76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_86836 on replicon NC_009357
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009357  OSTLU_86836  predicted protein  100 
 
 		 307 aa  604  9.999999999999999e-173  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0929863 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1226  DNA repair and recombination protein RadA  28.82 
 
 		 324 aa  82.4  0.000000000000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_17626  predicted protein  29 
 
 		 358 aa  73.6  0.000000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0870528  hitchhiker  0.00372316 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2310  DNA repair and recombination protein RadA  28.82 
 
 		 333 aa  72.8  0.000000000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.469487  hitchhiker  0.00856648 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1023  Rad51-like  27.33 
 
 		 315 aa  72.4  0.000000000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.973197  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_50387  predicted protein  29.01 
 
 		 351 aa  71.6  0.00000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.142215  normal  0.0213314 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1953  DNA repair and recombination protein RadA  28.47 
 
 		 330 aa  71.2  0.00000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0713  DNA repair and recombination protein RadA  28.12 
 
 		 330 aa  69.3  0.00000000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.33185 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2081  DNA repair and recombination protein RadA  29.17 
 
 		 332 aa  68.2  0.0000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_40092  Rad51 DNA recombination/repair protein  29.8 
 
 		 456 aa  67.8  0.0000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0009  DNA repair and recombination protein RadA  26.04 
 
 		 324 aa  68.2  0.0000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.416037  normal  0.130845 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1786  DNA repair and recombination protein RadB  35.75 
 
 		 235 aa  66.6  0.0000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.729381  normal  0.0464986 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1118  DNA repair and recombination protein RadA  27.08 
 
 		 358 aa  65.1  0.000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2123  DNA repair and recombination protein RadB  25.53 
 
 		 225 aa  64.7  0.000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10145  DNA repair protein (Rad57), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G12520)  29.63 
 
 		 554 aa  63.9  0.000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.263483 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1017  DNA repair and recombination protein RadA  26.99 
 
 		 358 aa  64.3  0.000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.103289  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_54137  Rad51 DNA recombination/repair protein  25.75 
 
 		 363 aa  61.6  0.00000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_54533  Rad51 DNA recombination/repair protein  31.71 
 
 		 350 aa  60.5  0.00000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.724719  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2159  DNA repair and recombination protein RadB  31.94 
 
 		 224 aa  59.7  0.00000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_33041  predicted protein  25.61 
 
 		 343 aa  58.9  0.00000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0526282 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0040  DNA repair and recombination protein RadA  24.22 
 
 		 327 aa  58.5  0.0000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1039  DNA repair and recombination protein RadB  27.98 
 
 		 243 aa  58.2  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0491  DNA repair and recombination protein RadB  27.07 
 
 		 227 aa  57  0.0000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK02320  RAD57 protein, putative  21.59 
 
 		 598 aa  57.4  0.0000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01237  UvsC protein [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:P78579]  25.08 
 
 		 348 aa  57  0.0000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.523208  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2033  DNA repair and recombination protein RadA  25.13 
 
 		 325 aa  56.6  0.0000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.507845  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0926  DNA repair and recombination protein RadB  29.55 
 
 		 221 aa  56.6  0.0000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1831  DNA repair and recombination protein RadA  27.32 
 
 		 343 aa  55.1  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2338  DNA repair and recombination protein RadA  27.51 
 
 		 325 aa  55.5  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.901889  normal  0.0155582 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0260  DNA repair and recombination protein RadB  30.64 
 
 		 224 aa  55.1  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.92433 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0430  DNA repair and recombination protein RadA  28.42 
 
 		 324 aa  53.9  0.000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM01780  meiotic recombination-related protein, putative  27.18 
 
 		 323 aa  53.1  0.000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.51774  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0537  DNA repair and recombination protein RadA  22.59 
 
 		 322 aa  52.8  0.000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_17589  predicted protein  26.97 
 
 		 288 aa  52.4  0.000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0328752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2429  DNA repair and recombination protein RadB  26.32 
 
 		 226 aa  52  0.00001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0982  DNA repair and recombination protein RadA  23.98 
 
 		 322 aa  52  0.00001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_17346  predicted protein  26.81 
 
 		 358 aa  52  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.908819  normal  0.780808 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1272  hypothetical protein  26.9 
 
