More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_0015 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013922  Nmag_0015  MscS Mechanosensitive ion channel  100 
 
 		 339 aa  670    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.189168  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1857  MscS Mechanosensitive ion channel  64.37 
 
 		 345 aa  368  1e-100  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1530  MscS Mechanosensitive ion channel  50.16 
 
 		 372 aa  312  6.999999999999999e-84  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.421553 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2760  MscS Mechanosensitive ion channel  52.77 
 
 		 344 aa  304  1.0000000000000001e-81  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.394899  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2475  MscS Mechanosensitive ion channel  52.96 
 
 		 334 aa  291  1e-77  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.288536  normal  0.672517 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0444  MscS Mechanosensitive ion channel  29.2 
 
 		 404 aa  109  7.000000000000001e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.920627  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2646  MscS mechanosensitive ion channel  29.82 
 
 		 322 aa  108  9.000000000000001e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0951  MscS Mechanosensitive ion channel  27.27 
 
 		 341 aa  103  6e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2229  MscS Mechanosensitive ion channel  29.86 
 
 		 400 aa  101  2e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.224666  normal  0.568068 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1529  MscS Mechanosensitive ion channel  29.08 
 
 		 385 aa  99  1e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1042  MscS Mechanosensitive ion channel  27.55 
 
 		 310 aa  99  1e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0091  MscS Mechanosensitive ion channel  29.33 
 
 		 297 aa  96.3  7e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2393  MscS Mechanosensitive ion channel  27.27 
 
 		 408 aa  95.5  1e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0661  MscS Mechanosensitive ion channel  28.42 
 
 		 295 aa  95.1  1e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2332  MscS Mechanosensitive ion channel  25.45 
 
 		 362 aa  93.6  5e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01983  MscS Mechanosensitive ion channel ei VT8  26.62 
 
 		 279 aa  93.2  6e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.865643  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1146  MscS mechanosensitive ion channel  32.04 
 
 		 366 aa  93.2  6e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.779955  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01095  mechanosensitive ion channel family protein  22.26 
 
 		 280 aa  92.8  8e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0015  MscS mechanosensitive ion channel  26 
 
 		 287 aa  92  1e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3271  putative small conductance mechanosensitive ion channel  27.71 
 
 		 306 aa  92.4  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.451043 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2568  MscS mechanosensitive ion channel  30.53 
 
 		 358 aa  92.4  1e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3343  mechanosensitive ion channel protein  25.37 
 
 		 813 aa  92.4  1e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.183155 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1699  MscS mechanosensitive ion channel  26.82 
 
 		 456 aa  92  1e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.254155  normal  0.22429 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1280  MscS Mechanosensitive ion channel  27.27 
 
 		 269 aa  91.3  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.138834  normal  0.117258 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1250  MscS mechanosensitive ion channel  26.7 
 
 		 361 aa  91.3  2e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000000414305  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03115  MscS Mechanosensitive ion channel  27.78 
 
 		 378 aa  90.5  4e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0384  mechanosensitive ion channel  29.86 
 
 		 752 aa  90.5  4e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2465  putative small-conductance mechanosensitive channel  32.2 
 
 		 275 aa  90.1  5e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.404234  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1942  MscS mechanosensitive ion channel  30.41 
 
 		 360 aa  89.7  6e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1633  hypothetical protein  27.48 
 
 		 364 aa  89.4  8e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.246622  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1453  MscS mechanosensitive ion channel  25.28 
 
 		 1105 aa  89.4  9e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1647  MscS Mechanosensitive ion channel  26.61 
 
 		 429 aa  88.6  1e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0949  MscS Mechanosensitive ion channel  25.48 
 
 		 273 aa  87.8  2e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2065  MscS mechanosensitive ion channel  30.86 
 
 		 359 aa  88.2  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01752  putative mechanosensitive channel protein (MscS family)  24.83 
 
 		 328 aa  88.6  2e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.249612  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2296  MscS mechanosensitive ion channel  24.63 
 
 		 270 aa  88.2  2e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2696  MscS Mechanosensitive ion channel  27.19 
 
 		 369 aa  87.8  2e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.415509  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4436  MscS mechanosensitive ion channel  24.9 
 
 		 432 aa  87.8  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.506103  normal  0.992693 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1465  hypothetical protein  31.1 
 
 		 753 aa  87.4  3e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2000  MscS Mechanosensitive ion channel  25.97 
 
 		 302 aa  87  4e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.03582 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0812  small-conductance mechanosensitive channel  25.7 
 
 		 274 aa  86.7  6e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2988  putative small-conductance mechanosensitive channel  29.33 
 
 		 806 aa  86.3  6e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000510417  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0579  MscS mechanosensitive ion channel  23.81 
 
 		 440 aa  86.3  7e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0872803  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1311  MscS Mechanosensitive ion channel  27.27 
 
 		 636 aa  86.3  7e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0757  MscS mechanosensitive ion channel  25.21 
 
 		 479 aa  86.3  7e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1339  MscS Mechanosensitive ion channel  27.27 
 
 		 636 aa  86.3  7e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000323872 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01467  mechanosensitive ion channel family protein  24.42 
 
 		 441 aa  86.3  8e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.619169  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0940  MscS mechanosensitive ion channel  26.24 
 
 		 275 aa  85.9  9e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.546965 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3392  MscS Mechanosensitive ion channel  22.73 
 
 		 833 aa  85.5  0.000000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2829  MscS mechanosensitive ion channel  25.18 
 
 		 294 aa  85.9  0.000000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0204  mechanosensitive ion channel family protein  27.38 
 
