33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_1504 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013926  Aboo_1504  Ribosomal protein L32e  100 
 
 
137 aa  273  8e-73  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000000000000813977  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0661  50S ribosomal protein L32e  56.56 
 
 
135 aa  140  5e-33  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.897537  hitchhiker  0.000933847 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1257  50S ribosomal protein L32e  56.56 
 
 
135 aa  140  7e-33  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0436378  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0162  50S ribosomal protein L32e  55.74 
 
 
135 aa  139  9.999999999999999e-33  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.0000825784  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1401  50S ribosomal protein L32e  51.26 
 
 
155 aa  136  1e-31  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.763324  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0727  50S ribosomal protein L32e  52.46 
 
 
135 aa  130  9e-30  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.743255  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2235  Ribosomal protein L32e  47.37 
 
 
236 aa  125  3e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0227  Ribosomal protein L32e  47.37 
 
 
240 aa  122  1e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.209595  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2309  50S ribosomal protein L32e  48.44 
 
 
335 aa  123  1e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1845  Ribosomal protein L32e  50 
 
 
240 aa  122  2e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0018  50S ribosomal protein L32e  46.03 
 
 
148 aa  119  9.999999999999999e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000000000144632  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2432  50S ribosomal protein L32e  47.66 
 
 
236 aa  119  1.9999999999999998e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0239  ribosomal protein L32e  54.96 
 
 
159 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0012  ribosomal protein L32e  53.85 
 
 
197 aa  112  1.0000000000000001e-24  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.118837  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1711  ribosomal protein L32e  49.58 
 
 
128 aa  110  7.000000000000001e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.00675824  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2236  50S ribosomal protein L32e  47.58 
 
 
149 aa  110  7.000000000000001e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000681185  normal  0.587371 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0093  50S ribosomal protein L32e  41.6 
 
 
145 aa  106  1e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000000176335  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0581  50S ribosomal protein L32e  43.44 
 
 
144 aa  100  6e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0869407  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0098  50S ribosomal protein L32e  42.19 
 
 
144 aa  100  6e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.965997 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0549  ribosomal protein L32e  41.94 
 
 
246 aa  100  8e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0692327  normal  0.362296 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0459  50S ribosomal protein L32e  40.98 
 
 
139 aa  95.5  2e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.025881  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2008  50S ribosomal protein L32e  50 
 
 
157 aa  95.1  2e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0175  50S ribosomal protein L32e  50 
 
 
153 aa  93.6  7e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1761  Ribosomal protein L32e  39.53 
 
 
138 aa  92.8  1e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.179144  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1256  50S ribosomal protein L32e  49.11 
 
 
153 aa  92.8  1e-18  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0391  50S ribosomal protein L32e  41.23 
 
 
134 aa  90.9  5e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.181601 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1866  50S ribosomal protein L32e  47.32 
 
 
153 aa  88.6  3e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0108  50S ribosomal protein L32e  40 
 
 
134 aa  82  0.000000000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  unclonable  0.00000000000970998  unclonable  0.000000353529 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07354  60S ribosomal protein L32 (AFU_orthologue; AFUA_2G16370)  38.68 
 
 
131 aa  70.1  0.00000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.399241 
 
 
-
 
NC_006682  CNM02240  conserved hypothetical protein  39.62 
 
 
129 aa  67.8  0.00000000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0914948  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_86947  predicted protein  38.3 
 
 
111 aa  64.3  0.0000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0883388  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_83982  predicted protein  36.79 
 
 
131 aa  63.5  0.0000000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.958141  normal  0.216433 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_21659  predicted protein  31.82 
 
 
136 aa  57.4  0.00000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>