 		 224 aa  52.4  0.00001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.998309 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2158  DNA repair and recombination protein RadB  30.81 
 
 		 235 aa  51.6  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1185  DNA repair and recombination protein RadA  28.92 
 
 		 349 aa  51.2  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09092  meiotic recombination protein (Dmc1), putative (AFU_orthologue; AFUA_7G02200)  28.42 
 
 		 658 aa  51.6  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.515485  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2940  DNA repair and recombination protein RadA  23.71 
 
 		 407 aa  51.2  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00873973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1918  DNA repair and recombination protein RadA  25.09 
 
 		 324 aa  51.2  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0762  Fis family transcriptional regulator  26.96 
 
 		 312 aa  51.6  0.00002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0530008 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0211  DNA repair and recombination protein RadA  28.64 
 
 		 343 aa  50.8  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_31781  predicted protein  29.01 
 
 		 379 aa  50.4  0.00003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0285  DNA repair and recombination protein RadB  21.02 
 
 		 213 aa  50.4  0.00004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.652849  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1396  Fis family transcriptional regulator  25.48 
 
 		 312 aa  50.1  0.00005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.358472  normal  0.485282 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2453  ATPase  28.57 
 
 		 234 aa  50.1  0.00005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.695737 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0885  DNA repair and recombination protein RadA  25.4 
 
 		 322 aa  49.7  0.00006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0907  DNA repair and recombination protein RadB  29.35 
 
 		 227 aa  49.3  0.00008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0077  DNA repair and recombination protein RadB  28.9 
 
 		 275 aa  49.3  0.00008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.327122  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0368  DNA repair and recombination protein RadA  23.3 
 
 		 322 aa  48.9  0.0001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1450  DNA repair and recombination protein RadA  23.62 
 
 		 322 aa  47.8  0.0002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0942903  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1633  Rad51 domain-containing protein  28.65 
 
 		 307 aa  47.8  0.0002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.11008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0469  DNA repair and recombination protein RadA  23.62 
 
 		 322 aa  47.8  0.0002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2624  DNA repair and recombination protein RadA  26.83 
 
 		 343 aa  48.5  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.387482 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1386  DNA repair and recombination protein RadA  23.78 
 
 		 388 aa  47.4  0.0003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2031  Rad51-like protein  27.83 
 
 		 314 aa  47.4  0.0003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000000738645 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2099  DNA repair and recombination protein RadA  23.45 
 
 		 325 aa  46.2  0.0006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0087  RecA/RadA recombinase-like protein  20.21 
 
 		 217 aa  45.8  0.0008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.439691 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0988  DNA repair and recombination protein RadB  20.32 
 
 		 216 aa  45.4  0.001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0377224  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2453  putative circadian clock protein, KaiC  28.98 
 
 		 478 aa  45.4  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0637  DNA repair and recombination protein RadA  23.71 
 
 		 329 aa  45.1  0.001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1273  DNA repair and recombination protein RadA  26 
 
 		 348 aa  45.4  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2624  putative circadian clock protein, KaiC  24.66 
 
 		 280 aa  44.7  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.209506  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1640  DNA repair and recombination protein RadB  19.13 
 
 		 215 aa  45.1  0.002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.301627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0274  DNA repair and recombination protein RadB  17.99 
 
 		 215 aa  44.7  0.002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.944285  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1490  DNA repair and recombination protein RadB  20.21 
 
 		 213 aa  43.9  0.003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.695224  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0486  Rad51-like protein  26.47 
 
 		 311 aa  43.5  0.004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.100378  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0743  Rad51-like  32.71 
 
 		 250 aa  43.5  0.005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1678  hypothetical protein  28.57 
 
 		 283 aa  43.5  0.005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.844314  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0716  KaiC  28.57 
 
 		 208 aa  43.1  0.006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_58642  predicted protein  21.74 
 
 		 541 aa  42.7  0.007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  hitchhiker  0.00988886  normal  0.20524 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06728  conserved hypothetical protein  26.72 
 
 		 366 aa  42.4  0.009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0483  hypothetical protein  31.29 
 
 		 286 aa  42.4  0.01  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.751724  hitchhiker  0.00130673 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>