More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0360 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0360  recA protein  100 
 
 		 339 aa  671    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000245068  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1627  recombinase A  65.85 
 
 		 341 aa  441  1e-123  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00182901  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3106  recA protein  66.67 
 
 		 346 aa  435  1e-121  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000524014  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2439  recA protein  63.53 
 
 		 347 aa  432  1e-120  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000566681  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1473  RecA protein  64.24 
 
 		 364 aa  431  1e-120  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0213351  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1581  recA protein  61.04 
 
 		 383 aa  433  1e-120  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3103  recA protein  62.96 
 
 		 343 aa  428  1e-119  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000175278  normal  0.820651 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11890  recA protein  64.11 
 
 		 357 aa  431  1e-119  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000128048  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1473  recA protein  61.54 
 
 		 355 aa  429  1e-119  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.000000112388  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0513  recA protein  60.55 
 
 		 350 aa  424  1e-118  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.213728 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0676  recA protein  61.11 
 
 		 347 aa  426  1e-118  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00169949  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0666  recA protein  60.74 
 
 		 378 aa  424  1e-118  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.386455  normal  0.202905 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2819  recombinase A  61.14 
 
 		 366 aa  426  1e-118  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.737949  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0284  recombinase A  60.8 
 
 		 418 aa  427  1e-118  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0864352  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3994  recA protein  60.42 
 
 		 352 aa  426  1e-118  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0864938  normal  0.282621 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1118  recA protein  59.88 
 
 		 365 aa  426  1e-118  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.145639  normal  0.0819488 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1545  recA protein  60.42 
 
 		 346 aa  424  1e-118  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.259692  normal  0.07485 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1419  recA protein  59.82 
 
 		 347 aa  424  1e-117  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27820  protein RecA  61.04 
 
 		 345 aa  424  1e-117  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0461192 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4194  recombinase A  61.73 
 
 		 358 aa  424  1e-117  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23200  protein RecA  60.42 
 
 		 359 aa  424  1e-117  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.930258  normal  0.114189 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2179  recA protein  60.78 
 
 		 347 aa  422  1e-117  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.385059  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1275  recombinase A  61.16 
 
 		 356 aa  424  1e-117  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.138864  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1725  recombinase A  60.86 
 
 		 360 aa  424  1e-117  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.971685  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1747  recombinase A  62.12 
 
 		 351 aa  422  1e-117  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000101073  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1927  recombinase A  61.35 
 
 		 352 aa  423  1e-117  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1645  recombinase A  61.35 
 
 		 352 aa  424  1e-117  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1021  RecA protein  61.42 
 
 		 379 aa  424  1e-117  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1492  recA protein  61.35 
 
 		 345 aa  422  1e-117  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.211084  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0881  recombinase A  61.33 
 
 		 340 aa  419  1e-116  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1280  recombinase A  60.98 
 
 		 362 aa  418  1e-116  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.118352  normal  0.176518 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1986  recombinase A  60.62 
 
 		 357 aa  419  1e-116  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.285484  normal  0.795588 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0653  recA protein  57.8 
 
 		 346 aa  419  1e-116  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1242  recA protein  60.74 
 
 		 376 aa  420  1e-116  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1785  recA protein  60.73 
 
 		 350 aa  420  1e-116  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0512  recombinase A  61.73 
 
 		 357 aa  420  1e-116  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.759794  normal  0.922847 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1219  recombinase A  60.74 
 
 		 347 aa  418  1e-116  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0979767  normal  0.281308 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2448  recA protein  60.43 
 
 		 350 aa  415  9.999999999999999e-116  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.276179  normal  0.953449 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0074  recA protein  62.46 
 
 		 344 aa  417  9.999999999999999e-116  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4080  recombinase A  59.88 
 
 		 361 aa  417  9.999999999999999e-116  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4376  recombinase A  59.76 
 
 		 363 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1050  recA protein  65.54 
 
 		 349 aa  416  9.999999999999999e-116  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000195685  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2405  recombinase A  60.55 
 
 		 341 aa  417  9.999999999999999e-116  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1034  recombinase A  60 
 
 		 343 aa  416  9.999999999999999e-116  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0682579  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1079  recA protein  61.47 
 
 		 348 aa  416  9.999999999999999e-116  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3741  recombinase A  60.37 
 
 		 364 aa  415  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.709907 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3161  recombinase A  61.7 
 
 		 336 aa  414  9.999999999999999e-116  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2134  recombinase A  60.12 
 
 		 347 aa  415  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00345325 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1567  recombinase A  60.98 
 
 		 363 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000432957 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3735  recombinase A  62.62 
 
