More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_2261 on replicon NC_009371
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009371  OSTLU_2261  predicted protein  100 
 
 
308 aa  642    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0533555  normal  0.774581 
 
 
-
 
NC_006683  CNN00820  pseudouridylate synthase, putative  34.04 
 
 
560 aa  179  5.999999999999999e-44  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_3578  predicted protein  34.02 
 
 
293 aa  142  5e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00298023  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_58964  predicted protein  46.15 
 
 
476 aa  123  4e-27  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06165  tRNA pseudouridine synthase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G08460)  46.88 
 
 
574 aa  116  5e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.306562 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_27900  predicted protein  32.79 
 
 
556 aa  94.4  2e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.864403 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1332  tRNA pseudouridine synthase A  25.89 
 
 
269 aa  83.6  0.000000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1156  tRNA pseudouridine synthase ACD  27.69 
 
 
270 aa  81.3  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.133341  normal  0.0146408 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0989  tRNA pseudouridine synthase A  27.41 
 
 
267 aa  79.7  0.00000000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1321  tRNA pseudouridine synthase A  27.59 
 
 
247 aa  78.6  0.0000000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1544  tRNA pseudouridine synthase A  27.44 
 
 
272 aa  78.2  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.14908  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0163  tRNA pseudouridine synthase A  27.1 
 
 
252 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000189836  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1815  tRNA pseudouridine synthase A  29.56 
 
 
274 aa  78.2  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0994252  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1985  tRNA pseudouridine synthase A  28.83 
 
 
274 aa  77.4  0.0000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0661846 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2269  tRNA-pseudouridine synthase I  28.16 
 
 
265 aa  77  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.584541  normal  0.109156 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1444  tRNA pseudouridine synthase A  23.28 
 
 
244 aa  77  0.0000000000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0012  tRNA pseudouridine synthase A  23.75 
 
 
246 aa  76.3  0.0000000000006  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.732766  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2322  tRNA pseudouridine synthase A  27.51 
 
 
272 aa  76.3  0.0000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0139  tRNA pseudouridine synthase A  27.82 
 
 
258 aa  76.3  0.0000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2620  tRNA pseudouridine synthase A  26.97 
 
 
306 aa  76.3  0.0000000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0142  tRNA pseudouridine synthase A  27.1 
 
 
247 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000419417  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0137  tRNA pseudouridine synthase A  27.1 
 
 
247 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000139661  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0135  tRNA pseudouridine synthase A  27.1 
 
 
247 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000154872  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0142  tRNA pseudouridine synthase A  27.1 
 
 
247 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000771013  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0155  tRNA pseudouridine synthase A  27.1 
 
 
252 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.18067e-36 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2139  tRNA pseudouridine synthase A  28.57 
 
 
274 aa  74.7  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.357252  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3997  tRNA pseudouridine synthase ACD  26.54 
 
 
270 aa  74.3  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.541279  hitchhiker  0.00061511 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0137  tRNA pseudouridine synthase A  26.72 
 
 
252 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000239358  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0217  tRNA pseudouridine synthase ACD  28.29 
 
 
276 aa  74.3  0.000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0142  tRNA pseudouridine synthase A  26.72 
 
 
247 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000629315  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5163  tRNA pseudouridine synthase A  27.1 
 
 
252 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000176686  hitchhiker  0.0000000000431811 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0173  tRNA pseudouridine synthase A  26.72 
 
 
252 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000175513  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0612  tRNA pseudouridine synthase A  27.8 
 
 
274 aa  73.9  0.000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2410  tRNA pseudouridine synthase A  27.51 
 
 
272 aa  73.9  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.293969  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0900  tRNA pseudouridine synthase A  24.43 
 
 
244 aa  73.2  0.000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000106944  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2759  tRNA pseudouridine synthase A  25.38 
 
 
261 aa  72.8  0.000000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00729091  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0100  tRNA pseudouridine synthase A  24.03 
 
 
258 aa  72.4  0.000000000008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4238  tRNA pseudouridine synthase A  28.46 
 
 
250 aa  71.6  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00146243 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1013  tRNA pseudouridine synthase A  25.38 
 
 
245 aa  72  0.00000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00481076  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1064  tRNA pseudouridine synthase A  23.62 
 
 
247 aa  71.6  0.00000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000223537  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2441  tRNA pseudouridine synthase A  25 
 
 
261 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.238005  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0223  tRNA pseudouridine synthase A  25.85 
 
 
293 aa  71.2  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00472694  normal  0.027676 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21360  pseudouridylate synthase I  27.9 
 
 
271 aa  71.6  0.00000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0418388  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0226  tRNA pseudouridine synthase A  25.85 
 
 
293 aa  70.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2273  tRNA pseudouridine synthase A  25 
 
 
263 aa  70.9  0.00000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000217948 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3303  tRNA pseudouridine synthase A  26.74 
 
 
245 aa  70.9  0.00000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0316618  normal  0.649703 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2836  tRNA pseudouridine synthase A  25 
 
 
261 aa  70.5  0.00000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0418534  hitchhiker  0.00932261 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1806  tRNA pseudouridine synthase A  25.91 
 
 
266 aa  70.9  0.00000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2123  tRNA pseudouridine synthase A  29.12 
 
 
257 aa  70.5  0.00000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.521479  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2742  tRNA pseudouridine synthase A  25 
 
 
261 aa  70.5  0.00000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0368715  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1560  tRNA pseudouridine synthase A  27.9 
 
