17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_31781 on replicon NC_011669
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011669  PHATRDRAFT_31781  predicted protein  100 
 
 		 379 aa  772    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_40092  Rad51 DNA recombination/repair protein  25.9 
 
 		 456 aa  65.5  0.000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_50387  predicted protein  24.05 
 
 		 351 aa  53.1  0.000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.142215  normal  0.0213314 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1017  DNA repair and recombination protein RadA  22.48 
 
 		 358 aa  51.2  0.00003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.103289  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1118  DNA repair and recombination protein RadA  24 
 
 		 358 aa  50.8  0.00004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_54137  Rad51 DNA recombination/repair protein  27.16 
 
 		 363 aa  50.4  0.00005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1953  DNA repair and recombination protein RadA  25.27 
 
 		 330 aa  48.9  0.0001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2310  DNA repair and recombination protein RadA  25.48 
 
 		 333 aa  47  0.0005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.469487  hitchhiker  0.00856648 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_17626  predicted protein  26.52 
 
 		 358 aa  47  0.0006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0870528  hitchhiker  0.00372316 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2081  DNA repair and recombination protein RadA  25.28 
 
 		 332 aa  46.6  0.0007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10145  DNA repair protein (Rad57), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G12520)  29.03 
 
 		 554 aa  45.4  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.263483 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0713  DNA repair and recombination protein RadA  24.18 
 
 		 330 aa  44.7  0.002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.33185 
 
 
-
 
NC_006680  CNK02320  RAD57 protein, putative  27.12 
 
 		 598 aa  45.1  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0009  DNA repair and recombination protein RadA  23.21 
 
 		 324 aa  44.7  0.003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.416037  normal  0.130845 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0368  DNA repair and recombination protein RadA  22.71 
 
 		 322 aa  44.3  0.004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM01780  meiotic recombination-related protein, putative  27.96 
 
 		 323 aa  43.5  0.006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.51774  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1450  DNA repair and recombination protein RadA  26.32 
 
 		 322 aa  42.7  0.01  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0942903  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>