253 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_17589 on replicon NC_009366
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009366  OSTLU_17589  predicted protein  100 
 
 		 288 aa  591  1e-168  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0328752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_17626  predicted protein  28.29 
 
 		 358 aa  78.2  0.0000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0870528  hitchhiker  0.00372316 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1786  DNA repair and recombination protein RadB  38.79 
 
 		 235 aa  72.8  0.000000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.729381  normal  0.0464986 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1023  Rad51-like  45.19 
 
 		 315 aa  71.6  0.00000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.973197  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2158  DNA repair and recombination protein RadB  28.24 
 
 		 235 aa  70.1  0.00000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_40092  Rad51 DNA recombination/repair protein  26.52 
 
 		 456 aa  69.7  0.00000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0077  DNA repair and recombination protein RadB  52.24 
 
 		 275 aa  68.6  0.0000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.327122  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1039  DNA repair and recombination protein RadB  26.29 
 
 		 243 aa  65.5  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0907  DNA repair and recombination protein RadB  44.71 
 
 		 227 aa  65.1  0.000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_50387  predicted protein  29.13 
 
 		 351 aa  65.1  0.000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.142215  normal  0.0213314 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2123  DNA repair and recombination protein RadB  25.97 
 
 		 225 aa  64.7  0.000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0926  DNA repair and recombination protein RadB  30.3 
 
 		 221 aa  64.3  0.000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0491  DNA repair and recombination protein RadB  33.04 
 
 		 227 aa  63.9  0.000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0285  DNA repair and recombination protein RadB  25.28 
 
 		 213 aa  63.5  0.000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.652849  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_54137  Rad51 DNA recombination/repair protein  27.47 
 
 		 363 aa  62.8  0.000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2429  DNA repair and recombination protein RadB  26.55 
 
 		 226 aa  60.5  0.00000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1953  DNA repair and recombination protein RadA  27.5 
 
 		 330 aa  59.7  0.00000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2159  DNA repair and recombination protein RadB  47.76 
 
 		 224 aa  59.3  0.00000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2081  DNA repair and recombination protein RadA  25.99 
 
 		 332 aa  59.3  0.00000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0040  DNA repair and recombination protein RadA  29.89 
 
 		 327 aa  58.5  0.0000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1629  DNA repair and recombination protein RadB  36.36 
 
 		 235 aa  57.8  0.0000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.554742  normal  0.462396 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1017  DNA repair and recombination protein RadA  27.01 
 
 		 358 aa  57.8  0.0000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.103289  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0713  DNA repair and recombination protein RadA  27.08 
 
 		 330 aa  57.4  0.0000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.33185 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2033  DNA repair and recombination protein RadA  29.61 
 
 		 325 aa  56.6  0.0000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.507845  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0743  Rad51-like  26.1 
 
 		 250 aa  56.6  0.0000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0009  DNA repair and recombination protein RadA  24.84 
 
 		 324 aa  56.2  0.0000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.416037  normal  0.130845 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2338  DNA repair and recombination protein RadA  30.56 
 
 		 325 aa  55.1  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.901889  normal  0.0155582 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0087  RecA/RadA recombinase-like protein  28.21 
 
 		 217 aa  55.1  0.000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.439691 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2940  DNA repair and recombination protein RadA  28.66 
 
 		 407 aa  54.3  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00873973  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0219  putative circadian clock protein, KaiC  26.75 
 
 		 267 aa  54.3  0.000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1272  hypothetical protein  30.17 
 
 		 224 aa  54.3  0.000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.998309 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2310  DNA repair and recombination protein RadA  26.05 
 
 		 333 aa  54.7  0.000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.469487  hitchhiker  0.00856648 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1490  DNA repair and recombination protein RadB  33.33 
 
 		 213 aa  53.5  0.000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.695224  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26240  predicted protein  34.65 
 
 		 369 aa  53.5  0.000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00269696 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_54533  Rad51 DNA recombination/repair protein  26.36 
 
 		 350 aa  53.1  0.000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.724719  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_86836  predicted protein  26.97 
 
 		 307 aa  53.1  0.000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0929863 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3994  recA protein  35.66 
 
 		 352 aa  52.8  0.000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0864938  normal  0.282621 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1226  DNA repair and recombination protein RadA  26.14 
 
 		 324 aa  52.4  0.000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1118  DNA repair and recombination protein RadA  24.91 
 
 		 358 aa  52.4  0.000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3106  recA protein  46.55 
 
 		 346 aa  52.4  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000524014  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0885  DNA repair and recombination protein RadA  28.39 
 
 		 322 aa  51.6  0.00001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0226  putative circadian clock protein, KaiC  27.1 
 
 		 267 aa  51.6  0.00001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.728159  normal  0.358869 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10530  protein RecA  29.95 
 
 		 368 aa  51.2  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.419207  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4116  recombinase A  34.51 
 
 		 356 aa  51.2  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.979014 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1328  putative circadian clock protein, KaiC  26.75 
 
 		 271 aa  51.2  0.00002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1671  recombinase A  35.92 
 
