More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_B0195 on replicon NC_008826
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008826  Mpe_B0195  putative replicative DNA helicase protein  100 
 
 		 289 aa  580  1.0000000000000001e-165  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.449191 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1198  putative replicative DNA helicase protein  99.65 
 
 		 299 aa  580  1e-164  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1822  replicative DNA helicase  51.92 
 
 		 469 aa  300  2e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0791999  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2826  replicative DNA helicase  51.6 
 
 		 473 aa  293  2e-78  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2391  replicative DNA helicase  51.05 
 
 		 469 aa  291  1e-77  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0985  replicative DNA helicase  52.31 
 
 		 472 aa  288  7e-77  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.701163 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1530  primary replicative DNA helicase  51.96 
 
 		 471 aa  288  1e-76  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.000128037  normal  0.452968 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1232  primary replicative DNA helicase  50.53 
 
 		 473 aa  286  2.9999999999999996e-76  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0177324 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2565  replicative DNA helicase  50.88 
 
 		 472 aa  286  4e-76  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.76517  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3212  primary replicative DNA helicase  50.88 
 
 		 472 aa  286  4e-76  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5225  replicative DNA helicase  51.05 
 
 		 477 aa  285  5e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2002  replicative DNA helicase  49.47 
 
 		 463 aa  285  7e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.691063  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1975  replicative DNA helicase  49.47 
 
 		 463 aa  284  1.0000000000000001e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.131049  normal  0.119575 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2580  replicative DNA helicase  51.07 
 
 		 468 aa  283  3.0000000000000004e-75  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.962288  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1186  replicative DNA helicase  50 
 
 		 462 aa  281  7.000000000000001e-75  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.104196  normal  0.0632375 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1247  replicative DNA helicase  50 
 
 		 462 aa  281  8.000000000000001e-75  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.250408  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1311  replicative DNA helicase  49.64 
 
 		 473 aa  279  3e-74  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3665  replicative DNA helicase  49.12 
 
 		 470 aa  279  3e-74  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0000253139  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1220  primary replicative DNA helicase  49.3 
 
 		 469 aa  278  6e-74  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.452255 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2101  primary replicative DNA helicase  48.06 
 
 		 463 aa  275  5e-73  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0892  replicative DNA helicase  48.81 
 
 		 462 aa  275  6e-73  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0803  replicative DNA helicase  52.29 
 
 		 460 aa  274  1.0000000000000001e-72  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0774  replicative DNA helicase  52.29 
 
 		 460 aa  274  1.0000000000000001e-72  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2382  replicative DNA helicase  49.64 
 
 		 472 aa  274  2.0000000000000002e-72  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0927  replicative DNA helicase  49.63 
 
 		 465 aa  272  4.0000000000000004e-72  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0223  DnaB helicase  50.34 
 
 		 472 aa  271  1e-71  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0432  replicative DNA helicase  50.18 
 
 		 479 aa  269  4e-71  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.789235  normal  0.752 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1779  replicative DNA helicase  48.04 
 
 		 460 aa  268  5.9999999999999995e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1807  replicative DNA helicase  47.69 
 
 		 460 aa  268  5.9999999999999995e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0915  replicative DNA helicase  46.64 
 
 		 462 aa  268  8e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.388027  normal  0.30922 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1931  replicative DNA helicase  50.19 
 
 		 461 aa  268  8.999999999999999e-71  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6209  replicative DNA helicase  48.04 
 
 		 460 aa  268  8.999999999999999e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.985308  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1870  replicative DNA helicase  48.04 
 
 		 460 aa  268  8.999999999999999e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.826495  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1404  replicative DNA helicase  48.04 
 
 		 460 aa  268  8.999999999999999e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5170  replicative DNA helicase  48.04 
 
 		 460 aa  268  1e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1890  replicative DNA helicase  47.69 
 
 		 460 aa  267  2e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.631373  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1400  replicative DNA helicase  47.69 
 
 		 460 aa  267  2e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.94223  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2412  replicative DNA helicase  47.69 
 
 		 460 aa  267  2e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0006  replicative DNA helicase  47.69 
 
 		 460 aa  267  2e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.176764  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2183  replicative DNA helicase  47.69 
 
 		 460 aa  267  2e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1330  primary replicative DNA helicase  46.5 
 
 		 462 aa  267  2e-70  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.455664  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1163  replicative DNA helicase  47.69 
 
 		 460 aa  267  2e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2247  replicative DNA helicase  47.69 
 
 		 460 aa  267  2e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.234397  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2286  replicative DNA helicase  47.69 
 
 		 460 aa  267  2e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1735  replicative DNA helicase  50 
 
 		 461 aa  266  4e-70  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0740032  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1790  replicative DNA helicase  46.62 
 
 		 461 aa  266  4e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0711961 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2452  replicative DNA helicase  46.62 
 
 		 461 aa  266  4e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.034153  normal  0.221442 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1409  replicative DNA helicase  49.43 
 
 		 449 aa  264  1e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000202868 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2801  replicative DNA helicase  49.24 
 
 		 449 aa  263  3e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.235348  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1947  replicative DNA helicase  47.33 
 
