More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene WD1050 on replicon NC_002978
Organism: Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002978  WD1050  recombinase A  100 
 
 
355 aa  721    Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0887  recombinase A  78.37 
 
 
357 aa  560  1e-158  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1109  recombinase A  76.97 
 
 
357 aa  555  1e-157  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2403  recA protein  73.29 
 
 
343 aa  496  1e-139  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.104177  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1202  recombinase A  70.86 
 
 
361 aa  493  9.999999999999999e-139  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2819  recombinase A  71.34 
 
 
366 aa  491  9.999999999999999e-139  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.737949  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1986  recombinase A  68.1 
 
 
361 aa  494  9.999999999999999e-139  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1165  recombinase A  70.86 
 
 
424 aa  493  9.999999999999999e-139  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.165606  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3524  recA protein  71.43 
 
 
355 aa  489  1e-137  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00288101 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2558  recombinase A  68.71 
 
 
362 aa  484  1e-136  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.352201  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0597  recombinase A  65.8 
 
 
356 aa  487  1e-136  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.408398  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0727  recombinase A  71.03 
 
 
347 aa  483  1e-135  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.794192  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0530  recA protein  70.72 
 
 
327 aa  483  1e-135  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1958  recombinase A  69.33 
 
 
362 aa  481  1e-135  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.212458 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1263  recombinase A  70.55 
 
 
360 aa  484  1e-135  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.778933  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2169  recombinase A  69.02 
 
 
364 aa  481  1e-135  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.423968  normal  0.0596488 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0513  recA protein  67.07 
 
 
350 aa  480  1e-134  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.213728 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4080  recombinase A  67.48 
 
 
361 aa  478  1e-134  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1522  recombinase A  67.16 
 
 
361 aa  480  1e-134  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1275  recombinase A  67.18 
 
 
356 aa  476  1e-133  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.138864  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1034  recombinase A  64.78 
 
 
343 aa  476  1e-133  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0682579  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1006  recA protein  67.9 
 
 
359 aa  475  1e-133  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0512  recombinase A  66.06 
 
 
357 aa  477  1e-133  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.759794  normal  0.922847 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2578  recA protein  69.11 
 
 
365 aa  473  1e-132  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0869161  normal  0.0795722 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1725  recombinase A  67.6 
 
 
360 aa  474  1e-132  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.971685  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1280  recombinase A  66.56 
 
 
362 aa  469  1.0000000000000001e-131  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.118352  normal  0.176518 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1986  recombinase A  65.95 
 
 
357 aa  468  1.0000000000000001e-131  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.285484  normal  0.795588 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4376  recombinase A  66.56 
 
 
363 aa  467  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0291  recA protein  68.28 
 
 
363 aa  464  9.999999999999999e-131  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0355806  hitchhiker  0.00687417 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3741  recombinase A  65.28 
 
 
364 aa  464  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.709907 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1616  recombinase A  66.87 
 
 
362 aa  468  9.999999999999999e-131  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5503  recA protein  68.28 
 
 
363 aa  464  9.999999999999999e-131  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.468538  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5453  recombinase A  66.26 
 
 
362 aa  466  9.999999999999999e-131  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.658876  normal  0.17766 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2228  recA protein  69.04 
 
 
363 aa  464  9.999999999999999e-131  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.522428  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2601  recA protein  68.42 
 
 
366 aa  462  1e-129  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.2342 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1288  recombinase A  66.15 
 
 
348 aa  464  1e-129  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1567  recombinase A  66.87 
 
 
363 aa  464  1e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000432957 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1730  recombinase A  65.95 
 
 
363 aa  462  1e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00591118  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1616  recA protein  62.03 
 
 
348 aa  463  1e-129  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.445296  normal  0.968936 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1230  recombinase A  65.34 
 
 
357 aa  464  1e-129  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.460816  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2824  recA protein  68.42 
 
 
366 aa  462  1e-129  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.217843  normal  0.126726 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2629  recA protein  68.42 
 
 
366 aa  462  1e-129  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1610  recA protein  65.22 
 
 
390 aa  462  1e-129  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.651077 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2105  recombinase A  69.44 
 
 
357 aa  459  9.999999999999999e-129  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.577481 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0452  recombinase A  69.44 
 
 
357 aa  459  9.999999999999999e-129  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03079  recombinase A  66.77 
 
 
348 aa  458  9.999999999999999e-129  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.353429  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1927  recombinase A  62.54 
 
 
352 aa  459  9.999999999999999e-129  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1645  recombinase A  65.63 
 
 
352 aa  458  9.999999999999999e-129  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3161  recombinase A  65.64 
 
 
336 aa  459  9.999999999999999e-129  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2082  recombinase A  65.33 
 
