272 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008942  Mlab_1272  hypothetical protein  100 
 
 		 224 aa  454  1e-127  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.998309 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2159  DNA repair and recombination protein RadB  58.72 
 
 		 224 aa  268  2.9999999999999997e-71  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0260  DNA repair and recombination protein RadB  58.33 
 
 		 224 aa  266  1e-70  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.92433 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2429  DNA repair and recombination protein RadB  56.02 
 
 		 226 aa  254  1.0000000000000001e-66  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2453  ATPase  53.02 
 
 		 234 aa  234  6e-61  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.695737 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2123  DNA repair and recombination protein RadB  46.7 
 
 		 225 aa  192  3e-48  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1039  DNA repair and recombination protein RadB  44.8 
 
 		 243 aa  184  9e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0926  DNA repair and recombination protein RadB  42.27 
 
 		 221 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0491  DNA repair and recombination protein RadB  39.37 
 
 		 227 aa  159  4e-38  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2158  DNA repair and recombination protein RadB  38.22 
 
 		 235 aa  152  5e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0907  DNA repair and recombination protein RadB  38.81 
 
 		 227 aa  152  5e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1786  DNA repair and recombination protein RadB  38.84 
 
 		 235 aa  151  8e-36  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.729381  normal  0.0464986 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0077  DNA repair and recombination protein RadB  34.07 
 
 		 275 aa  145  7.0000000000000006e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.327122  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1640  DNA repair and recombination protein RadB  37.09 
 
 		 215 aa  138  4.999999999999999e-32  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.301627  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1629  DNA repair and recombination protein RadB  40.09 
 
 		 235 aa  136  3.0000000000000003e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.554742  normal  0.462396 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0274  DNA repair and recombination protein RadB  35.21 
 
 		 215 aa  134  9.999999999999999e-31  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.944285  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1490  DNA repair and recombination protein RadB  35.81 
 
 		 213 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.695224  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0988  DNA repair and recombination protein RadB  36.62 
 
 		 216 aa  132  3e-30  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0377224  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0285  DNA repair and recombination protein RadB  34.88 
 
 		 213 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.652849  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1226  DNA repair and recombination protein RadA  36.97 
 
 		 324 aa  112  3e-24  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0009  DNA repair and recombination protein RadA  34.73 
 
 		 324 aa  109  3e-23  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.416037  normal  0.130845 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1953  DNA repair and recombination protein RadA  33.9 
 
 		 330 aa  106  3e-22  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2081  DNA repair and recombination protein RadA  33.47 
 
 		 332 aa  105  4e-22  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0713  DNA repair and recombination protein RadA  33.05 
 
 		 330 aa  103  2e-21  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.33185 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2310  DNA repair and recombination protein RadA  33.05 
 
 		 333 aa  101  7e-21  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.469487  hitchhiker  0.00856648 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1118  DNA repair and recombination protein RadA  33.47 
 
 		 358 aa  94  2e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0430  DNA repair and recombination protein RadA  34.27 
 
 		 324 aa  90.1  3e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1023  Rad51-like  39.41 
 
 		 315 aa  85.1  9e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.973197  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1017  DNA repair and recombination protein RadA  32.22 
 
 		 358 aa  82.8  0.000000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.103289  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01237  UvsC protein [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:P78579]  32.39 
 
 		 348 aa  82.8  0.000000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.523208  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1386  DNA repair and recombination protein RadA  31.93 
 
 		 388 aa  82.4  0.000000000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2940  DNA repair and recombination protein RadA  32.13 
 
 		 407 aa  81.3  0.00000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00873973  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09092  meiotic recombination protein (Dmc1), putative (AFU_orthologue; AFUA_7G02200)  30.29 
 
 		 658 aa  77.4  0.0000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.515485  normal  1 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_54533  Rad51 DNA recombination/repair protein  29.08 
 
 		 350 aa  75.1  0.0000000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.724719  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0885  DNA repair and recombination protein RadA  29.55 
 
 		 322 aa  73.9  0.000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0982  DNA repair and recombination protein RadA  29.32 
 
 		 322 aa  73.6  0.000000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1450  DNA repair and recombination protein RadA  29.72 
 
 		 322 aa  72.8  0.000000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0942903  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2033  DNA repair and recombination protein RadA  29.73 
 
 		 325 aa  72  0.000000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.507845  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0368  DNA repair and recombination protein RadA  28.92 
 
 		 322 aa  71.6  0.000000000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0537  DNA repair and recombination protein RadA  29.72 
 
 		 322 aa  70.5  0.00000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0469  DNA repair and recombination protein RadA  29.32 
 
 		 322 aa  70.9  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1396  Fis family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 312 aa  68.9  0.00000000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.358472  normal  0.485282 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0153  recombinase A  29.22 
 
 		 344 aa  67.4  0.0000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2338  DNA repair and recombination protein RadA  27.82 
 
 		 325 aa  67  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.901889  normal  0.0155582 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_17346  predicted protein  29.44 
 
