119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_1473 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_1473  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  100 
 
 
341 aa  656    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0301891 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0540  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  47.04 
 
 
348 aa  263  3e-69  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.855792  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0523  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  47.04 
 
 
348 aa  262  6e-69  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0837  leucine-rich repeat-containing protein  37.45 
 
 
1085 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2223  hypothetical protein  39.35 
 
 
347 aa  171  1e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.173641 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1220  internalin  38.89 
 
 
765 aa  147  3e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.359434  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1419  putative internalin  38.89 
 
 
779 aa  147  3e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.131072 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1246  internalin  38.89 
 
 
542 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1245  NEAr transporter  36.03 
 
 
766 aa  144  2e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1485  putative internalin  36.44 
 
 
766 aa  144  2e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3962  putative internalin  36.03 
 
 
760 aa  144  2e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.769038  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1444  internalin, putative  36.03 
 
 
755 aa  144  3e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.101045  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1222  internalin  37.96 
 
 
772 aa  144  3e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.347362  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1382  putative internalin  35.63 
 
 
760 aa  143  5e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19830  leucine-rich repeat protein  34.11 
 
 
531 aa  131  2.0000000000000002e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1864  leucine-rich protein  40 
 
 
1266 aa  130  3e-29  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4750  internalin protein  37.38 
 
 
995 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000909405 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0459  internalin protein  34.82 
 
 
1112 aa  129  6e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.695574  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0520  internalin  34.82 
 
 
1070 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.753967  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0552  internalin  34.82 
 
 
1070 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.166539  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1815  leucine-rich repeat-containing protein  37.02 
 
 
772 aa  128  1.0000000000000001e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000180506  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0607  internalin, putative  38.5 
 
 
1088 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16430  hypothetical protein  36.51 
 
 
643 aa  124  3e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.425088  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3007  leucine-rich repeat-containing protein  37.14 
 
 
789 aa  121  1.9999999999999998e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.165879 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3049  leucine-rich repeat-containing protein  37.14 
 
 
789 aa  121  1.9999999999999998e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2587  peptidase M56 BlaR1  34.07 
 
 
858 aa  115  1.0000000000000001e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1202  internalin-related protein  34.36 
 
 
399 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.83099 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0588  internalin protein  35.85 
 
 
994 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.887348  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0918  internalin-related protein  29.87 
 
 
399 aa  114  3e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.482168 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3741  hypothetical protein  30.77 
 
 
421 aa  110  3e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.162842  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0608  internalin protein  35.38 
 
 
1012 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0682  internalin protein  34.43 
 
 
993 aa  109  6e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000101433  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2500  leucine-rich repeat-containing protein  32.33 
 
 
1351 aa  109  7.000000000000001e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0463  internalin protein  34.91 
 
 
954 aa  108  1e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0349325  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0810  internalin-related protein  31.49 
 
 
400 aa  107  2e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.448764  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0892  internalin-related protein  30.6 
 
 
467 aa  107  4e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1265  internalin-related protein  30.8 
 
 
400 aa  106  5e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.805237  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1379  leucine-rich repeat-containing protein  30.11 
 
 
1052 aa  105  1e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0467  cell wall anchor domain-containing protein  35.38 
 
 
1011 aa  105  1e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19840  leucine-rich repeat protein  31.76 
 
 
284 aa  104  3e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10088  protein phosphatase PP1 regulatory subunit Sds22, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G04800)  36.11 
 
 
355 aa  97.1  4e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.580332  normal  0.688338 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1551  leucine-rich repeat protein  31.84 
 
 
399 aa  94.7  2e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.823905  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3230  hypothetical protein  29.09 
 
 
718 aa  92  1e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00921587  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0907  protein of unknown function/lipoprotein, putative  32.08 
 
 
877 aa  89.7  6e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1193  internalin-related protein  31.06 
 
 
400 aa  89.7  6e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0638484  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2055  leucine-rich protein  31.4 
 
 
565 aa  85.9  9e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.805099  normal  0.572158 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1557  hypothetical protein  29.02 
 
 
498 aa  83.6  0.000000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000266916 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0527  hypothetical protein  30.74 
 
 
312 aa  79.3  0.00000000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1404  hypothetical protein  36.18 
 
 
1231 aa  75.9  0.0000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.868224 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2585  hypothetical protein  33.33 
 
 
692 aa  75.9  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0674734  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7693  Phosphoprotein phosphatase  29.06 
 
 
1263 aa  75.5  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3253  small GTP-binding protein  33.6 
 
 
867 aa  75.1  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2893  chitinase II  38.05 
 
 
587 aa  73.6  0.000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000583173  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1493  small GTP-binding protein domain-containing protein  31.78 
 
