More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_26240 on replicon NC_009364
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009364  OSTLU_26240  predicted protein  100 
 
 
369 aa  744    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00269696 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0945  recombinase A  61.67 
 
 
349 aa  447  1.0000000000000001e-124  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0972  recombinase A  61.67 
 
 
349 aa  447  1.0000000000000001e-124  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000464693  normal  0.0586083 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1949  recombinase A  59.83 
 
 
376 aa  438  9.999999999999999e-123  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0381  recombinase A  63.38 
 
 
374 aa  436  1e-121  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.620471  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22971  recombinase A  61.54 
 
 
379 aa  432  1e-120  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1133  recombinase A  57.88 
 
 
377 aa  429  1e-119  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20071  recombinase A  57.88 
 
 
377 aa  429  1e-119  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4116  recombinase A  62.85 
 
 
356 aa  430  1e-119  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.979014 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17531  recombinase A  60.67 
 
 
365 aa  426  1e-118  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  unclonable  0.00363576  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17691  recombinase A  61.18 
 
 
365 aa  422  1e-117  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.757808  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1654  recombinase A  61.18 
 
 
365 aa  422  1e-117  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0348  recombinase A  59.6 
 
 
356 aa  424  1e-117  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16811  recombinase A  58.41 
 
 
367 aa  423  1e-117  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17441  recombinase A  61.18 
 
 
370 aa  421  1e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.633631  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2695  recombinase A  59.08 
 
 
360 aa  414  1e-114  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.611822  decreased coverage  0.00221105 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4925  recombinase A  60.68 
 
 
358 aa  399  9.999999999999999e-111  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.705325  normal  0.253637 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1671  recombinase A  60.68 
 
 
357 aa  401  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3994  recA protein  56.73 
 
 
352 aa  392  1e-108  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0864938  normal  0.282621 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27820  protein RecA  58.54 
 
 
345 aa  388  1e-107  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0461192 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2403  recA protein  56.07 
 
 
343 aa  389  1e-107  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.104177  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0721  recA protein  61.41 
 
 
359 aa  389  1e-107  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23200  protein RecA  56.36 
 
 
359 aa  390  1e-107  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.930258  normal  0.114189 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1765  recombinase A  55.45 
 
 
348 aa  385  1e-106  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1765  recombinase A  55.45 
 
 
348 aa  385  1e-106  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0666  recA protein  57.41 
 
 
378 aa  387  1e-106  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.386455  normal  0.202905 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2448  recA protein  56.36 
 
 
350 aa  386  1e-106  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.276179  normal  0.953449 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1219  recombinase A  56.67 
 
 
347 aa  385  1e-106  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0979767  normal  0.281308 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3525  recombinase A  55.49 
 
 
345 aa  388  1e-106  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.551254  normal  0.0703421 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1419  recA protein  56.89 
 
 
347 aa  387  1e-106  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17690  RecA protein  54.85 
 
 
367 aa  385  1e-106  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.72475  normal  0.370795 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3975  recombinase A  55.96 
 
 
350 aa  387  1e-106  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1041  recA protein  56.76 
 
 
364 aa  387  1e-106  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4080  recombinase A  54.65 
 
 
361 aa  382  1e-105  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0284  recombinase A  56.17 
 
 
418 aa  383  1e-105  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0864352  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1280  recombinase A  53.2 
 
 
362 aa  383  1e-105  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.118352  normal  0.176518 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_54013  chloroplast-targeted nuclear-encoded recombinase  54.04 
 
 
431 aa  381  1e-105  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.481805  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1592  recA protein  53.3 
 
 
347 aa  384  1e-105  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1079  recA protein  54.91 
 
 
348 aa  382  1e-105  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10530  protein RecA  56.48 
 
 
368 aa  383  1e-105  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.419207  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3015  recombinase A  56.44 
 
 
347 aa  381  1e-105  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.514179  hitchhiker  0.000000000000973321 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1473  recA protein  57.32 
 
 
355 aa  384  1e-105  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.000000112388  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3103  recA protein  58.39 
 
 
343 aa  384  1e-105  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000175278  normal  0.820651 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0653  recA protein  54.34 
 
 
346 aa  384  1e-105  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1785  recA protein  55.09 
 
 
350 aa  382  1e-105  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2420  recombinase A  55.66 
 
 
350 aa  384  1e-105  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.157742  normal  0.0782537 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1545  recA protein  54.88 
 
 
346 aa  383  1e-105  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.259692  normal  0.07485 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1389  recombinase A  56.17 
 
 
348 aa  379  1e-104  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.384565  normal  0.0556082 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2202  recA protein  55.86 
 