 		 357 aa  51.2  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0637  DNA repair and recombination protein RadA  29.19 
 
 		 329 aa  50.8  0.00002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0729  DNA repair protein RadA  24.18 
 
 		 467 aa  50.4  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.634843 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0274  DNA repair and recombination protein RadB  40.32 
 
 		 215 aa  50.8  0.00003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.944285  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2453  ATPase  33.67 
 
 		 234 aa  50.4  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.695737 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27820  protein RecA  34.97 
 
 		 345 aa  50.4  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0461192 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0200  DNA repair protein RadA  43.94 
 
 		 457 aa  50.4  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0988  DNA repair and recombination protein RadB  40.32 
 
 		 216 aa  50.4  0.00003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0377224  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0430  DNA repair and recombination protein RadA  33.8 
 
 		 324 aa  50.4  0.00003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3294  recA protein  29.41 
 
 		 729 aa  50.8  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.088639  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1640  DNA repair and recombination protein RadB  35.14 
 
 		 215 aa  50.1  0.00004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.301627  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1242  recA protein  29.95 
 
 		 376 aa  50.4  0.00004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1581  recA protein  39.68 
 
 		 383 aa  49.7  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01237  UvsC protein [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:P78579]  29.23 
 
 		 348 aa  49.7  0.00006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.523208  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00149  recombinase A  40.62 
 
 		 344 aa  49.7  0.00006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.781257  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6708  recombinase A  32.87 
 
 		 345 aa  49.3  0.00007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.141706  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0584  recombinase A  34.83 
 
 		 385 aa  49.3  0.00007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000230133  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1118  recA protein  32.17 
 
 		 365 aa  48.9  0.00009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.145639  normal  0.0819488 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0924  DNA recombination protein, RecA  46.55 
 
 		 342 aa  48.9  0.00009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0603  DNA repair protein RadA  34.26 
 
 		 462 aa  48.9  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.981961  normal  0.107382 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2147  recombinase A  34.27 
 
 		 347 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1185  DNA repair and recombination protein RadA  26.83 
 
 		 349 aa  48.5  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1492  recA protein  33.57 
 
 		 345 aa  48.5  0.0001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.211084  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2193  recombinase A  34.27 
 
 		 347 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0979046 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2134  recombinase A  34.27 
 
 		 347 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00345325 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0666  recA protein  44.83 
 
 		 378 aa  47.8  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.386455  normal  0.202905 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2099  DNA repair and recombination protein RadA  26.45 
 
 		 325 aa  47.8  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1545  recA protein  32.87 
 
 		 346 aa  47.8  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.259692  normal  0.07485 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0360  DNA repair protein RadA  43.94 
 
 		 457 aa  47.8  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0284  recombinase A  43.1 
 
 		 418 aa  48.1  0.0002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0864352  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1831  DNA repair and recombination protein RadA  27.63 
 
 		 343 aa  47.8  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2179  recA protein  38.46 
 
 		 347 aa  48.1  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.385059  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1473  recA protein  41.38 
 
 		 355 aa  47.8  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.000000112388  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2202  recA protein  32.87 
 
 		 347 aa  48.1  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4183  recA protein  46.88 
 
 		 349 aa  47.8  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.888096  normal  0.191355 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0945  recombinase A  35.66 
 
 		 349 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3919  recA protein  43.1 
 
 		 344 aa  47.8  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1460  recombinase A  29.41 
 
 		 351 aa  48.1  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00992179  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07230  protein RecA  34.27 
 
 		 351 aa  47.8  0.0002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.533016  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1041  recA protein  28.72 
 
 		 364 aa  47.8  0.0002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1462  recombinase A  29.41 
 
 		 352 aa  47.8  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000631927 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0972  recombinase A  35.66 
 
 		 349 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000464693  normal  0.0586083 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12750  DNA recombination protein RecA  34.27 
 
 		 790 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000250397  normal  0.0414269 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0710  hypothetical protein  26.62 
 
 		 277 aa  47.4  0.0002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000127893 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_17346  predicted protein  27.74 
 
 		 358 aa  47.8  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.908819  normal  0.780808 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1419  recA protein  32.87 
 
 		 347 aa  48.1  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0779  recA protein  43.1 
 
 		 362 aa  47.4  0.0003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000418573  normal  0.0314858 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0537  DNA repair and recombination protein RadA  36.05 
 
 		 322 aa  47  0.0003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0960  recombinase A  28.09 
 
 		 356 aa  47.4  0.0003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00998532  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1658  recA protein  31.46 
 
 		 377 aa  47.4  0.0003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000206716  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0360  recA protein  39.68 
 
 		 339 aa  47  0.0003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000245068  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1476  recombinase A  40.62 
 
 		 345 aa  47  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.158308  normal  0.357343 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1492  recA protein  32.17 
 
 		 348 aa  47  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.148956 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23200  protein RecA  28.34 
 
 		 359 aa  47.4  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.930258  normal  0.114189 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2341  recA protein  43.1 
 
 		 350 aa  47.4  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>