46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_2309 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013158  Huta_2309  50S ribosomal protein L32e  100 
 
 		 335 aa  645    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1845  Ribosomal protein L32e  70.54 
 
 		 240 aa  303  2.0000000000000002e-81  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2432  50S ribosomal protein L32e  68.38 
 
 		 236 aa  302  6.000000000000001e-81  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0227  Ribosomal protein L32e  65.55 
 
 		 240 aa  290  2e-77  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.209595  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2235  Ribosomal protein L32e  65.84 
 
 		 236 aa  285  8e-76  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0018  50S ribosomal protein L32e  47.1 
 
 		 148 aa  136  4e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000000000144632  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1504  Ribosomal protein L32e  48.44 
 
 		 137 aa  124  3e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000000000000813977  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2236  50S ribosomal protein L32e  48.74 
 
 		 149 aa  113  5e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000681185  normal  0.587371 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0581  50S ribosomal protein L32e  48.33 
 
 		 144 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0869407  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1711  ribosomal protein L32e  50.42 
 
 		 128 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.00675824  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0093  50S ribosomal protein L32e  43.75 
 
 		 145 aa  108  1e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000000176335  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0459  50S ribosomal protein L32e  46.22 
 
 		 139 aa  107  2e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.025881  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0549  ribosomal protein L32e  45.76 
 
 		 246 aa  107  3e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0692327  normal  0.362296 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1401  50S ribosomal protein L32e  40.16 
 
 		 155 aa  104  2e-21  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.763324  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0098  50S ribosomal protein L32e  41.67 
 
 		 144 aa  103  3e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.965997 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0727  50S ribosomal protein L32e  44.95 
 
 		 135 aa  102  1e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.743255  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1257  50S ribosomal protein L32e  42.2 
 
 		 135 aa  98.6  1e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0436378  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0661  50S ribosomal protein L32e  42.2 
 
 		 135 aa  98.6  1e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.897537  hitchhiker  0.000933847 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0162  50S ribosomal protein L32e  42.2 
 
 		 135 aa  97.8  3e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.0000825784  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0175  50S ribosomal protein L32e  50 
 
 		 153 aa  96.7  5e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0239  ribosomal protein L32e  46.73 
 
 		 159 aa  95.9  9e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1256  50S ribosomal protein L32e  49.53 
 
 		 153 aa  95.1  2e-18  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2008  50S ribosomal protein L32e  48.6 
 
 		 157 aa  92.8  8e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0012  ribosomal protein L32e  40.46 
 
 		 197 aa  92.4  1e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.118837  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1866  50S ribosomal protein L32e  45.79 
 
 		 153 aa  85.9  9e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0391  50S ribosomal protein L32e  38.18 
 
 		 134 aa  78.6  0.0000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.181601 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1761  Ribosomal protein L32e  38.79 
 
 		 138 aa  78.2  0.0000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.179144  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0108  50S ribosomal protein L32e  42.2 
 
 		 134 aa  74.3  0.000000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  unclonable  0.00000000000970998  unclonable  0.000000353529 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2940  DNA repair and recombination protein RadA  29.27 
 
 		 407 aa  62  0.00000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00873973  normal  1 
 
 
-
 
NC_006682  CNM02240  conserved hypothetical protein  36.45 
 
 		 129 aa  60.5  0.00000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0914948  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_21659  predicted protein  35.48 
 
 		 136 aa  57.8  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07354  60S ribosomal protein L32 (AFU_orthologue; AFUA_2G16370)  32.71 
 
 		 131 aa  55.8  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.399241 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_86947  predicted protein  36.17 
 
 		 111 aa  55.1  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0883388  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1918  DNA repair and recombination protein RadA  56.67 
 
 		 324 aa  54.3  0.000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0040  DNA repair and recombination protein RadA  48.15 
 
 		 327 aa  45.4  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_83982  predicted protein  30.19 
 
 		 131 aa  45.8  0.001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.958141  normal  0.216433 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0498  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  45 
 
 		 739 aa  45.4  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3233  helix-hairpin-helix motif protein  48.98 
 
 		 485 aa  44.3  0.003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2338  DNA repair and recombination protein RadA  50 
 
 		 325 aa  43.9  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.901889  normal  0.0155582 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0994  helix-hairpin-helix DNA-binding, class 1  48.78 
 
 		 106 aa  43.9  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0755916  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0318  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  41.67 
 
 		 756 aa  43.5  0.005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0430  DNA repair and recombination protein RadA  43.55 
 
 		 324 aa  43.1  0.006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0666  NusA antitermination factor  45.83 
 
 		 463 aa  43.1  0.007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0123778 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4922  DNA-directed DNA polymerase  40.3 
 
 		 410 aa  43.1  0.007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0212665 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2099  DNA repair and recombination protein RadA  38.98 
 
 		 325 aa  42.7  0.008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0991  poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase, class III, PhaC subunit  37.18 
 
 		 464 aa  42.7  0.01  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>