More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_0713 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010525  Tneu_1953  DNA repair and recombination protein RadA  96.36 
 
 		 330 aa  654    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0713  DNA repair and recombination protein RadA  100 
 
 		 330 aa  672    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.33185 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2081  DNA repair and recombination protein RadA  91.87 
 
 		 332 aa  633  1e-180  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2310  DNA repair and recombination protein RadA  90.39 
 
 		 333 aa  616  1e-175  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.469487  hitchhiker  0.00856648 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1118  DNA repair and recombination protein RadA  68.63 
 
 		 358 aa  491  9.999999999999999e-139  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1017  DNA repair and recombination protein RadA  63.64 
 
 		 358 aa  432  1e-120  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.103289  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0430  DNA repair and recombination protein RadA  54.22 
 
 		 324 aa  338  9e-92  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1226  DNA repair and recombination protein RadA  52.75 
 
 		 324 aa  327  2.0000000000000001e-88  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2099  DNA repair and recombination protein RadA  50.79 
 
 		 325 aa  324  1e-87  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2338  DNA repair and recombination protein RadA  52.02 
 
 		 325 aa  322  4e-87  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.901889  normal  0.0155582 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0040  DNA repair and recombination protein RadA  51.09 
 
 		 327 aa  321  9.000000000000001e-87  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0009  DNA repair and recombination protein RadA  51.13 
 
 		 324 aa  319  3.9999999999999996e-86  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.416037  normal  0.130845 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1386  DNA repair and recombination protein RadA  50.63 
 
 		 388 aa  318  6e-86  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2033  DNA repair and recombination protein RadA  51.09 
 
 		 325 aa  316  4e-85  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.507845  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0885  DNA repair and recombination protein RadA  52.96 
 
 		 322 aa  308  6.999999999999999e-83  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0637  DNA repair and recombination protein RadA  47.68 
 
 		 329 aa  308  8e-83  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2940  DNA repair and recombination protein RadA  46.75 
 
 		 407 aa  307  2.0000000000000002e-82  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00873973  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1185  DNA repair and recombination protein RadA  45.51 
 
 		 349 aa  296  2e-79  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1273  DNA repair and recombination protein RadA  44.9 
 
 		 348 aa  288  6e-77  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1918  DNA repair and recombination protein RadA  47.96 
 
 		 324 aa  287  1e-76  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1831  DNA repair and recombination protein RadA  45.16 
 
 		 343 aa  287  2e-76  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0211  DNA repair and recombination protein RadA  44.44 
 
 		 343 aa  283  2.0000000000000002e-75  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0982  DNA repair and recombination protein RadA  44.69 
 
 		 322 aa  277  2e-73  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0368  DNA repair and recombination protein RadA  44.94 
 
 		 322 aa  276  4e-73  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0537  DNA repair and recombination protein RadA  45.45 
 
 		 322 aa  275  8e-73  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2624  DNA repair and recombination protein RadA  41.94 
 
 		 343 aa  273  2.0000000000000002e-72  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.387482 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1450  DNA repair and recombination protein RadA  44.03 
 
 		 322 aa  273  4.0000000000000004e-72  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0942903  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0469  DNA repair and recombination protein RadA  44.55 
 
 		 322 aa  272  5.000000000000001e-72  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01237  UvsC protein [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:P78579]  43.67 
 
 		 348 aa  266  2.9999999999999995e-70  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.523208  normal  1 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_54533  Rad51 DNA recombination/repair protein  43.91 
 
 		 350 aa  259  6e-68  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.724719  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09092  meiotic recombination protein (Dmc1), putative (AFU_orthologue; AFUA_7G02200)  44.3 
 
 		 658 aa  256  4e-67  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.515485  normal  1 
 
 
-
 
NC_006682  CNM01780  meiotic recombination-related protein, putative  43 
 
 		 323 aa  244  1.9999999999999999e-63  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.51774  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_33041  predicted protein  42.72 
 
 		 343 aa  239  2.9999999999999997e-62  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0526282 
 
 
-
 
NC_006670  CNA06990  recombinase, putative  45.08 
 
 		 365 aa  239  6.999999999999999e-62  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.108784  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1023  Rad51-like  43.81 
 
 		 315 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.973197  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_17346  predicted protein  40.76 
 
 		 358 aa  229  5e-59  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.908819  normal  0.780808 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0743  Rad51-like  46.28 
 
 		 250 aa  192  7e-48  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1633  Rad51 domain-containing protein  36.66 
 
 		 307 aa  153  4e-36  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.11008  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0486  Rad51-like protein  35.58 
 
 		 311 aa  152  1e-35  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.100378  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2031  Rad51-like protein  34.82 
 
 		 314 aa  146  6e-34  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000000738645 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1396  Fis family transcriptional regulator  35.03 
 
 		 312 aa  143  4e-33  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.358472  normal  0.485282 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0762  Fis family transcriptional regulator  34.82 
 
 		 312 aa  141  9.999999999999999e-33  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0530008 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_17626  predicted protein  31.72 
 
 		 358 aa  122  9.999999999999999e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0870528  hitchhiker  0.00372316 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2123  DNA repair and recombination protein RadB  35.81 
 
 		 225 aa  115  8.999999999999998e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1039  DNA repair and recombination protein RadB  34.52 
 
 		 243 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0926  DNA repair and recombination protein RadB  32.77 
 
