More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1918 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_1918  DNA repair and recombination protein RadA  100 
 
 		 324 aa  655    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0040  DNA repair and recombination protein RadA  76.4 
 
 		 327 aa  525  1e-148  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0637  DNA repair and recombination protein RadA  74.47 
 
 		 329 aa  510  1e-143  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2099  DNA repair and recombination protein RadA  73.52 
 
 		 325 aa  501  1e-141  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2940  DNA repair and recombination protein RadA  72.9 
 
 		 407 aa  492  9.999999999999999e-139  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00873973  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2338  DNA repair and recombination protein RadA  63.98 
 
 		 325 aa  417  9.999999999999999e-116  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.901889  normal  0.0155582 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2033  DNA repair and recombination protein RadA  60.87 
 
 		 325 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.507845  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0211  DNA repair and recombination protein RadA  57.31 
 
 		 343 aa  399  9.999999999999999e-111  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1831  DNA repair and recombination protein RadA  56.43 
 
 		 343 aa  399  9.999999999999999e-111  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0430  DNA repair and recombination protein RadA  61.2 
 
 		 324 aa  394  1e-108  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1273  DNA repair and recombination protein RadA  56.18 
 
 		 348 aa  387  1e-106  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0885  DNA repair and recombination protein RadA  62.58 
 
 		 322 aa  385  1e-106  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2624  DNA repair and recombination protein RadA  55.26 
 
 		 343 aa  382  1e-105  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.387482 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1185  DNA repair and recombination protein RadA  53.96 
 
 		 349 aa  381  1e-104  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2081  DNA repair and recombination protein RadA  49.38 
 
 		 332 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2310  DNA repair and recombination protein RadA  49.85 
 
 		 333 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.469487  hitchhiker  0.00856648 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0713  DNA repair and recombination protein RadA  48.76 
 
 		 330 aa  305  7e-82  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.33185 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1953  DNA repair and recombination protein RadA  49.07 
 
 		 330 aa  303  2.0000000000000002e-81  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1118  DNA repair and recombination protein RadA  47.81 
 
 		 358 aa  294  1e-78  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0009  DNA repair and recombination protein RadA  46.69 
 
 		 324 aa  288  1e-76  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.416037  normal  0.130845 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0982  DNA repair and recombination protein RadA  47.09 
 
 		 322 aa  287  2e-76  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1226  DNA repair and recombination protein RadA  44.79 
 
 		 324 aa  285  1.0000000000000001e-75  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1017  DNA repair and recombination protein RadA  46.39 
 
 		 358 aa  278  9e-74  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.103289  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0537  DNA repair and recombination protein RadA  48.01 
 
 		 322 aa  277  2e-73  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0368  DNA repair and recombination protein RadA  46.79 
 
 		 322 aa  271  1e-71  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1450  DNA repair and recombination protein RadA  46.63 
 
 		 322 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0942903  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0469  DNA repair and recombination protein RadA  46.63 
 
 		 322 aa  268  1e-70  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1386  DNA repair and recombination protein RadA  45.09 
 
 		 388 aa  267  2e-70  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01237  UvsC protein [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:P78579]  39.44 
 
 		 348 aa  226  3e-58  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.523208  normal  1 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_54533  Rad51 DNA recombination/repair protein  41.21 
 
 		 350 aa  226  3e-58  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.724719  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09092  meiotic recombination protein (Dmc1), putative (AFU_orthologue; AFUA_7G02200)  39.45 
 
 		 658 aa  226  4e-58  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.515485  normal  1 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_33041  predicted protein  39.94 
 
 		 343 aa  216  2.9999999999999998e-55  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0526282 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_17346  predicted protein  36.42 
 
 		 358 aa  209  7e-53  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.908819  normal  0.780808 
 
 
-
 
NC_006682  CNM01780  meiotic recombination-related protein, putative  36.91 
 
 		 323 aa  207  1e-52  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.51774  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA06990  recombinase, putative  38.99 
 
 		 365 aa  204  1e-51  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.108784  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1023  Rad51-like  38.99 
 
 		 315 aa  181  1e-44  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.973197  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1396  Fis family transcriptional regulator  30.96 
 
 		 312 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.358472  normal  0.485282 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0486  Rad51-like protein  30.65 
 
 		 311 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.100378  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2031  Rad51-like protein  31.09 
 
 		 314 aa  117  3e-25  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000000738645 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1633  Rad51 domain-containing protein  29.56 
 
 		 307 aa  116  3.9999999999999997e-25  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.11008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0762  Fis family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 312 aa  115  7.999999999999999e-25  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0530008 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0743  Rad51-like  35.8 
 
 		 250 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_17626  predicted protein  28.66 
 
 		 358 aa  107  3e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0870528  hitchhiker  0.00372316 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_54137  Rad51 DNA recombination/repair protein  29.06 
 
 		 363 aa  107  3e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0907  DNA repair and recombination protein RadB  31.2 
 
 		 227 aa  94.4  2e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0491  DNA repair and recombination protein RadB  30.2 
 
 		 227 aa  93.6  4e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_50387  predicted protein  27.84 
 
 		 351 aa  93.2  6e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.142215  normal  0.0213314 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1786  DNA repair and recombination protein RadB  32.93 
 
