208 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNN00820 on replicon NC_006683
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006683  CNN00820  pseudouridylate synthase, putative  100 
 
 		 560 aa  1160    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_58964  predicted protein  42.86 
 
 		 476 aa  315  9.999999999999999e-85  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_2261  predicted protein  34.31 
 
 		 308 aa  174  2.9999999999999996e-42  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0533555  normal  0.774581 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06165  tRNA pseudouridine synthase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G08460)  51.28 
 
 		 574 aa  167  2.9999999999999998e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.306562 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_3578  predicted protein  30.35 
 
 		 293 aa  143  9e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00298023  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_27900  predicted protein  23.93 
 
 		 556 aa  79  0.0000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.864403 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1625  tRNA pseudouridine synthase A  33.59 
 
 		 275 aa  63.9  0.000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.875957  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0686  tRNA pseudouridine synthase ACD  33.33 
 
 		 246 aa  61.2  0.00000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000903127  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1355  tRNA pseudouridine synthase A  34.15 
 
 		 237 aa  59.7  0.0000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0794079  normal  0.0223344 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1675  tRNA pseudouridine synthase ACD  36.22 
 
 		 281 aa  59.3  0.0000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.352236  hitchhiker  0.000000344781 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0994  pseudouridylate synthase  30.95 
 
 		 236 aa  58.9  0.0000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1494  tRNA pseudouridine synthase A  22.73 
 
 		 259 aa  58.9  0.0000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.643957  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2995  tRNA pseudouridine synthase ACD  22.78 
 
 		 278 aa  58.2  0.0000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00964869 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_3550  predicted protein  32.59 
 
 		 257 aa  58.2  0.0000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.658668  normal  0.123693 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3371  Pseudouridine synthase I, TruA, alpha/beta domain protein  25.31 
 
 		 295 aa  57.4  0.0000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1332  tRNA pseudouridine synthase A  32.31 
 
 		 269 aa  57  0.0000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1175  tRNA pseudouridine synthase A  34.45 
 
 		 253 aa  56.6  0.000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.261971  normal  0.0900523 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2400  tRNA pseudouridine synthase ACD  33.33 
 
 		 276 aa  56.6  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2410  tRNA pseudouridine synthase A  24.2 
 
 		 272 aa  56.2  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.293969  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2322  tRNA pseudouridine synthase A  23.89 
 
 		 272 aa  56.2  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0223  tRNA pseudouridine synthase A  30.3 
 
 		 293 aa  55.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00472694  normal  0.027676 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0226  tRNA pseudouridine synthase A  30.3 
 
 		 293 aa  55.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1248  tRNA pseudouridine synthase A  21.54 
 
 		 248 aa  55.8  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17411  tRNA pseudouridine synthase A  33.86 
 
 		 268 aa  55.8  0.000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_28572  predicted protein  24.73 
 
 		 286 aa  55.8  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0301527  hitchhiker  0.000000212396 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_446  pseudouridylate synthase  34.71 
 
 		 246 aa  55.5  0.000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.00000000000332106  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1544  tRNA pseudouridine synthase A  23.57 
 
 		 272 aa  55.1  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.14908  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3729  tRNA pseudouridine synthase A  33.33 
 
 		 306 aa  55.5  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0481  tRNA pseudouridine synthase A  24.18 
 
 		 246 aa  55.1  0.000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.000000089193  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0868  tRNA pseudouridine synthase A  34.65 
 
 		 262 aa  54.7  0.000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00469579  hitchhiker  0.00315924 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1426  tRNA pseudouridine synthase A  34.33 
 
 		 261 aa  54.7  0.000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0400831  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1491  tRNA pseudouridine synthase A  34.33 
 
 		 261 aa  54.7  0.000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.125203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2742  tRNA pseudouridine synthase A  36.57 
 
 		 261 aa  54.3  0.000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0368715  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2759  tRNA pseudouridine synthase A  34.33 
 
 		 261 aa  54.3  0.000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00729091  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0504  tRNA pseudouridine synthase A  33.88 
 
 		 248 aa  53.9  0.000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00170943  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1617  tRNA pseudouridine synthase A  36.57 
 
 		 261 aa  53.9  0.000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00313277  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1060  tRNA pseudouridine synthase A  21.22 
 
 		 248 aa  53.9  0.000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1985  tRNA pseudouridine synthase A  23.9 
 
 		 274 aa  53.9  0.000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0661846 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0746  tRNA pseudouridine synthase A  32 
 
 		 247 aa  53.9  0.000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  3.57289e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0696  tRNA pseudouridine synthase A  31.88 
 
 		 259 aa  53.9  0.000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.214001  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2441  tRNA pseudouridine synthase A  34.33 
 
 		 261 aa  53.9  0.000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.238005  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2836  tRNA pseudouridine synthase A  36.57 
 
 		 261 aa  53.5  0.000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0418534  hitchhiker  0.00932261 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0217  tRNA pseudouridine synthase ACD  33.33 
 
 		 276 aa  53.5  0.00001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2081  pseudouridylate synthase  31.5 
 
 		 289 aa  53.1  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.999551 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1395  tRNA pseudouridine synthase A  22.15 
 
 		 261 aa  53.1  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1479  tRNA pseudouridine synthase A  33.58 
 
 		 261 aa  53.5  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0778674  normal  0.668888 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1560  tRNA pseudouridine synthase A  31.58 
 
 		 302 aa  53.5  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.949883  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2273  tRNA pseudouridine synthase A  29.6 
 
 		 263 aa  52.8  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000217948 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2299  pseudouridylate synthase  29.92 
 
