More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_1450 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009637  MmarC7_0469  DNA repair and recombination protein RadA  99.07 
 
 		 322 aa  656    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1450  DNA repair and recombination protein RadA  100 
 
 		 322 aa  661    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0942903  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0368  DNA repair and recombination protein RadA  96.89 
 
 		 322 aa  622  1e-177  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0537  DNA repair and recombination protein RadA  92.55 
 
 		 322 aa  599  1e-170  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0982  DNA repair and recombination protein RadA  81.99 
 
 		 322 aa  551  1e-156  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0430  DNA repair and recombination protein RadA  52.04 
 
 		 324 aa  320  1.9999999999999998e-86  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2099  DNA repair and recombination protein RadA  50.46 
 
 		 325 aa  311  1e-83  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2338  DNA repair and recombination protein RadA  48.63 
 
 		 325 aa  303  2.0000000000000002e-81  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.901889  normal  0.0155582 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1273  DNA repair and recombination protein RadA  44 
 
 		 348 aa  302  5.000000000000001e-81  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2940  DNA repair and recombination protein RadA  49.38 
 
 		 407 aa  296  4e-79  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00873973  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1185  DNA repair and recombination protein RadA  43.75 
 
 		 349 aa  292  5e-78  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1831  DNA repair and recombination protein RadA  44 
 
 		 343 aa  288  7e-77  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0040  DNA repair and recombination protein RadA  47.4 
 
 		 327 aa  288  8e-77  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0637  DNA repair and recombination protein RadA  48.34 
 
 		 329 aa  288  1e-76  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2033  DNA repair and recombination protein RadA  47.6 
 
 		 325 aa  288  1e-76  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.507845  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0885  DNA repair and recombination protein RadA  48.79 
 
 		 322 aa  288  1e-76  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0211  DNA repair and recombination protein RadA  42.9 
 
 		 343 aa  287  1e-76  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1226  DNA repair and recombination protein RadA  44.03 
 
 		 324 aa  286  2.9999999999999996e-76  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0009  DNA repair and recombination protein RadA  45.25 
 
 		 324 aa  285  1.0000000000000001e-75  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.416037  normal  0.130845 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2624  DNA repair and recombination protein RadA  42.36 
 
 		 343 aa  284  2.0000000000000002e-75  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.387482 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1953  DNA repair and recombination protein RadA  45.14 
 
 		 330 aa  282  4.0000000000000003e-75  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2081  DNA repair and recombination protein RadA  45.45 
 
 		 332 aa  282  5.000000000000001e-75  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1118  DNA repair and recombination protein RadA  47.34 
 
 		 358 aa  281  8.000000000000001e-75  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1918  DNA repair and recombination protein RadA  47.24 
 
 		 324 aa  281  1e-74  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0713  DNA repair and recombination protein RadA  44.83 
 
 		 330 aa  279  4e-74  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.33185 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2310  DNA repair and recombination protein RadA  44.79 
 
 		 333 aa  277  1e-73  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.469487  hitchhiker  0.00856648 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1017  DNA repair and recombination protein RadA  44.38 
 
 		 358 aa  261  1e-68  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.103289  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1386  DNA repair and recombination protein RadA  43.52 
 
 		 388 aa  259  5.0000000000000005e-68  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_54533  Rad51 DNA recombination/repair protein  39.44 
 
 		 350 aa  233  3e-60  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.724719  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01237  UvsC protein [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:P78579]  40.45 
 
 		 348 aa  228  1e-58  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.523208  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09092  meiotic recombination protein (Dmc1), putative (AFU_orthologue; AFUA_7G02200)  40.68 
 
 		 658 aa  215  9e-55  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.515485  normal  1 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_33041  predicted protein  39.56 
 
 		 343 aa  211  1e-53  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0526282 
 
 
-
 
NC_006682  CNM01780  meiotic recombination-related protein, putative  37.86 
 
 		 323 aa  208  1e-52  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.51774  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA06990  recombinase, putative  37.54 
 
 		 365 aa  196  5.000000000000001e-49  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.108784  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_17346  predicted protein  35.6 
 
 		 358 aa  182  8.000000000000001e-45  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.908819  normal  0.780808 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1023  Rad51-like  36.56 
 
 		 315 aa  180  2.9999999999999997e-44  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.973197  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0743  Rad51-like  35.1 
 
 		 250 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1633  Rad51 domain-containing protein  32.18 
 
 		 307 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.11008  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0486  Rad51-like protein  32.92 
 
 		 311 aa  125  1e-27  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.100378  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1396  Fis family transcriptional regulator  30.75 
 
 		 312 aa  120  3e-26  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.358472  normal  0.485282 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2031  Rad51-like protein  30.56 
 
 		 314 aa  118  9.999999999999999e-26  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000000738645 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0762  Fis family transcriptional regulator  29.72 
 
 		 312 aa  112  6e-24  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0530008 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_17626  predicted protein  28.57 
 
 		 358 aa  108  1e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0870528  hitchhiker  0.00372316 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0491  DNA repair and recombination protein RadB  29.1 
 
 		 227 aa  83.6  0.000000000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1039  DNA repair and recombination protein RadB  30.58 
 
 		 243 aa  81.6  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1786  DNA repair and recombination protein RadB  29.55 
 
