146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_2974 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_2974  Outer membrane autotransporter barrel  100 
 
 		 814 aa  1583    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3087  Outer membrane autotransporter barrel  71.85 
 
 		 2407 aa  834    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2512  Outer membrane autotransporter barrel  51.33 
 
 		 1019 aa  614  9.999999999999999e-175  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.150059 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4066  outer membrane autotransporter barrel domain protein  56.31 
 
 		 1081 aa  610  1e-173  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.392825  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5268  putative outer membrane autotransporter barrel  56.43 
 
 		 1078 aa  601  1e-170  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.362559 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2173  Outer membrane autotransporter barrel  55.18 
 
 		 1180 aa  593  1e-168  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.193519  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3411  Outer membrane autotransporter barrel  57.86 
 
 		 1130 aa  585  1.0000000000000001e-165  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1975  Outer membrane autotransporter  52.91 
 
 		 1111 aa  577  1.0000000000000001e-163  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4300  Outer membrane autotransporter barrel  54.19 
 
 		 987 aa  537  1e-151  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.359518 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7237  putative outer membrane autotransporter barrel precursor  52.14 
 
 		 882 aa  536  1e-151  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3958  putative outer membrane autotransporter barrel precursor  51.63 
 
 		 907 aa  484  1e-135  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1881  outer membrane autotransporter barrel domain protein  44.44 
 
 		 1532 aa  396  1e-109  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7520  outer membrane autotransporter domain-containing protein  38.8 
 
 		 1177 aa  325  3e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2708  Outer membrane autotransporter barrel  39.29 
 
 		 678 aa  233  1e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1826  outer membrane protein  56.06 
 
 		 190 aa  148  4.0000000000000006e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.400541  normal  0.391918 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2325  outer membrane autotransporter  29.47 
 
 		 1782 aa  144  7e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0522858  hitchhiker  0.00737544 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3734  Outer membrane autotransporter barrel  29.15 
 
 		 1001 aa  143  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.29394 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0480  outer membrane autotransporter barrel domain protein  28.02 
 
 		 1029 aa  140  7e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.876293  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1649  autotransporter, putative  28.64 
 
 		 1001 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2684  Outer membrane autotransporter barrel  27.42 
 
 		 1028 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.335444  unclonable  0.0000368637 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1650  autotransporter, putative  28.84 
 
 		 1055 aa  121  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3607  outer membrane autotransporter  27.5 
 
 		 1333 aa  119  1.9999999999999998e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0449  Outer membrane autotransporter barrel  27.35 
 
 		 816 aa  119  3e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.761733 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3929  outer membrane autotransporter barrel domain protein  25.73 
 
 		 1011 aa  118  3.9999999999999997e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0206  outer membrane autotransporter barrel domain protein  27.7 
 
 		 1285 aa  113  1.0000000000000001e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0891162 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4737  outer membrane autotransporter  28.23 
 
 		 1033 aa  112  2.0000000000000002e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5200  autotransporter, putative  27.67 
 
 		 986 aa  110  2e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4738  outer membrane autotransporter  27.35 
 
 		 1004 aa  109  2e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0336  Outer membrane autotransporter barrel  27.2 
 
 		 995 aa  107  1e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.988518 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2455  outer membrane autotransporter barrel domain protein  25.98 
 
 		 919 aa  104  6e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.739869  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1611  putative serine protease  28.29 
 
 		 991 aa  104  7e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5838  outer membrane autotransporter barrel domain protein  25.96 
 
 		 1227 aa  101  6e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3549  outer membrane autotransporter barrel domain protein  25.71 
 
 		 1125 aa  100  9e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0779  hypothetical protein  25.33 
 
 		 1881 aa  99.4  3e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4722  outer membrane autotransporter  26.86 
 
 		 2003 aa  99  4e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0137  outer membrane autotransporter  24.8 
 
 		 1519 aa  98.2  5e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5354  outer membrane autotransporter  28.43 
 
 		 2365 aa  98.6  5e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0199943  normal  0.02642 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1566  Outer membrane autotransporter barrel  27.11 
 
 		 1119 aa  98.2  6e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18630  putative serine protease  27.86 
 
 		 995 aa  97.8  6e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.169589 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4933  outer membrane autotransporter  28.43 
 
 		 2346 aa  97.4  8e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.348524  unclonable  0.000124828 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2875  outer membrane autotransporter barrel domain protein  27.27 
 
 		 1848 aa  96.7  2e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.189813 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4364  outer membrane autotransporter  27.5 
 
 		 2371 aa  95.9  3e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00430062 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3756  Outer membrane autotransporter barrel  27.63 
 
 		 3506 aa  95.5  4e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2876  outer membrane autotransporter  25.99 
 
 		 1550 aa  95.5  4e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4881  outer membrane autotransporter  27.55 
 
 		 2366 aa  95.1  5e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.312195  decreased coverage  0.00000000166918 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0933  outer membrane autotransporter  23.58 
 
 		 4248 aa  92.8  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2683  Outer membrane autotransporter barrel  40.49 
 
 		 983 aa  91.7  5e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.525643  hitchhiker  0.000404465 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1774  serine protease  27.55 
 
 		 1508 aa  91.7  5e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.903556  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3532  outer membrane autotransporter  27.34 
 
 		 1152 aa  90.1  1e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5637  Outer membrane autotransporter barrel  25.68 
 
