More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0779 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_0779  recA protein  100 
 
 		 362 aa  723    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000418573  normal  0.0314858 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1619  recA protein  78.57 
 
 		 352 aa  521  1e-147  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000177143  hitchhiker  0.0000000069085 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07480  RecA protein  72.78 
 
 		 352 aa  511  1e-144  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0526583  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10720  protein RecA  70.8 
 
 		 361 aa  495  1e-139  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000907009  unclonable  0.00000000149755 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1219  recombinase A  64.93 
 
 		 347 aa  471  1e-132  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0979767  normal  0.281308 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0653  recA protein  70.4 
 
 		 346 aa  472  1e-132  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1021  RecA protein  63.66 
 
 		 379 aa  471  1e-132  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0676  recA protein  68.85 
 
 		 347 aa  466  9.999999999999999e-131  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00169949  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3994  recA protein  65.59 
 
 		 352 aa  464  9.999999999999999e-131  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0864938  normal  0.282621 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1419  recA protein  65.59 
 
 		 347 aa  467  9.999999999999999e-131  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3525  recombinase A  64.72 
 
 		 345 aa  467  9.999999999999999e-131  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.551254  normal  0.0703421 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17690  RecA protein  64.07 
 
 		 367 aa  462  1e-129  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.72475  normal  0.370795 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2202  recA protein  66.18 
 
 		 347 aa  463  1e-129  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0666  recA protein  62.79 
 
 		 378 aa  461  1e-129  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.386455  normal  0.202905 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6708  recombinase A  64.52 
 
 		 345 aa  463  1e-129  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.141706  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10530  protein RecA  64.91 
 
 		 368 aa  459  9.999999999999999e-129  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.419207  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0284  recombinase A  64.76 
 
 		 418 aa  461  9.999999999999999e-129  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0864352  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1041  recA protein  67.07 
 
 		 364 aa  459  9.999999999999999e-129  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23200  protein RecA  65.95 
 
 		 359 aa  460  9.999999999999999e-129  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.930258  normal  0.114189 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2819  recombinase A  64.53 
 
 		 366 aa  460  9.999999999999999e-129  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.737949  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0711  recombinase A  65.75 
 
 		 345 aa  459  9.999999999999999e-129  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2179  recA protein  68.25 
 
 		 347 aa  455  1e-127  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.385059  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2134  recombinase A  64.71 
 
 		 347 aa  457  1e-127  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00345325 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4183  recA protein  65.77 
 
 		 349 aa  457  1e-127  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.888096  normal  0.191355 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1545  recA protein  63.64 
 
 		 346 aa  456  1e-127  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.259692  normal  0.07485 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27820  protein RecA  68.35 
 
 		 345 aa  456  1e-127  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0461192 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3975  recombinase A  66.06 
 
 		 350 aa  457  1e-127  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2147  recombinase A  64.71 
 
 		 347 aa  457  1e-127  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1627  recombinase A  64.24 
 
 		 341 aa  455  1e-127  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00182901  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1118  recA protein  65.03 
 
 		 365 aa  456  1e-127  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.145639  normal  0.0819488 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2193  recombinase A  64.71 
 
 		 347 aa  457  1e-127  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0979046 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2420  recombinase A  65.85 
 
 		 350 aa  455  1e-127  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.157742  normal  0.0782537 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3524  recA protein  63.02 
 
 		 355 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00288101 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5453  recombinase A  63.64 
 
 		 362 aa  454  1.0000000000000001e-126  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.658876  normal  0.17766 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1280  recombinase A  63.33 
 
 		 362 aa  451  1.0000000000000001e-126  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.118352  normal  0.176518 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1785  recA protein  64.65 
 
 		 350 aa  454  1.0000000000000001e-126  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1079  recA protein  63.86 
 
 		 348 aa  452  1.0000000000000001e-126  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1730  recombinase A  62.9 
 
 		 363 aa  451  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00591118  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1958  recombinase A  64.09 
 
 		 362 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.212458 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2216  RecA protein  64.83 
 
 		 366 aa  452  1.0000000000000001e-126  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.139784 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1242  recA protein  65.34 
 
 		 376 aa  453  1.0000000000000001e-126  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2169  recombinase A  64.39 
 
 		 364 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.423968  normal  0.0596488 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1473  RecA protein  65.31 
 
 		 364 aa  451  1.0000000000000001e-126  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0213351  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1492  recA protein  66.26 
 
 		 345 aa  454  1.0000000000000001e-126  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.211084  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2341  recA protein  64.18 
 
 		 350 aa  452  1.0000000000000001e-126  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3106  recA protein  64.22 
 
 		 346 aa  452  1.0000000000000001e-126  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000524014  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1986  recombinase A  63.66 
 
 		 361 aa  454  1.0000000000000001e-126  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4376  recombinase A  63.19 
 
