More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NSE_0530 on replicon NC_007798
Organism: Neorickettsia sennetsu str. Miyayama



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007798  NSE_0530  recA protein  100 
 
 
327 aa  655    Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2403  recA protein  70.21 
 
 
343 aa  488  1e-137  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.104177  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0727  recombinase A  71.12 
 
 
347 aa  485  1e-136  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.794192  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2819  recombinase A  68.69 
 
 
366 aa  486  1e-136  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.737949  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1050  recombinase A  70.72 
 
 
355 aa  483  1e-135  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0512  recombinase A  69.47 
 
 
357 aa  481  1e-135  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.759794  normal  0.922847 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1006  recA protein  68.9 
 
 
359 aa  481  1e-135  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0597  recombinase A  69.04 
 
 
356 aa  481  1e-135  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.408398  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1202  recombinase A  69 
 
 
361 aa  480  1e-134  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1165  recombinase A  69 
 
 
424 aa  481  1e-134  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.165606  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1986  recombinase A  68.69 
 
 
361 aa  477  1e-134  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0513  recA protein  67.68 
 
 
350 aa  479  1e-134  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.213728 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1765  recombinase A  69.85 
 
 
348 aa  476  1e-133  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1765  recombinase A  69.85 
 
 
348 aa  476  1e-133  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2558  recombinase A  68.69 
 
 
362 aa  475  1e-133  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.352201  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1275  recombinase A  68.85 
 
 
356 aa  476  1e-133  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.138864  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1986  recombinase A  69.78 
 
 
357 aa  475  1e-133  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.285484  normal  0.795588 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1263  recombinase A  69.3 
 
 
360 aa  476  1e-133  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.778933  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3524  recA protein  68.39 
 
 
355 aa  477  1e-133  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00288101 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1034  recombinase A  66.16 
 
 
343 aa  473  1e-132  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0682579  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1958  recombinase A  68.39 
 
 
362 aa  473  1e-132  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.212458 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1725  recombinase A  68.75 
 
 
360 aa  472  1e-132  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.971685  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2169  recombinase A  68.09 
 
 
364 aa  472  1e-132  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.423968  normal  0.0596488 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1522  recombinase A  68.09 
 
 
361 aa  473  1e-132  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4080  recombinase A  66.26 
 
 
361 aa  470  1.0000000000000001e-131  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1616  recA protein  67.59 
 
 
348 aa  469  1.0000000000000001e-131  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.445296  normal  0.968936 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03079  recombinase A  69.21 
 
 
348 aa  469  1.0000000000000001e-131  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.353429  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1280  recombinase A  66.57 
 
 
362 aa  469  1.0000000000000001e-131  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.118352  normal  0.176518 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2578  recA protein  69.55 
 
 
365 aa  467  1.0000000000000001e-131  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0869161  normal  0.0795722 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1230  recombinase A  68.22 
 
 
357 aa  469  1.0000000000000001e-131  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.460816  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5453  recombinase A  67.48 
 
 
362 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.658876  normal  0.17766 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4134  recA protein  67.59 
 
 
345 aa  464  9.999999999999999e-131  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00773385  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0924  DNA recombination protein, RecA  67.69 
 
 
342 aa  466  9.999999999999999e-131  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1592  recA protein  66.46 
 
 
347 aa  464  9.999999999999999e-131  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1567  recombinase A  66.87 
 
 
363 aa  467  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000432957 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1730  recombinase A  66.57 
 
 
363 aa  467  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00591118  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1616  recombinase A  65.65 
 
 
362 aa  466  9.999999999999999e-131  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2082  recombinase A  67.28 
 
 
347 aa  466  9.999999999999999e-131  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4376  recombinase A  66.26 
 
 
363 aa  467  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3741  recombinase A  65.96 
 
 
364 aa  463  1e-129  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.709907 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1981  recombinase A  67.28 
 
 
349 aa  462  1e-129  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00686398 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3956  recA protein  68.75 
 
 
384 aa  461  1e-129  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.544899  normal  0.165355 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1050  recA protein  67.6 
 
 
345 aa  459  9.999999999999999e-129  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0444945 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3015  recombinase A  66.46 
 
 
347 aa  458  9.999999999999999e-129  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.514179  hitchhiker  0.000000000000973321 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1288  recombinase A  66.67 
 
 
348 aa  459  9.999999999999999e-129  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0634  recombinase A  66.46 
 
 
347 aa  458  9.999999999999999e-129  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.139362  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1610  recA protein  66.56 
 
 
390 aa  458  9.999999999999999e-129  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.651077 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0932  recA protein  67.6 
 
