115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_2624 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_2624  DNA repair and recombination protein RadA  100 
 
 		 343 aa  700    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.387482 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0211  DNA repair and recombination protein RadA  80.47 
 
 		 343 aa  572  1.0000000000000001e-162  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1831  DNA repair and recombination protein RadA  79.59 
 
 		 343 aa  570  1e-161  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1185  DNA repair and recombination protein RadA  76.52 
 
 		 349 aa  547  1e-154  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1273  DNA repair and recombination protein RadA  75.87 
 
 		 348 aa  539  9.999999999999999e-153  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2033  DNA repair and recombination protein RadA  60.88 
 
 		 325 aa  429  1e-119  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.507845  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2338  DNA repair and recombination protein RadA  59.71 
 
 		 325 aa  425  1e-118  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.901889  normal  0.0155582 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2099  DNA repair and recombination protein RadA  57.4 
 
 		 325 aa  403  1e-111  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0885  DNA repair and recombination protein RadA  62.2 
 
 		 322 aa  398  9.999999999999999e-111  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0040  DNA repair and recombination protein RadA  57.99 
 
 		 327 aa  395  1e-109  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2940  DNA repair and recombination protein RadA  55.19 
 
 		 407 aa  378  1e-104  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00873973  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0637  DNA repair and recombination protein RadA  53.22 
 
 		 329 aa  379  1e-104  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0430  DNA repair and recombination protein RadA  55.06 
 
 		 324 aa  379  1e-104  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1918  DNA repair and recombination protein RadA  54.97 
 
 		 324 aa  363  3e-99  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1226  DNA repair and recombination protein RadA  42.86 
 
 		 324 aa  288  1e-76  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0009  DNA repair and recombination protein RadA  42.86 
 
 		 324 aa  287  2e-76  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.416037  normal  0.130845 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2310  DNA repair and recombination protein RadA  43.27 
 
 		 333 aa  279  4e-74  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.469487  hitchhiker  0.00856648 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0982  DNA repair and recombination protein RadA  42.65 
 
 		 322 aa  278  7e-74  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2081  DNA repair and recombination protein RadA  41.94 
 
 		 332 aa  275  8e-73  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0713  DNA repair and recombination protein RadA  41.94 
 
 		 330 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.33185 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1953  DNA repair and recombination protein RadA  41.94 
 
 		 330 aa  272  5.000000000000001e-72  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1450  DNA repair and recombination protein RadA  41.79 
 
 		 322 aa  270  2e-71  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0942903  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0368  DNA repair and recombination protein RadA  41.67 
 
 		 322 aa  269  7e-71  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0469  DNA repair and recombination protein RadA  41.79 
 
 		 322 aa  268  7e-71  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0537  DNA repair and recombination protein RadA  41.38 
 
 		 322 aa  263  3e-69  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1118  DNA repair and recombination protein RadA  40.53 
 
 		 358 aa  262  6.999999999999999e-69  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1017  DNA repair and recombination protein RadA  42.6 
 
 		 358 aa  259  4e-68  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.103289  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1386  DNA repair and recombination protein RadA  40.12 
 
 		 388 aa  249  6e-65  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01237  UvsC protein [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:P78579]  34.59 
 
 		 348 aa  203  3e-51  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.523208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_33041  predicted protein  35.12 
 
 		 343 aa  199  7.999999999999999e-50  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0526282 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_54533  Rad51 DNA recombination/repair protein  35.03 
 
 		 350 aa  197  2.0000000000000003e-49  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.724719  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09092  meiotic recombination protein (Dmc1), putative (AFU_orthologue; AFUA_7G02200)  35.42 
 
 		 658 aa  189  4e-47  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.515485  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA06990  recombinase, putative  34.57 
 
 		 365 aa  182  6e-45  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.108784  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM01780  meiotic recombination-related protein, putative  37.28 
 
 		 323 aa  177  3e-43  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.51774  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_17346  predicted protein  32.63 
 
 		 358 aa  175  9.999999999999999e-43  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.908819  normal  0.780808 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1023  Rad51-like  31.07 
 
 		 315 aa  157  2e-37  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.973197  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_17626  predicted protein  28.86 
 
 		 358 aa  110  3e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0870528  hitchhiker  0.00372316 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_54137  Rad51 DNA recombination/repair protein  27.35 
 
 		 363 aa  106  6e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0743  Rad51-like  31.95 
 
 		 250 aa  105  2e-21  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1396  Fis family transcriptional regulator  28.36 
 
 		 312 aa  98.6  1e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.358472  normal  0.485282 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0486  Rad51-like protein  25.46 
 
 		 311 aa  90.5  4e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.100378  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1633  Rad51 domain-containing protein  26.62 
 
 		 307 aa  89.7  6e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.11008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2031  Rad51-like protein  26.35 
 
 		 314 aa  86.3  7e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000000738645 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0762  Fis family transcriptional regulator  27.16 
 
 		 312 aa  86.3  8e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0530008 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1786  DNA repair and recombination protein RadB  32.2 
 
 		 235 aa  82  0.00000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.729381  normal  0.0464986 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_50387  predicted protein  28.27 
 
 		 351 aa  80.9  0.00000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.142215  normal  0.0213314 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0077  DNA repair and recombination protein RadB  28.03 
 
