89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_17626 on replicon NC_009366
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009366  OSTLU_17626  predicted protein  100 
 
 		 358 aa  728    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0870528  hitchhiker  0.00372316 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_54137  Rad51 DNA recombination/repair protein  39.48 
 
 		 363 aa  218  1e-55  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1226  DNA repair and recombination protein RadA  29.85 
 
 		 324 aa  143  5e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0009  DNA repair and recombination protein RadA  30.18 
 
 		 324 aa  138  2e-31  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.416037  normal  0.130845 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1017  DNA repair and recombination protein RadA  31.53 
 
 		 358 aa  136  6.0000000000000005e-31  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.103289  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1023  Rad51-like  33.93 
 
 		 315 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.973197  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2338  DNA repair and recombination protein RadA  29.79 
 
 		 325 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.901889  normal  0.0155582 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0430  DNA repair and recombination protein RadA  30.32 
 
 		 324 aa  129  6e-29  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2081  DNA repair and recombination protein RadA  32.33 
 
 		 332 aa  126  6e-28  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2310  DNA repair and recombination protein RadA  30.82 
 
 		 333 aa  124  2e-27  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.469487  hitchhiker  0.00856648 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0040  DNA repair and recombination protein RadA  28.11 
 
 		 327 aa  125  2e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2033  DNA repair and recombination protein RadA  28.4 
 
 		 325 aa  124  2e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.507845  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0885  DNA repair and recombination protein RadA  31.43 
 
 		 322 aa  124  2e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1953  DNA repair and recombination protein RadA  31.12 
 
 		 330 aa  124  3e-27  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1118  DNA repair and recombination protein RadA  29.43 
 
 		 358 aa  121  9.999999999999999e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0637  DNA repair and recombination protein RadA  28.99 
 
 		 329 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0713  DNA repair and recombination protein RadA  31.72 
 
 		 330 aa  122  9.999999999999999e-27  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.33185 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1185  DNA repair and recombination protein RadA  30.11 
 
 		 349 aa  121  1.9999999999999998e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1273  DNA repair and recombination protein RadA  30.03 
 
 		 348 aa  120  3e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0211  DNA repair and recombination protein RadA  28.11 
 
 		 343 aa  120  3e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_33041  predicted protein  29.46 
 
 		 343 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0526282 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1386  DNA repair and recombination protein RadA  27.89 
 
 		 388 aa  113  6e-24  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09092  meiotic recombination protein (Dmc1), putative (AFU_orthologue; AFUA_7G02200)  33.33 
 
 		 658 aa  112  1.0000000000000001e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.515485  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2624  DNA repair and recombination protein RadA  28.86 
 
 		 343 aa  110  3e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.387482 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2940  DNA repair and recombination protein RadA  26.55 
 
 		 407 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00873973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2099  DNA repair and recombination protein RadA  27.35 
 
 		 325 aa  109  8.000000000000001e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0982  DNA repair and recombination protein RadA  27.43 
 
 		 322 aa  107  2e-22  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1831  DNA repair and recombination protein RadA  26.98 
 
 		 343 aa  107  2e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_50387  predicted protein  32.26 
 
 		 351 aa  104  2e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.142215  normal  0.0213314 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_54533  Rad51 DNA recombination/repair protein  28.41 
 
 		 350 aa  103  4e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.724719  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0368  DNA repair and recombination protein RadA  29.12 
 
 		 322 aa  102  1e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM01780  meiotic recombination-related protein, putative  30.92 
 
 		 323 aa  101  2e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.51774  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1450  DNA repair and recombination protein RadA  28.42 
 
 		 322 aa  99.8  7e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0942903  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0469  DNA repair and recombination protein RadA  29.12 
 
 		 322 aa  98.2  2e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0537  DNA repair and recombination protein RadA  27.72 
 
 		 322 aa  97.4  3e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01237  UvsC protein [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:P78579]  29.79 
 
 		 348 aa  94.4  3e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.523208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_17346  predicted protein  30.43 
 
 		 358 aa  92.4  1e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.908819  normal  0.780808 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1918  DNA repair and recombination protein RadA  27.76 
 
 		 324 aa  87.4  3e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_40092  Rad51 DNA recombination/repair protein  31.44 
 
 		 456 aa  81.6  0.00000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA06990  recombinase, putative  27.67 
 
 		 365 aa  79.3  0.0000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.108784  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0743  Rad51-like  34.33 
 
 		 250 aa  77.8  0.0000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2123  DNA repair and recombination protein RadB  26.25 
 
 		 225 aa  68.2  0.0000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_17589  predicted protein  27.49 
 
 		 288 aa  66.6  0.0000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0328752  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10145  DNA repair protein (Rad57), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G12520)  27.19 
 
