More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A0923 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007614  Nmul_A0923  secretion protein HlyD  100 
 
 		 311 aa  642    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.00699557  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0621  secretion protein HlyD  37.36 
 
 		 245 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2356  secretion protein HlyD family protein  36.33 
 
 		 293 aa  165  8e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2674  secretion protein HlyD family protein  35.41 
 
 		 289 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0130408  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2397  secretion protein HlyD family protein  35.92 
 
 		 289 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.689244  normal  0.456873 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3234  hypothetical protein  35.77 
 
 		 309 aa  162  8.000000000000001e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.475662  normal  0.284484 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1344  secretion protein HlyD  36.98 
 
 		 237 aa  147  3e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.44179  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2174  hypothetical protein  34.41 
 
 		 261 aa  140  1.9999999999999998e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0043286  normal  0.543418 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001980  probable RND efflux membrane fusion protein  27.01 
 
 		 367 aa  84.7  0.000000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.979341  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00481  hypothetical protein  26.94 
 
 		 368 aa  85.1  0.000000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2253  secretion protein HlyD  32.77 
 
 		 398 aa  83.2  0.000000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.706134 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1776  CmeA  28.57 
 
 		 379 aa  80.5  0.00000000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000125677  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3268  HlyD family secretion protein  28.69 
 
 		 372 aa  79  0.0000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4327  HlyD family secretion protein  28.21 
 
 		 372 aa  76.6  0.0000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2627  secretion protein HlyD  30.04 
 
 		 399 aa  75.9  0.0000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.524182 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0962  secretion protein HlyD  25.21 
 
 		 405 aa  75.9  0.0000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.255558  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0372  RND family efflux transporter MFP subunit  28.21 
 
 		 372 aa  75.9  0.0000000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0090  putative multidrug transporter, HlyD family  24.22 
 
 		 368 aa  75.5  0.000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4149  RND family efflux transporter MFP subunit  27.05 
 
 		 372 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.815582  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0466  RND family efflux transporter MFP subunit  26.69 
 
 		 372 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.808341  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03344  acriflavin resistance protein  27.31 
 
 		 417 aa  73.9  0.000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1830  RND family efflux transporter MFP subunit  27.39 
 
 		 359 aa  73.9  0.000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.495597  normal  0.102007 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2553  hypothetical protein  23.97 
 
 		 368 aa  73.6  0.000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000355433  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3127  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.79 
 
 		 416 aa  73.2  0.000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1815  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.71 
 
 		 388 aa  72.8  0.000000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.100454  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1681  RND family efflux transporter MFP subunit  28.75 
 
 		 434 aa  72.4  0.000000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0776882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1930  RND family efflux transporter MFP subunit  25.72 
 
 		 388 aa  72.4  0.00000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0761316  hitchhiker  0.00258561 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1389  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.9 
 
 		 374 aa  71.2  0.00000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000158934  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2282  secretion protein HlyD  28.12 
 
 		 467 aa  71.2  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0779  RND family efflux transporter MFP subunit  27.8 
 
 		 415 aa  70.9  0.00000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.521132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0341  RND family efflux transporter MFP subunit  29.22 
 
 		 375 aa  69.7  0.00000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.666034  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3362  RND family efflux transporter MFP subunit  26.91 
 
 		 358 aa  70.1  0.00000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2097  RND family efflux transporter MFP subunit  25.78 
 
 		 391 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.902105  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3829  secretion protein HlyD  25.54 
 
 		 387 aa  69.3  0.00000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.192626  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1921  RND family efflux transporter MFP subunit  26.69 
 
 		 340 aa  69.3  0.00000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00271277  normal  0.413551 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3361  RND family efflux transporter MFP subunit  28.81 
 
 		 410 aa  69.3  0.00000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1515  RND family efflux transporter MFP subunit  24.25 
 
 		 405 aa  69.3  0.00000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5714  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.87 
 
 		 420 aa  68.6  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.171189  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01077  HlyD family secretion protein  26.61 
 
 		 376 aa  68.9  0.0000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2229  RND family efflux transporter MFP subunit  26.75 
 
 		 405 aa  68.6  0.0000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1967  RND family efflux transporter MFP subunit  26.17 
 
 		 391 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0310111  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0276  transporter, putative  28.57 
 
 		 383 aa  68.2  0.0000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1965  secretion protein HlyD  26.72 
 
 		 388 aa  68.2  0.0000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.455875 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0290  putative transporter  28.57 
 
 		 383 aa  68.2  0.0000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.507974  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6521  RND family efflux transporter MFP subunit  28.28 
 
 		 410 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.745567  normal  0.0817001 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1704  RND family efflux transporter MFP subunit  25.97 
 
 		 358 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.271919  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0753  secretion protein HlyD  23.69 
 
 		 370 aa  67  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0161  RND family efflux transporter MFP subunit  27.59 
 
 		 380 aa  67.4  0.0000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1955  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.92 
 
 		 400 aa  67  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.159137  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1999  RND family efflux transporter MFP subunit  26.59 
 