 		 985 aa  88.6  4e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.217038  normal  0.176654 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0135  outer membrane autotransporter barrel domain protein  25.57 
 
 		 910 aa  88.6  5e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2865  outer membrane autotransporter  26.09 
 
 		 994 aa  88.6  5e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1114  serine protease  27.54 
 
 		 965 aa  84.7  0.000000000000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0955353  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0758  outer membrane autotransporter barrel  27.8 
 
 		 2396 aa  84  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00291921 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2844  outer membrane autotransporter barrel domain protein  33.87 
 
 		 1357 aa  83.6  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.241851  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3437  Outer membrane autotransporter  26.87 
 
 		 1179 aa  82.4  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0360967 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1004  beta strand repeat-containing protein  26.65 
 
 		 909 aa  81.3  0.00000000000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0132  outer membrane autotransporter barrel domain protein  25.83 
 
 		 972 aa  80.9  0.00000000000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6355  outer membrane autotransporter  29.43 
 
 		 4238 aa  80.5  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.51084 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0892  autotransporter, putative  26.1 
 
 		 1016 aa  80.1  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4115  outer membrane autotransporter  27.91 
 
 		 3954 aa  80.5  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6533  Outer membrane autotransporter barrel  29.53 
 
 		 3822 aa  79  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6767  outer membrane autotransporter  29.53 
 
 		 4238 aa  79.3  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1203  outer membrane autotransporter  23.63 
 
 		 1769 aa  79  0.0000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7274  hypothetical protein  25.06 
 
 		 990 aa  78.6  0.0000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3733  Outer membrane autotransporter barrel  41.88 
 
 		 1038 aa  76.6  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.418268  normal  0.311183 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2277  outer membrane autotransporter  25.3 
 
 		 980 aa  75.9  0.000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.356388 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1857  outer membrane autotransporter barrel domain protein  34.45 
 
 		 1322 aa  75.1  0.000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000638249 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1306  outer membrane autotransporter barrel domain protein  23.3 
 
 		 1489 aa  74.3  0.000000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2102  outer membrane autotransporter  23.97 
 
 		 1006 aa  74.7  0.000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1933  outer membrane autotransporter  40.91 
 
 		 1053 aa  74.7  0.000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0182819 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6464  outer membrane autotransporter  31.28 
 
 		 1459 aa  74.3  0.000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1082  outer membrane autotransporter barrel domain protein  24.06 
 
 		 915 aa  74.3  0.000000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5186  outer membrane autotransporter  23.7 
 
 		 1056 aa  72  0.00000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01745  serine protease  27.51 
 
 		 942 aa  72  0.00000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6125  beta strand repeat-containing protein  28.43 
 
 		 1325 aa  72  0.00000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2458  outer membrane autotransporter  21.71 
 
 		 1369 aa  69.3  0.0000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00908706  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3729  outer membrane autotransporter barrel domain protein  24.06 
 
 		 913 aa  68.9  0.0000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1117  beta strand repeat-containing protein  34.83 
 
 		 422 aa  65.5  0.000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3061  outer membrane autotransporter  25.67 
 
 		 677 aa  65.1  0.000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.26513 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2017  Outer membrane autotransporter barrel  25.5 
 
 		 1156 aa  65.1  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.375408 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2147  outer membrane autotransporter barrel domain protein  23.81 
 
 		 1134 aa  65.1  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2115  outer membrane autotransporter barrel domain protein  30.18 
 
 		 1694 aa  63.5  0.00000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0846995  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1554  autotransporter-associated beta strand repeat protein  31.96 
 
 		 2363 aa  63.5  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.623464 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2586  Outer membrane autotransporter barrel  25.64 
 
 		 1154 aa  62.4  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.501537  normal  0.680105 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3844  outer membrane autotransporter barrel domain protein  32.99 
 
 		 926 aa  61.6  0.00000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3162  putative hemagglutinin-related protein  24.81 
 
 		 1012 aa  59.3  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00703  serine protease  30.71 
 
 		 911 aa  59.3  0.0000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.585891  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3728  cadherin  31.86 
 
 		 3089 aa  58.5  0.0000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1478  Outer membrane autotransporter barrel  26.38 
 
 		 650 aa  58.2  0.0000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1031  outer membrane autotransporter  36.26 
 
 		 1172 aa  57.8  0.0000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0914454  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0586  outer membrane autotransporter  55.07 
 
 		 2926 aa  57.4  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1672  beta strand repeat-containing protein  49.48 
 
 		 3391 aa  57.4  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0848841 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0714  autotransporter, putative  25.74 
 
 		 763 aa  56.2  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3587  outer membrane autotransporter  21.07 
 
 		 1011 aa  56.6  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.334084  normal  0.0742158 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0308  beta strand repeat-containing protein  34.29 
 
 		 970 aa  55.1  0.000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  unclonable  0.000000319801  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0340  serine protease  34.29 
 
 		 949 aa  55.1  0.000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.000000485293  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2208  beta strand repeat-containing protein  60 
 
 		 1869 aa  54.7  0.000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.848116  normal  0.0253068 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0206  beta strand repeat-containing protein  34.29 
 
 		 970 aa  54.3  0.000008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1258  beta strand repeat-containing protein  48.94 
 
 		 550 aa  54.3  0.000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.305666  normal  0.49742 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>