 		 554 aa  64.7  0.000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.263483 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1396  Fis family transcriptional regulator  29.28 
 
 		 312 aa  64.3  0.000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.358472  normal  0.485282 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06728  conserved hypothetical protein  23.65 
 
 		 366 aa  64.3  0.000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1786  DNA repair and recombination protein RadB  28.92 
 
 		 235 aa  62.8  0.000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.729381  normal  0.0464986 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0491  DNA repair and recombination protein RadB  23.23 
 
 		 227 aa  62  0.00000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2158  DNA repair and recombination protein RadB  31.84 
 
 		 235 aa  60.5  0.00000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0087  RecA/RadA recombinase-like protein  23.68 
 
 		 217 aa  60.5  0.00000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.439691 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0907  DNA repair and recombination protein RadB  28.11 
 
 		 227 aa  59.7  0.00000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_86836  predicted protein  28.67 
 
 		 307 aa  58.9  0.0000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0929863 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0926  DNA repair and recombination protein RadB  26.46 
 
 		 221 aa  58.2  0.0000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1640  DNA repair and recombination protein RadB  24.39 
 
 		 215 aa  57.4  0.0000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.301627  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1633  Rad51 domain-containing protein  25.95 
 
 		 307 aa  56.2  0.0000008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.11008  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0077  DNA repair and recombination protein RadB  27.98 
 
 		 275 aa  56.2  0.0000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.327122  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2159  DNA repair and recombination protein RadB  26.36 
 
 		 224 aa  55.8  0.000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0274  DNA repair and recombination protein RadB  23.74 
 
 		 215 aa  54.3  0.000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.944285  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0988  DNA repair and recombination protein RadB  25.53 
 
 		 216 aa  54.3  0.000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0377224  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1039  DNA repair and recombination protein RadB  25.49 
 
 		 243 aa  53.9  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10322  Rad51 family DNA repair protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G14460)  29.8 
 
 		 422 aa  53.5  0.000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.177234 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1272  hypothetical protein  27 
 
 		 224 aa  52.8  0.000009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.998309 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_58642  predicted protein  26.83 
 
 		 541 aa  52.8  0.000009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  hitchhiker  0.00988886  normal  0.20524 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0762  Fis family transcriptional regulator  27.92 
 
 		 312 aa  52.4  0.00001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0530008 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2031  Rad51-like protein  27.5 
 
 		 314 aa  51.6  0.00002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000000738645 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0486  Rad51-like protein  24.19 
 
 		 311 aa  48.5  0.0002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.100378  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1490  DNA repair and recombination protein RadB  23.94 
 
 		 213 aa  48.5  0.0002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.695224  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0247  DNA repair protein RadA  22.73 
 
 		 448 aa  48.5  0.0002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_31781  predicted protein  26.52 
 
 		 379 aa  47  0.0005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4772  DNA repair protein RadA  31.76 
 
 		 457 aa  45.4  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000283378 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0562  DNA repair protein RadA  25.11 
 
 		 454 aa  45.1  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0548  DNA repair protein RadA  25.11 
 
 		 454 aa  45.1  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1162  recA protein  36.13 
 
 		 356 aa  44.3  0.003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.501327  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00880  DNA repair protein RadA  22.7 
 
 		 451 aa  44.3  0.003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000000121912  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0285  DNA repair and recombination protein RadB  21.69 
 
 		 213 aa  44.3  0.003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.652849  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1629  DNA repair and recombination protein RadB  25.87 
 
 		 235 aa  44.3  0.004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.554742  normal  0.462396 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0260  DNA repair and recombination protein RadB  26.56 
 
 		 224 aa  43.9  0.004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.92433 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0080  DNA repair protein RadA  24.03 
 
 		 484 aa  43.9  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2453  ATPase  35.19 
 
 		 234 aa  43.9  0.005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.695737 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0398  DNA repair protein RadA  27.78 
 
 		 454 aa  43.5  0.005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0090486 
 
 
-
 
NC_006680  CNK02320  RAD57 protein, putative  23.29 
 
 		 598 aa  43.5  0.005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3106  recA protein  31.07 
 
 		 346 aa  43.9  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000524014  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1479  DNA repair protein RadA  21.72 
 
 		 457 aa  43.5  0.006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0327327  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0363  DNA repair protein RadA  38.89 
 
 		 465 aa  43.1  0.007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0881  recombinase A  27.55 
 
 		 343 aa  43.1  0.007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.115374  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0988  recombinase A  27.55 
 
 		 343 aa  43.1  0.007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1786  DNA repair protein RadA  23.04 
 
 		 454 aa  43.1  0.007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000301687  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2354  DNA repair protein RadA  24.74 
 
 		 514 aa  42.7  0.01  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.561638  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2303  DNA repair protein RadA  24.74 
 
 		 514 aa  42.7  0.01  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>