 		 470 aa  263  3e-69  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1794  replicative DNA helicase  47.33 
 
 		 471 aa  259  3e-68  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.549463  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1867  replicative DNA helicase  47.33 
 
 		 471 aa  259  3e-68  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.745764  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3756  replicative DNA helicase  47.31 
 
 		 442 aa  259  5.0000000000000005e-68  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00600051  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2568  primary replicative DNA helicase  50.72 
 
 		 456 aa  258  9e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00282826  normal  0.174192 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0082  replicative DNA helicase  43.93 
 
 		 446 aa  257  1e-67  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0882  replicative DNA helicase  45.95 
 
 		 447 aa  257  1e-67  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00111559  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2637  replicative DNA helicase  46.81 
 
 		 476 aa  257  2e-67  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.415006 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4930  replicative DNA helicase  47.91 
 
 		 465 aa  256  2e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000680092 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1827  replicative DNA helicase  48.23 
 
 		 481 aa  257  2e-67  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.981728  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04796  replicative DNA helicase  46.45 
 
 		 476 aa  255  6e-67  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.744907  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4873  replicative DNA helicase  47.55 
 
 		 465 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.495294  normal  0.581353 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0538  replicative DNA helicase  46.29 
 
 		 465 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.294706 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4754  replicative DNA helicase  47.55 
 
 		 465 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.100967 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5658  replicative DNA helicase  45.07 
 
 		 464 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.313319  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4664  replicative DNA helicase  47.55 
 
 		 465 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0851035 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4929  replicative DNA helicase  45.23 
 
 		 464 aa  252  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0649  replicative DNA helicase  45.49 
 
 		 464 aa  252  5.000000000000001e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000112072 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2387  replicative DNA helicase  46.84 
 
 		 442 aa  252  5.000000000000001e-66  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65130  replicative DNA helicase  44.72 
 
 		 464 aa  252  6e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2256  primary replicative DNA helicase  45.55 
 
 		 445 aa  251  7e-66  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000224677  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0585  replicative DNA helicase  45.23 
 
 		 464 aa  251  8.000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.35566 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2442  replicative DNA helicase  47.06 
 
 		 457 aa  251  9.000000000000001e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000892281 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2819  replicative DNA helicase  47.06 
 
 		 457 aa  251  9.000000000000001e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0928  replicative DNA helicase  48.33 
 
 		 449 aa  250  2e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000728284  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1995  replicative DNA helicase  46.31 
 
 		 456 aa  249  4e-65  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1360  replicative DNA helicase  44.84 
 
 		 473 aa  249  4e-65  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2139  replicative DNA helicase  46.15 
 
 		 451 aa  249  5e-65  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.147021  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0330  DnaB helicase  43.73 
 
 		 450 aa  248  8e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.850269  normal  0.345432 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2134  replicative DNA helicase  49.43 
 
 		 441 aa  248  8e-65  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000149646  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4349  replicative DNA helicase  44.8 
 
 		 441 aa  248  1e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0748508  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0998  replicative DNA helicase  47.42 
 
 		 456 aa  246  2e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5618  replicative DNA helicase  44.29 
 
 		 318 aa  247  2e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000715712  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5340  replicative DNA helicase  44.64 
 
 		 449 aa  247  2e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000100588  hitchhiker  0.000000000805673 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5261  replicative DNA helicase  44.64 
 
 		 453 aa  247  2e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000442873  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5321  replicative DNA helicase  44.29 
 
 		 453 aa  246  3e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0278999  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5149  replicative DNA helicase  44.29 
 
 		 453 aa  246  3e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000056604  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5165  replicative DNA helicase  44.29 
 
 		 453 aa  246  3e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000098375  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5578  replicative DNA helicase  44.29 
 
 		 453 aa  246  3e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6689500000000002e-23 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5717  replicative DNA helicase  44.29 
 
 		 453 aa  246  3e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000293177  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5595  replicative DNA helicase  44.29 
 
 		 453 aa  246  3e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000964148  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5656  replicative DNA helicase  44.29 
 
 		 453 aa  246  3e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000115662  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3033  DnaB-like helicase-like  53.39 
 
 		 821 aa  246  4e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  unclonable  0.00000237623  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1097  replicative DNA helicase  45.23 
 
 		 481 aa  246  4e-64  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.513997  normal  0.0220544 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2021  replicative DNA helicase  46.02 
 
 		 508 aa  246  4.9999999999999997e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00119519  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3461  replicative DNA helicase  45.74 
 
 		 458 aa  245  6.999999999999999e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.951861  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07680  replicative DNA helicase  43.77 
 
 		 463 aa  245  6.999999999999999e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0192  replicative DNA helicase DnaB  46.92 
 
 		 466 aa  244  9e-64  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0972  replicative DNA helicase  43.69 
 
 		 456 aa  244  9.999999999999999e-64  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1003  replicative DNA helicase  47.48 
 
 		 473 aa  244  9.999999999999999e-64  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.792284  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2083  primary replicative DNA helicase  50.19 
 
 		 452 aa  243  1.9999999999999999e-63  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>