More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_0033 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013926  Aboo_0033  hypothetical protein  100 
 
 		 230 aa  474  1e-133  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1389  putative circadian clock protein, KaiC  26.96 
 
 		 402 aa  75.9  0.0000000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.201888  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2944  putative circadian clock protein, KaiC  54.84 
 
 		 496 aa  73.9  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00911179  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1661  putative circadian clock protein, KaiC  26.09 
 
 		 344 aa  72.4  0.000000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.321518  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1030  Non-specific serine/threonine protein kinase  26.67 
 
 		 498 aa  72.4  0.000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3136  putative circadian clock protein, KaiC  35.4 
 
 		 498 aa  71.6  0.000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00540403  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3030  Non-specific serine/threonine protein kinase  54.84 
 
 		 497 aa  70.5  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.470915  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1808  circadian clock protein KaiC  25.22 
 
 		 454 aa  69.7  0.00000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4008  circadian clock protein KaiC  29.22 
 
 		 559 aa  69.3  0.00000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.376445  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0067  putative circadian clock protein, KaiC  24 
 
 		 532 aa  68.6  0.00000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.643949  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0444  KaiA binding protein  27.23 
 
 		 224 aa  68.6  0.00000000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0716  putative circadian clock protein, KaiC  26.58 
 
 		 266 aa  68.6  0.00000000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0711817  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5757  putative circadian clock protein, KaiC  28.21 
 
 		 481 aa  67.8  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.36007  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0603  DNA repair protein RadA  23.04 
 
 		 462 aa  67  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.981961  normal  0.107382 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3984  circadian clock protein KaiC  27.08 
 
 		 570 aa  66.6  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.612648  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1657  putative circadian clock protein, KaiC  22.64 
 
 		 501 aa  66.6  0.0000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3412  DNA repair protein RadA  25 
 
 		 475 aa  65.5  0.0000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.176098  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0555  putative circadian clock protein, KaiC  23.14 
 
 		 229 aa  65.1  0.0000000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4017  Non-specific serine/threonine protein kinase  24.89 
 
 		 491 aa  65.1  0.0000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.546145  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2453  putative circadian clock protein, KaiC  27.72 
 
 		 478 aa  65.1  0.0000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3311  circadian clock protein KaiC  27 
 
 		 570 aa  64.3  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.140965 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2238  putative circadian clock protein, KaiC  24.05 
 
 		 497 aa  65.1  0.000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3229  non-specific serine/threonine protein kinase  31.61 
 
 		 494 aa  63.9  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0484  hypothetical protein  24.79 
 
 		 491 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.424786  normal  0.883095 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0483  putative circadian clock protein, KaiC  23.48 
 
 		 362 aa  63.9  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5592  hypothetical protein  27.47 
 
 		 480 aa  63.5  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0798  RecA-superfamily ATPase implicated in signal transduction-like protein  31.79 
 
 		 249 aa  63.9  0.000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5730  Non-specific serine/threonine protein kinase  24.9 
 
 		 480 aa  63.9  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2779  Non-specific serine/threonine protein kinase  24.58 
 
 		 504 aa  63.5  0.000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1691  KaiC  28.09 
 
 		 259 aa  62.8  0.000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.601669  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0524  putative circadian clock protein, KaiC  36.17 
 
 		 364 aa  63.2  0.000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1884  putative circadian clock protein, KaiC  30.3 
 
 		 569 aa  62.4  0.000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.780487  normal  0.628661 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0297  putative circadian clock protein, KaiC  47.76 
 
 		 320 aa  62  0.000000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.0000433674  normal  0.105078 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3435  putative circadian clock protein, KaiC  24.05 
 
 		 492 aa  62  0.000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0200  DNA repair protein RadA  25.53 
 
 		 457 aa  62  0.000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4304  DNA repair protein RadA  27.83 
 
 		 476 aa  61.6  0.000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0337551 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0741  circadian clock protein KaiC  28.69 
 
 		 562 aa  61.6  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1702  putative circadian clock protein, KaiC  27.92 
 
 		 499 aa  61.6  0.000000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.197448  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0135  putative circadian clock protein, KaiC  25.35 
 
 		 506 aa  61.2  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.034427 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6554  circadian clock protein KaiC  28.22 
 
 		 584 aa  61.6  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.242881 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4409  DNA repair protein RadA  27.83 
 
 		 481 aa  61.2  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.589948 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3120  putative circadian clock protein, KaiC  25.93 
 
 		 575 aa  61.2  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.374294  normal  0.928661 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3936  DNA repair protein RadA  27.83 
 
 		 476 aa  61.6  0.00000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.075328 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0781  tetrahydromethanopterin S-methyltransferase subunit C-like protein  36.05 
 
 		 238 aa  61.2  0.00000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.207407  unclonable  0.000000000000156433 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1291  putative circadian clock protein, KaiC  28.08 
 
 		 287 aa  60.8  0.00000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0235304 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4631  DNA repair protein RadA  26.89 
 
 		 477 aa  60.8  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.742671  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1663  circadian clock protein KaiC  27.07 
 
 		 574 aa  60.1  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.455072  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3897  DNA repair protein RadA  27.83 
 
 		 478 aa  60.8  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.217877 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2597  DNA repair protein RadA  27.36 
 
