More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_54013 on replicon NC_011669
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011669  PHATRDRAFT_54013  chloroplast-targeted nuclear-encoded recombinase  100 
 
 		 431 aa  877    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.481805  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2695  recombinase A  65.24 
 
 		 360 aa  453  1.0000000000000001e-126  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.611822  decreased coverage  0.00221105 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0945  recombinase A  64.43 
 
 		 349 aa  453  1.0000000000000001e-126  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0972  recombinase A  64.43 
 
 		 349 aa  453  1.0000000000000001e-126  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000464693  normal  0.0586083 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17531  recombinase A  65.57 
 
 		 365 aa  449  1e-125  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  unclonable  0.00363576  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4116  recombinase A  66.67 
 
 		 356 aa  448  1e-125  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.979014 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16811  recombinase A  63.24 
 
 		 367 aa  444  1e-123  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1949  recombinase A  64.88 
 
 		 376 aa  442  1e-123  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0381  recombinase A  64.79 
 
 		 374 aa  443  1e-123  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.620471  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1654  recombinase A  67.19 
 
 		 365 aa  443  1e-123  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17441  recombinase A  67.19 
 
 		 370 aa  442  1e-123  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.633631  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17691  recombinase A  67.19 
 
 		 365 aa  443  1e-123  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.757808  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22971  recombinase A  62.61 
 
 		 379 aa  442  1e-123  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20071  recombinase A  61.34 
 
 		 377 aa  436  1e-121  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1133  recombinase A  63.78 
 
 		 377 aa  436  1e-121  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0348  recombinase A  61.96 
 
 		 356 aa  426  1e-118  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4925  recombinase A  64.8 
 
 		 358 aa  417  9.999999999999999e-116  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.705325  normal  0.253637 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1671  recombinase A  63.91 
 
 		 357 aa  415  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0721  recA protein  65.7 
 
 		 359 aa  411  1e-113  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1725  recombinase A  61.13 
 
 		 360 aa  402  1e-111  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.971685  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3103  recA protein  59.44 
 
 		 343 aa  399  9.999999999999999e-111  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000175278  normal  0.820651 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0618  recA protein  58.13 
 
 		 347 aa  398  9.999999999999999e-111  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.186792  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0512  recombinase A  58.97 
 
 		 357 aa  398  9.999999999999999e-111  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.759794  normal  0.922847 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1275  recombinase A  58.31 
 
 		 356 aa  397  1e-109  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.138864  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26240  predicted protein  57.67 
 
 		 369 aa  398  1e-109  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00269696 
 
 
-
 
NC_004310  BR1202  recombinase A  58.75 
 
 		 361 aa  393  1e-108  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1280  recombinase A  56.62 
 
 		 362 aa  392  1e-108  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.118352  normal  0.176518 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0284  recombinase A  53.67 
 
 		 418 aa  394  1e-108  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0864352  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1165  recombinase A  58.75 
 
 		 424 aa  392  1e-108  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.165606  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0513  recA protein  58.46 
 
 		 350 aa  392  1e-108  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.213728 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1041  recA protein  57.72 
 
 		 364 aa  393  1e-108  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0727  recombinase A  55.71 
 
 		 347 aa  394  1e-108  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.794192  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1765  recombinase A  54.26 
 
 		 348 aa  389  1e-107  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2448  recA protein  54.2 
 
 		 350 aa  385  1e-106  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.276179  normal  0.953449 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0628  recA protein  58.82 
 
 		 346 aa  385  1e-106  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.067585  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1765  recombinase A  53.98 
 
 		 348 aa  388  1e-106  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1034  recombinase A  58.13 
 
 		 343 aa  385  1e-106  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0682579  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5453  recombinase A  58.23 
 
 		 362 aa  385  1e-106  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.658876  normal  0.17766 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1592  recA protein  55.75 
 
 		 347 aa  388  1e-106  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3741  recombinase A  59.15 
 
 		 364 aa  386  1e-106  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.709907 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1986  recombinase A  58.44 
 
 		 361 aa  388  1e-106  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1616  recombinase A  56.06 
 
 		 362 aa  386  1e-106  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1462  recombinase A  55.43 
 
 		 352 aa  387  1e-106  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000631927 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0676  recA protein  57.37 
 
 		 347 aa  387  1e-106  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00169949  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4376  recombinase A  55.49 
 
 		 363 aa  388  1e-106  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1460  recombinase A  54.31 
 
 		 351 aa  386  1e-106  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00992179  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4080  recombinase A  56.4 
 
 		 361 aa  382  1e-105  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1473  recA protein  56.11 
 
 		 355 aa  384  1e-105  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.000000112388  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2403  recA protein  57.5 
 
 		 343 aa  383  1e-105  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.104177  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17690  RecA protein  52.91 
 