 		 249 aa  52.4  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000390138  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1815  tRNA pseudouridine synthase A  23.87 
 
 		 274 aa  52.4  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0994252  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1421  tRNA pseudouridine synthase A  32.03 
 
 		 250 aa  52.8  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.126301  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2939  tRNA pseudouridine synthase A  30.86 
 
 		 244 aa  52.4  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1665  tRNA pseudouridine synthase A  24.19 
 
 		 293 aa  52.4  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.298328  normal  0.709625 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1859  tRNA pseudouridine synthase ACD  32.56 
 
 		 245 aa  52.8  0.00002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.411434  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2139  tRNA pseudouridine synthase A  23.87 
 
 		 274 aa  52.4  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.357252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0937  tRNA pseudouridine synthase ACD  32.56 
 
 		 244 aa  52.8  0.00002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0879  tRNA pseudouridine synthase A  21.61 
 
 		 248 aa  52  0.00003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0410  tRNA pseudouridine synthase A  23.86 
 
 		 245 aa  52  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0468  tRNA pseudouridine synthase A  30.43 
 
 		 271 aa  52  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000442967  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6020  tRNA pseudouridine synthase A  30.56 
 
 		 275 aa  52  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0748411  normal  0.102476 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1051  tRNA pseudouridine synthase A  23.29 
 
 		 276 aa  51.2  0.00004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.238902 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1568  tRNA pseudouridine synthase A  32.37 
 
 		 280 aa  51.6  0.00004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.952303  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0966  tRNA pseudouridine synthase A  32.77 
 
 		 284 aa  51.6  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.982634  normal  0.313334 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0012  tRNA pseudouridine synthase A  31.25 
 
 		 246 aa  51.2  0.00004  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.732766  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1395  tRNA pseudouridine synthase A  33.09 
 
 		 277 aa  51.2  0.00004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2717  tRNA pseudouridine synthase A  30.88 
 
 		 287 aa  51.6  0.00004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0374382 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0409  tRNA pseudouridine synthase A  23.53 
 
 		 245 aa  51.2  0.00005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.816199  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0801  tRNA pseudouridine synthase A  36.8 
 
 		 262 aa  51.2  0.00005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0247033  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01500  pseudouridylate synthase I  28.38 
 
 		 246 aa  50.8  0.00006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  8.6087e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0989  tRNA pseudouridine synthase A  34.62 
 
 		 267 aa  50.8  0.00006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02450  pseudouridylate synthase I  28.38 
 
 		 246 aa  50.8  0.00006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000086341  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1237  tRNA pseudouridine synthase ACD  28.97 
 
 		 245 aa  50.4  0.00009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0714167  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0956  tRNA pseudouridine synthase A  30.66 
 
 		 261 aa  49.7  0.0001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0850507  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2497  tRNA pseudouridine synthase A  38.4 
 
 		 271 aa  49.7  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2308  tRNA pseudouridine synthase A  22.73 
 
 		 273 aa  50.1  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.742773  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0717  tRNA pseudouridine synthase A  29.92 
 
 		 282 aa  49.7  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000371927  normal  0.874871 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1055  tRNA pseudouridine synthase A  30.66 
 
 		 261 aa  49.7  0.0001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.859222  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1380  tRNA pseudouridine synthase A  31.15 
 
 		 243 aa  50.1  0.0001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1626  tRNA pseudouridine synthase A  30.71 
 
 		 268 aa  50.1  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.895885  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0381  tRNA pseudouridine synthase A  24.35 
 
 		 264 aa  50.1  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1486  tRNA pseudouridine synthase A  35.07 
 
 		 261 aa  50.1  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0039876  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2469  tRNA pseudouridine synthase A  32.06 
 
 		 278 aa  49.7  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.371859 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0626  tRNA pseudouridine synthase A  29.1 
 
 		 252 aa  49.7  0.0001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.133889  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2714  tRNA pseudouridine synthase ACD  32.06 
 
 		 280 aa  49.7  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.971768  normal  0.823422 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0473  tRNA pseudouridine synthase A  20.45 
 
 		 245 aa  49.7  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3803  tRNA pseudouridine synthase A  23.95 
 
 		 259 aa  48.9  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0401  tRNA pseudouridine synthase A  20.45 
 
 		 245 aa  49.3  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1408  tRNA pseudouridine synthase A  31.85 
 
 		 276 aa  49.3  0.0002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.372461 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1916  tRNA pseudouridine synthase A  31.34 
 
 		 260 aa  48.9  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.392139  normal  0.974239 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2426  tRNA pseudouridine synthase A  32.26 
 
 		 246 aa  49.3  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000220887  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1790  tRNA pseudouridine synthase A  32.28 
 
 		 260 aa  48.9  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1604  tRNA pseudouridine synthase A  32.09 
 
 		 263 aa  49.3  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0139  tRNA pseudouridine synthase A  22.33 
 
 		 258 aa  49.3  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0793  tRNA pseudouridine synthase A  31.25 
 
 		 245 aa  49.7  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000229391  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1417  tRNA pseudouridine synthase A  34.65 
 
 		 270 aa  48.9  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1048  tRNA pseudouridine synthase A  32.28 
 
 		 244 aa  49.3  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000774285  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2984  tRNA pseudouridine synthase A  32.09 
 
 		 261 aa  49.3  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000426991  normal  0.427567 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2510  tRNA pseudouridine synthase A  30.34 
 
 		 270 aa  48.9  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0487  tRNA pseudouridine synthase A  20.45 
 
 		 245 aa  48.5  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2585  tRNA pseudouridine synthase A  30.23 
 
 		 275 aa  48.5  0.0003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>