More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_1028 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013525  Tter_1028  DnaB domain protein helicase domain protein  100 
 
 		 341 aa  689    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1358  replicative DNA helicase  29.63 
 
 		 453 aa  66.2  0.0000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.059229  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4164  replicative DNA helicase  26.97 
 
 		 469 aa  66.2  0.0000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5914  replicative DNA helicase  28.57 
 
 		 453 aa  65.9  0.0000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5558  replicative DNA helicase  27.2 
 
 		 464 aa  65.9  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00148847 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0024  replicative DNA helicase  26.72 
 
 		 479 aa  65.5  0.000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39470  primary replicative DNA helicase  25.84 
 
 		 459 aa  65.5  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0340273  normal  0.250985 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3553  replicative DNA helicase  26.16 
 
 		 454 aa  63.5  0.000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.520185 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0490  replicative DNA helicase  28.63 
 
 		 500 aa  62.8  0.000000009  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7308  replicative DNA helicase  25.88 
 
 		 452 aa  61.6  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.036629  normal  0.0750337 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0739  replicative DNA helicase  30.16 
 
 		 463 aa  61.6  0.00000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9348  replicative DNA helicase  24.59 
 
 		 451 aa  61.2  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.500437 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0256  DNA repair protein RadA  45.31 
 
 		 457 aa  61.2  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00319082  normal  0.307702 
 
 
-
 
NC_011779  BbuZS7_G33  putative replicative helicase  24.69 
 
 		 275 aa  61.6  0.00000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5469  replicative DNA helicase  26.44 
 
 		 448 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.430835  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5868  replicative DNA helicase  26.44 
 
 		 464 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5742  replicative DNA helicase  25.77 
 
 		 460 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.130016 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1693  replicative DNA helicase  24.72 
 
 		 470 aa  60.8  0.00000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1149  replicative DNA helicase  30.42 
 
 		 444 aa  60.8  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000486046  hitchhiker  0.00581399 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4552  replicative DNA helicase  26.32 
 
 		 468 aa  60.8  0.00000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.355354  normal  0.656762 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6265  replicative DNA helicase  25.9 
 
 		 441 aa  60.8  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0006  replicative DNA helicase  24.8 
 
 		 471 aa  60.5  0.00000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0667  replicative DNA helicase  25.96 
 
 		 446 aa  60.5  0.00000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4518  primary replicative DNA helicase  25.49 
 
 		 452 aa  60.5  0.00000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.729039  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0655  replicative DNA helicase  28.81 
 
 		 447 aa  60.5  0.00000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.329356  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1530  primary replicative DNA helicase  30.83 
 
 		 471 aa  60.5  0.00000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.000128037  normal  0.452968 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15351  replicative DNA helicase  27.04 
 
 		 307 aa  60.1  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0041  replicative DNA helicase  29.25 
 
 		 585 aa  60.1  0.00000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1815  replicative DNA helicase  28.69 
 
 		 446 aa  59.7  0.00000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1360  replicative DNA helicase  26.87 
 
 		 473 aa  59.7  0.00000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0517  replicative DNA helicase  37.11 
 
 		 445 aa  58.5  0.0000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0466276  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2543  primary replicative DNA helicase  26.94 
 
 		 468 aa  58.9  0.0000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0137  replicative DNA helicase  26.64 
 
 		 474 aa  58.9  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.174045  normal  0.162999 
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3596  replicative DNA helicase  29.01 
 
 		 437 aa  58.9  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3540  replicative DNA helicase  26.34 
 
 		 454 aa  58.9  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2083  primary replicative DNA helicase  27.39 
 
 		 452 aa  58.9  0.0000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3990  replicative DNA helicase  30.42 
 
 		 444 aa  58.9  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000661916 
 
 
-
 
NC_004310  BR0450  replicative DNA helicase  27.45 
 
 		 501 aa  57.8  0.0000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.741231  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02520  primary replicative DNA helicase  26.25 
 
 		 455 aa  58.2  0.0000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2924  replicative DNA helicase  26.69 
 
 		 459 aa  58.2  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.124062  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0456  replicative DNA helicase  27.45 
 
 		 501 aa  58.5  0.0000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.859558  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0563  replicative DNA helicase  27.45 
 
 		 501 aa  58.5  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0432  replicative DNA helicase  27.59 
 
 		 479 aa  58.2  0.0000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.789235  normal  0.752 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0129  replicative DNA helicase  28.15 
 
 		 485 aa  58.2  0.0000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000444194  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0111  replicative DNA helicase  25.77 
 
 		 455 aa  57.8  0.0000003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3562  DnaB domain protein helicase domain protein  25.26 
 
 		 479 aa  57.4  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2211  replicative DNA helicase  26.97 
 
 		 442 aa  57.8  0.0000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1031  replicative DNA helicase  26.61 
 
 		 451 aa  57.8  0.0000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0416  replicative DNA helicase  26.89 
 
 		 498 aa  57.8  0.0000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.727024 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1089  replicative DNA helicase  26.61 
 