 		 363 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1522  recombinase A  63.66 
 
 		 361 aa  450  1e-125  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3103  recA protein  66.36 
 
 		 343 aa  451  1e-125  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000175278  normal  0.820651 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2439  recA protein  63.04 
 
 		 347 aa  451  1e-125  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000566681  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1050  recA protein  61.81 
 
 		 345 aa  449  1e-125  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0444945 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0932  recA protein  61.81 
 
 		 345 aa  449  1e-125  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2405  recombinase A  65.35 
 
 		 341 aa  450  1e-125  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1616  recombinase A  62.61 
 
 		 362 aa  449  1e-125  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1425  recombinase A  65.94 
 
 		 348 aa  451  1e-125  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.976211  normal  0.0337506 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1616  recA protein  65.22 
 
 		 348 aa  450  1e-125  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.445296  normal  0.968936 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4080  recombinase A  63.8 
 
 		 361 aa  448  1e-125  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1263  recombinase A  61.78 
 
 		 360 aa  448  1e-125  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.778933  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1927  recombinase A  69.09 
 
 		 352 aa  450  1e-125  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1645  recombinase A  69.09 
 
 		 352 aa  451  1e-125  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11890  recA protein  63.86 
 
 		 357 aa  450  1e-125  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000128048  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2403  recA protein  64.13 
 
 		 343 aa  449  1e-125  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.104177  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1389  recombinase A  65.94 
 
 		 348 aa  450  1e-125  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.384565  normal  0.0556082 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0628  recA protein  63.24 
 
 		 346 aa  444  1.0000000000000001e-124  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.067585  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1165  recombinase A  63.08 
 
 		 424 aa  447  1.0000000000000001e-124  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.165606  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07230  protein RecA  64.72 
 
 		 351 aa  447  1.0000000000000001e-124  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.533016  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1202  recombinase A  63.08 
 
 		 361 aa  447  1.0000000000000001e-124  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1050  recA protein  67.38 
 
 		 349 aa  447  1.0000000000000001e-124  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000195685  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1492  recA protein  65.44 
 
 		 348 aa  446  1.0000000000000001e-124  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.148956 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0440  recombinase A  61.99 
 
 		 358 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3741  recombinase A  61.74 
 
 		 364 aa  445  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.709907 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0650  recombinase A  64.11 
 
 		 357 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.590321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1034  recombinase A  65.44 
 
 		 343 aa  445  1.0000000000000001e-124  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0682579  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1567  recombinase A  63.33 
 
 		 363 aa  447  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000432957 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03079  recombinase A  64.6 
 
 		 348 aa  444  1.0000000000000001e-124  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.353429  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0671  recombinase A  63.19 
 
 		 358 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.180955 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1230  recombinase A  65.27 
 
 		 357 aa  446  1.0000000000000001e-124  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.460816  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2699  recombinase A  63.61 
 
 		 359 aa  444  1.0000000000000001e-124  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3295  recombinase A  63.5 
 
 		 358 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.303399  normal  0.877549 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2573  recombinase A  63.61 
 
 		 359 aa  444  1.0000000000000001e-124  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.803783  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4194  recombinase A  66.56 
 
 		 358 aa  446  1.0000000000000001e-124  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2448  recA protein  64.42 
 
 		 350 aa  447  1.0000000000000001e-124  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.276179  normal  0.953449 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2528  recA protein  66.57 
 
 		 343 aa  446  1.0000000000000001e-124  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1610  recA protein  64.42 
 
 		 390 aa  447  1.0000000000000001e-124  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.651077 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2404  recombinase A  63.19 
 
 		 356 aa  442  1e-123  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0810  recombinase A  63.19 
 
 		 356 aa  442  1e-123  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1765  recombinase A  61.8 
 
 		 348 aa  442  1e-123  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1765  recombinase A  61.8 
 
 		 348 aa  442  1e-123  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0017  recombinase A  63.19 
 
 		 356 aa  442  1e-123  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0971  recombinase A  63.19 
 
 		 356 aa  442  1e-123  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0005  recA protein  62.61 
 
 		 355 aa  442  1e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0310986  normal  0.0651314 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0643  recombinase A  63.5 
 
 		 356 aa  443  1e-123  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.940587  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3735  recombinase A  65.73 
 
 		 338 aa  443  1e-123  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3630  recombinase A  65.73 
 
 		 338 aa  442  1e-123  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0618  recA protein  65.73 
 
 		 347 aa  443  1e-123  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.186792  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0513  recA protein  64.37 
 
 		 350 aa  442  1e-123  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.213728 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1462  recombinase A  63.5 
 
 		 352 aa  442  1e-123  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000631927 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1460  recombinase A  62.88 
 
 		 351 aa  441  1e-123  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00992179  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2652  recombinase A  63 
 
 		 356 aa  443  1e-123  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>