 		 275 aa  75.1  0.000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.327122  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2158  DNA repair and recombination protein RadB  25.59 
 
 		 235 aa  71.6  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0491  DNA repair and recombination protein RadB  26.79 
 
 		 227 aa  67.4  0.0000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1629  DNA repair and recombination protein RadB  27.16 
 
 		 235 aa  65.9  0.000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.554742  normal  0.462396 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2159  DNA repair and recombination protein RadB  28.07 
 
 		 224 aa  64.7  0.000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0907  DNA repair and recombination protein RadB  26.14 
 
 		 227 aa  65.1  0.000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1272  hypothetical protein  26.94 
 
 		 224 aa  61.6  0.00000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.998309 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0087  RecA/RadA recombinase-like protein  24.37 
 
 		 217 aa  60.5  0.00000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.439691 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0260  DNA repair and recombination protein RadB  25.73 
 
 		 224 aa  57  0.0000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.92433 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0926  DNA repair and recombination protein RadB  24.61 
 
 		 221 aa  55.8  0.000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10145  DNA repair protein (Rad57), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G12520)  27.27 
 
 		 554 aa  53.5  0.000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.263483 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2123  DNA repair and recombination protein RadB  24.57 
 
 		 225 aa  50.8  0.00003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2429  DNA repair and recombination protein RadB  27.93 
 
 		 226 aa  50.8  0.00003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1039  DNA repair and recombination protein RadB  25 
 
 		 243 aa  50.4  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2453  ATPase  23.58 
 
 		 234 aa  50.4  0.00004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.695737 
 
 
-
 
NC_006680  CNK02320  RAD57 protein, putative  25.89 
 
 		 598 aa  49.3  0.00009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_40092  Rad51 DNA recombination/repair protein  22.69 
 
 		 456 aa  48.9  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26240  predicted protein  24.23 
 
 		 369 aa  48.5  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00269696 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1616  recA protein  26.01 
 
 		 348 aa  47.8  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.445296  normal  0.968936 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2819  recombinase A  24.55 
 
 		 366 aa  47.4  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.737949  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0988  DNA repair and recombination protein RadB  22.61 
 
 		 216 aa  47.8  0.0003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0377224  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0666  NusA antitermination factor  37.88 
 
 		 463 aa  47  0.0004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0123778 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2432  50S ribosomal protein L32e  42.19 
 
 		 236 aa  47.4  0.0004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1267  recA protein  31.29 
 
 		 358 aa  47  0.0005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.165392  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0360  recA protein  24.31 
 
 		 339 aa  46.6  0.0006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000245068  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0530  recA protein  24.56 
 
 		 327 aa  46.6  0.0007  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1732  recombinase A  25.23 
 
 		 352 aa  46.2  0.0008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0649106  normal  0.0921204 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0131  recombinase A  30.71 
 
 		 365 aa  46.2  0.0008  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2439  recA protein  23.64 
 
 		 347 aa  46.2  0.0009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000566681  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1288  recombinase A  26.03 
 
 		 348 aa  45.4  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2014  recombinase A  25.23 
 
 		 352 aa  45.8  0.001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.306298 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1545  recA protein  26.46 
 
 		 346 aa  45.8  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.259692  normal  0.07485 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2398  recA protein  26.58 
 
 		 428 aa  45.8  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  1.38659e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0551  recombinase A  24.02 
 
 		 328 aa  45.1  0.002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.99148  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0523  recombinase A  24.1 
 
 		 362 aa  45.1  0.002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000473291  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0274  DNA repair and recombination protein RadB  22.51 
 
 		 215 aa  44.7  0.002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.944285  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0471  recombinase A  23.25 
 
 		 352 aa  44.7  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0455  recombinase A  23.25 
 
 		 352 aa  44.7  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4033  recA protein  25.1 
 
 		 354 aa  44.3  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1378  recombinase A  25.1 
 
 		 354 aa  44.7  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0217782  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2197  recombinase A  23.32 
 
 		 364 aa  44.3  0.003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000000188561  hitchhiker  0.00000561972 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1816  recA protein  26.5 
 
 		 375 aa  44.3  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.54195  normal  0.626066 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_58642  predicted protein  22.69 
 
 		 541 aa  44.3  0.003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  hitchhiker  0.00988886  normal  0.20524 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1640  DNA repair and recombination protein RadB  22.65 
 
 		 215 aa  44.3  0.003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.301627  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4376  recombinase A  23.42 
 
 		 363 aa  44.3  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03079  recombinase A  23.53 
 
 		 348 aa  44.7  0.003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.353429  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10322  Rad51 family DNA repair protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G14460)  24.1 
 
 		 422 aa  44.3  0.004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.177234 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2405  recombinase A  28.06 
 
 		 341 aa  43.9  0.004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1175  recombinase A  25.51 
 
 		 352 aa  43.5  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.214888 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0074  recA protein  23.68 
 
 		 344 aa  43.5  0.005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4685  recA protein  23.83 
 
 		 377 aa  43.5  0.005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  unclonable  0.0000000254393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3015  recombinase A  25.93 
 
 		 347 aa  43.5  0.005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.514179  hitchhiker  0.000000000000973321 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0206  recA protein  24.42 
 
 		 350 aa  43.5  0.006  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.613588  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1231  recombinase A  25.31 
 
 		 355 aa  43.1  0.006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000000176903 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>