73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_19690 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_19690  hypothetical protein  100 
 
 		 285 aa  538  9.999999999999999e-153  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0713543  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16110  hypothetical protein  60.43 
 
 		 280 aa  310  2e-83  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.359187  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1701  beta-lactamase inhibitory protein II  50.91 
 
 		 298 aa  288  5.0000000000000004e-77  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1846  beta-lactamase inhibitory protein II  51.09 
 
 		 295 aa  288  6e-77  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3497  beta-lactamase inhibitory protein II  50.36 
 
 		 295 aa  283  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05390  hypothetical protein  53.26 
 
 		 297 aa  281  1e-74  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1928  hypothetical protein  49.16 
 
 		 260 aa  243  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0196407  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4469  Fibronectin type III domain protein  41.7 
 
 		 624 aa  129  6e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1922  regulator of chromosome condensation RCC1  37.09 
 
 		 1222 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00199148  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0956  regulator of chromosome condensation RCC1  31.94 
 
 		 743 aa  113  4.0000000000000004e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.454345  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3493  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  37.75 
 
 		 921 aa  100  3e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00348376  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1708  hypothetical protein  40.58 
 
 		 127 aa  92.8  6e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1843  hypothetical protein  39.86 
 
 		 153 aa  91.3  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.93252  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0506  putative outer membrane adhesin like protein  32.09 
 
 		 2816 aa  88.2  1e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2569  regulator of chromosome condensation RCC1  27.83 
 
 		 363 aa  84.7  0.000000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00852612  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2565  regulator of chromosome condensation RCC1  27.83 
 
 		 363 aa  84.7  0.000000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0283551  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2977  regulator of chromosome condensation RCC1  30.33 
 
 		 579 aa  74.3  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.483456  hitchhiker  0.0000496688 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2978  regulator of chromosome condensation, RCC1  30.31 
 
 		 561 aa  73.9  0.000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.310394  hitchhiker  0.0000443731 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2688  regulator of chromosome condensation, RCC1  30.67 
 
 		 818 aa  73.2  0.000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.274478  normal  0.0258848 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1863  regulator of chromosome condensation RCC1  30.48 
 
 		 593 aa  72.8  0.000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.59713  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2687  regulator of chromosome condensation, RCC1  30.86 
 
 		 821 aa  72.4  0.000000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00360144 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1189  regulator of chromosome condensation, RCC1  26.43 
 
 		 1679 aa  70.9  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0258  cellulosome enzyme, dockerin type I  26.81 
 
 		 469 aa  70.5  0.00000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000567445  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4565  hypothetical protein  32.28 
 
 		 477 aa  70.1  0.00000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.186558 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1051  regulator of chromosome condensation RCC1  28.76 
 
 		 714 aa  69.7  0.00000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4248  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  29.72 
 
 		 1848 aa  69.7  0.00000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.296495 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2567  regulator of chromosome condensation, RCC1  27.42 
 
 		 555 aa  68.9  0.00000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000116375 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1475  regulator of chromosome condensation, RCC1  27.96 
 
 		 1919 aa  66.6  0.0000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1055  regulator of chromosome condensation RCC1  30.1 
 
 		 717 aa  66.6  0.0000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2120  fibronectin type III domain-containing protein  28.1 
 
 		 1178 aa  65.5  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.348152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4383  regulator of chromosome condensation RCC1  33.85 
 
 		 546 aa  65.1  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.843021  hitchhiker  0.000224903 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3298  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  30.34 
 
 		 706 aa  63.5  0.000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1251  BNR repeat-containing protein  27.82 
 
 		 2082 aa  62.4  0.000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0373  alpha-tubulin suppressor and related RCC1domain-containing protein  34.38 
 
 		 307 aa  62  0.000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000297826  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4382  regulator of chromosome condensation, RCC1  28.87 
 
 		 556 aa  61.6  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000505558 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0421  regulator of chromosome condensation, RCC1  28.12 
 
 		 837 aa  61.2  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0560026 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1585  regulator of chromosome condensation, RCC1  32.23 
 
 		 570 aa  60.1  0.00000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.179205  normal  0.90186 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1979  regulator of chromosome condensation, RCC1  28.09 
 