 		 271 aa  85.5  0.000000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.171183  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0202  mechanosensitive ion channel family protein  27.38 
 
 		 271 aa  85.9  0.000000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1888  MscS Mechanosensitive ion channel  25.66 
 
 		 362 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02189  hypothetical protein  29.47 
 
 		 249 aa  85.1  0.000000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0057  MscS mechanosensitive ion channel  23.75 
 
 		 437 aa  85.1  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4892  MscS Mechanosensitive ion channel  29.07 
 
 		 560 aa  84.7  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3910  hypothetical protein  26.72 
 
 		 301 aa  84.3  0.000000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1359  MscS mechanosensitive ion channel  27.21 
 
 		 275 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000000124466  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3758  MscS Mechanosensitive ion channel  26.76 
 
 		 809 aa  84.3  0.000000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.992907  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3620  MscS mechanosensitive ion channel  25.19 
 
 		 277 aa  85.1  0.000000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.812148  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1153  MscS Mechanosensitive ion channel  26.15 
 
 		 352 aa  84.7  0.000000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3058  MscS mechanosensitive ion channel  28.51 
 
 		 435 aa  84.3  0.000000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.914338 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0209  MscS mechanosensitive ion channel  26.82 
 
 		 685 aa  84.3  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0673077 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2803  MscS mechanosensitive ion channel  26.64 
 
 		 277 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1632  MscS mechanosensitive ion channel  26.55 
 
 		 877 aa  84.7  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.253181  normal  0.172693 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2137  MscS mechanosensitive ion channel  25.74 
 
 		 288 aa  84.3  0.000000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.857102  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1140  MscS mechanosensitive ion channel  29.51 
 
 		 274 aa  84.3  0.000000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.15609  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0057  MscS Mechanosensitive ion channel  25.45 
 
 		 421 aa  83.6  0.000000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.185804  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1245  MscS mechanosensitive ion channel  29.73 
 
 		 274 aa  84  0.000000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.016266  normal  0.622604 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2507  MscS mechanosensitive ion channel  27.05 
 
 		 475 aa  83.6  0.000000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0390  MscS mechanosensitive ion channel  24.25 
 
 		 274 aa  83.6  0.000000000000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.855015  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1245  ion channel protein  27.65 
 
 		 261 aa  83.2  0.000000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.306888 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0136  MscS mechanosensitive ion channel  27.89 
 
 		 451 aa  83.2  0.000000000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.100396  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1187  MscS Mechanosensitive ion channel  28.73 
 
 		 305 aa  82.8  0.000000000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0250538  hitchhiker  0.00000123969 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0360  MscS mechanosensitive ion channel  26.96 
 
 		 393 aa  82.8  0.000000000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3013  MscS mechanosensitive ion channel  25.57 
 
 		 843 aa  82.8  0.000000000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2284  MscS mechanosensitive ion channel  25.72 
 
 		 273 aa  82.4  0.00000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4521  MscS Mechanosensitive ion channel  22.26 
 
 		 291 aa  82  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.958869 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1093  MscS Mechanosensitive ion channel  27 
 
 		 389 aa  82  0.00000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.464677  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2842  MscS mechanosensitive ion channel  27.56 
 
 		 369 aa  82.4  0.00000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2942  MscS mechanosensitive ion channel  27.4 
 
 		 304 aa  82.4  0.00000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.176096  normal  0.766616 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5091  MscS Mechanosensitive ion channel  27.14 
 
 		 637 aa  82.4  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00148956  normal  0.0183068 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1345  MscS mechanosensitive ion channel  30.81 
 
 		 274 aa  82.4  0.00000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000767633  hitchhiker  0.0000248019 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03562  hypothetical protein  27.47 
 
 		 288 aa  81.3  0.00000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1895  MscS Mechanosensitive ion channel  29.61 
 
 		 286 aa  81.3  0.00000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.461855 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0585  putative small-conductance mechanosensitive channel  25.42 
 
 		 277 aa  81.3  0.00000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000591532  normal  0.0145572 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0156  MscS mechanosensitive ion channel  22.66 
 
 		 437 aa  81.3  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0421972  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3627  MscS mechanosensitive ion channel  24.32 
 
 		 268 aa  81.3  0.00000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.143912 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1518  hypothetical protein  30.2 
 
 		 732 aa  80.9  0.00000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3013  MscS mechanosensitive ion channel  30.6 
 
 		 275 aa  80.9  0.00000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000253066  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3340  small-conductance mechanosensitive channel  25.48 
 
 		 275 aa  80.1  0.00000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4420  MscS mechanosensitive ion channel  27.86 
 
 		 279 aa  80.5  0.00000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0689552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3028  MscS mechanosensitive ion channel  30.51 
 
 		 275 aa  80.5  0.00000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000445897  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1220  MscS mechanosensitive ion channel  27.59 
 
 		 305 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0859387 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3171  MscS mechanosensitive ion channel  30.05 
 
 		 275 aa  80.1  0.00000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000563606  hitchhiker  0.0000513684 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7380  mechanosensitive ion channel protein  22.81 
 
 		 439 aa  80.1  0.00000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.31736  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2101  MscS Mechanosensitive ion channel  30.81 
 
 		 299 aa  80.1  0.00000000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000172333  normal  0.177745 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1350  MscS Mechanosensitive ion channel  30.05 
 
 		 275 aa  80.1  0.00000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000676183  hitchhiker  0.0000000000523866 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002474  small-conductance mechanosensitive channel  27.07 
 
 		 288 aa  80.1  0.00000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57110  hypothetical protein  28.63 
 
 		 278 aa  79.7  0.00000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>