 		 477 aa  60.5  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.803027  normal  0.0563961 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2260  KaiA binding  26.89 
 
 		 231 aa  59.7  0.00000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00780772 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5760  putative circadian clock protein, KaiC  23.87 
 
 		 496 aa  60.1  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0048  putative circadian clock protein, KaiC  24.47 
 
 		 235 aa  59.7  0.00000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0039  putative circadian clock protein, KaiC  22.47 
 
 		 505 aa  59.7  0.00000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0424208 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2095  KaiC  33.33 
 
 		 243 aa  59.3  0.00000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1956  DNA repair protein RadA  27.36 
 
 		 455 aa  58.5  0.00000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3359  circadian clock protein KaiC  24.57 
 
 		 510 aa  58.5  0.00000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2542  circadian clock protein KaiC  27.04 
 
 		 560 aa  57.8  0.0000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4341  circadian clock protein KaiC  28.09 
 
 		 574 aa  58.2  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.213757  hitchhiker  0.00291063 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0799  Sigma 54 interacting domain protein  30.29 
 
 		 242 aa  57.8  0.0000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0493  DNA repair protein RadA  22.71 
 
 		 453 aa  57.8  0.0000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.119863  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0009  circadian clock protein KaiC  29.49 
 
 		 563 aa  57.8  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.310441  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2609  hypothetical protein  23.08 
 
 		 505 aa  57  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4478  circadian clock protein KaiC  26.52 
 
 		 575 aa  57.4  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.79331  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4110  circadian clock protein KaiC  26.52 
 
 		 575 aa  57.4  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0566  DNA repair protein RadA  23.08 
 
 		 473 aa  57.4  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00646319 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2353  putative circadian clock protein, KaiC  25.84 
 
 		 489 aa  56.6  0.0000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2689  putative circadian clock protein, KaiC  23.98 
 
 		 234 aa  56.6  0.0000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1170  putative circadian clock protein, KaiC  21.49 
 
 		 237 aa  56.2  0.0000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0984322  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0547  hypothetical protein  24.29 
 
 		 242 aa  56.2  0.0000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000268994  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0561  hypothetical protein  24.29 
 
 		 242 aa  56.2  0.0000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00523047  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2718  hypothetical protein  23.14 
 
 		 494 aa  55.8  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.150479  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4591  circadian clock protein KaiC  26.72 
 
 		 567 aa  55.8  0.0000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.277881  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4148  circadian clock protein KaiC  24.14 
 
 		 510 aa  55.8  0.0000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0860299 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0360  DNA repair protein RadA  23.93 
 
 		 457 aa  55.8  0.0000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1116  circadian clock protein KaiC  23.53 
 
 		 550 aa  55.5  0.0000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0758  KaiC  46.15 
 
 		 301 aa  55.8  0.0000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.28576  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2228  putative circadian clock protein, KaiC  25.42 
 
 		 484 aa  55.8  0.0000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5974  non-specific serine/threonine protein kinase  24.12 
 
 		 504 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.270987  normal  0.51709 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1507  DNA repair protein RadA  24.64 
 
 		 466 aa  55.5  0.0000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0219  putative circadian clock protein, KaiC  44.44 
 
 		 267 aa  55.1  0.0000009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6620  putative circadian clock protein, KaiC  22.22 
 
 		 497 aa  55.1  0.0000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1138  putative circadian clock protein, KaiC  27.49 
 
 		 482 aa  55.1  0.0000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.860477  normal  0.0108343 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0255  putative circadian clock protein, KaiC  25 
 
 		 262 aa  54.7  0.000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2451  KaiC  23.14 
 
 		 494 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.970563  hitchhiker  0.00417767 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3110  hypothetical protein  27.83 
 
 		 241 aa  54.7  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0481513  normal  0.666956 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2454  DNA repair protein RadA  25.35 
 
 		 483 aa  54.7  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.819464  normal  0.726284 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3006  circadian clock protein KaiC  23.71 
 
 		 506 aa  54.7  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1513  KaiC  25.65 
 
 		 459 aa  54.7  0.000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00132783  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2995  DNA repair protein RadA  25.35 
 
 		 495 aa  55.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.446194 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3203  putative circadian clock protein, KaiC  23.11 
 
 		 481 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0945  putative circadian clock protein, KaiC  27.91 
 
 		 241 aa  54.7  0.000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.553729  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0489  DNA repair protein RadA  24.29 
 
 		 457 aa  54.3  0.000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.665667  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1662  putative circadian clock protein, KaiC  23.53 
 
 		 472 aa  53.9  0.000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.628139 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2711  DNA repair protein RadA  23.14 
 
 		 454 aa  54.3  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5921  putative circadian clock protein, KaiC  46.3 
 
 		 502 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.3624  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3032  putative circadian clock protein, KaiC  25.21 
 
 		 483 aa  53.9  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_40092  Rad51 DNA recombination/repair protein  26.38 
 
 		 456 aa  54.3  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1102  non-specific serine/threonine protein kinase  22.52 
 
 		 489 aa  53.9  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0689  putative circadian clock protein, KaiC  26.99 
 
 		 467 aa  53.9  0.000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.95223  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1297  putative circadian clock protein, KaiC  23.62 
 
 		 492 aa  53.1  0.000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.551481  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>