 
345 aa  459  9.999999999999999e-129  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0810  recombinase A  69.01 
 
 
356 aa  454  1e-127  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0272  recombinase A  69.01 
 
 
356 aa  454  1e-127  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1732  recombinase A  69.35 
 
 
352 aa  455  1e-127  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0649106  normal  0.0921204 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2672  recombinase A  69.01 
 
 
356 aa  454  1e-127  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.996925  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0814  recombinase A  69.01 
 
 
356 aa  454  1e-127  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.538126  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0971  recombinase A  69.01 
 
 
356 aa  454  1e-127  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0017  recombinase A  69.01 
 
 
356 aa  454  1e-127  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0643  recombinase A  69.01 
 
 
356 aa  455  1e-127  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.940587  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4685  recA protein  69.87 
 
 
377 aa  457  1e-127  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  unclonable  0.0000000254393  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1231  recombinase A  65.74 
 
 
355 aa  456  1e-127  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000000000176903 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0881  recombinase A  65.95 
 
 
343 aa  454  1e-127  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.115374  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2404  recombinase A  69.01 
 
 
356 aa  454  1e-127  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1927  recombinase A  64.72 
 
 
352 aa  454  1e-127  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1645  recombinase A  64.72 
 
 
352 aa  454  1e-127  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1303  recombinase A  68.12 
 
 
355 aa  457  1e-127  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1643  recombinase A  69.78 
 
 
355 aa  457  1e-127  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.883064  decreased coverage  0.00000000000602005 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1627  recombinase A  66.87 
 
 
341 aa  456  1e-127  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00182901  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0988  recombinase A  65.95 
 
 
343 aa  454  1e-127  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0070  recombinase A  67.28 
 
 
354 aa  456  1e-127  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02549  recombinase A  66.98 
 
 
353 aa  451  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0190601  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38560  recombinase A  66.25 
 
 
349 aa  454  1.0000000000000001e-126  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2373  recombinase A  68.21 
 
 
357 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.263861  normal  0.548421 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1629  recombinase A  65.43 
 
 
355 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.849206  normal  0.20246 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2681  recombinase A  67.82 
 
 
356 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.288266  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0650  recombinase A  68.37 
 
 
357 aa  451  1.0000000000000001e-126  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.590321  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3117  recombinase A  66.05 
 
 
355 aa  451  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1013  recombinase A  66.98 
 
 
353 aa  451  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.580458  unclonable  0.0000000301114 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1175  recombinase A  65.74 
 
 
352 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.214888 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0996  recA protein  66.67 
 
 
363 aa  452  1.0000000000000001e-126  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.579129  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3269  recombinase A  66.05 
 
 
355 aa  451  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5979  recombinase A  68.14 
 
 
348 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0714479 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1248  recombinase A  66.05 
 
 
355 aa  451  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000030102 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2835  recombinase A  66.98 
 
 
353 aa  451  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0246819  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1109  recombinase A  70.53 
 
 
357 aa  452  1.0000000000000001e-126  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3732  recA protein  66.36 
 
 
358 aa  453  1.0000000000000001e-126  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000212043 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4030  recombinase A  65.12 
 
 
355 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.104307  unclonable  0.0000000000000597568 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2228  recA protein  67.07 
 
 
363 aa  451  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.522428  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0623  recA protein  64.81 
 
 
352 aa  452  1.0000000000000001e-126  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.306263  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2014  recombinase A  69.03 
 
 
352 aa  453  1.0000000000000001e-126  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.306298 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3126  recombinase A  66.05 
 
 
355 aa  451  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1523  recombinase A  65.43 
 
 
346 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2041  recombinase A  67.82 
 
 
356 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.461458  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3178  recombinase A  66.98 
 
 
353 aa  451  1.0000000000000001e-126  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0943419  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3946  recombinase A  66.98 
 
 
353 aa  451  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.44116  normal  0.835205 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2699  recombinase A  68.05 
 
 
359 aa  451  1.0000000000000001e-126  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17530  recombinase A  65.43 
 
 
346 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3174  recombinase A  66.67 
 
 
352 aa  451  1.0000000000000001e-126  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0591186  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2652  recombinase A  67.82 
 
 
356 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4088  recombinase A  65.43 
 
 
355 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2983  recombinase A  66.98 
 
 
353 aa  451  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0313902  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2822  recombinase A  66.98 
 
 
353 aa  451  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0783343  decreased coverage  0.0000036093 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2747  recombinase A  66.36 
 
 
357 aa  451  1.0000000000000001e-126  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>