 		 451 aa  57.8  0.0000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0882  replicative DNA helicase  27.64 
 
 		 447 aa  57.8  0.0000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00111559  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27870  primary replicative DNA helicase  28.03 
 
 		 464 aa  57.4  0.0000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0308941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0078  replicative DNA helicase  25.97 
 
 		 474 aa  57  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.149462  normal  0.111475 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0734  replicative DNA helicase  26.67 
 
 		 499 aa  57  0.0000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00267216  normal  0.96044 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0852  primary replicative DNA helicase  26.4 
 
 		 443 aa  57  0.0000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0880  DNA repair protein RadA  35.79 
 
 		 450 aa  56.6  0.0000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.510643  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3883  replicative DNA helicase  24.69 
 
 		 461 aa  56.6  0.0000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000215257 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37750  primary replicative DNA helicase  25.82 
 
 		 461 aa  56.6  0.0000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0987  replicative DNA helicase  26.67 
 
 		 496 aa  56.6  0.0000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.326082  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0535  replicative DNA helicase  25.63 
 
 		 443 aa  56.6  0.0000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1220  primary replicative DNA helicase  24.81 
 
 		 469 aa  56.2  0.0000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.452255 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0972  replicative DNA helicase  27.1 
 
 		 456 aa  56.6  0.0000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2325  DnaB domain protein helicase domain protein  26.54 
 
 		 464 aa  56.6  0.0000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0591718  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1827  replicative DNA helicase  26.69 
 
 		 481 aa  56.2  0.0000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.981728  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1339  DNA repair protein RadA  36.36 
 
 		 446 aa  56.2  0.0000008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.826628  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1212  DNA repair protein RadA  45.31 
 
 		 449 aa  56.2  0.0000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.563327  normal  0.69556 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1220  DNA repair protein RadA  36.36 
 
 		 446 aa  56.2  0.0000008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0209  replicative DNA helicase  24.44 
 
 		 467 aa  56.2  0.0000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000508188  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0375  replicative DNA helicase  24.9 
 
 		 483 aa  55.8  0.0000009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0985  replicative DNA helicase  26.28 
 
 		 472 aa  55.8  0.0000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.701163 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2176  DNA repair protein RadA  28.08 
 
 		 434 aa  55.8  0.0000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5064  replicative DNA helicase  28.33 
 
 		 844 aa  55.8  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000360056 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1273  DnaB replicative helicase  26.55 
 
 		 472 aa  55.5  0.000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.539414  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3411  replicative DNA helicase  25.57 
 
 		 454 aa  55.8  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2743  DNA repair protein RadA  43.28 
 
 		 453 aa  55.8  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2970  replicative DNA helicase  25.73 
 
 		 444 aa  55.5  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2430  DNA repair protein RadA  43.28 
 
 		 453 aa  55.8  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2648  replicative DNA helicase  25.73 
 
 		 439 aa  55.5  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0318  DNA repair protein RadA  41.27 
 
 		 470 aa  55.5  0.000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4110  primary replicative DNA helicase  24.69 
 
 		 460 aa  55.8  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1232  primary replicative DNA helicase  27.53 
 
 		 473 aa  55.5  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0177324 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21441  DnaB replicative helicase  26.55 
 
 		 472 aa  55.5  0.000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1198  putative replicative DNA helicase protein  26.77 
 
 		 299 aa  55.8  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4119  replicative DNA helicase  28.95 
 
 		 444 aa  54.7  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5225  replicative DNA helicase  27.53 
 
 		 477 aa  55.1  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3459  DNA repair protein RadA  39.68 
 
 		 452 aa  55.1  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.261832  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0097  replicative DNA helicase  26.56 
 
 		 473 aa  54.7  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.100227  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4159  replicative DNA helicase  28.95 
 
 		 444 aa  54.7  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.275363 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3350  replicative DNA helicase  24.58 
 
 		 453 aa  55.1  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.298617  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0360  DNA repair protein RadA  38.46 
 
 		 457 aa  54.7  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1515  replicative DNA helicase  25.88 
 
 		 498 aa  55.1  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.84588  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2391  replicative DNA helicase  26.4 
 
 		 469 aa  54.7  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0085  replicative DNA helicase  26.56 
 
 		 473 aa  54.7  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0195  putative replicative DNA helicase protein  26.39 
 
 		 289 aa  55.1  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.449191 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2307  replicative DNA helicase  26.14 
 
 		 497 aa  54.3  0.000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.954316  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0019  primary replicative DNA helicase  24.15 
 
 		 449 aa  54.7  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.000143574  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2826  replicative DNA helicase  27.62 
 
 		 473 aa  54.3  0.000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4444  replicative DNA helicase  26.59 
 
 		 447 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18641  DnaB replicative helicase  25.9 
 
 		 460 aa  54.3  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.753101  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1050  replicative DNA helicase  26.27 
 
 		 498 aa  54.3  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.250549 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>