95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_50387 on replicon NC_009363
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009363  OSTLU_50387  predicted protein  100 
 
 		 351 aa  696    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.142215  normal  0.0213314 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_40092  Rad51 DNA recombination/repair protein  34.44 
 
 		 456 aa  130  2.0000000000000002e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_17626  predicted protein  32.26 
 
 		 358 aa  110  3e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0870528  hitchhiker  0.00372316 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1118  DNA repair and recombination protein RadA  28.66 
 
 		 358 aa  107  3e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2310  DNA repair and recombination protein RadA  28.88 
 
 		 333 aa  106  7e-22  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.469487  hitchhiker  0.00856648 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1023  Rad51-like  28.97 
 
 		 315 aa  105  1e-21  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.973197  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2081  DNA repair and recombination protein RadA  29.61 
 
 		 332 aa  104  2e-21  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0713  DNA repair and recombination protein RadA  28.35 
 
 		 330 aa  103  5e-21  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.33185 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_54137  Rad51 DNA recombination/repair protein  33.09 
 
 		 363 aa  102  7e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01237  UvsC protein [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:P78579]  26.73 
 
 		 348 aa  102  9e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.523208  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0040  DNA repair and recombination protein RadA  27.57 
 
 		 327 aa  100  4e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1017  DNA repair and recombination protein RadA  28.89 
 
 		 358 aa  99.8  6e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.103289  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1953  DNA repair and recombination protein RadA  28.88 
 
 		 330 aa  99.8  6e-20  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1226  DNA repair and recombination protein RadA  26.44 
 
 		 324 aa  95.5  1e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0009  DNA repair and recombination protein RadA  26.52 
 
 		 324 aa  92  1e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.416037  normal  0.130845 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_33041  predicted protein  30.66 
 
 		 343 aa  92  1e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0526282 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0430  DNA repair and recombination protein RadA  27.13 
 
 		 324 aa  89.4  9e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2940  DNA repair and recombination protein RadA  24.93 
 
 		 407 aa  88.2  2e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00873973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2099  DNA repair and recombination protein RadA  25.9 
 
 		 325 aa  88.2  2e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2624  DNA repair and recombination protein RadA  28.27 
 
 		 343 aa  87.4  3e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.387482 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09092  meiotic recombination protein (Dmc1), putative (AFU_orthologue; AFUA_7G02200)  30.89 
 
 		 658 aa  86.3  7e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.515485  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2338  DNA repair and recombination protein RadA  27.3 
 
 		 325 aa  86.3  7e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.901889  normal  0.0155582 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1386  DNA repair and recombination protein RadA  26.63 
 
 		 388 aa  85.5  0.000000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1185  DNA repair and recombination protein RadA  27.15 
 
 		 349 aa  85.5  0.000000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_54533  Rad51 DNA recombination/repair protein  29.51 
 
 		 350 aa  85.1  0.000000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.724719  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0211  DNA repair and recombination protein RadA  26.95 
 
 		 343 aa  85.1  0.000000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1831  DNA repair and recombination protein RadA  26.6 
 
 		 343 aa  84.3  0.000000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1918  DNA repair and recombination protein RadA  28.31 
 
 		 324 aa  83.6  0.000000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0885  DNA repair and recombination protein RadA  26.76 
 
 		 322 aa  82.4  0.00000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM01780  meiotic recombination-related protein, putative  29.6 
 
 		 323 aa  81.3  0.00000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.51774  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0637  DNA repair and recombination protein RadA  26.11 
 
 		 329 aa  81.6  0.00000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1273  DNA repair and recombination protein RadA  25.42 
 
 		 348 aa  80.1  0.00000000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_17346  predicted protein  31.98 
 
 		 358 aa  79.3  0.0000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.908819  normal  0.780808 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0537  DNA repair and recombination protein RadA  27.76 
 
 		 322 aa  77.8  0.0000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0368  DNA repair and recombination protein RadA  27.76 
 
 		 322 aa  75.5  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA06990  recombinase, putative  27.54 
 
 		 365 aa  72  0.00000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.108784  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2033  DNA repair and recombination protein RadA  27.43 
 
 		 325 aa  72  0.00000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.507845  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1396  Fis family transcriptional regulator  26.72 
 
 		 312 aa  72  0.00000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.358472  normal  0.485282 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1450  DNA repair and recombination protein RadA  26.74 
 
 		 322 aa  70.5  0.00000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0942903  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0926  DNA repair and recombination protein RadB  28.45 
 
 		 221 aa  70.1  0.00000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0486  Rad51-like protein  26.98 
 
 		 311 aa  68.9  0.0000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.100378  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0469  DNA repair and recombination protein RadA  27.52 
 
 		 322 aa  68.6  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0982  DNA repair and recombination protein RadA  25.87 
 
 		 322 aa  67.4  0.0000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1633  Rad51 domain-containing protein  27.81 
 
 		 307 aa  64.7  0.000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.11008  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1039  DNA repair and recombination protein RadB  25.63 
 
 		 243 aa  64.3  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0491  DNA repair and recombination protein RadB  29.94 
 
