More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH_1109 on replicon NC_007799
Organism: Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007354  Ecaj_0887  recombinase A  94.68 
 
 		 357 aa  672    Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1109  recombinase A  100 
 
 		 357 aa  726    Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1050  recombinase A  76.97 
 
 		 355 aa  574  1.0000000000000001e-162  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2819  recombinase A  71.12 
 
 		 366 aa  495  1e-139  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.737949  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1202  recombinase A  69.78 
 
 		 361 aa  485  1e-136  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1165  recombinase A  69.78 
 
 		 424 aa  485  1e-136  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.165606  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2403  recA protein  70.19 
 
 		 343 aa  483  1e-135  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.104177  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1986  recombinase A  69.16 
 
 		 361 aa  483  1e-135  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3524  recA protein  69.78 
 
 		 355 aa  483  1e-135  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00288101 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0512  recombinase A  67.07 
 
 		 357 aa  480  1e-134  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.759794  normal  0.922847 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0727  recombinase A  68.94 
 
 		 347 aa  478  1e-134  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.794192  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1006  recA protein  68.11 
 
 		 359 aa  478  1e-134  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1958  recombinase A  68.22 
 
 		 362 aa  475  1e-133  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.212458 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1275  recombinase A  66.57 
 
 		 356 aa  477  1e-133  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.138864  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2169  recombinase A  68.54 
 
 		 364 aa  476  1e-133  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.423968  normal  0.0596488 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4080  recombinase A  68.21 
 
 		 361 aa  476  1e-133  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0513  recA protein  68.12 
 
 		 350 aa  477  1e-133  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.213728 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0597  recombinase A  67.07 
 
 		 356 aa  478  1e-133  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.408398  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2558  recombinase A  68.73 
 
 		 362 aa  475  1e-133  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.352201  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0291  recA protein  68.18 
 
 		 363 aa  472  1e-132  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0355806  hitchhiker  0.00687417 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1522  recombinase A  67.91 
 
 		 361 aa  471  1e-132  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1263  recombinase A  67.8 
 
 		 360 aa  471  1e-132  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.778933  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1034  recombinase A  66.15 
 
 		 343 aa  472  1e-132  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0682579  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5503  recA protein  68.18 
 
 		 363 aa  471  1e-132  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.468538  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2228  recA protein  68.29 
 
 		 363 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.522428  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1280  recombinase A  66.87 
 
 		 362 aa  469  1.0000000000000001e-131  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.118352  normal  0.176518 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0530  recA protein  70.53 
 
 		 327 aa  471  1.0000000000000001e-131  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1986  recombinase A  66.47 
 
 		 357 aa  470  1.0000000000000001e-131  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.285484  normal  0.795588 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4376  recombinase A  67.49 
 
 		 363 aa  468  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1725  recombinase A  67.19 
 
 		 360 aa  471  1.0000000000000001e-131  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.971685  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2629  recA protein  66.97 
 
 		 366 aa  466  9.999999999999999e-131  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2601  recA protein  67.57 
 
 		 366 aa  467  9.999999999999999e-131  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.2342 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1616  recombinase A  66.87 
 
 		 362 aa  464  9.999999999999999e-131  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2578  recA protein  68.69 
 
 		 365 aa  468  9.999999999999999e-131  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0869161  normal  0.0795722 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1230  recombinase A  63.07 
 
 		 357 aa  466  9.999999999999999e-131  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.460816  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5453  recombinase A  66.87 
 
 		 362 aa  466  9.999999999999999e-131  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.658876  normal  0.17766 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1645  recombinase A  66.05 
 
 		 352 aa  465  9.999999999999999e-131  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2824  recA protein  67.57 
 
 		 366 aa  467  9.999999999999999e-131  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.217843  normal  0.126726 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3630  recombinase A  68.87 
 
 		 338 aa  464  1e-129  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3741  recombinase A  67.18 
 
 		 364 aa  464  1e-129  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.709907 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1288  recombinase A  65.05 
 
 		 348 aa  463  1e-129  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1567  recombinase A  66.87 
 
 		 363 aa  462  1e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000432957 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1730  recombinase A  66.87 
 
 		 363 aa  464  1e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00591118  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3735  recombinase A  68.87 
 
 		 338 aa  463  1e-129  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1927  recombinase A  66.05 
 
 		 352 aa  464  1e-129  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1616  recA protein  62.43 
 
 		 348 aa  462  1e-129  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.445296  normal  0.968936 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0440  recombinase A  65.86 
 
 		 358 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1592  recA protein  65.14 
 
 		 347 aa  459  9.999999999999999e-129  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3161  recombinase A  65.12 
 
 		 336 aa  458  9.999999999999999e-129  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1610  recA protein  63.47 
 
