44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_1845 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013202  Hmuk_1845  Ribosomal protein L32e  100 
 
 		 240 aa  470  1e-132  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2309  50S ribosomal protein L32e  72.77 
 
 		 335 aa  300  1e-80  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0227  Ribosomal protein L32e  71.24 
 
 		 240 aa  294  9e-79  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.209595  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2235  Ribosomal protein L32e  68.83 
 
 		 236 aa  290  1e-77  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2432  50S ribosomal protein L32e  69.57 
 
 		 236 aa  288  6e-77  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0018  50S ribosomal protein L32e  47.62 
 
 		 148 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000000000144632  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1504  Ribosomal protein L32e  50 
 
 		 137 aa  122  5e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000000000000813977  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0093  50S ribosomal protein L32e  45.6 
 
 		 145 aa  108  7.000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000000176335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1711  ribosomal protein L32e  50 
 
 		 128 aa  108  1e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.00675824  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0581  50S ribosomal protein L32e  46.67 
 
 		 144 aa  102  6e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0869407  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2236  50S ribosomal protein L32e  48.36 
 
 		 149 aa  101  1e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000681185  normal  0.587371 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0549  ribosomal protein L32e  44.26 
 
 		 246 aa  96.3  4e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0692327  normal  0.362296 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0459  50S ribosomal protein L32e  43.81 
 
 		 139 aa  95.5  6e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.025881  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0098  50S ribosomal protein L32e  41.54 
 
 		 144 aa  94.4  1e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.965997 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0727  50S ribosomal protein L32e  45.28 
 
 		 135 aa  93.6  3e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.743255  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1401  50S ribosomal protein L32e  43.4 
 
 		 155 aa  92.8  4e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.763324  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1257  50S ribosomal protein L32e  40.16 
 
 		 135 aa  92  8e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0436378  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0661  50S ribosomal protein L32e  40.16 
 
 		 135 aa  91.7  1e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.897537  hitchhiker  0.000933847 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0175  50S ribosomal protein L32e  48.7 
 
 		 153 aa  90.5  2e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0239  ribosomal protein L32e  46.73 
 
 		 159 aa  90.5  2e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0162  50S ribosomal protein L32e  40.16 
 
 		 135 aa  90.9  2e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.0000825784  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1256  50S ribosomal protein L32e  49.53 
 
 		 153 aa  87.8  2e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0012  ribosomal protein L32e  39.87 
 
 		 197 aa  86.7  3e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.118837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2008  50S ribosomal protein L32e  47.66 
 
 		 157 aa  84.7  0.000000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1866  50S ribosomal protein L32e  45.79 
 
 		 153 aa  79  0.00000000000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1761  Ribosomal protein L32e  37.82 
 
 		 138 aa  71.2  0.00000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.179144  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0391  50S ribosomal protein L32e  35.85 
 
 		 134 aa  69.7  0.00000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.181601 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0108  50S ribosomal protein L32e  41.28 
 
 		 134 aa  69.3  0.00000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  unclonable  0.00000000000970998  unclonable  0.000000353529 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_86947  predicted protein  35.87 
 
 		 111 aa  53.5  0.000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0883388  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_21659  predicted protein  36.96 
 
 		 136 aa  53.1  0.000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07354  60S ribosomal protein L32 (AFU_orthologue; AFUA_2G16370)  36.08 
 
 		 131 aa  52  0.000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.399241 
 
 
-
 
NC_006682  CNM02240  conserved hypothetical protein  35.87 
 
 		 129 aa  51.6  0.00001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0914948  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1918  DNA repair and recombination protein RadA  43.28 
 
 		 324 aa  46.2  0.0004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10691  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  48.98 
 
 		 105 aa  45.8  0.0006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.240216  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2338  DNA repair and recombination protein RadA  40 
 
 		 325 aa  45.8  0.0006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.901889  normal  0.0155582 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0040  DNA repair and recombination protein RadA  36.76 
 
 		 327 aa  44.3  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0994  helix-hairpin-helix DNA-binding, class 1  53.66 
 
 		 106 aa  43.9  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0755916  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0430  DNA repair and recombination protein RadA  37.65 
 
 		 324 aa  43.5  0.003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10691  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  53.66 
 
 		 109 aa  43.1  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0116459  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12171  hypothetical protein  34.38 
 
 		 248 aa  42.4  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.758213  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0498  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35 
 
 		 739 aa  42.4  0.007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2033  DNA repair and recombination protein RadA  35.38 
 
 		 325 aa  42  0.009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.507845  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0318  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.18 
 
 		 756 aa  41.6  0.01  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1538  DNA ligase, NAD-dependent  33.87 
 
 		 645 aa  42  0.01  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>