71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_2618 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010718  Nther_2618  polymorphic outer membrane protein  100 
 
 
863 aa  1714    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0354  hypothetical protein  27.99 
 
 
536 aa  112  4.0000000000000004e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00332519 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3399  polymorphic outer membrane protein  34.34 
 
 
483 aa  88.2  6e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3646  polymorphic outer membrane protein  23.7 
 
 
509 aa  72  0.00000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.749989  hitchhiker  0.00730149 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1704  polymorphic outer membrane protein  31.92 
 
 
1755 aa  68.6  0.0000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.041755  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3329  polymorphic outer membrane protein  30.21 
 
 
558 aa  66.6  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000300518 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4920  hypothetical protein  32.16 
 
 
468 aa  65.1  0.000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0390615  normal  0.0715167 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4658  Cytochrome-c peroxidase  25.13 
 
 
768 aa  61.2  0.00000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.264501  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1609  hypothetical protein  32.37 
 
 
435 aa  61.2  0.00000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.44696  normal  0.0279779 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2509  hypothetical protein  31.23 
 
 
476 aa  60.8  0.00000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.16291  normal  0.0412393 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4397  hypothetical protein  29.39 
 
 
454 aa  60.5  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.792915  normal  0.0309659 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1106  hypothetical protein  27.96 
 
 
509 aa  58.9  0.0000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.875896 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0279  parallel beta-helix repeat-containing protein  26.3 
 
 
458 aa  58.5  0.0000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0201  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  27.89 
 
 
884 aa  58.2  0.0000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4370  polymorphic outer membrane protein  30.45 
 
 
450 aa  57.4  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000293469 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0320  polymorphic membrane protein  31.37 
 
 
361 aa  56.6  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.960666  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4219  hypothetical protein  25.48 
 
 
466 aa  55.1  0.000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.958199 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4376  parallel beta-helix repeat-containing protein  28.95 
 
 
464 aa  55.5  0.000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.632591  decreased coverage  0.0000519323 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2358  hypothetical protein  30.8 
 
 
477 aa  55.1  0.000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.640506  normal  0.200266 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3407  hypothetical protein  26.88 
 
 
454 aa  55.1  0.000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1206  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  25.44 
 
 
677 aa  55.1  0.000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0723  hypothetical protein  27.44 
 
 
1318 aa  54.7  0.000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.661776 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2143  cell surface protein  25 
 
 
638 aa  54.3  0.000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0254077  normal  0.694951 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1643  cell surface protein  25.09 
 
 
1200 aa  53.9  0.00001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0809  surface layer protein B  31.12 
 
 
735 aa  53.5  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3408  polymorphic outer membrane protein  30.5 
 
 
461 aa  53.5  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2283  polymorphic outer membrane protein  25.94 
 
 
1296 aa  53.5  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4375  parallel beta-helix repeat-containing protein  28.57 
 
 
465 aa  52.8  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000665337 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0754  fibronectin type III domain-containing protein  30.56 
 
 
2192 aa  52  0.00004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0067  cell surface protein  32.77 
 
 
302 aa  52  0.00005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0239  cell surface protein  28.68 
 
 
153 aa  51.2  0.00008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00514923  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1615  hypothetical protein  30.82 
 
 
452 aa  50.8  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0681298 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2670  hypothetical protein  30.26 
 
 
635 aa  50.4  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.734137  normal  0.611525 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0383  hypothetical protein  29.82 
 
 
493 aa  50.4  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0788229 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3406  parallel beta-helix repeat-containing protein  27.31 
 
 
479 aa  50.4  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.525217  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1626  periplasmic copper-binding  30 
 
 
899 aa  49.7  0.0002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0959099  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2908  periplasmic copper-binding  24.05 
 
 
422 aa  50.1  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.109404  normal  0.407024 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1619  hypothetical protein  25.41 
 
 
454 aa  49.7  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.892418  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3987  hypothetical protein  28.05 
 
 
467 aa  49.3  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2043  parallel beta-helix repeat-containing protein  31.02 
 
 
2031 aa  49.7  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0695  periplasmic copper-binding  23.2 
 
 
417 aa  48.9  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.16971  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3654  polymorphic outer membrane protein  31.2 
 
 
462 aa  48.1  0.0006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  hitchhiker  0.00892124  hitchhiker  0.00240143 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2297  putative signal peptide protein  24.23 
 
 
2742 aa  48.1  0.0006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.992598  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1787  polymorphic outer membrane protein  26.32 
 
 
1332 aa  48.1  0.0007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2766  cell surface protein  30 
 
 
409 aa  48.1  0.0007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.095819 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2853  surface layer protein B  30.67 
 
 
547 aa  48.1  0.0007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0013219  hitchhiker  0.00194524 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2897  polymorphic outer membrane protein  26.42 
 
 
459 aa  47  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.966498  normal  0.981249 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2754  cell surface glycoprotein (S-layer protein)  35.37 
 
 
341 aa  47.4  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00332846  hitchhiker  0.00111806 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3143  periplasmic copper-binding  32.8 
 
 
452 aa  47.4  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10338  probable extracellular nuclease  31.5 
 
 
2160 aa  46.2  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1020  hypothetical protein  24.81 
 
 
435 aa  46.6  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2511  polymorphic membrane protein  25.91 
 
 
477 aa  47  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.238754  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1127  hypothetical protein  25.48 
 
 
461 aa  47  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.5274  normal  0.895772 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2844  hypothetical protein  25.78 
 
 
1001 aa  47  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0777438  normal  0.0344466 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1737  nitrous oxide reductase maturation protein NosD  27.54 
 
 
428 aa  46.6  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4332  hypothetical protein  28.24 
 
 
477 aa  46.2  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.252215  normal  0.0577257 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1075  periplasmic copper-binding  25.63 
 
 
442 aa  45.8  0.004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1434  cell surface protein  29.81 
 
 
375 aa  45.8  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.195558 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3647  hypothetical protein  26.75 
 
 
464 aa  45.8  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.279677  hitchhiker  0.00645734 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0455  pectate lyase-related protein  25.89 
 
 
563 aa  45.1  0.005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1058  periplasmic copper-binding  25.35 
 
 
423 aa  45.1  0.005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1137  periplasmic copper-binding  25.35 
 
 
423 aa  45.1  0.005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0889147  normal  0.932026 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3320  hypothetical protein  28.46 
 
 
439 aa  45.4  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.11516  normal  0.143363 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4700  hypothetical protein  24.69 
 
 
2698 aa  45.1  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.709916  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4374  polymorphic outer membrane protein  30.05 
 
 
459 aa  45.1  0.006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000585185 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2929  surface layer protein B  26.15 
 
 
471 aa  45.1  0.006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0075773  hitchhiker  0.00586153 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2283  hypothetical protein  36.07 
 
 
427 aa  44.7  0.007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.275033 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2593  periplasmic protein TonB links inner and outer membranes-like  27.05 
 
 
1197 aa  44.7  0.008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0238559  normal  0.0624657 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1510  periplasmic copper-binding  26.09 
 
 
505 aa  44.7  0.008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.163469  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1640  polymorphic outer membrane protein  30.95 
 
 
767 aa  44.3  0.009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1229  hypothetical protein  29.75 
 
 
481 aa  44.3  0.01  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0257494  normal  0.865842 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>