 		 390 aa  459  9.999999999999999e-129  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.651077 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1267  recA protein  66.46 
 
 		 358 aa  460  9.999999999999999e-129  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.165392  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3956  recA protein  64.83 
 
 		 384 aa  455  1e-127  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.544899  normal  0.165355 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2094  recombinase A  63.85 
 
 		 365 aa  454  1e-127  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1765  recombinase A  63.24 
 
 		 348 aa  456  1e-127  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1765  recombinase A  63.24 
 
 		 348 aa  456  1e-127  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3103  recA protein  65.34 
 
 		 343 aa  455  1e-127  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000175278  normal  0.820651 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1303  recombinase A  62.64 
 
 		 355 aa  456  1e-127  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0456  recA protein  64.17 
 
 		 358 aa  456  1e-127  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1643  recombinase A  65.03 
 
 		 355 aa  457  1e-127  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.883064  decreased coverage  0.00000000000602005 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1627  recombinase A  65.94 
 
 		 341 aa  454  1.0000000000000001e-126  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00182901  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03079  recombinase A  65.95 
 
 		 348 aa  452  1.0000000000000001e-126  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.353429  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2405  recombinase A  64.89 
 
 		 341 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0671  recombinase A  63.79 
 
 		 358 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.180955 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2082  recombinase A  62.14 
 
 		 347 aa  452  1.0000000000000001e-126  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3295  recombinase A  65.26 
 
 		 358 aa  451  1.0000000000000001e-126  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.303399  normal  0.877549 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1050  recA protein  64.02 
 
 		 345 aa  451  1e-125  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0444945 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4075  recA protein  62.35 
 
 		 358 aa  449  1e-125  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0386592  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0988  recombinase A  63.8 
 
 		 343 aa  449  1e-125  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0017  recombinase A  64.39 
 
 		 356 aa  449  1e-125  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0810  recombinase A  64.39 
 
 		 356 aa  449  1e-125  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4134  recA protein  62.17 
 
 		 345 aa  450  1e-125  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00773385  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0272  recombinase A  64.39 
 
 		 356 aa  449  1e-125  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2681  recombinase A  64.09 
 
 		 356 aa  447  1e-125  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.288266  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0971  recombinase A  64.39 
 
 		 356 aa  449  1e-125  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0924  DNA recombination protein, RecA  64.22 
 
 		 342 aa  451  1e-125  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0452  recombinase A  67.27 
 
 		 357 aa  450  1e-125  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2404  recombinase A  64.39 
 
 		 356 aa  449  1e-125  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2105  recombinase A  67.27 
 
 		 357 aa  450  1e-125  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.577481 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4108  recA protein  62.04 
 
 		 358 aa  448  1e-125  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.633837  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0643  recombinase A  64.39 
 
 		 356 aa  450  1e-125  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.940587  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0616  recombinase A  64.29 
 
 		 364 aa  450  1e-125  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0258  recA protein  65.45 
 
 		 361 aa  451  1e-125  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2041  recombinase A  64.09 
 
 		 356 aa  447  1e-125  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.461458  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2672  recombinase A  64.39 
 
 		 356 aa  449  1e-125  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.996925  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0814  recombinase A  64.39 
 
 		 356 aa  449  1e-125  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.538126  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0932  recA protein  64.02 
 
 		 345 aa  451  1e-125  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2652  recombinase A  64.09 
 
 		 356 aa  447  1e-125  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0881  recombinase A  63.8 
 
 		 343 aa  449  1e-125  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.115374  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1549  recA protein  60.91 
 
 		 362 aa  445  1.0000000000000001e-124  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  unclonable  0.00000000000205683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2373  recombinase A  66.97 
 
 		 357 aa  447  1.0000000000000001e-124  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.263861  normal  0.548421 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0676  recA protein  64.8 
 
 		 347 aa  446  1.0000000000000001e-124  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00169949  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0527  recombinase A  63.61 
 
 		 353 aa  444  1.0000000000000001e-124  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.000554316  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0650  recombinase A  64.09 
 
 		 357 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.590321  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3964  RecA protein  61.73 
 
 		 358 aa  445  1.0000000000000001e-124  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.122144  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4685  recA protein  62.96 
 
 		 377 aa  447  1.0000000000000001e-124  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  unclonable  0.0000000254393  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2573  recombinase A  63.5 
 
 		 359 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.803783  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3732  recA protein  65.22 
 
 		 358 aa  447  1.0000000000000001e-124  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000212043 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1981  recombinase A  64.62 
 
 		 349 aa  445  1.0000000000000001e-124  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00686398 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3179  recombinase A  65.47 
 
 		 340 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38560  recombinase A  63.5 
 
 		 349 aa  445  1.0000000000000001e-124  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>