 		 338 aa  417  9.999999999999999e-116  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1730  recombinase A  60.98 
 
 		 363 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00591118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2147  recombinase A  60.12 
 
 		 347 aa  415  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1423  recA protein  60.12 
 
 		 344 aa  414  9.999999999999999e-116  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.716578  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5453  recombinase A  61.59 
 
 		 362 aa  416  9.999999999999999e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.658876  normal  0.17766 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2193  recombinase A  60.12 
 
 		 347 aa  415  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0979046 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2420  recombinase A  59.82 
 
 		 350 aa  417  9.999999999999999e-116  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.157742  normal  0.0782537 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3630  recombinase A  62.01 
 
 		 338 aa  417  9.999999999999999e-116  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1616  recA protein  60 
 
 		 348 aa  414  1e-114  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.445296  normal  0.968936 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1324  recombinase A  61.4 
 
 		 354 aa  413  1e-114  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.427425 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6708  recombinase A  59.82 
 
 		 345 aa  413  1e-114  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.141706  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07480  RecA protein  61.16 
 
 		 352 aa  413  1e-114  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0526583  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10530  protein RecA  59.15 
 
 		 368 aa  413  1e-114  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.419207  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1986  recombinase A  58.56 
 
 		 361 aa  412  1e-114  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1765  recombinase A  60.73 
 
 		 348 aa  412  1e-114  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1765  recombinase A  60.73 
 
 		 348 aa  412  1e-114  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2403  recA protein  60.37 
 
 		 343 aa  412  1e-114  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.104177  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1372  recombinase A  60.37 
 
 		 352 aa  414  1e-114  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17690  RecA protein  58.59 
 
 		 367 aa  413  1e-114  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.72475  normal  0.370795 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3525  recombinase A  60.12 
 
 		 345 aa  414  1e-114  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.551254  normal  0.0703421 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1288  recombinase A  60.18 
 
 		 348 aa  411  1e-114  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1616  recombinase A  60.67 
 
 		 362 aa  413  1e-114  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3975  recombinase A  59.52 
 
 		 350 aa  413  1e-114  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2216  RecA protein  59.2 
 
 		 366 aa  414  1e-114  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.139784 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2341  recA protein  59.2 
 
 		 350 aa  414  1e-114  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1619  recA protein  61.89 
 
 		 352 aa  413  1e-114  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000177143  hitchhiker  0.0000000069085 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0988  recA protein  60.43 
 
 		 335 aa  410  1e-113  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1202  recombinase A  58.26 
 
 		 361 aa  410  1e-113  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1165  recombinase A  58.26 
 
 		 424 aa  410  1e-113  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.165606  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5903  recA protein  60.42 
 
 		 379 aa  410  1e-113  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1592  recA protein  58.61 
 
 		 347 aa  409  1e-113  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1267  recA protein  61.23 
 
 		 358 aa  408  1e-113  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.165392  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3524  recA protein  59.51 
 
 		 355 aa  410  1e-113  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00288101 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1389  recombinase A  58.28 
 
 		 348 aa  410  1e-113  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.384565  normal  0.0556082 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0258  recA protein  59.02 
 
 		 361 aa  409  1e-113  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1230  recombinase A  59.69 
 
 		 357 aa  409  1e-113  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.460816  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0628  recA protein  60.12 
 
 		 346 aa  408  1e-113  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.067585  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2202  recA protein  57.7 
 
 		 347 aa  408  1e-113  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1425  recombinase A  58.28 
 
 		 348 aa  410  1e-113  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.976211  normal  0.0337506 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0986  recA protein  64.24 
 
 		 356 aa  409  1e-113  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000028976  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1462  recombinase A  59.51 
 
 		 352 aa  409  1e-113  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000631927 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1492  recA protein  61.95 
 
 		 348 aa  409  1e-113  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.148956 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1460  recombinase A  58.9 
 
 		 351 aa  409  1e-113  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00992179  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2094  recombinase A  60.48 
 
 		 365 aa  409  1e-113  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0597  recombinase A  59.08 
 
 		 356 aa  409  1e-113  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.408398  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0727  recombinase A  60.43 
 
 		 347 aa  410  1e-113  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.794192  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1958  recombinase A  58.86 
 
 		 362 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.212458 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0924  DNA recombination protein, RecA  59.16 
 
 		 342 aa  406  1.0000000000000001e-112  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2431  recombinase A  61.96 
 
 		 343 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.173685  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1371  recombinase A  59.82 
 
 		 347 aa  404  1.0000000000000001e-112  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.150356  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1523  recombinase A  57.88 
 
 		 346 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>