More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_11520 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013204  Elen_0026  replicative DNA helicase  72.43 
 
 
470 aa  671    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.44109  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11520  primary replicative DNA helicase  100 
 
 
473 aa  966    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.213802  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27870  primary replicative DNA helicase  66.74 
 
 
464 aa  614  9.999999999999999e-175  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0308941  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0024  replicative DNA helicase  45.76 
 
 
479 aa  406  1.0000000000000001e-112  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2256  primary replicative DNA helicase  44.95 
 
 
445 aa  366  1e-100  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000224677  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0082  replicative DNA helicase  43.81 
 
 
446 aa  359  6e-98  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3553  replicative DNA helicase  42.76 
 
 
454 aa  358  9e-98  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.520185 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2387  replicative DNA helicase  43.55 
 
 
442 aa  358  9.999999999999999e-98  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2910  primary replicative DNA helicase  45.18 
 
 
448 aa  356  5.999999999999999e-97  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000233122  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1409  replicative DNA helicase  43.84 
 
 
449 aa  355  1e-96  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000202868 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0882  replicative DNA helicase  44.57 
 
 
447 aa  353  2.9999999999999997e-96  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00111559  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4349  replicative DNA helicase  43.78 
 
 
441 aa  353  4e-96  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0748508  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1931  replicative DNA helicase  45.23 
 
 
461 aa  353  5e-96  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2801  replicative DNA helicase  43.51 
 
 
449 aa  352  5.9999999999999994e-96  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.235348  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0927  replicative DNA helicase  43.2 
 
 
465 aa  351  1e-95  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0928  replicative DNA helicase  42.79 
 
 
449 aa  352  1e-95  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000728284  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0998  replicative DNA helicase  42.51 
 
 
456 aa  351  2e-95  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1353  replicative DNA helicase  44.04 
 
 
450 aa  350  2e-95  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3301  replicative DNA helicase  44.7 
 
 
440 aa  351  2e-95  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.21798  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1349  primary replicative DNA helicase  42.95 
 
 
513 aa  349  5e-95  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00606931  normal  0.114778 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4929  replicative DNA helicase  44.24 
 
 
444 aa  349  6e-95  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000797839  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3184  replicative DNA helicase  40.95 
 
 
445 aa  349  7e-95  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.998408  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0134  primary replicative DNA helicase  43.12 
 
 
444 aa  349  8e-95  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.132489  normal  0.322197 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1815  replicative DNA helicase  45.18 
 
 
446 aa  348  9e-95  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0332  replicative DNA helicase  42.37 
 
 
460 aa  347  3e-94  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9348  replicative DNA helicase  41.5 
 
 
451 aa  346  5e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.500437 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2568  primary replicative DNA helicase  41.53 
 
 
456 aa  345  1e-93  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00282826  normal  0.174192 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1735  replicative DNA helicase  43.85 
 
 
461 aa  344  2e-93  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0740032  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3350  replicative DNA helicase  41.16 
 
 
453 aa  344  2e-93  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.298617  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2211  replicative DNA helicase  42.86 
 
 
442 aa  344  2e-93  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2924  replicative DNA helicase  41.99 
 
 
459 aa  343  4e-93  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.124062  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37750  primary replicative DNA helicase  43.15 
 
 
461 aa  343  5e-93  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2027  replicative DNA helicase  43.35 
 
 
451 aa  342  7e-93  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4008  replicative DNA helicase  43.12 
 
 
453 aa  342  8e-93  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000502825  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5340  replicative DNA helicase  42.86 
 
 
449 aa  341  1e-92  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000100588  hitchhiker  0.000000000805673 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39470  primary replicative DNA helicase  41.63 
 
 
459 aa  341  1e-92  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0340273  normal  0.250985 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5261  replicative DNA helicase  42.86 
 
 
453 aa  341  2e-92  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000442873  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5321  replicative DNA helicase  42.86 
 
 
453 aa  341  2e-92  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0278999  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5149  replicative DNA helicase  42.86 
 
 
453 aa  341  2e-92  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000056604  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5165  replicative DNA helicase  42.86 
 
 
453 aa  341  2e-92  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000098375  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5578  replicative DNA helicase  42.86 
 
 
453 aa  341  2e-92  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6689500000000002e-23 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5595  replicative DNA helicase  42.86 
 
 
453 aa  340  2e-92  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000964148  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5717  replicative DNA helicase  42.86 
 
 
453 aa  341  2e-92  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000293177  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5656  replicative DNA helicase  42.86 
 
 
453 aa  341  2e-92  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000115662  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4110  primary replicative DNA helicase  39.34 
 
 
460 aa  341  2e-92  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1827  replicative DNA helicase  39.14 
 
 
481 aa  340  2.9999999999999998e-92  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.981728  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2970  replicative DNA helicase  41.14 
 
 
444 aa  340  4e-92  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2648  replicative DNA helicase  41.14 
 
 
439 aa  340  4e-92  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4175  replicative DNA helicase  42.22 
 
 
457 aa  340  4e-92  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.767502  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04796  replicative DNA helicase  42.92 
 
 
476 aa  340  5e-92  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.744907  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2519  replicative DNA helicase  41.89 
 
