44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNK02320 on replicon NC_006680
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006680  CNK02320  RAD57 protein, putative  100 
 
 		 598 aa  1214    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10145  DNA repair protein (Rad57), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G12520)  30.32 
 
 		 554 aa  79  0.0000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.263483 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1118  DNA repair and recombination protein RadA  30.49 
 
 		 358 aa  68.2  0.0000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_40092  Rad51 DNA recombination/repair protein  30.25 
 
 		 456 aa  67  0.0000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_58642  predicted protein  27.27 
 
 		 541 aa  65.9  0.000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  hitchhiker  0.00988886  normal  0.20524 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2310  DNA repair and recombination protein RadA  30.3 
 
 		 333 aa  61.2  0.00000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.469487  hitchhiker  0.00856648 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01237  UvsC protein [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:P78579]  26.64 
 
 		 348 aa  60.1  0.0000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.523208  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1953  DNA repair and recombination protein RadA  30.04 
 
 		 330 aa  59.3  0.0000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0713  DNA repair and recombination protein RadA  30.4 
 
 		 330 aa  58.9  0.0000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.33185 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0637  DNA repair and recombination protein RadA  29.95 
 
 		 329 aa  59.7  0.0000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2081  DNA repair and recombination protein RadA  29.52 
 
 		 332 aa  58.5  0.0000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0885  DNA repair and recombination protein RadA  29.69 
 
 		 322 aa  58.2  0.0000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1017  DNA repair and recombination protein RadA  28.82 
 
 		 358 aa  58.5  0.0000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.103289  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_17346  predicted protein  22.9 
 
 		 358 aa  56.6  0.000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.908819  normal  0.780808 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_54137  Rad51 DNA recombination/repair protein  26.61 
 
 		 363 aa  57  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_33041  predicted protein  25.58 
 
 		 343 aa  55.8  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0526282 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2158  DNA repair and recombination protein RadB  28.11 
 
 		 235 aa  56.2  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_50387  predicted protein  23.97 
 
 		 351 aa  54.7  0.000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.142215  normal  0.0213314 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1023  Rad51-like  24.88 
 
 		 315 aa  54.7  0.000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.973197  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0077  DNA repair and recombination protein RadB  27.19 
 
 		 275 aa  54.7  0.000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.327122  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0009  DNA repair and recombination protein RadA  24.65 
 
 		 324 aa  53.9  0.000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.416037  normal  0.130845 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2624  DNA repair and recombination protein RadA  25.89 
 
 		 343 aa  53.1  0.00001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.387482 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1386  DNA repair and recombination protein RadA  24.79 
 
 		 388 aa  53.5  0.00001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1831  DNA repair and recombination protein RadA  26.76 
 
 		 343 aa  53.5  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1273  DNA repair and recombination protein RadA  28.38 
 
 		 348 aa  52.8  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2338  DNA repair and recombination protein RadA  26.79 
 
 		 325 aa  52.8  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.901889  normal  0.0155582 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1226  DNA repair and recombination protein RadA  24.55 
 
 		 324 aa  50.1  0.0001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1786  DNA repair and recombination protein RadB  26.51 
 
 		 235 aa  50.1  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.729381  normal  0.0464986 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1185  DNA repair and recombination protein RadA  28.57 
 
 		 349 aa  48.5  0.0003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0907  DNA repair and recombination protein RadB  26.76 
 
 		 227 aa  48.5  0.0004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2159  DNA repair and recombination protein RadB  24.42 
 
 		 224 aa  48.5  0.0004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2033  DNA repair and recombination protein RadA  27.91 
 
 		 325 aa  47.8  0.0006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.507845  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0040  DNA repair and recombination protein RadA  27.78 
 
 		 327 aa  47.4  0.0007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0211  DNA repair and recombination protein RadA  23.81 
 
 		 343 aa  47  0.0009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1633  Rad51 domain-containing protein  25.98 
 
 		 307 aa  47  0.001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.11008  normal  1 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_54533  Rad51 DNA recombination/repair protein  24.77 
 
 		 350 aa  47  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.724719  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0537  DNA repair and recombination protein RadA  25 
 
 		 322 aa  45.8  0.002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2940  DNA repair and recombination protein RadA  27.05 
 
 		 407 aa  45.8  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00873973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0982  DNA repair and recombination protein RadA  22.79 
 
 		 322 aa  45.4  0.003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0430  DNA repair and recombination protein RadA  26.04 
 
 		 324 aa  45.4  0.003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0491  DNA repair and recombination protein RadB  32.88 
 
 		 227 aa  45.1  0.004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1396  Fis family transcriptional regulator  21.36 
 
 		 312 aa  44.7  0.005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.358472  normal  0.485282 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_31781  predicted protein  27.12 
 
 		 379 aa  44.7  0.006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0743  Rad51-like  26.84 
 
 		 250 aa  44.3  0.006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>