119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_2120 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_2120  fibronectin type III domain-containing protein  100 
 
 
1178 aa  2393    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.348152  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4612  immunoglobulin I-set domain-containing protein  62.64 
 
 
714 aa  417  9.999999999999999e-116  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.830673  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4618  NHL repeat-containing protein  60.8 
 
 
1026 aa  410  1.0000000000000001e-112  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0797  immunoglobulin I-set domain-containing protein  52.31 
 
 
826 aa  405  1e-111  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.431236  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1393  immunoglobulin I-set domain-containing protein  61.11 
 
 
810 aa  396  1e-108  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1394  immunoglobulin I-set domain-containing protein  60.41 
 
 
1126 aa  396  1e-108  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4617  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  58.91 
 
 
633 aa  392  1e-107  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0031  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  58.72 
 
 
701 aa  385  1e-105  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0166776 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1618  immunoglobulin I-set domain-containing protein  55.17 
 
 
540 aa  374  1e-102  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.490097  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4610  glycoside hydrolase family protein  54.26 
 
 
721 aa  376  1e-102  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4304  hypothetical protein  56.5 
 
 
920 aa  369  1e-100  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.126578  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4616  immunoglobulin I-set domain-containing protein  54.55 
 
 
408 aa  368  1e-100  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1253  peptidase C10 streptopain  55.62 
 
 
884 aa  363  1e-98  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.662646 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2042  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  58.41 
 
 
805 aa  358  2.9999999999999997e-97  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.218324 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4251  Ig family protein  53.61 
 
 
2802 aa  348  2e-94  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.676511 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3823  carbohydrate-binding CenC domain-containing protein  55.4 
 
 
1255 aa  344  5e-93  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0816549  normal  0.385041 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0327  Alpha-N-arabinofuranosidase  53.18 
 
 
1221 aa  336  2e-90  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.495752  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4126  hypothetical protein  45.35 
 
 
640 aa  334  5e-90  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.657356  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0854  immunoglobulin I-set domain-containing protein  50.72 
 
 
1607 aa  325  2e-87  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2514  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  50.15 
 
 
1383 aa  325  3e-87  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0032  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase cyclophilin type  45.78 
 
 
664 aa  318  3e-85  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.468114  decreased coverage  0.00512066 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4248  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  50.45 
 
 
1848 aa  318  4e-85  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.296495 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3237  glycoside hydrolase family protein  51.29 
 
 
1195 aa  317  9e-85  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.414155 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0556  immunoglobulin I-set domain-containing protein  50.73 
 
 
1130 aa  315  2.9999999999999996e-84  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.329662  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2184  immunoglobulin I-set domain-containing protein  49.15 
 
 
1507 aa  305  4.0000000000000003e-81  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0853  hypothetical protein  53.4 
 
 
1176 aa  291  5.0000000000000004e-77  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0561524  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3163  beta-lactamase  47.79 
 
 
862 aa  286  2.0000000000000002e-75  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.111664  normal  0.813914 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0638  PKD domain-containing protein  57.2 
 
 
1285 aa  285  4.0000000000000003e-75  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2256  immunoglobulin I-set domain-containing protein  44.03 
 
 
1183 aa  285  4.0000000000000003e-75  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0104124 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0313  immunoglobulin I-set domain-containing protein  46.78 
 
 
887 aa  283  2e-74  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.488254  normal  0.343901 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2854  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  44.32 
 
 
1292 aa  270  8e-71  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0274394  normal  0.093276 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0852  immunoglobulin I-set domain-containing protein  49.7 
 
 
1176 aa  269  2e-70  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0651  hypothetical protein  47.28 
 
 
462 aa  268  4e-70  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.168362  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0312  hypothetical protein  43.93 
 
 
3563 aa  264  6e-69  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.61904 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3151  beta-lactamase  44.76 
 
 
933 aa  259  2e-67  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3660  peptidase S41  43.82 
 
 
791 aa  255  3e-66  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.120532  normal  0.922939 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3371  GDSL family lipase  48.61 
 
 
648 aa  236  2.0000000000000002e-60  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.754827  normal  0.777259 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0346  hypothetical protein  43.02 
 
 
288 aa  190  1e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3963  hypothetical protein  44.58 
 
 
1083 aa  166  2.0000000000000002e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4469  Fibronectin type III domain protein  32.07 
 
 
624 aa  144  9.999999999999999e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1922  regulator of chromosome condensation RCC1  36.46 
 
 
1222 aa  142  4.999999999999999e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00199148  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3493  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  34.07 
 
 
921 aa  124  9.999999999999999e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00348376  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0373  alpha-tubulin suppressor and related RCC1domain-containing protein  32.96 
 
 
307 aa  100  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000297826  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0956  regulator of chromosome condensation RCC1  29.01 
 
 
743 aa  90.9  1e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.454345  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1642  peptidase M11, gametolysin  28.65 
 
 
1022 aa  87.8  0.000000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1928  hypothetical protein  32.03 
 
 
260 aa  80.9  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0196407  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1701  beta-lactamase inhibitory protein II  34.64 
 
 
298 aa  78.6  0.0000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1846  beta-lactamase inhibitory protein II  31.98 
 
