47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_2235 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013743  Htur_2235  Ribosomal protein L32e  100 
 
 		 236 aa  464  9.999999999999999e-131  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0227  Ribosomal protein L32e  86.25 
 
 		 240 aa  373  1e-102  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.209595  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1845  Ribosomal protein L32e  69.4 
 
 		 240 aa  300  1e-80  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2309  50S ribosomal protein L32e  69 
 
 		 335 aa  290  1e-77  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2432  50S ribosomal protein L32e  67.66 
 
 		 236 aa  282  3.0000000000000004e-75  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0018  50S ribosomal protein L32e  50.66 
 
 		 148 aa  143  2e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000000000144632  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1504  Ribosomal protein L32e  47.37 
 
 		 137 aa  125  5e-28  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000000000000813977  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0093  50S ribosomal protein L32e  46.09 
 
 		 145 aa  118  7e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000000176335  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2236  50S ribosomal protein L32e  49.18 
 
 		 149 aa  115  6.9999999999999995e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000681185  normal  0.587371 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1711  ribosomal protein L32e  48.7 
 
 		 128 aa  111  9e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.00675824  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0098  50S ribosomal protein L32e  43.08 
 
 		 144 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.965997 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0581  50S ribosomal protein L32e  46.67 
 
 		 144 aa  108  8.000000000000001e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0869407  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0459  50S ribosomal protein L32e  45.53 
 
 		 139 aa  107  1e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.025881  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0549  ribosomal protein L32e  44.26 
 
 		 246 aa  105  6e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0692327  normal  0.362296 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0239  ribosomal protein L32e  41.83 
 
 		 159 aa  101  1e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1257  50S ribosomal protein L32e  39.67 
 
 		 135 aa  99.4  5e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0436378  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0661  50S ribosomal protein L32e  39.67 
 
 		 135 aa  99  5e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.897537  hitchhiker  0.000933847 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1401  50S ribosomal protein L32e  36.89 
 
 		 155 aa  98.6  8e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.763324  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0162  50S ribosomal protein L32e  39.34 
 
 		 135 aa  98.2  9e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.0000825784  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0727  50S ribosomal protein L32e  41.23 
 
 		 135 aa  97.8  1e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.743255  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0175  50S ribosomal protein L32e  48.7 
 
 		 153 aa  94  2e-18  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0012  ribosomal protein L32e  39.55 
 
 		 197 aa  92.8  4e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.118837  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1256  50S ribosomal protein L32e  49.53 
 
 		 153 aa  90.9  1e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2008  50S ribosomal protein L32e  47.66 
 
 		 157 aa  88.2  1e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1761  Ribosomal protein L32e  45.45 
 
 		 138 aa  82.8  0.000000000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.179144  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1866  50S ribosomal protein L32e  44.86 
 
 		 153 aa  81.6  0.00000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0108  50S ribosomal protein L32e  43.12 
 
 		 134 aa  78.6  0.00000000000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  unclonable  0.00000000000970998  unclonable  0.000000353529 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0391  50S ribosomal protein L32e  38.53 
 
 		 134 aa  73.9  0.000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.181601 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07354  60S ribosomal protein L32 (AFU_orthologue; AFUA_2G16370)  36.45 
 
 		 131 aa  65.9  0.0000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.399241 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_21659  predicted protein  38.04 
 
 		 136 aa  65.1  0.0000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_86947  predicted protein  35.48 
 
 		 111 aa  58.9  0.00000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0883388  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM02240  conserved hypothetical protein  35.45 
 
 		 129 aa  57.8  0.0000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0914948  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_83982  predicted protein  32.08 
 
 		 131 aa  54.7  0.000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.958141  normal  0.216433 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1918  DNA repair and recombination protein RadA  46.03 
 
 		 324 aa  52  0.000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0040  DNA repair and recombination protein RadA  44.62 
 
 		 327 aa  50.8  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0994  helix-hairpin-helix DNA-binding, class 1  46.51 
 
 		 106 aa  45.4  0.0007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0755916  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0637  DNA repair and recombination protein RadA  39.19 
 
 		 329 aa  44.7  0.001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12171  hypothetical protein  42 
 
 		 248 aa  44.7  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.758213  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2099  DNA repair and recombination protein RadA  39.39 
 
 		 325 aa  43.9  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2940  DNA repair and recombination protein RadA  39.68 
 
 		 407 aa  43.9  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00873973  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0430  DNA repair and recombination protein RadA  41.94 
 
 		 324 aa  43.9  0.002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0318  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40.74 
 
 		 756 aa  43.5  0.003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1823  excinuclease ABC subunit C  50 
 
 		 674 aa  42.7  0.005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000135046 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1467  excinuclease ABC subunit C  47.06 
 
 		 604 aa  42.7  0.005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2033  DNA repair and recombination protein RadA  41.94 
 
 		 325 aa  42.4  0.006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.507845  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2975  excinuclease ABC, C subunit  37.21 
 
 		 708 aa  42.4  0.007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.720202  normal  0.0556657 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0009  DNA repair and recombination protein RadA  35.71 
 
 		 324 aa  42  0.008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.416037  normal  0.130845 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>