33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_1866 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008701  Pisl_1866  50S ribosomal protein L32e  100 
 
 
153 aa  300  4.0000000000000003e-81  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1256  50S ribosomal protein L32e  88.24 
 
 
153 aa  250  4.0000000000000004e-66  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0175  50S ribosomal protein L32e  85.62 
 
 
153 aa  242  9.999999999999999e-64  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2008  50S ribosomal protein L32e  84.77 
 
 
157 aa  235  2e-61  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0012  ribosomal protein L32e  47.45 
 
 
197 aa  131  3e-30  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.118837  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0239  ribosomal protein L32e  57.02 
 
 
159 aa  120  5e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1401  50S ribosomal protein L32e  41.86 
 
 
155 aa  108  3e-23  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.763324  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0093  50S ribosomal protein L32e  43.41 
 
 
145 aa  107  5e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000000176335  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0018  50S ribosomal protein L32e  45.24 
 
 
148 aa  107  7.000000000000001e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000000000144632  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0727  50S ribosomal protein L32e  44 
 
 
135 aa  102  3e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.743255  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0391  50S ribosomal protein L32e  45.22 
 
 
134 aa  101  4e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.181601 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1504  Ribosomal protein L32e  48.82 
 
 
137 aa  99.8  1e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000000000000813977  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0661  50S ribosomal protein L32e  43.75 
 
 
135 aa  98.6  3e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.897537  hitchhiker  0.000933847 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1257  50S ribosomal protein L32e  43.75 
 
 
135 aa  98.2  4e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0436378  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0162  50S ribosomal protein L32e  43.75 
 
 
135 aa  97.8  4e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.0000825784  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1761  Ribosomal protein L32e  45.6 
 
 
138 aa  94.7  4e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.179144  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0108  50S ribosomal protein L32e  45.53 
 
 
134 aa  92.4  2e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  unclonable  0.00000000000970998  unclonable  0.000000353529 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1711  ribosomal protein L32e  44.17 
 
 
128 aa  90.1  1e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.00675824  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2309  50S ribosomal protein L32e  45.76 
 
 
335 aa  89.7  1e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0459  50S ribosomal protein L32e  43.8 
 
 
139 aa  88.6  3e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.025881  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0581  50S ribosomal protein L32e  44.72 
 
 
144 aa  87  7e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0869407  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0098  50S ribosomal protein L32e  40.48 
 
 
144 aa  85.9  2e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.965997 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2235  Ribosomal protein L32e  45.76 
 
 
236 aa  85.9  2e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1845  Ribosomal protein L32e  45.76 
 
 
240 aa  82.4  0.000000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2432  50S ribosomal protein L32e  46.3 
 
 
236 aa  79.7  0.00000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0227  Ribosomal protein L32e  43.22 
 
 
240 aa  78.6  0.00000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.209595  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2236  50S ribosomal protein L32e  45.53 
 
 
149 aa  75.1  0.0000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000681185  normal  0.587371 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0549  ribosomal protein L32e  40.32 
 
 
246 aa  71.2  0.000000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0692327  normal  0.362296 
 
 
-
 
NC_006682  CNM02240  conserved hypothetical protein  35.77 
 
 
129 aa  65.9  0.0000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0914948  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_21659  predicted protein  28.79 
 
 
136 aa  64.7  0.0000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_83982  predicted protein  33.33 
 
 
131 aa  62.4  0.000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.958141  normal  0.216433 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07354  60S ribosomal protein L32 (AFU_orthologue; AFUA_2G16370)  31.97 
 
 
131 aa  60.8  0.000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.399241 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_86947  predicted protein  31.96 
 
 
111 aa  57.8  0.00000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0883388  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>