 
347 aa  379  1e-104  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1523  recombinase A  55.29 
 
 
346 aa  381  1e-104  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1616  recA protein  55.32 
 
 
348 aa  380  1e-104  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.445296  normal  0.968936 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4376  recombinase A  53.48 
 
 
363 aa  381  1e-104  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0924  DNA recombination protein, RecA  56.27 
 
 
342 aa  379  1e-104  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3741  recombinase A  53.2 
 
 
364 aa  379  1e-104  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.709907 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4183  recA protein  57.1 
 
 
349 aa  381  1e-104  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.888096  normal  0.191355 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1567  recombinase A  53.48 
 
 
363 aa  380  1e-104  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000432957 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1730  recombinase A  52.92 
 
 
363 aa  378  1e-104  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00591118  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38560  recombinase A  56.13 
 
 
349 aa  381  1e-104  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1725  recombinase A  55.59 
 
 
360 aa  380  1e-104  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.971685  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1425  recombinase A  55.86 
 
 
348 aa  378  1e-104  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.976211  normal  0.0337506 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3732  recA protein  54 
 
 
358 aa  379  1e-104  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000212043 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6708  recombinase A  55.76 
 
 
345 aa  380  1e-104  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.141706  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17530  recombinase A  55.29 
 
 
346 aa  381  1e-104  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1242  recA protein  55.45 
 
 
376 aa  380  1e-104  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1492  recA protein  55.56 
 
 
345 aa  380  1e-104  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.211084  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5453  recombinase A  53.24 
 
 
362 aa  378  1e-104  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.658876  normal  0.17766 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0618  recA protein  55.52 
 
 
347 aa  380  1e-104  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.186792  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1629  recombinase A  56.17 
 
 
355 aa  377  1e-103  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.849206  normal  0.20246 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4088  recombinase A  56.17 
 
 
355 aa  377  1e-103  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4030  recombinase A  56.17 
 
 
355 aa  378  1e-103  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.104307  unclonable  0.0000000000000597568 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2134  recombinase A  53.82 
 
 
347 aa  375  1e-103  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00345325 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1747  recombinase A  54.47 
 
 
351 aa  375  1e-103  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000101073  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1619  recA protein  57.1 
 
 
352 aa  375  1e-103  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000177143  hitchhiker  0.0000000069085 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1231  recombinase A  56.17 
 
 
355 aa  377  1e-103  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000000000176903 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1627  recombinase A  55.76 
 
 
341 aa  376  1e-103  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00182901  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1175  recombinase A  54.49 
 
 
352 aa  377  1e-103  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.214888 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2405  recombinase A  54.6 
 
 
341 aa  375  1e-103  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2819  recombinase A  55.72 
 
 
366 aa  377  1e-103  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.737949  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2216  RecA protein  54.27 
 
 
366 aa  375  1e-103  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.139784 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2147  recombinase A  53.82 
 
 
347 aa  375  1e-103  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0513  recA protein  56.07 
 
 
350 aa  375  1e-103  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.213728 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3106  recA protein  55.43 
 
 
346 aa  378  1e-103  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000524014  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1462  recombinase A  50.99 
 
 
352 aa  375  1e-103  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000631927 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0512  recombinase A  54.62 
 
 
357 aa  377  1e-103  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.759794  normal  0.922847 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1460  recombinase A  53.66 
 
 
351 aa  376  1e-103  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00992179  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1610  recA protein  53.64 
 
 
390 aa  376  1e-103  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.651077 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2341  recA protein  54.85 
 
 
350 aa  377  1e-103  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2193  recombinase A  53.82 
 
 
347 aa  375  1e-103  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0979046 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4194  recombinase A  56.52 
 
 
358 aa  377  1e-103  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1492  recA protein  54.55 
 
 
348 aa  372  1e-102  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.148956 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1581  recA protein  53.78 
 
 
383 aa  372  1e-102  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4033  recA protein  55.56 
 
 
354 aa  374  1e-102  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1378  recombinase A  55.56 
 
 
354 aa  374  1e-102  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0217782  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3524  recA protein  55.49 
 
 
355 aa  374  1e-102  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00288101 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3964  RecA protein  53.43 
 
 
358 aa  372  1e-102  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.122144  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1275  recombinase A  56.66 
 
 
356 aa  374  1e-102  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.138864  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1345  recombinase A  50.71 
 
 
347 aa  372  1e-102  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0958775  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0676  recA protein  55.25 
 
 
347 aa  373  1e-102  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00169949  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1616  recombinase A  52.65 
 
 
362 aa  374  1e-102  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1371  recombinase A  50.71 
 
 
347 aa  372  1e-102  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.150356  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>