More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_3560 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_3560  multi-sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 
712 aa  1453    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.348943  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4419  multi-sensor hybrid histidine kinase  48.85 
 
 
654 aa  508  9.999999999999999e-143  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.386835 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4753  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.23 
 
 
630 aa  424  1e-117  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3580  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.38 
 
 
1428 aa  412  1e-114  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.506123  normal  0.532587 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0366  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  39.3 
 
 
1081 aa  414  1e-114  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3043  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.55 
 
 
1122 aa  412  1e-113  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000641159  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4343  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.37 
 
 
759 aa  406  1.0000000000000001e-112  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.77937  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2816  multi-sensor hybrid histidine kinase  48.36 
 
 
682 aa  405  1e-111  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0864703 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0225  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.42 
 
 
1418 aa  402  9.999999999999999e-111  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.180068  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3071  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.64 
 
 
1222 aa  393  1e-108  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0997499 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0320  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.04 
 
 
838 aa  395  1e-108  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.88782 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3771  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.12 
 
 
714 aa  390  1e-107  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.756709  normal  0.201817 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0788  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.9 
 
 
634 aa  392  1e-107  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1343  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.04 
 
 
576 aa  387  1e-106  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.413012  normal  0.0352192 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0198  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.83 
 
 
1344 aa  381  1e-104  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.592297 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0674  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.46 
 
 
1021 aa  380  1e-104  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3579  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.12 
 
 
1432 aa  370  1e-101  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.133683  normal  0.981214 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2408  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.21 
 
 
647 aa  370  1e-101  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.385618  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2234  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.46 
 
 
935 aa  369  1e-100  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2693  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.53 
 
 
873 aa  365  2e-99  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1351  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.44 
 
 
774 aa  362  2e-98  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0462938  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0435  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.15 
 
 
703 aa  358  1.9999999999999998e-97  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1127  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  35.03 
 
 
989 aa  346  7e-94  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.476664 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0933  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.78 
 
 
760 aa  340  4e-92  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.964864  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0945  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.65 
 
 
926 aa  335  2e-90  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2379  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.85 
 
 
1509 aa  329  1.0000000000000001e-88  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2659  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.61 
 
 
1070 aa  323  5e-87  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.337944  normal  0.276356 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3457  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.4 
 
 
1070 aa  321  3e-86  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4428  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.49 
 
 
622 aa  320  3.9999999999999996e-86  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.724504 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3256  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.04 
 
 
802 aa  307  5.0000000000000004e-82  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0463  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.72 
 
 
642 aa  294  3e-78  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.683271 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2865  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.55 
 
 
853 aa  295  3e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1337  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.88 
 
 
822 aa  294  5e-78  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.121372 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2401  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.93 
 
 
991 aa  293  6e-78  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.986059 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3966  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.7 
 
 
677 aa  293  8e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000186378 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3878  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.36 
 
 
673 aa  293  9e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3265  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.39 
 
 
1106 aa  292  1e-77  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1351  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.52 
 
 
859 aa  291  3e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000388966 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3272  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.01 
 
 
962 aa  291  4e-77  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0842  sensory box histidine kinase/response regulator  32.07 
 
 
787 aa  290  5.0000000000000004e-77  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.220519  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1414  sensory box histidine kinase/response regulator  34.31 
 
 
844 aa  290  8e-77  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00865388  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0272  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.08 
 
 
1113 aa  288  2.9999999999999996e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1396  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.91 
 
 
721 aa  288  2.9999999999999996e-76  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.814379  normal  0.333041 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2137  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.91 
 
 
1260 aa  287  4e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2639  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.76 
 
 
817 aa  287  5e-76  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2406  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.38 
 
 
773 aa  286  1.0000000000000001e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0257  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.93 
 
 
1108 aa  284  3.0000000000000004e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000213837 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2707  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.57 
 
 
776 aa  285  3.0000000000000004e-75  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2079  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.09 
 
 
1260 aa  283  6.000000000000001e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.8885299999999995e-20 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2781  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.29 
 
 
897 aa  281  2e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1904  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.8 
 