 		 390 aa  67  0.0000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00132105  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1580  RND family efflux transporter MFP subunit  29.46 
 
 		 365 aa  67  0.0000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.186167  normal  0.460313 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2584  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.94 
 
 		 421 aa  66.6  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3522  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.94 
 
 		 421 aa  66.6  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2521  RND family efflux transporter MFP subunit  24.69 
 
 		 354 aa  66.2  0.0000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.199325  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1830  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.69 
 
 		 354 aa  66.2  0.0000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000238284  normal  0.23398 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3608  secretion protein HlyD  29.63 
 
 		 400 aa  66.2  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.221607  normal  0.363906 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2514  RND family efflux transporter MFP subunit  24.69 
 
 		 354 aa  66.2  0.0000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000208657  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1629  RND family efflux transporter MFP subunit  25.58 
 
 		 358 aa  66.2  0.0000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.185382  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0031  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.3 
 
 		 392 aa  66.2  0.0000000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000323168  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3579  putative transmembrane multidrug efflux system transmembrane protein  27.91 
 
 		 414 aa  65.9  0.0000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2634  RND family efflux transporter MFP subunit  25.1 
 
 		 354 aa  65.9  0.0000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.182724  normal  0.987528 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3508  secretion protein HlyD  27.97 
 
 		 424 aa  65.9  0.0000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1857  secretion protein HlyD  26.88 
 
 		 390 aa  65.9  0.0000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.779454 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1704  RND family efflux transporter MFP subunit  25.97 
 
 		 354 aa  65.9  0.0000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0254  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.07 
 
 		 417 aa  65.1  0.000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.513446 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0358  RND family efflux transporter MFP subunit  24.52 
 
 		 372 aa  65.1  0.000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4150  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.79 
 
 		 397 aa  65.5  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00923789  hitchhiker  0.000000297953 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2543  secretion protein HlyD  24.76 
 
 		 471 aa  65.5  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.467529  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3658  multidrug resistance efflux pump  26.9 
 
 		 343 aa  65.1  0.000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2275  RND family efflux transporter MFP subunit  25.31 
 
 		 354 aa  65.5  0.000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0060878  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2043  RND family efflux transporter MFP subunit  24.91 
 
 		 404 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.148074  normal  0.931139 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2064  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.46 
 
 		 365 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2409  cobalt-zinc-cadmium resistance protein CzcB, putative  25.66 
 
 		 404 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.228901  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0247  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.28 
 
 		 380 aa  64.7  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3286  RND family efflux transporter MFP subunit  25.66 
 
 		 404 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.522349 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3475  secretion protein HlyD-like protein  22.7 
 
 		 373 aa  64.7  0.000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.555415 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3679  RND family efflux transporter MFP subunit  29.46 
 
 		 365 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0225  secretion protein HlyD  24.28 
 
 		 380 aa  64.7  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.34961  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1649  RND family efflux transporter MFP subunit  24.48 
 
 		 354 aa  63.9  0.000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.499517  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2439  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.3 
 
 		 379 aa  63.9  0.000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000851177  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00705  cation efflux system protein  26.75 
 
 		 371 aa  64.3  0.000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.333087  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2583  secretion protein HlyD family protein  27.31 
 
 		 437 aa  63.5  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.860708  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3533  RND family efflux transporter MFP subunit  26.2 
 
 		 409 aa  63.5  0.000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.722317 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1925  HlyD family secretion protein  25.58 
 
 		 354 aa  63.5  0.000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1756  acriflavin resistance protein  24.49 
 
 		 363 aa  63.5  0.000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0637221  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4014  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.49 
 
 		 362 aa  63.5  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0181773  normal  0.127593 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2071  RND efflux system membrane fusion protein  27.35 
 
 		 407 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.226746  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01922  RND efflux membrane fusion protein  22.78 
 
 		 318 aa  63.5  0.000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1374  heavy metal resistance protein CzcB  25.84 
 
 		 484 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1178  RND family efflux transporter MFP subunit  25 
 
 		 390 aa  63.2  0.000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1617  secretion protein HlyD  28.72 
 
 		 408 aa  63.2  0.000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0160623  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2275  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.2 
 
 		 427 aa  63.2  0.000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.178981 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3038  secretion protein HlyD  25.81 
 
 		 403 aa  62.8  0.000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000167095  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3969  secretion protein HlyD  26.25 
 
 		 407 aa  62.4  0.000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0953607  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2151  RND family efflux transporter MFP subunit  28.44 
 
 		 471 aa  62.4  0.000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.563694  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2259  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.09 
 
 		 397 aa  62  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.141283  normal  0.411522 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5686  RND family efflux transporter MFP subunit  23.81 
 
 		 401 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.214167 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1047  RND family efflux transporter subunit MFP  24.72 
 
 		 461 aa  62  0.00000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0423833  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5875  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.21 
 
 		 407 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0955286  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4006  RND family efflux transporter MFP subunit  28.02 
 
 		 386 aa  61.6  0.00000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>