 		 358 aa  67.4  0.0000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.908819  normal  0.780808 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1633  Rad51 domain-containing protein  29.58 
 
 		 307 aa  67  0.0000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.11008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2094  recombinase A  28.93 
 
 		 365 aa  67.4  0.0000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM01780  meiotic recombination-related protein, putative  27.47 
 
 		 323 aa  66.2  0.0000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.51774  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2099  DNA repair and recombination protein RadA  28.69 
 
 		 325 aa  66.2  0.0000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0131  recombinase A  30.73 
 
 		 365 aa  66.2  0.0000000004  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0040  DNA repair and recombination protein RadA  28.94 
 
 		 327 aa  66.2  0.0000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0530  recA protein  30.3 
 
 		 327 aa  65.9  0.0000000005  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0743  Rad51-like  40.31 
 
 		 250 aa  65.5  0.0000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1643  recombinase A  31.18 
 
 		 355 aa  65.1  0.0000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.883064  decreased coverage  0.00000000000602005 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0296  recA protein  29.95 
 
 		 339 aa  65.1  0.0000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.197187  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1787  recombinase A  30.81 
 
 		 348 aa  64.3  0.000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.744188  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1845  recombinase A  31.18 
 
 		 343 aa  64.7  0.000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1669  recombinase A  31.18 
 
 		 343 aa  64.7  0.000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0440  recombinase A  31.03 
 
 		 358 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_33041  predicted protein  29.3 
 
 		 343 aa  64.7  0.000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0526282 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0551  recombinase A  30.81 
 
 		 352 aa  64.3  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2047  recombinase A  31.18 
 
 		 343 aa  63.9  0.000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.161674  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0616  recombinase A  28.1 
 
 		 364 aa  63.9  0.000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0455  recombinase A  30.81 
 
 		 352 aa  63.9  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0637  DNA repair and recombination protein RadA  27.49 
 
 		 329 aa  64.3  0.000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3750  recA protein  33.53 
 
 		 340 aa  63.9  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.79987  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0211  DNA repair and recombination protein RadA  27.08 
 
 		 343 aa  63.5  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0471  recombinase A  30.81 
 
 		 352 aa  63.9  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1525  recA protein  28.45 
 
 		 353 aa  63.9  0.000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.0000000245316  unclonable  4.38442e-19 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0400  recombinase A  30.06 
 
 		 387 aa  63.9  0.000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.392545  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1382  recombinase A  37.5 
 
 		 376 aa  63.9  0.000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.217546  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0355  recA protein  31.03 
 
 		 367 aa  63.2  0.000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.677666 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1981  recombinase A  30.59 
 
 		 349 aa  63.5  0.000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00686398 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2699  recombinase A  29.65 
 
 		 359 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2573  recombinase A  29.65 
 
 		 359 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.803783  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3814  recombinase A  38.1 
 
 		 343 aa  63.2  0.000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000388705  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3629  recombinase A  38.1 
 
 		 343 aa  62.8  0.000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000256078  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0527  recombinase A  30.46 
 
 		 353 aa  62.8  0.000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.000554316  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3295  recombinase A  31.03 
 
 		 358 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.303399  normal  0.877549 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2014  recombinase A  30 
 
 		 352 aa  62.8  0.000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.306298 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2681  recombinase A  29.65 
 
 		 356 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.288266  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0924  DNA recombination protein, RecA  31.18 
 
 		 342 aa  62.4  0.000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2041  recombinase A  29.65 
 
 		 356 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.461458  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1833  recA protein  31.18 
 
 		 363 aa  62.4  0.000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0352919  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2652  recombinase A  29.65 
 
 		 356 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0810  recombinase A  31.03 
 
 		 356 aa  62.4  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3521  recA protein (recombinase A), N-terminal region  38.1 
 
 		 208 aa  62.4  0.000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000289981  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3792  RecA protein  38.1 
 
 		 208 aa  62.4  0.000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000169081 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0272  recombinase A  31.03 
 
 		 356 aa  62.4  0.000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1421  recombinase A  38.1 
 
 		 343 aa  62  0.000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000173809  normal  0.454678 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0971  recombinase A  31.03 
 
 		 356 aa  62.4  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5979  recombinase A  29.65 
 
 		 348 aa  62.4  0.000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0714479 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2404  recombinase A  31.03 
 
 		 356 aa  62.4  0.000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2672  recombinase A  31.03 
 
 		 356 aa  62.4  0.000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.996925  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0814  recombinase A  31.03 
 
 		 356 aa  62.4  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.538126  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0017  recombinase A  31.03 
 
 		 356 aa  62.4  0.000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1732  recombinase A  30 
 
 		 352 aa  62  0.000000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0649106  normal  0.0921204 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0643  recombinase A  31.03 
 
 		 356 aa  62  0.000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.940587  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0466  recombinase A  29.89 
 
 		 353 aa  62  0.000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2431  recombinase A  38.1 
 
 		 343 aa  62  0.000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.173685  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>