 		 235 aa  78.6  0.0000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.729381  normal  0.0464986 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2158  DNA repair and recombination protein RadB  27.46 
 
 		 235 aa  78.2  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0260  DNA repair and recombination protein RadB  28.69 
 
 		 224 aa  77.4  0.0000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.92433 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0907  DNA repair and recombination protein RadB  28.4 
 
 		 227 aa  76.3  0.0000000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2159  DNA repair and recombination protein RadB  31.58 
 
 		 224 aa  75.5  0.000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1272  hypothetical protein  30.52 
 
 		 224 aa  73.2  0.000000000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.998309 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2123  DNA repair and recombination protein RadB  26.94 
 
 		 225 aa  72.8  0.000000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_54137  Rad51 DNA recombination/repair protein  26.64 
 
 		 363 aa  72  0.00000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0077  DNA repair and recombination protein RadB  28.01 
 
 		 275 aa  68.9  0.0000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.327122  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_50387  predicted protein  26.69 
 
 		 351 aa  68.2  0.0000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.142215  normal  0.0213314 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1640  DNA repair and recombination protein RadB  28.27 
 
 		 215 aa  67.4  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.301627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0988  DNA repair and recombination protein RadB  28.27 
 
 		 216 aa  67.4  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0377224  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0274  DNA repair and recombination protein RadB  27.85 
 
 		 215 aa  64.7  0.000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.944285  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0926  DNA repair and recombination protein RadB  25.2 
 
 		 221 aa  64.3  0.000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1629  DNA repair and recombination protein RadB  26.61 
 
 		 235 aa  63.9  0.000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.554742  normal  0.462396 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0087  RecA/RadA recombinase-like protein  26.11 
 
 		 217 aa  62  0.00000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.439691 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_40092  Rad51 DNA recombination/repair protein  28.3 
 
 		 456 aa  61.2  0.00000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2453  ATPase  27.93 
 
 		 234 aa  60.5  0.00000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.695737 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0972  recombinase A  26.91 
 
 		 349 aa  58.5  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000464693  normal  0.0586083 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2429  DNA repair and recombination protein RadB  30.6 
 
 		 226 aa  58.9  0.0000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1324  recombinase A  26.85 
 
 		 354 aa  58.5  0.0000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.427425 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1490  DNA repair and recombination protein RadB  28.44 
 
 		 213 aa  58.9  0.0000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.695224  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0945  recombinase A  26.91 
 
 		 349 aa  58.5  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10145  DNA repair protein (Rad57), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G12520)  30.39 
 
 		 554 aa  57.8  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.263483 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1732  recombinase A  25.4 
 
 		 352 aa  57.8  0.0000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0649106  normal  0.0921204 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03480  RecA  26.6 
 
 		 337 aa  57.8  0.0000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0452  recombinase A  25.46 
 
 		 357 aa  57.4  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2105  recombinase A  25.46 
 
 		 357 aa  57.4  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.577481 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2439  recA protein  25.23 
 
 		 347 aa  57.8  0.0000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000566681  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0597  recombinase A  25.93 
 
 		 356 aa  57.8  0.0000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.408398  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2373  recombinase A  25.45 
 
 		 357 aa  57  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.263861  normal  0.548421 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2014  recombinase A  25.4 
 
 		 352 aa  57  0.0000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.306298 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0285  DNA repair and recombination protein RadB  23.21 
 
 		 213 aa  56.6  0.0000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.652849  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0727  recombinase A  28.39 
 
 		 347 aa  56.6  0.0000006  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.794192  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1643  recombinase A  25.12 
 
 		 355 aa  56.6  0.0000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.883064  decreased coverage  0.00000000000602005 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5034  recA protein  30.28 
 
 		 364 aa  56.6  0.0000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0381  recombinase A  26.24 
 
 		 374 aa  56.2  0.0000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.620471  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0804  recA protein  26.92 
 
 		 389 aa  56.2  0.0000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0466  recombinase A  27.9 
 
 		 353 aa  56.2  0.0000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2824  recA protein  27.41 
 
 		 366 aa  56.2  0.0000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.217843  normal  0.126726 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2601  recA protein  27.41 
 
 		 366 aa  56.2  0.0000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.2342 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0988  recA protein  27.27 
 
 		 335 aa  55.8  0.0000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1949  recombinase A  25.34 
 
 		 376 aa  56.2  0.0000008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17441  recombinase A  25.43 
 
 		 370 aa  55.8  0.0000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.633631  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3948  recA protein  25.76 
 
 		 384 aa  55.8  0.0000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2228  recA protein  27.8 
 
 		 363 aa  55.5  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.522428  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17691  recombinase A  25 
 
 		 365 aa  55.5  0.000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.757808  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1654  recombinase A  25 
 
 		 365 aa  55.5  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0874  recA protein  26.47 
 
 		 367 aa  55.5  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.532648 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2629  recA protein  27.41 
 
 		 366 aa  55.5  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22971  recombinase A  25.43 
 
 		 379 aa  55.5  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0634  recombinase A  26.36 
 
 		 347 aa  55.5  0.000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.139362  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1981  recombinase A  25 
 
 		 349 aa  55.8  0.000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00686398 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0291  recA protein  27.35 
 
 		 363 aa  55.1  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0355806  hitchhiker  0.00687417 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17531  recombinase A  25 
 
 		 365 aa  55.5  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  unclonable  0.00363576  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>