 
295 aa  76.6  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1101  alpha-tubulin suppressor  32.3 
 
 
911 aa  75.9  0.000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1475  regulator of chromosome condensation, RCC1  30.14 
 
 
1919 aa  75.9  0.000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2569  regulator of chromosome condensation RCC1  29.24 
 
 
363 aa  75.1  0.000000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00852612  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0161  alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain-containing proteins-like protein  29.25 
 
 
726 aa  74.7  0.00000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1251  BNR repeat-containing protein  30.6 
 
 
2082 aa  73.6  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2565  regulator of chromosome condensation RCC1  28.9 
 
 
363 aa  73.6  0.00000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0283551  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1189  regulator of chromosome condensation, RCC1  31.01 
 
 
1679 aa  72.8  0.00000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3497  beta-lactamase inhibitory protein II  32.79 
 
 
295 aa  70.9  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1773  peptidase M11 gametolysin  23.95 
 
 
1027 aa  69.7  0.0000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0528  peptidase M11, gametolysin  25.99 
 
 
653 aa  67.8  0.000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1863  regulator of chromosome condensation RCC1  30 
 
 
593 aa  67.8  0.000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.59713  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0258  cellulosome enzyme, dockerin type I  27.36 
 
 
469 aa  67.4  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000567445  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05390  hypothetical protein  30.04 
 
 
297 aa  66.6  0.000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0529  peptidase M11, gametolysin  24.44 
 
 
653 aa  66.2  0.000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3503  hypothetical protein  24.44 
 
 
653 aa  66.2  0.000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2687  regulator of chromosome condensation, RCC1  27.21 
 
 
821 aa  65.1  0.000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00360144 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19690  hypothetical protein  28.1 
 
 
285 aa  65.5  0.000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0713543  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0506  putative outer membrane adhesin like protein  27.45 
 
 
2816 aa  63.5  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1051  regulator of chromosome condensation RCC1  29.22 
 
 
714 aa  63.5  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2688  regulator of chromosome condensation, RCC1  24.57 
 
 
818 aa  60.1  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.274478  normal  0.0258848 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3298  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  32.93 
 
 
706 aa  60.5  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1593  regulator of chromosome condensation RCC1  28.87 
 
 
558 aa  60.1  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0107683  decreased coverage  0.00113997 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16110  hypothetical protein  32.07 
 
 
280 aa  59.3  0.0000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.359187  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1556  hypothetical protein  27.59 
 
 
826 aa  58.5  0.0000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.253387  normal  0.486048 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0649  hypothetical protein  26.63 
 
 
478 aa  57  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.30778 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0110  putative lipoprotein  25.21 
 
 
1408 aa  55.5  0.000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0799  alpha-tubulin suppressor  22.1 
 
 
461 aa  55.5  0.000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.16068  decreased coverage  0.00221798 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2564  PKD domain-containing protein  26.4 
 
 
1107 aa  55.5  0.000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.543991 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0430  alpha-tubulin suppressor  25.17 
 
 
807 aa  55.1  0.000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3185  Ig family protein  26.47 
 
 
1129 aa  54.3  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2974  hypothetical protein  26.64 
 
 
576 aa  54.3  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3177  hypothetical protein  26.01 
 
 
480 aa  54.7  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1574  hypothetical protein  24.71 
 
 
501 aa  53.9  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.800091 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2304  alpha-tubulin suppressor  24.73 
 
 
461 aa  53.9  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.876578  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1179  cell wall anchor domain-containing protein  29.03 
 
 
558 aa  53.5  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3474  hypothetical protein  25.63 
 
 
478 aa  53.1  0.00003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1539  regulator of chromosome condensation RCC1  28.1 
 
 
569 aa  52.8  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.781451  hitchhiker  0.00406058 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1729  regulator of chromosome condensation RCC1  30.54 
 
 
681 aa  52.4  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.378302 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3769  hypothetical protein  25 
 
 
480 aa  52  0.00007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3578  hypothetical protein  25.63 
 
 
480 aa  52  0.00007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1055  regulator of chromosome condensation RCC1  26.55 
 
 
717 aa  51.6  0.00008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0813  hypothetical protein  25.63 
 
 
480 aa  51.2  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1193  cell wall anchor domain-containing protein  27.19 
 
 
577 aa  51.2  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.770644  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2795  hypothetical protein  27.27 
 
 
576 aa  50.4  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3646  hypothetical protein  25 
 
 
480 aa  50.4  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0151062  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1072  regulator of chromosome condensation RCC1  29.49 
 
 
553 aa  50.4  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0600576  decreased coverage  0.000288682 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3304  hypothetical protein  25.13 
 
 
478 aa  49.7  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0661  hypothetical protein  24.54 
 
 
480 aa  49.7  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2978  regulator of chromosome condensation, RCC1  28.79 
 
 
561 aa  49.7  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.310394  hitchhiker  0.0000443731 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000064  Ca2+-binding protein  23.18 
 
 
594 aa  49.7  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.731988  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2892  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain-containing protein-like protein  29.5 
 
 
835 aa  50.1  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000061  peptidase M11 gametolysin  25.31 
 
 
560 aa  48.9  0.0005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>