 		 367 aa  382  1e-105  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.72475  normal  0.370795 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0291  recA protein  60.06 
 
 		 363 aa  383  1e-105  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0355806  hitchhiker  0.00687417 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2819  recombinase A  57.01 
 
 		 366 aa  384  1e-105  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.737949  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2228  recA protein  57.68 
 
 		 363 aa  383  1e-105  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.522428  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23200  protein RecA  57.23 
 
 		 359 aa  382  1e-105  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.930258  normal  0.114189 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1567  recombinase A  59.15 
 
 		 363 aa  383  1e-105  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000432957 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1730  recombinase A  58.54 
 
 		 363 aa  384  1e-105  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00591118  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5503  recA protein  60.06 
 
 		 363 aa  382  1e-105  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.468538  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1006  recA protein  56.67 
 
 		 359 aa  383  1e-105  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1021  RecA protein  54.05 
 
 		 379 aa  384  1e-105  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1522  recombinase A  58.13 
 
 		 361 aa  383  1e-105  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1324  recombinase A  53.4 
 
 		 354 aa  379  1e-104  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.427425 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1118  recA protein  52.54 
 
 		 365 aa  378  1e-104  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.145639  normal  0.0819488 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10530  protein RecA  56.65 
 
 		 368 aa  380  1e-104  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.419207  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1378  recombinase A  54.68 
 
 		 354 aa  379  1e-104  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0217782  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1079  recA protein  58.13 
 
 		 348 aa  381  1e-104  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0988  recA protein  53.68 
 
 		 335 aa  380  1e-104  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1288  recombinase A  54.9 
 
 		 348 aa  381  1e-104  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2169  recombinase A  58.13 
 
 		 364 aa  379  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.423968  normal  0.0596488 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1545  recA protein  53.57 
 
 		 346 aa  379  1e-104  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.259692  normal  0.07485 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1267  recA protein  56.11 
 
 		 358 aa  379  1e-104  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.165392  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0666  recA protein  56.11 
 
 		 378 aa  379  1e-104  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.386455  normal  0.202905 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03480  RecA  54.75 
 
 		 337 aa  379  1e-104  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1345  recombinase A  52.66 
 
 		 347 aa  380  1e-104  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0958775  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1371  recombinase A  52.66 
 
 		 347 aa  380  1e-104  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.150356  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2558  recombinase A  56.1 
 
 		 362 aa  378  1e-104  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.352201  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0005  recA protein  55.62 
 
 		 355 aa  379  1e-104  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0310986  normal  0.0651314 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1492  recA protein  55.59 
 
 		 345 aa  379  1e-104  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.211084  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2179  recA protein  56.84 
 
 		 347 aa  379  1e-104  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.385059  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1046  recombinase A  56.35 
 
 		 355 aa  379  1e-104  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.558521 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27820  protein RecA  54.82 
 
 		 345 aa  376  1e-103  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0461192 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2601  recA protein  57.89 
 
 		 366 aa  376  1e-103  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.2342 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4033  recA protein  55.69 
 
 		 354 aa  377  1e-103  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10720  protein RecA  53.16 
 
 		 361 aa  375  1e-103  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000907009  unclonable  0.00000000149755 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1175  recombinase A  53.85 
 
 		 352 aa  376  1e-103  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.214888 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2747  recombinase A  54.42 
 
 		 357 aa  375  1e-103  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38560  recombinase A  56.04 
 
 		 349 aa  378  1e-103  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3525  recombinase A  55.28 
 
 		 345 aa  375  1e-103  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.551254  normal  0.0703421 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1986  recombinase A  57.45 
 
 		 357 aa  376  1e-103  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.285484  normal  0.795588 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1523  recombinase A  56.04 
 
 		 346 aa  378  1e-103  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0258  recA protein  57.1 
 
 		 361 aa  376  1e-103  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1230  recombinase A  56.52 
 
 		 357 aa  376  1e-103  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.460816  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2147  recombinase A  54.46 
 
 		 347 aa  375  1e-103  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1195  recombinase A  55.46 
 
 		 355 aa  377  1e-103  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.111178  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1219  recombinase A  54.28 
 
 		 347 aa  378  1e-103  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0979767  normal  0.281308 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17530  recombinase A  56.04 
 
 		 346 aa  378  1e-103  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1958  recombinase A  57.81 
 
 		 362 aa  378  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.212458 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0981  recA protein  54.23 
 
 		 358 aa  377  1e-103  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2341  recA protein  54.28 
 
 		 350 aa  377  1e-103  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2193  recombinase A  54.46 
 
 		 347 aa  375  1e-103  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0979046 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0634  recombinase A  53.85 
 
 		 347 aa  376  1e-103  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.139362  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>