 		 221 aa  105  8e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0907  DNA repair and recombination protein RadB  34.2 
 
 		 227 aa  105  1e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2159  DNA repair and recombination protein RadB  34.45 
 
 		 224 aa  104  2e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0491  DNA repair and recombination protein RadB  34.19 
 
 		 227 aa  104  2e-21  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1272  hypothetical protein  33.05 
 
 		 224 aa  103  4e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.998309 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2453  ATPase  31.17 
 
 		 234 aa  99.4  7e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.695737 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0260  DNA repair and recombination protein RadB  31.47 
 
 		 224 aa  99.4  8e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.92433 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_54137  Rad51 DNA recombination/repair protein  26.44 
 
 		 363 aa  99  9e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_50387  predicted protein  28.35 
 
 		 351 aa  99  1e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.142215  normal  0.0213314 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1786  DNA repair and recombination protein RadB  33.9 
 
 		 235 aa  98.2  2e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.729381  normal  0.0464986 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10145  DNA repair protein (Rad57), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G12520)  37.61 
 
 		 554 aa  96.7  5e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.263483 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2158  DNA repair and recombination protein RadB  33.91 
 
 		 235 aa  95.5  1e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0988  DNA repair and recombination protein RadB  30.4 
 
 		 216 aa  92  1e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0377224  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0274  DNA repair and recombination protein RadB  30.84 
 
 		 215 aa  92  1e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.944285  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1640  DNA repair and recombination protein RadB  29.96 
 
 		 215 aa  90.9  3e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.301627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2429  DNA repair and recombination protein RadB  30.8 
 
 		 226 aa  88.2  2e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0087  RecA/RadA recombinase-like protein  33.33 
 
 		 217 aa  86.3  7e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.439691 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1490  DNA repair and recombination protein RadB  30.26 
 
 		 213 aa  85.1  0.000000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.695224  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1629  DNA repair and recombination protein RadB  33.05 
 
 		 235 aa  84  0.000000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.554742  normal  0.462396 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0077  DNA repair and recombination protein RadB  29.89 
 
 		 275 aa  82  0.00000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.327122  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0886  recA protein  26.29 
 
 		 356 aa  70.5  0.00000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_58642  predicted protein  29.79 
 
 		 541 aa  69.3  0.00000000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  hitchhiker  0.00988886  normal  0.20524 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1949  recombinase A  28.57 
 
 		 376 aa  68.9  0.0000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0360  recA protein  27.96 
 
 		 339 aa  68.9  0.0000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000245068  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17691  recombinase A  30 
 
 		 365 aa  67.8  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.757808  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17441  recombinase A  30 
 
 		 370 aa  68.2  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.633631  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1654  recombinase A  30 
 
 		 365 aa  67.8  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_40092  Rad51 DNA recombination/repair protein  26.91 
 
 		 456 aa  68.2  0.0000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16811  recombinase A  30 
 
 		 367 aa  68.2  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17531  recombinase A  30 
 
 		 365 aa  68.2  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  unclonable  0.00363576  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0381  recombinase A  29.05 
 
 		 374 aa  67  0.0000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.620471  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0074  recA protein  27.49 
 
 		 344 aa  66.6  0.0000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4152  recombinase A  29.72 
 
 		 343 aa  66.6  0.0000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0090  recombinase A  26.51 
 
 		 333 aa  66.2  0.0000000007  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.999196  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1267  recA protein  27.75 
 
 		 358 aa  66.2  0.0000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.165392  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2695  recombinase A  29.95 
 
 		 360 aa  65.9  0.0000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.611822  decreased coverage  0.00221105 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1133  recombinase A  28.91 
 
 		 377 aa  65.5  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1567  recombinase A  30.52 
 
 		 363 aa  65.5  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000432957 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0285  DNA repair and recombination protein RadB  27.88 
 
 		 213 aa  65.1  0.000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.652849  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20071  recombinase A  28.91 
 
 		 377 aa  65.5  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4925  recombinase A  28.5 
 
 		 358 aa  64.7  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.705325  normal  0.253637 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1592  recA protein  29.77 
 
 		 347 aa  64.7  0.000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2169  recombinase A  29.67 
 
 		 364 aa  64.7  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.423968  normal  0.0596488 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1833  recA protein  29.17 
 
 		 363 aa  65.1  0.000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0352919  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1162  recA protein  26.05 
 
 		 356 aa  63.9  0.000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.501327  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2105  recombinase A  29.17 
 
 		 357 aa  63.9  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.577481 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1525  recA protein  29.17 
 
 		 353 aa  64.3  0.000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.0000000245316  unclonable  4.38442e-19 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0452  recombinase A  29.17 
 
 		 357 aa  63.9  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1958  recombinase A  29.67 
 
 		 362 aa  64.3  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.212458 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22971  recombinase A  28.57 
 
 		 379 aa  64.3  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1479  DNA repair protein RadA  27 
 
 		 457 aa  63.9  0.000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0327327  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0131  recombinase A  27.91 
 
 		 365 aa  63.5  0.000000004  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_54013  chloroplast-targeted nuclear-encoded recombinase  27.75 
 
 		 431 aa  63.9  0.000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.481805  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1549  recA protein  28.7 
 
 		 362 aa  63.5  0.000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  unclonable  0.00000000000205683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26240  predicted protein  27.19 
 
 		 369 aa  63.9  0.000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00269696 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>