 		 235 aa  91.7  1e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.729381  normal  0.0464986 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0926  DNA repair and recombination protein RadB  31.85 
 
 		 221 aa  89.7  6e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2158  DNA repair and recombination protein RadB  29.91 
 
 		 235 aa  85.9  8e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1629  DNA repair and recombination protein RadB  29.49 
 
 		 235 aa  80.5  0.00000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.554742  normal  0.462396 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2159  DNA repair and recombination protein RadB  32.91 
 
 		 224 aa  79.7  0.00000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0077  DNA repair and recombination protein RadB  26.94 
 
 		 275 aa  79.7  0.00000000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.327122  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2123  DNA repair and recombination protein RadB  26.21 
 
 		 225 aa  77.4  0.0000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0260  DNA repair and recombination protein RadB  28.4 
 
 		 224 aa  75.5  0.000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.92433 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0087  RecA/RadA recombinase-like protein  28.09 
 
 		 217 aa  73.6  0.000000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.439691 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1039  DNA repair and recombination protein RadB  25.82 
 
 		 243 aa  70.1  0.00000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1272  hypothetical protein  27.35 
 
 		 224 aa  67  0.0000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.998309 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1640  DNA repair and recombination protein RadB  28.15 
 
 		 215 aa  65.5  0.000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.301627  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10145  DNA repair protein (Rad57), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G12520)  31 
 
 		 554 aa  63.9  0.000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.263483 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2429  DNA repair and recombination protein RadB  28.51 
 
 		 226 aa  63.9  0.000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2453  ATPase  27.48 
 
 		 234 aa  62.8  0.000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.695737 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0988  DNA repair and recombination protein RadB  28.15 
 
 		 216 aa  60.8  0.00000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0377224  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0274  DNA repair and recombination protein RadB  28.03 
 
 		 215 aa  59.3  0.00000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.944285  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26240  predicted protein  28.71 
 
 		 369 aa  58.5  0.0000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00269696 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0074  recA protein  26.83 
 
 		 344 aa  57.8  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0924  DNA recombination protein, RecA  26.37 
 
 		 342 aa  56.2  0.0000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1324  recombinase A  25.56 
 
 		 354 aa  55.8  0.0000009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.427425 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1567  recombinase A  26.41 
 
 		 363 aa  55.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000432957 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1522  recombinase A  27.67 
 
 		 361 aa  55.1  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_86836  predicted protein  28.77 
 
 		 307 aa  55.5  0.000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0929863 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2309  50S ribosomal protein L32e  56.67 
 
 		 335 aa  55.1  0.000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0455  recombinase A  26.09 
 
 		 352 aa  53.9  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0471  recombinase A  26.09 
 
 		 352 aa  53.9  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3956  recA protein  26.57 
 
 		 384 aa  53.5  0.000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.544899  normal  0.165355 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1280  recombinase A  26.84 
 
 		 362 aa  53.5  0.000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.118352  normal  0.176518 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1162  recA protein  25.12 
 
 		 356 aa  53.5  0.000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.501327  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1616  recombinase A  26.41 
 
 		 362 aa  53.5  0.000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1747  recombinase A  25.73 
 
 		 351 aa  53.5  0.000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000101073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_58642  predicted protein  29.32 
 
 		 541 aa  53.1  0.000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  hitchhiker  0.00988886  normal  0.20524 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0551  recombinase A  25.87 
 
 		 352 aa  53.1  0.000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2558  recombinase A  27.18 
 
 		 362 aa  53.1  0.000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.352201  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0452  recombinase A  23.76 
 
 		 357 aa  53.1  0.000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2169  recombinase A  28.02 
 
 		 364 aa  53.1  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.423968  normal  0.0596488 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0360  recA protein  24.04 
 
 		 339 aa  53.1  0.000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000245068  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2105  recombinase A  23.76 
 
 		 357 aa  53.1  0.000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.577481 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1958  recombinase A  28.02 
 
 		 362 aa  53.1  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.212458 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4685  recA protein  26.57 
 
 		 377 aa  52.8  0.000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  unclonable  0.0000000254393  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1730  recombinase A  25.56 
 
 		 363 aa  53.1  0.000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00591118  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4376  recombinase A  26.01 
 
 		 363 aa  52.8  0.000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2819  recombinase A  25.57 
 
 		 366 aa  52.8  0.000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.737949  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2373  recombinase A  24.27 
 
 		 357 aa  52.8  0.000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.263861  normal  0.548421 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3741  recombinase A  25.54 
 
 		 364 aa  52.4  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.709907 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0634  recombinase A  23.71 
 
 		 347 aa  52  0.00001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.139362  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2235  Ribosomal protein L32e  48.33 
 
 		 236 aa  52  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2578  recA protein  27.36 
 
 		 365 aa  51.2  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0869161  normal  0.0795722 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0872  recombinase A  24.88 
 
 		 414 aa  51.2  0.00002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.396783  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1765  recombinase A  23.18 
 
 		 348 aa  51.6  0.00002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2432  50S ribosomal protein L32e  46.77 
 
 		 236 aa  51.6  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_40092  Rad51 DNA recombination/repair protein  25 
 
 		 456 aa  51.6  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>