 		 227 aa  64.3  0.000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_31781  predicted protein  24.37 
 
 		 379 aa  63.2  0.000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0762  Fis family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 312 aa  63.2  0.000000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0530008 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1490  DNA repair and recombination protein RadB  24.43 
 
 		 213 aa  62.8  0.000000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.695224  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2031  Rad51-like protein  28.76 
 
 		 314 aa  62  0.00000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000000738645 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0087  RecA/RadA recombinase-like protein  22.22 
 
 		 217 aa  61.6  0.00000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.439691 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1786  DNA repair and recombination protein RadB  32.49 
 
 		 235 aa  60.8  0.00000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.729381  normal  0.0464986 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0743  Rad51-like  29.94 
 
 		 250 aa  61.2  0.00000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_86836  predicted protein  29.43 
 
 		 307 aa  60.1  0.00000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0929863 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1640  DNA repair and recombination protein RadB  22.4 
 
 		 215 aa  59.3  0.0000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.301627  normal  1 
 
 
-
 
NC_006680  CNK02320  RAD57 protein, putative  24.83 
 
 		 598 aa  58.9  0.0000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2429  DNA repair and recombination protein RadB  26.21 
 
 		 226 aa  59.3  0.0000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2453  ATPase  27.68 
 
 		 234 aa  57.4  0.0000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.695737 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_17589  predicted protein  30 
 
 		 288 aa  57.8  0.0000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0328752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0988  DNA repair and recombination protein RadB  22.4 
 
 		 216 aa  57.4  0.0000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0377224  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1272  hypothetical protein  29.65 
 
 		 224 aa  57.4  0.0000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.998309 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0274  DNA repair and recombination protein RadB  22.31 
 
 		 215 aa  55.5  0.000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.944285  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0260  DNA repair and recombination protein RadB  27.01 
 
 		 224 aa  55.5  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.92433 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10145  DNA repair protein (Rad57), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G12520)  29.67 
 
 		 554 aa  54.7  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.263483 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0285  DNA repair and recombination protein RadB  27.59 
 
 		 213 aa  55.1  0.000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.652849  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2158  DNA repair and recombination protein RadB  31.07 
 
 		 235 aa  53.9  0.000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2123  DNA repair and recombination protein RadB  26.02 
 
 		 225 aa  53.5  0.000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0603  DNA repair protein RadA  33.15 
 
 		 462 aa  53.1  0.000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.981961  normal  0.107382 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2159  DNA repair and recombination protein RadB  27.42 
 
 		 224 aa  52.8  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3412  DNA repair protein RadA  30.81 
 
 		 475 aa  51.2  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.176098  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0907  DNA repair and recombination protein RadB  30.54 
 
 		 227 aa  50.1  0.00006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06728  conserved hypothetical protein  24.6 
 
 		 366 aa  49.7  0.00009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_58642  predicted protein  21.24 
 
 		 541 aa  47.8  0.0003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  hitchhiker  0.00988886  normal  0.20524 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13618  DNA repair protein RadA  28.93 
 
 		 480 aa  47.4  0.0004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.516493 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0228  DNA repair protein RadA  29.47 
 
 		 460 aa  46.6  0.0006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.745621 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1372  recombinase A  26.29 
 
 		 352 aa  46.6  0.0007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0836  DNA repair protein RadA  23.12 
 
 		 457 aa  45.8  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0984957  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0200  DNA repair protein RadA  26.78 
 
 		 457 aa  45.1  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0263  DNA repair protein RadA  25.99 
 
 		 452 aa  44.7  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.992448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0256  DNA repair protein RadA  27.37 
 
 		 457 aa  44.7  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00319082  normal  0.307702 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1212  DNA repair protein RadA  27.16 
 
 		 449 aa  44.3  0.003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.563327  normal  0.69556 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1204  DNA repair protein RadA  25.99 
 
 		 457 aa  43.9  0.004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1685  DNA repair protein RadA  29.44 
 
 		 466 aa  44.3  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.420653 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0360  DNA repair protein RadA  27.32 
 
 		 457 aa  43.9  0.004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0247  DNA repair protein RadA  25.73 
 
 		 448 aa  43.5  0.005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0566  DNA repair protein RadA  28.71 
 
 		 473 aa  43.9  0.005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00646319 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0599  DNA repair protein RadA  27.13 
 
 		 461 aa  43.5  0.005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.316853  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1905  recombinase A  28.22 
 
 		 357 aa  43.5  0.006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.954739 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1328  KaiC  27.53 
 
 		 482 aa  43.5  0.006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1479  DNA repair protein RadA  24.16 
 
 		 457 aa  43.5  0.006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0327327  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0493  DNA repair protein RadA  28.09 
 
 		 453 aa  43.1  0.007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.119863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0182  DNA repair protein RadA  25.98 
 
 		 449 aa  43.1  0.007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2711  DNA repair protein RadA  28.34 
 
 		 454 aa  42.7  0.009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0033  RecA protein  28.16 
 
 		 358 aa  42.7  0.01  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0077  DNA repair and recombination protein RadB  41.82 
 
 		 275 aa  42.7  0.01  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.327122  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>