 		 554 aa  60.1  0.00000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.158856  normal  0.33934 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1086  cell wall anchor domain-containing protein  28.38 
 
 		 566 aa  60.5  0.00000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.628609  normal  0.014892 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4652  regulator of chromosome condensation, RCC1  28.93 
 
 		 555 aa  58.9  0.00000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.197342  normal  0.250899 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1394  immunoglobulin I-set domain-containing protein  33.53 
 
 		 1126 aa  57.4  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2349  cell wall anchor domain-containing protein  31.07 
 
 		 551 aa  57  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.846562  normal  0.0247307 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1539  regulator of chromosome condensation RCC1  29.18 
 
 		 569 aa  57  0.0000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.781451  hitchhiker  0.00406058 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0668  regulator of chromosome condensation RCC1  27.85 
 
 		 784 aa  56.2  0.0000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000606887  hitchhiker  0.00000503803 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0799  alpha-tubulin suppressor  21.39 
 
 		 461 aa  55.8  0.0000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.16068  decreased coverage  0.00221798 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1176  regulator of chromosome condensation, RCC1  27.98 
 
 		 567 aa  55.1  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.308067  normal  0.550522 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1193  cell wall anchor domain-containing protein  27.36 
 
 		 577 aa  55.1  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.770644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1729  regulator of chromosome condensation RCC1  36.51 
 
 		 681 aa  55.5  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.378302 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0670  regulator of chromosome condensation RCC1  34.09 
 
 		 778 aa  53.9  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00126758  hitchhiker  0.0000346041 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1715  regulator of chromosome condensation, RCC1  28.07 
 
 		 563 aa  53.5  0.000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000999119 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1179  cell wall anchor domain-containing protein  28.63 
 
 		 558 aa  53.1  0.000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1593  regulator of chromosome condensation RCC1  25.77 
 
 		 558 aa  52.8  0.000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0107683  decreased coverage  0.00113997 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1101  regulator of chromosome condensation RCC1  26.34 
 
 		 1187 aa  51.2  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0264  regulator of chromosome condensation RCC1  30.6 
 
 		 792 aa  51.6  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0100345  normal  0.0222912 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4380  regulator of chromosome condensation RCC1  29.28 
 
 		 554 aa  50.8  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000261598 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1101  alpha-tubulin suppressor  23.28 
 
 		 911 aa  50.8  0.00003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0669  regulator of chromosome condensation RCC1  31.11 
 
 		 776 aa  48.9  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000957147  hitchhiker  0.000042388 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_4661  predicted protein  27.41 
 
 		 328 aa  48.5  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0235224  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4499  regulator of chromosome condensation, RCC1  27.46 
 
 		 553 aa  48.5  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.243819  hitchhiker  0.00250831 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0161  alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain-containing proteins-like protein  28.16 
 
 		 726 aa  48.1  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1538  regulator of chromosome condensation RCC1  29.13 
 
 		 560 aa  47  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00391297 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_4127  predicted protein  27.21 
 
 		 390 aa  46.2  0.0006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.048963  normal  0.0914218 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2304  alpha-tubulin suppressor  25.54 
 
 		 461 aa  46.2  0.0006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.876578  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1007  regulator of chromosome condensation RCC1  28.09 
 
 		 443 aa  45.1  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0742  copper amine oxidase domain-containing protein  27.34 
 
 		 547 aa  45.1  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6709  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  24.36 
 
 		 535 aa  44.7  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.93763 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1102  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  27.66 
 
 		 787 aa  43.5  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06510  RCC1 domain-containing protein, alpha-tubulin suppressor  34.72 
 
 		 900 aa  43.5  0.004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.10191  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0430  alpha-tubulin suppressor  25.97 
 
 		 807 aa  43.5  0.004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0960  BNR repeat-containing protein  25.38 
 
 		 449 aa  43.1  0.005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0736661  normal  0.223675 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1072  regulator of chromosome condensation RCC1  28.57 
 
 		 553 aa  43.1  0.005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0600576  decreased coverage  0.000288682 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_37043  predicted protein  26.76 
 
 		 643 aa  42.7  0.006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5337  regulator of chromosome condensation RCC1  28.65 
 
 		 618 aa  42.4  0.008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>