51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_2432 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_2432  50S ribosomal protein L32e  100 
 
 		 236 aa  468  1.0000000000000001e-131  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2309  50S ribosomal protein L32e  67.95 
 
 		 335 aa  297  8e-80  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1845  Ribosomal protein L32e  70 
 
 		 240 aa  282  3.0000000000000004e-75  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2235  Ribosomal protein L32e  65.96 
 
 		 236 aa  268  5e-71  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0227  Ribosomal protein L32e  66.23 
 
 		 240 aa  266  2.9999999999999995e-70  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.209595  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0018  50S ribosomal protein L32e  47.4 
 
 		 148 aa  134  9.999999999999999e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000000000144632  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1504  Ribosomal protein L32e  47.66 
 
 		 137 aa  119  3e-26  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000000000000813977  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2236  50S ribosomal protein L32e  52.03 
 
 		 149 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000681185  normal  0.587371 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0581  50S ribosomal protein L32e  47.5 
 
 		 144 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0869407  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0093  50S ribosomal protein L32e  44.53 
 
 		 145 aa  109  3e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000000176335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0098  50S ribosomal protein L32e  48.67 
 
 		 144 aa  107  1e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.965997 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0459  50S ribosomal protein L32e  46.34 
 
 		 139 aa  107  2e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.025881  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1711  ribosomal protein L32e  52.34 
 
 		 128 aa  106  3e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.00675824  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1401  50S ribosomal protein L32e  42.11 
 
 		 155 aa  102  7e-21  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.763324  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0549  ribosomal protein L32e  48.54 
 
 		 246 aa  101  8e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0692327  normal  0.362296 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0727  50S ribosomal protein L32e  44.74 
 
 		 135 aa  96.7  3e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.743255  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1257  50S ribosomal protein L32e  42.11 
 
 		 135 aa  95.9  4e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0436378  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0661  50S ribosomal protein L32e  42.11 
 
 		 135 aa  95.9  5e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.897537  hitchhiker  0.000933847 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0162  50S ribosomal protein L32e  42.11 
 
 		 135 aa  95.1  8e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.0000825784  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0239  ribosomal protein L32e  45.79 
 
 		 159 aa  92.8  4e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0012  ribosomal protein L32e  51.11 
 
 		 197 aa  92  7e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.118837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0175  50S ribosomal protein L32e  50 
 
 		 153 aa  89  6e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1256  50S ribosomal protein L32e  50.47 
 
 		 153 aa  88.6  7e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2008  50S ribosomal protein L32e  48.6 
 
 		 157 aa  84.3  0.000000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1866  50S ribosomal protein L32e  45.79 
 
 		 153 aa  78.6  0.00000000000008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0108  50S ribosomal protein L32e  38.89 
 
 		 134 aa  76.3  0.0000000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  unclonable  0.00000000000970998  unclonable  0.000000353529 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0391  50S ribosomal protein L32e  38.94 
 
 		 134 aa  76.3  0.0000000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.181601 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1761  Ribosomal protein L32e  37.82 
 
 		 138 aa  74.7  0.000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.179144  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07354  60S ribosomal protein L32 (AFU_orthologue; AFUA_2G16370)  37.7 
 
 		 131 aa  73.9  0.000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.399241 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_21659  predicted protein  40.22 
 
 		 136 aa  67.4  0.0000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM02240  conserved hypothetical protein  36.45 
 
 		 129 aa  63.2  0.000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0914948  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_86947  predicted protein  35.11 
 
 		 111 aa  61.2  0.00000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0883388  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_83982  predicted protein  33.02 
 
 		 131 aa  53.1  0.000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.958141  normal  0.216433 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2099  DNA repair and recombination protein RadA  43.75 
 
 		 325 aa  52.4  0.000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2338  DNA repair and recombination protein RadA  43.55 
 
 		 325 aa  50.4  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.901889  normal  0.0155582 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0040  DNA repair and recombination protein RadA  39.71 
 
 		 327 aa  50.4  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1918  DNA repair and recombination protein RadA  46.03 
 
 		 324 aa  50.8  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1316  excinuclease ABC subunit C  42.65 
 
 		 627 aa  50.4  0.00002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.235211  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1410  excinuclease ABC subunit C  40.58 
 
 		 621 aa  48.9  0.00006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1831  DNA repair and recombination protein RadA  44.44 
 
 		 343 aa  48.1  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1403  excinuclease ABC subunit C  40.3 
 
 		 614 aa  47.4  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.252536  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00582  excinuclease ABC subunit C  42.42 
 
 		 618 aa  47.4  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2624  DNA repair and recombination protein RadA  42.19 
 
 		 343 aa  46.6  0.0003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.387482 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0211  DNA repair and recombination protein RadA  42.86 
 
 		 343 aa  46.6  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2940  DNA repair and recombination protein RadA  46.94 
 
 		 407 aa  46.6  0.0004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00873973  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2033  DNA repair and recombination protein RadA  40.32 
 
 		 325 aa  46.2  0.0005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.507845  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1273  DNA repair and recombination protein RadA  42.19 
 
 		 348 aa  45.8  0.0006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0637  DNA repair and recombination protein RadA  35.23 
 
 		 329 aa  45.4  0.0007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0430  DNA repair and recombination protein RadA  41.94 
 
 		 324 aa  44.3  0.001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1185  DNA repair and recombination protein RadA  36.92 
 
 		 349 aa  42.4  0.007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0318  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.54 
 
 		 756 aa  42.4  0.007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>