32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_83982 on replicon NC_009045
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009045  PICST_83982  predicted protein  100 
 
 
131 aa  268  2e-71  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.958141  normal  0.216433 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07354  60S ribosomal protein L32 (AFU_orthologue; AFUA_2G16370)  62.6 
 
 
131 aa  172  9.999999999999999e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.399241 
 
 
-
 
NC_006682  CNM02240  conserved hypothetical protein  60 
 
 
129 aa  160  4.0000000000000004e-39  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0914948  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_21659  predicted protein  46.62 
 
 
136 aa  130  6e-30  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_86947  predicted protein  55.56 
 
 
111 aa  121  3e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0883388  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1504  Ribosomal protein L32e  36.79 
 
 
137 aa  63.5  0.0000000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000000000000813977  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2008  50S ribosomal protein L32e  36.61 
 
 
157 aa  63.5  0.0000000009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0093  50S ribosomal protein L32e  30.43 
 
 
145 aa  63.2  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000000176335  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1711  ribosomal protein L32e  33.94 
 
 
128 aa  63.2  0.000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.00675824  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0108  50S ribosomal protein L32e  33.33 
 
 
134 aa  62.8  0.000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  unclonable  0.00000000000970998  unclonable  0.000000353529 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0391  50S ribosomal protein L32e  35.4 
 
 
134 aa  62.4  0.000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.181601 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0018  50S ribosomal protein L32e  32.17 
 
 
148 aa  62.4  0.000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000000000144632  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1256  50S ribosomal protein L32e  36.61 
 
 
153 aa  60.8  0.000000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1866  50S ribosomal protein L32e  34.82 
 
 
153 aa  60.8  0.000000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0727  50S ribosomal protein L32e  33.93 
 
 
135 aa  60.5  0.000000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.743255  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0175  50S ribosomal protein L32e  35.19 
 
 
153 aa  60.1  0.000000009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0098  50S ribosomal protein L32e  30.36 
 
 
144 aa  58.9  0.00000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.965997 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1401  50S ribosomal protein L32e  27.68 
 
 
155 aa  58.9  0.00000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.763324  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1761  Ribosomal protein L32e  31.78 
 
 
138 aa  57.8  0.00000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.179144  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0581  50S ribosomal protein L32e  32.73 
 
 
144 aa  57.4  0.00000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0869407  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0012  ribosomal protein L32e  33.33 
 
 
197 aa  56.2  0.0000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.118837  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0239  ribosomal protein L32e  29.31 
 
 
159 aa  55.1  0.0000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2235  Ribosomal protein L32e  32.08 
 
 
236 aa  55.1  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0162  50S ribosomal protein L32e  31.25 
 
 
135 aa  54.7  0.0000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.0000825784  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2236  50S ribosomal protein L32e  29.82 
 
 
149 aa  54.7  0.0000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000681185  normal  0.587371 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2432  50S ribosomal protein L32e  33.02 
 
 
236 aa  53.9  0.0000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0661  50S ribosomal protein L32e  30.36 
 
 
135 aa  53.1  0.000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.897537  hitchhiker  0.000933847 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1257  50S ribosomal protein L32e  30.36 
 
 
135 aa  53.5  0.000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0436378  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0549  ribosomal protein L32e  33.64 
 
 
246 aa  52.8  0.000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0692327  normal  0.362296 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0227  Ribosomal protein L32e  32.08 
 
 
240 aa  52.8  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.209595  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0459  50S ribosomal protein L32e  31.78 
 
 
139 aa  49.3  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.025881  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2309  50S ribosomal protein L32e  30.19 
 
 
335 aa  47  0.00009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>