 
302 aa  70.9  0.00000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.949883  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1486  tRNA pseudouridine synthase A  25 
 
 
261 aa  70.1  0.00000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0039876  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1617  tRNA pseudouridine synthase A  25 
 
 
261 aa  70.5  0.00000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00313277  normal 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_3550  predicted protein  29.35 
 
 
257 aa  69.7  0.00000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.658668  normal  0.123693 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1416  tRNA pseudouridine synthase A  26.56 
 
 
246 aa  69.7  0.00000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1494  tRNA pseudouridine synthase A  27.61 
 
 
259 aa  70.1  0.00000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.643957  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2308  tRNA pseudouridine synthase A  27.04 
 
 
273 aa  69.7  0.00000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.742773  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0937  tRNA pseudouridine synthase ACD  25.19 
 
 
244 aa  69.7  0.00000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2400  tRNA pseudouridine synthase ACD  26.75 
 
 
276 aa  69.7  0.00000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2040  tRNA pseudouridine synthase A  26.14 
 
 
274 aa  69.7  0.00000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.545725  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_84338  pseudouridine synthase  25.7 
 
 
465 aa  69.3  0.00000000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.188482  normal  0.052244 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0964  tRNA pseudouridine synthase A  30.12 
 
 
243 aa  69.3  0.00000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1426  tRNA pseudouridine synthase A  24.52 
 
 
261 aa  69.3  0.00000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0400831  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1491  tRNA pseudouridine synthase A  24.52 
 
 
261 aa  69.3  0.00000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.125203  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12020  pseudouridylate synthase I  25.11 
 
 
273 aa  69.3  0.00000000008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0626  tRNA pseudouridine synthase A  25.67 
 
 
252 aa  69.3  0.00000000008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.133889  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1161  tRNA pseudouridine synthase A  27.04 
 
 
271 aa  69.3  0.00000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0226119  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0020  tRNA pseudouridine synthase A  26.09 
 
 
243 aa  68.9  0.00000000009  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1248  tRNA pseudouridine synthase A  25.65 
 
 
248 aa  68.9  0.00000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3729  tRNA pseudouridine synthase A  24.89 
 
 
306 aa  68.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3352  pseudouridylate synthase  27.97 
 
 
278 aa  68.9  0.0000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23260  pseudouridylate synthase I  26.86 
 
 
346 aa  68.9  0.0000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2469  tRNA pseudouridine synthase A  27.39 
 
 
278 aa  68.6  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.371859 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1337  tRNA pseudouridine synthase A  26.77 
 
 
269 aa  68.6  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.354676  normal  0.497364 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1479  tRNA pseudouridine synthase A  24.52 
 
 
261 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0778674  normal  0.668888 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0143  tRNA pseudouridine synthase A  24.14 
 
 
248 aa  67.8  0.0000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000160558  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1625  tRNA pseudouridine synthase A  23.87 
 
 
275 aa  68.2  0.0000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.875957  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1395  tRNA pseudouridine synthase A  23.46 
 
 
261 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4942  tRNA pseudouridine synthase ACD  25.48 
 
 
272 aa  67.8  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1859  tRNA pseudouridine synthase ACD  26.55 
 
 
245 aa  68.2  0.0000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.411434  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1060  tRNA pseudouridine synthase A  25.28 
 
 
248 aa  67.4  0.0000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0336  tRNA pseudouridine synthase A  25.21 
 
 
297 aa  67.4  0.0000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0521282  decreased coverage  0.000493402 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3803  tRNA pseudouridine synthase A  25.63 
 
 
259 aa  67  0.0000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0136  tRNA pseudouridine synthase A  25.28 
 
 
247 aa  67  0.0000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000296429  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1368  tRNA pseudouridine synthase A  24.89 
 
 
276 aa  67  0.0000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0595  tRNA pseudouridine synthase A  28.4 
 
 
294 aa  66.6  0.0000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.436943 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1051  tRNA pseudouridine synthase A  26.45 
 
 
255 aa  66.2  0.0000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000873816  hitchhiker  0.00519599 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1666  tRNA pseudouridine synthase A  28.57 
 
 
261 aa  65.9  0.0000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.0056205  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0059  tRNA pseudouridine synthase A  25.87 
 
 
268 aa  65.9  0.0000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.933928  normal  0.0174964 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1421  tRNA pseudouridine synthase A  26.95 
 
 
250 aa  65.9  0.0000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.126301  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2995  tRNA pseudouridine synthase ACD  27.48 
 
 
278 aa  65.9  0.0000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00964869 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3828  tRNA pseudouridine synthase A  24.68 
 
 
244 aa  65.5  0.000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl155  tRNA pseudouridine synthase A  24.81 
 
 
251 aa  65.1  0.000000001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1305  tRNA pseudouridine synthase A  29.6 
 
 
263 aa  65.5  0.000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0505813  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0466  tRNA pseudouridine synthase A  23.62 
 
 
252 aa  65.1  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000184743  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0381  tRNA pseudouridine synthase A  29.39 
 
 
264 aa  65.5  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3462  tRNA pseudouridine synthase A  28.39 
 
 
261 aa  65.1  0.000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.209779  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1452  tRNA pseudouridine synthase A  23.88 
 
 
256 aa  65.9  0.000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000896278  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0744  tRNA pseudouridine synthase A  24.51 
 
 
240 aa  65.5  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1234  tRNA pseudouridine synthase A  29.2 
 
 
261 aa  65.5  0.000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.512181  normal  0.233712 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>