 
347 aa  460  9.999999999999999e-129  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4134  recA protein  63.45 
 
 
345 aa  457  1e-127  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00773385  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1765  recombinase A  64.33 
 
 
348 aa  457  1e-127  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1765  recombinase A  64.33 
 
 
348 aa  457  1e-127  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0924  DNA recombination protein, RecA  65.64 
 
 
342 aa  455  1e-127  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3103  recA protein  65.23 
 
 
343 aa  456  1e-127  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000175278  normal  0.820651 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2373  recombinase A  69.44 
 
 
357 aa  457  1e-127  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.263861  normal  0.548421 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0070  recombinase A  63.39 
 
 
354 aa  453  1.0000000000000001e-126  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1267  recA protein  65.63 
 
 
358 aa  451  1.0000000000000001e-126  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.165392  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2405  recombinase A  65 
 
 
341 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38560  recombinase A  64.92 
 
 
349 aa  452  1.0000000000000001e-126  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3735  recombinase A  67.92 
 
 
338 aa  453  1.0000000000000001e-126  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1643  recombinase A  68.21 
 
 
355 aa  454  1.0000000000000001e-126  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.883064  decreased coverage  0.00000000000602005 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3630  recombinase A  67.92 
 
 
338 aa  453  1.0000000000000001e-126  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0881  recombinase A  66.16 
 
 
343 aa  453  1.0000000000000001e-126  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.115374  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3956  recA protein  65.76 
 
 
384 aa  451  1.0000000000000001e-126  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.544899  normal  0.165355 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1833  recA protein  63.74 
 
 
363 aa  451  1.0000000000000001e-126  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0352919  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0988  recombinase A  66.16 
 
 
343 aa  453  1.0000000000000001e-126  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1549  recA protein  62.99 
 
 
362 aa  452  1.0000000000000001e-126  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  unclonable  0.00000000000205683  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02549  recombinase A  63.75 
 
 
353 aa  449  1e-125  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0190601  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0456  recA protein  64.35 
 
 
358 aa  451  1e-125  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2835  recombinase A  63.75 
 
 
353 aa  449  1e-125  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0246819  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2822  recombinase A  63.75 
 
 
353 aa  449  1e-125  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0783343  decreased coverage  0.0000036093 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3138  recombinase A  63.14 
 
 
353 aa  448  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000383703 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2948  recombinase A  63.14 
 
 
353 aa  448  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3178  recombinase A  63.75 
 
 
353 aa  449  1e-125  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0943419  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3946  recombinase A  63.75 
 
 
353 aa  449  1e-125  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.44116  normal  0.835205 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1013  recombinase A  63.75 
 
 
353 aa  449  1e-125  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.580458  unclonable  0.0000000301114 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3015  recombinase A  63.14 
 
 
353 aa  448  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.288903  decreased coverage  0.0000000499102 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0440  recombinase A  63.34 
 
 
358 aa  447  1e-125  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2980  recombinase A  63.14 
 
 
353 aa  448  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.200628  decreased coverage  0.0000974758 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1592  recA protein  61.75 
 
 
347 aa  449  1e-125  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1627  recombinase A  66.36 
 
 
341 aa  451  1e-125  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00182901  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02514  hypothetical protein  63.75 
 
 
353 aa  449  1e-125  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0302057  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3732  recA protein  62.29 
 
 
358 aa  449  1e-125  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000212043 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3031  recombinase A  63.14 
 
 
353 aa  448  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00473022  hitchhiker  0.000967818 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1981  recombinase A  65.94 
 
 
349 aa  451  1e-125  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00686398 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1050  recA protein  64.74 
 
 
345 aa  449  1e-125  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0444945 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0932  recA protein  64.74 
 
 
345 aa  449  1e-125  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2983  recombinase A  63.75 
 
 
353 aa  449  1e-125  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0313902  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3174  recombinase A  63.44 
 
 
352 aa  450  1e-125  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0591186  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0990  recA protein  63.44 
 
 
353 aa  446  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000616835  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1523  recombinase A  63.69 
 
 
346 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2236  recA protein  67.18 
 
 
347 aa  447  1.0000000000000001e-124  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4075  recA protein  60.29 
 
 
358 aa  445  1.0000000000000001e-124  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0386592  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0643  recombinase A  65.95 
 
 
356 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.940587  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3964  RecA protein  61.68 
 
 
358 aa  446  1.0000000000000001e-124  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.122144  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17530  recombinase A  63.69 
 
 
346 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3179  recombinase A  66.07 
 
 
340 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0981  recA protein  61.95 
 
 
358 aa  446  1.0000000000000001e-124  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2681  recombinase A  65.54 
 
 
356 aa  442  1e-123  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.288266  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>