More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_3756 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011891  A2cp1_3756  recA protein  100 
 
 		 316 aa  624  1e-178  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3617  recA protein  96.84 
 
 		 316 aa  609  1e-173  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3687  recA protein  97.15 
 
 		 343 aa  610  1e-173  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3750  recA protein  84.62 
 
 		 340 aa  531  1e-150  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.79987  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3161  recombinase A  69.28 
 
 		 336 aa  444  1.0000000000000001e-124  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1034  recombinase A  68.47 
 
 		 343 aa  446  1.0000000000000001e-124  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0682579  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3630  recombinase A  70.45 
 
 		 338 aa  442  1e-123  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3735  recombinase A  70.42 
 
 		 338 aa  443  1e-123  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0513  recA protein  72.24 
 
 		 350 aa  437  9.999999999999999e-123  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.213728 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0456  recA protein  72.88 
 
 		 358 aa  441  9.999999999999999e-123  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3524  recA protein  70.41 
 
 		 355 aa  435  1e-121  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00288101 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1275  recombinase A  71.77 
 
 		 356 aa  435  1e-121  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.138864  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0932  recA protein  70.45 
 
 		 345 aa  437  1e-121  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1050  recA protein  70.45 
 
 		 345 aa  437  1e-121  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0444945 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1610  recA protein  70.9 
 
 		 390 aa  437  1e-121  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.651077 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2403  recA protein  70.07 
 
 		 343 aa  434  1e-120  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.104177  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1165  recombinase A  71.88 
 
 		 424 aa  432  1e-120  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.165606  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3295  recombinase A  71.24 
 
 		 358 aa  431  1e-120  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.303399  normal  0.877549 
 
 
-
 
NC_004310  BR1202  recombinase A  71.88 
 
 		 361 aa  431  1e-120  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1280  recombinase A  70.83 
 
 		 362 aa  431  1e-120  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.118352  normal  0.176518 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2405  recombinase A  67.2 
 
 		 341 aa  433  1e-120  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2819  recombinase A  70 
 
 		 366 aa  433  1e-120  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.737949  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3964  RecA protein  70.9 
 
 		 358 aa  432  1e-120  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.122144  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4075  recA protein  70.57 
 
 		 358 aa  432  1e-120  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0386592  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0671  recombinase A  70.9 
 
 		 358 aa  431  1e-120  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.180955 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1730  recombinase A  71.88 
 
 		 363 aa  431  1e-120  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00591118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1725  recombinase A  71.43 
 
 		 360 aa  432  1e-120  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.971685  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4376  recombinase A  71.53 
 
 		 363 aa  431  1e-120  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0810  recombinase A  70.57 
 
 		 356 aa  429  1e-119  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0272  recombinase A  70.57 
 
 		 356 aa  429  1e-119  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4108  recA protein  70.23 
 
 		 358 aa  431  1e-119  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.633837  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0971  recombinase A  70.57 
 
 		 356 aa  429  1e-119  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1986  recombinase A  71.88 
 
 		 361 aa  428  1e-119  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5979  recombinase A  69.9 
 
 		 348 aa  428  1e-119  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0714479 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2404  recombinase A  70.57 
 
 		 356 aa  429  1e-119  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2578  recA protein  71.53 
 
 		 365 aa  431  1e-119  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0869161  normal  0.0795722 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1592  recA protein  65.4 
 
 		 347 aa  428  1e-119  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0017  recombinase A  70.57 
 
 		 356 aa  429  1e-119  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0643  recombinase A  70.23 
 
 		 356 aa  428  1e-119  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.940587  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3741  recombinase A  71.53 
 
 		 364 aa  429  1e-119  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.709907 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0814  recombinase A  70.57 
 
 		 356 aa  429  1e-119  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.538126  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1567  recombinase A  71.18 
 
 		 363 aa  429  1e-119  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000432957 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1616  recombinase A  70.83 
 
 		 362 aa  427  1e-119  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1833  recA protein  68.9 
 
 		 363 aa  427  1e-119  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0352919  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2681  recombinase A  69.9 
 
 		 356 aa  429  1e-119  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.288266  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2041  recombinase A  69.9 
 
 		 356 aa  429  1e-119  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.461458  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0512  recombinase A  71.43 
 
 		 357 aa  430  1e-119  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.759794  normal  0.922847 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1549  recA protein  69.57 
 
 		 362 aa  429  1e-119  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  unclonable  0.00000000000205683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5453  recombinase A  69.79 
 
 		 362 aa  427  1e-119  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.658876  normal  0.17766 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2652  recombinase A  69.9 
 
 		 356 aa  429  1e-119  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2672  recombinase A  70.57 
 
 		 356 aa  429  1e-119  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.996925  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0440  recombinase A  70.23 
 