 
1107 aa  72.8  0.000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2066  leucine-rich repeat protein  33.21 
 
 
508 aa  72  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2608  hypothetical protein  37.27 
 
 
197 aa  71.6  0.00000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1060  leucine-rich repeat protein  32.89 
 
 
205 aa  70.5  0.00000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0894682 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2057  leucine-rich repeat protein  33.94 
 
 
482 aa  68.9  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.723392  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_67704  regulatory subunit for the mitotic function of type I protein phosphatase  30.51 
 
 
384 aa  67  0.0000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006686  CND03590  enzyme regulator, putative  32.49 
 
 
374 aa  66.2  0.0000000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.733317  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2306  leucine-rich repeat-containing protein  32.09 
 
 
863 aa  65.5  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.98495 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1158  leucine-rich repeat-containing protein  26.05 
 
 
539 aa  65.9  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0603774  normal  0.76428 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_14518  predicted protein  29.33 
 
 
279 aa  65.5  0.000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0602  two component regulator  30.45 
 
 
2491 aa  64.3  0.000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4586  putative signal transduction protein with Nacht domain  28.91 
 
 
1086 aa  63.5  0.000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2048  glycoprotein  27.98 
 
 
528 aa  62.8  0.000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3344  hypothetical protein  32.74 
 
 
892 aa  62.4  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.952611  hitchhiker  0.00915052 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28748  predicted protein  31.03 
 
 
935 aa  61.6  0.00000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1882  hypothetical protein  33.71 
 
 
1744 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.44453  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4481  Ig domain protein  37.5 
 
 
637 aa  62  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.174755  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2449  hypothetical protein  33.16 
 
 
886 aa  59.7  0.00000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0222  normal 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_73960  predicted protein  30.84 
 
 
1335 aa  58.9  0.0000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.847897 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2183  hypothetical protein  28.52 
 
 
571 aa  58.2  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4041  small GTP-binding protein  33.47 
 
 
937 aa  57  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.668162  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3343  hypothetical protein  34.01 
 
 
238 aa  56.6  0.0000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.960237  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02459  conserved leucine-rich repeat protein (AFU_orthologue; AFUA_6G10390)  33.1 
 
 
1780 aa  55.5  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.186892 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1392  putative signal transduction protein with Nacht domain  27.69 
 
 
1091 aa  55.5  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3999  small GTP-binding protein  33.47 
 
 
937 aa  55.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_2593  predicted protein  30.53 
 
 
304 aa  54.7  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.319799  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4909  Miro domain protein  34.44 
 
 
1015 aa  54.3  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.903502 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1476  Miro domain protein  41.51 
 
 
998 aa  53.9  0.000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.184541  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03913  Adenylate cyclasePutative uncharacterized protein (EC 4.6.1.1); [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8NJJ8]  26.92 
 
 
2132 aa  53.5  0.000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.508421 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3798  small GTP-binding protein  32.76 
 
 
1041 aa  53.5  0.000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0604  PKD domain-containing protein  31.78 
 
 
1290 aa  53.5  0.000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7397  NTPase (NACHT family)-like protein  29.65 
 
 
1106 aa  53.5  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.676249  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2003  internalin-related protein  31.69 
 
 
424 aa  53.1  0.000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00000199876  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1045  hypothetical protein  40 
 
 
356 aa  53.5  0.000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0229946 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3264  hypothetical protein  31.58 
 
 
452 aa  52.4  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1105  hypothetical protein  29.49 
 
 
314 aa  52  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000125481  normal  0.311601 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1195  putative leucine rich repeat protein  32.58 
 
 
204 aa  50.4  0.00004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0953  hypothetical protein  27.27 
 
 
310 aa  50.8  0.00004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6120  hypothetical protein  28.28 
 
 
211 aa  50.1  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_92844  predicted protein  30.83 
 
 
255 aa  50.1  0.00006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.67948  normal  0.862336 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2618  hypothetical protein  29.25 
 
 
165 aa  48.5  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0431913  normal 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_1199  predicted protein  30.08 
 
 
486 aa  47.8  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2648  hypothetical protein  32.06 
 
 
1298 aa  47.4  0.0003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.472601 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_67440  adenylate cyclase (ATP pyrophosphate-lyase) (Adenylyl cyclase)  28.57 
 
 
1749 aa  47.4  0.0003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01220  hypothetical protein  26.02 
 
 
432 aa  47.4  0.0004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1833  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  27.91 
 
 
476 aa  47.4  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.113448  normal  0.602761 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46346  predicted protein  25.6 
 
 
716 aa  46.6  0.0006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0737232  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>