 
651 aa  281  3e-74  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.326262  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2373  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.91 
 
 
769 aa  280  5e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3150  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.7 
 
 
1309 aa  280  5e-74  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1812  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.93 
 
 
773 aa  278  2e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.021882 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3112  putative PAS/PAC sensor protein  33.88 
 
 
733 aa  279  2e-73  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0685  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.14 
 
 
770 aa  278  2e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000495863 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0672  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.26 
 
 
770 aa  278  3e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3722  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.92 
 
 
845 aa  277  4e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0181  two component signal transduction histidine kinase/response regulator hybrid  32.78 
 
 
749 aa  276  8e-73  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2943  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.77 
 
 
981 aa  276  8e-73  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.677183 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3014  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.8 
 
 
1132 aa  276  1.0000000000000001e-72  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.829917  hitchhiker  0.00701741 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3264  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.33 
 
 
1134 aa  275  2.0000000000000002e-72  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1398  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.35 
 
 
853 aa  274  3e-72  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1555  sensory box histidine kinase/response regulator  36.8 
 
 
1112 aa  274  4.0000000000000004e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1192  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.25 
 
 
912 aa  274  5.000000000000001e-72  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.444 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1138  Signal transduction histidine kinase  39.51 
 
 
888 aa  273  6e-72  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.408537  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3617  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.1 
 
 
845 aa  273  6e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2011  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.05 
 
 
814 aa  273  1e-71  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.866808 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3132  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.12 
 
 
743 aa  272  1e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.583735  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3277  ATP-binding region, ATPase-like  33.8 
 
 
812 aa  272  2e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.438196  hitchhiker  0.00707292 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2523  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.4 
 
 
1194 aa  271  2.9999999999999997e-71  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0700  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.2 
 
 
1419 aa  271  4e-71  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.81616  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1283  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.14 
 
 
1322 aa  268  2e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000035266 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2001  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.16 
 
 
796 aa  268  2e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  7.77001e-34 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2619  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.19 
 
 
789 aa  268  2.9999999999999995e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0163342  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4534  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.19 
 
 
789 aa  268  2.9999999999999995e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00178045  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1138  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.43 
 
 
983 aa  268  2.9999999999999995e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0364  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.9 
 
 
1013 aa  268  2.9999999999999995e-70  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2717  sensory box histidine kinase/response regulator  32.96 
 
 
676 aa  267  4e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.230475  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2939  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.5 
 
 
1279 aa  267  4e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.111329  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0801  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.09 
 
 
953 aa  267  4e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.220837  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3263  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.54 
 
 
639 aa  267  5e-70  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3268  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.54 
 
 
1079 aa  266  8e-70  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0044  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.9 
 
 
810 aa  265  1e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2152  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.83 
 
 
670 aa  266  1e-69  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.381885  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2264  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.48 
 
 
692 aa  266  1e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1910  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.4 
 
 
994 aa  266  1e-69  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2226  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.28 
 
 
796 aa  266  1e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000698755  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2554  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.78 
 
 
551 aa  264  3e-69  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.344016  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1740  multi-sensor hybrid histidine kinase / cell cycle control histidine kinase CckA  36.4 
 
 
866 aa  265  3e-69  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0223971  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1432  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.9 
 
 
810 aa  265  3e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000530681 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1952  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.06 
 
 
692 aa  264  4e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3668  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.61 
 
 
653 aa  263  6e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0873112  normal  0.0648404 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2764  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.51 
 
 
1275 aa  263  6.999999999999999e-69  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0647988  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0119  PAS sensor protein  30.18 
 
 
1561 aa  263  6.999999999999999e-69  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2358  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  33.14 
 
 
916 aa  263  8e-69  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2685  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.56 
 
 
660 aa  262  1e-68  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.41147  normal  0.190122 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3362  PAS sensor protein  32.41 
 
 
678 aa  263  1e-68  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3771  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.67 
 
 
874 aa  262  2e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0139218  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1171  histidine kinase  39.36 
 
 
527 aa  261  2e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00415214  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>