49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_0227 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013922  Nmag_0227  Ribosomal protein L32e  100 
 
 		 240 aa  468  1.0000000000000001e-131  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.209595  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2235  Ribosomal protein L32e  87.08 
 
 		 236 aa  366  1e-100  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1845  Ribosomal protein L32e  71.24 
 
 		 240 aa  298  3e-80  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2309  50S ribosomal protein L32e  66.96 
 
 		 335 aa  290  1e-77  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2432  50S ribosomal protein L32e  66.67 
 
 		 236 aa  276  3e-73  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0018  50S ribosomal protein L32e  52.71 
 
 		 148 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000000000144632  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1504  Ribosomal protein L32e  47.37 
 
 		 137 aa  123  3e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000000000000813977  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2236  50S ribosomal protein L32e  49.18 
 
 		 149 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000681185  normal  0.587371 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1711  ribosomal protein L32e  49.57 
 
 		 128 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.00675824  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0093  50S ribosomal protein L32e  43.75 
 
 		 145 aa  107  1e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000000176335  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0459  50S ribosomal protein L32e  44.54 
 
 		 139 aa  105  4e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.025881  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0098  50S ribosomal protein L32e  41.54 
 
 		 144 aa  102  4e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.965997 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1401  50S ribosomal protein L32e  38.52 
 
 		 155 aa  100  1e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.763324  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0549  ribosomal protein L32e  44.26 
 
 		 246 aa  100  1e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0692327  normal  0.362296 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0581  50S ribosomal protein L32e  44.17 
 
 		 144 aa  100  2e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0869407  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0661  50S ribosomal protein L32e  40.35 
 
 		 135 aa  99.4  4e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.897537  hitchhiker  0.000933847 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1257  50S ribosomal protein L32e  40.35 
 
 		 135 aa  99.8  4e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0436378  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0727  50S ribosomal protein L32e  42.98 
 
 		 135 aa  99.4  5e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.743255  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0162  50S ribosomal protein L32e  40.35 
 
 		 135 aa  99  6e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.0000825784  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0239  ribosomal protein L32e  48.18 
 
 		 159 aa  95.9  4e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0012  ribosomal protein L32e  39.55 
 
 		 197 aa  87.8  1e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.118837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0175  50S ribosomal protein L32e  46.09 
 
 		 153 aa  85.9  5e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1256  50S ribosomal protein L32e  46.73 
 
 		 153 aa  83.2  0.000000000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2008  50S ribosomal protein L32e  45.79 
 
 		 157 aa  82  0.000000000000009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1761  Ribosomal protein L32e  38.35 
 
 		 138 aa  79  0.00000000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.179144  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0108  50S ribosomal protein L32e  41.28 
 
 		 134 aa  73.6  0.000000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  unclonable  0.00000000000970998  unclonable  0.000000353529 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1866  50S ribosomal protein L32e  42.06 
 
 		 153 aa  73.6  0.000000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0391  50S ribosomal protein L32e  36.7 
 
 		 134 aa  69.3  0.00000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.181601 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07354  60S ribosomal protein L32 (AFU_orthologue; AFUA_2G16370)  32.8 
 
 		 131 aa  63.5  0.000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.399241 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_21659  predicted protein  38.46 
 
 		 136 aa  63.2  0.000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM02240  conserved hypothetical protein  35.45 
 
 		 129 aa  57.4  0.0000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0914948  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_86947  predicted protein  36.26 
 
 		 111 aa  56.6  0.0000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0883388  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1918  DNA repair and recombination protein RadA  34.45 
 
 		 324 aa  52  0.000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_83982  predicted protein  32.08 
 
 		 131 aa  52  0.000009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.958141  normal  0.216433 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0040  DNA repair and recombination protein RadA  38.57 
 
 		 327 aa  49.3  0.00005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0994  helix-hairpin-helix DNA-binding, class 1  51.16 
 
 		 106 aa  46.6  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0755916  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2099  DNA repair and recombination protein RadA  40.32 
 
 		 325 aa  45.1  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2338  DNA repair and recombination protein RadA  41.94 
 
 		 325 aa  43.9  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.901889  normal  0.0155582 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2940  DNA repair and recombination protein RadA  44.9 
 
 		 407 aa  44.3  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00873973  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1823  excinuclease ABC subunit C  52.08 
 
 		 674 aa  43.5  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000135046 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12171  hypothetical protein  42 
 
 		 248 aa  43.5  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.758213  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1804  excinuclease ABC subunit C  45.83 
 
 		 599 aa  42.7  0.005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.919457  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2975  excinuclease ABC, C subunit  36.9 
 
 		 708 aa  42.7  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.720202  normal  0.0556657 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1831  DNA repair and recombination protein RadA  34.29 
 
 		 343 aa  42.4  0.006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0430  DNA repair and recombination protein RadA  40.32 
 
 		 324 aa  42.4  0.007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1467  excinuclease ABC subunit C  40.35 
 
 		 604 aa  42  0.008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1458  DNA topoisomerase I  50 
 
 		 827 aa  42  0.009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10691  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  41.18 
 
 		 105 aa  42  0.009  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.240216  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1011  excinuclease ABC, C subunit  50 
 
 		 479 aa  42  0.01  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>