 		 358 aa  430  1e-119  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1616  recA protein  67.56 
 
 		 348 aa  424  1e-118  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.445296  normal  0.968936 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2573  recombinase A  69.57 
 
 		 359 aa  427  1e-118  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.803783  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0650  recombinase A  69.57 
 
 		 357 aa  426  1e-118  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.590321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1523  recombinase A  72.22 
 
 		 346 aa  424  1e-118  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2699  recombinase A  69.57 
 
 		 359 aa  427  1e-118  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17530  recombinase A  72.22 
 
 		 346 aa  424  1e-118  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2528  recA protein  68.56 
 
 		 343 aa  425  1e-118  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2169  recombinase A  71.53 
 
 		 364 aa  424  1e-117  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.423968  normal  0.0596488 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2558  recombinase A  69.73 
 
 		 362 aa  421  1e-117  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.352201  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0219  recombinase A  69.13 
 
 		 333 aa  422  1e-117  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0711  recombinase A  68.23 
 
 		 345 aa  422  1e-117  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1958  recombinase A  71.18 
 
 		 362 aa  423  1e-117  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.212458 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4080  recombinase A  70.73 
 
 		 361 aa  423  1e-117  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4030  recombinase A  68.56 
 
 		 355 aa  419  1e-116  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.104307  unclonable  0.0000000000000597568 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3015  recombinase A  67.86 
 
 		 347 aa  420  1e-116  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.514179  hitchhiker  0.000000000000973321 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1765  recombinase A  63.06 
 
 		 348 aa  418  1e-116  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1765  recombinase A  63.46 
 
 		 348 aa  418  1e-116  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1732  recombinase A  66.67 
 
 		 352 aa  418  1e-116  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0649106  normal  0.0921204 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1986  recombinase A  67 
 
 		 357 aa  417  1e-116  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.285484  normal  0.795588 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1288  recombinase A  67.67 
 
 		 348 aa  420  1e-116  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1263  recombinase A  70.49 
 
 		 360 aa  420  1e-116  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.778933  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38560  recombinase A  69.8 
 
 		 349 aa  420  1e-116  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3179  recombinase A  69.84 
 
 		 340 aa  420  1e-116  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1267  recA protein  68.06 
 
 		 358 aa  418  1e-116  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.165392  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5903  recA protein  69.07 
 
 		 379 aa  420  1e-116  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2179  recA protein  68.67 
 
 		 347 aa  417  1e-116  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.385059  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1118  recA protein  67.56 
 
 		 365 aa  418  1e-116  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.145639  normal  0.0819488 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4088  recombinase A  68.56 
 
 		 355 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0145  recombinase A  72.92 
 
 		 338 aa  417  9.999999999999999e-116  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1629  recombinase A  68.56 
 
 		 355 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.849206  normal  0.20246 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1231  recombinase A  68.56 
 
 		 355 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000000176903 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23200  protein RecA  68.56 
 
 		 359 aa  416  9.999999999999999e-116  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.930258  normal  0.114189 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0387  recA protein  69.44 
 
 		 347 aa  414  9.999999999999999e-116  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3956  recA protein  69.55 
 
 		 384 aa  416  9.999999999999999e-116  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.544899  normal  0.165355 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0527  recombinase A  67.31 
 
 		 353 aa  414  9.999999999999999e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.000554316  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0198  recombinase A  69.8 
 
 		 339 aa  415  9.999999999999999e-116  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0327556 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0676  recA protein  68.79 
 
 		 347 aa  416  9.999999999999999e-116  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00169949  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4685  recA protein  65.29 
 
 		 377 aa  414  9.999999999999999e-116  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  unclonable  0.0000000254393  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0623  recA protein  66.67 
 
 		 352 aa  416  9.999999999999999e-116  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.306263  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2014  recombinase A  66.33 
 
 		 352 aa  417  9.999999999999999e-116  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.306298 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1006  recA protein  70.53 
 
 		 359 aa  417  9.999999999999999e-116  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1981  recombinase A  66.33 
 
 		 349 aa  416  9.999999999999999e-116  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00686398 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1522  recombinase A  70.49 
 
 		 361 aa  417  9.999999999999999e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1492  recA protein  64.04 
 
 		 345 aa  415  9.999999999999999e-116  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.211084  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17690  RecA protein  64.63 
 
 		 367 aa  415  9.999999999999999e-116  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.72475  normal  0.370795 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1242  recA protein  68.9 
 
 		 376 aa  416  9.999999999999999e-116  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0924  DNA recombination protein, RecA  70.88 
 
 		 342 aa  414  1e-114  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1175  recombinase A  67.89 
 
 		 352 aa  413  1e-114  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.214888 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>