 
457 aa  339  5.9999999999999996e-92  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.662901  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1822  replicative DNA helicase  43.93 
 
 
469 aa  339  5.9999999999999996e-92  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0791999  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0948  hypothetical protein  41.85 
 
 
509 aa  339  8e-92  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3540  replicative DNA helicase  43.09 
 
 
454 aa  338  9e-92  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0191  replicative DNA helicase  43.98 
 
 
525 aa  338  9e-92  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.848822  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1149  replicative DNA helicase  45.56 
 
 
444 aa  338  9e-92  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000486046  hitchhiker  0.00581399 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2637  replicative DNA helicase  42.92 
 
 
476 aa  338  9.999999999999999e-92  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.415006 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0209  replicative DNA helicase  41.99 
 
 
467 aa  338  9.999999999999999e-92  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000508188  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0019  primary replicative DNA helicase  42.05 
 
 
449 aa  338  1.9999999999999998e-91  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.000143574  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3883  replicative DNA helicase  39.46 
 
 
461 aa  337  1.9999999999999998e-91  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000215257 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1693  replicative DNA helicase  41.84 
 
 
470 aa  336  5.999999999999999e-91  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1409  primary replicative DNA helicase  41.74 
 
 
456 aa  335  1e-90  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000016213  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0852  primary replicative DNA helicase  40.91 
 
 
443 aa  335  1e-90  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00845  replicative DNA helicase  43.26 
 
 
512 aa  334  2e-90  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.243087  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3273  replicative DNA helicase  41.28 
 
 
456 aa  333  3e-90  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2083  primary replicative DNA helicase  44.98 
 
 
452 aa  333  3e-90  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2382  replicative DNA helicase  42.09 
 
 
472 aa  333  3e-90  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0223  DnaB helicase  44.57 
 
 
472 aa  333  4e-90  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0137  replicative DNA helicase  42.38 
 
 
474 aa  333  4e-90  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.174045  normal  0.162999 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1097  replicative DNA helicase  39.33 
 
 
481 aa  333  4e-90  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.513997  normal  0.0220544 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4518  primary replicative DNA helicase  43.35 
 
 
452 aa  333  5e-90  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.729039  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3411  replicative DNA helicase  41.8 
 
 
454 aa  333  5e-90  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4552  replicative DNA helicase  42.44 
 
 
468 aa  332  8e-90  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.355354  normal  0.656762 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1330  primary replicative DNA helicase  41.59 
 
 
462 aa  332  1e-89  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.455664  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0006  replicative DNA helicase  42.27 
 
 
471 aa  330  3e-89  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0534  replicative DNA helicase  40.32 
 
 
458 aa  330  3e-89  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1358  replicative DNA helicase  42.76 
 
 
453 aa  330  5.0000000000000004e-89  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.059229  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0803  replicative DNA helicase  41.86 
 
 
460 aa  329  8e-89  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0774  replicative DNA helicase  42.08 
 
 
460 aa  329  8e-89  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3990  replicative DNA helicase  44.19 
 
 
444 aa  327  2.0000000000000001e-88  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000661916 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23150  primary replicative DNA helicase  39.73 
 
 
462 aa  327  2.0000000000000001e-88  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.749598  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2021  replicative DNA helicase  40.82 
 
 
508 aa  327  4.0000000000000003e-88  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00119519  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2391  replicative DNA helicase  43.05 
 
 
469 aa  327  4.0000000000000003e-88  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7308  replicative DNA helicase  42.02 
 
 
452 aa  326  5e-88  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.036629  normal  0.0750337 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1232  primary replicative DNA helicase  43.15 
 
 
473 aa  326  5e-88  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0177324 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0330  DnaB helicase  42.47 
 
 
450 aa  326  6e-88  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.850269  normal  0.345432 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2003  replicative DNA helicase  44.52 
 
 
450 aa  325  1e-87  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.282919  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1916  replicative DNA helicase  40.22 
 
 
529 aa  325  1e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1073  replicative DNA helicase  40.52 
 
 
539 aa  325  1e-87  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00005629  normal  0.377937 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1867  replicative DNA helicase  40.98 
 
 
471 aa  324  2e-87  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.745764  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1794  replicative DNA helicase  40.98 
 
 
471 aa  324  2e-87  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.549463  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2565  replicative DNA helicase  44.52 
 
 
472 aa  323  3e-87  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.76517  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3212  primary replicative DNA helicase  44.52 
 
 
472 aa  323  3e-87  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5742  replicative DNA helicase  39.96 
 
 
460 aa  322  6e-87  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.130016 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0892  replicative DNA helicase  43.05 
 
 
462 aa  322  7e-87  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0985  replicative DNA helicase  42.7 
 
 
472 aa  322  7e-87  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.701163 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0758  replicative DNA helicase  42.95 
 
 
468 aa  322  8e-87  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000129174  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7239  replicative DNA helicase  41.67 
 
 
524 aa  322  8e-87  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.167922  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02520  primary replicative DNA helicase  40.09 
 
 
455 aa  322  8e-87  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3095  replicative DNA helicase  41.08 
 
 
446 aa  322  9.000000000000001e-87  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0322768  normal  0.184151 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>