More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_1301 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008553  Mthe_1301  rhomboid family protein  100 
 
 		 205 aa  402  1e-111  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0857  rhomboid-like protein  43.16 
 
 		 279 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00124204  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0205  rhomboid protein  41 
 
 		 207 aa  129  3e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0326633  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_139  rhomboid  39.53 
 
 		 190 aa  115  6e-25  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0132  rhomboid family protein  43.66 
 
 		 190 aa  113  2.0000000000000002e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0239  rhomboid family protein  48.74 
 
 		 190 aa  112  3e-24  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0124  rhomboid family protein  41.03 
 
 		 209 aa  95.1  7e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2632  Rhomboid family protein  32.16 
 
 		 310 aa  87.4  1e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2735  rhomboid family protein  37.59 
 
 		 278 aa  86.7  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.77359  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2879  Rhomboid family protein  35.71 
 
 		 224 aa  83.2  0.000000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0599  AN1-type Zinc finger protein  40.54 
 
 		 321 aa  81.6  0.000000000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.715069  normal  0.614872 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2516  Rhomboid family protein  36.18 
 
 		 276 aa  81.6  0.000000000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.258607  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1299  serine protease  32.67 
 
 		 234 aa  79  0.00000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.342347  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2451  Rhomboid family protein  35.4 
 
 		 326 aa  79  0.00000000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2907  Rhomboid family protein  34.75 
 
 		 273 aa  78.6  0.00000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0042  rhomboid family protein  38.22 
 
 		 396 aa  79  0.00000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0740017  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1658  rhomboid family protein  29.38 
 
 		 444 aa  78.2  0.00000000000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.598011  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05680  peptidase, S54 (rhomboid) family, putative  32.61 
 
 		 232 aa  77.4  0.0000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.811656  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0665  rhomboid family protein  36.08 
 
 		 200 aa  77  0.0000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2965  Rhomboid family protein  32.16 
 
 		 318 aa  76.3  0.0000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.58204  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2124  hypothetical protein  31.43 
 
 		 273 aa  75.9  0.0000000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1572  S54 family peptidase  32.89 
 
 		 260 aa  75.1  0.0000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.013038  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0267  rhomboid family protein  28.05 
 
 		 231 aa  75.1  0.0000000000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0342264 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2019  rhomboid family protein  30.22 
 
 		 226 aa  74.7  0.0000000000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.334479  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6787  Rhomboid family protein  31.64 
 
 		 280 aa  73.9  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.132625 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2531  rhomboid family protein  34.32 
 
 		 263 aa  74.7  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.751924 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2536  Rhomboid family protein  31.94 
 
 		 273 aa  74.3  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.237379  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1485  S54 family peptidase  32.24 
 
 		 260 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0631033  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0099  Rhomboid family protein  35.39 
 
 		 205 aa  73.9  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.36939  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1039  serine protease  32.24 
 
 		 202 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.224714  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1192  S54 family peptidase  32.24 
 
 		 202 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.970208  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0073  peptidase  32.24 
 
 		 229 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.104712  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3565  rhomboid-like protein  30.48 
 
 		 252 aa  73.2  0.000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0787  Rhomboid family protein  33.56 
 
 		 291 aa  73.2  0.000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.565548  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0021  S54 family peptidase  32.24 
 
 		 202 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0391  S54 family peptidase  32.24 
 
 		 202 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0331  rhomboid family protein  31.48 
 
 		 227 aa  72.4  0.000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0043  hypothetical protein  35.21 
 
 		 264 aa  72.4  0.000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0498442  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2277  Rhomboid family protein  31.65 
 
 		 283 aa  71.6  0.000000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1663  integral membrane protein  32.61 
 
 		 220 aa  71.6  0.000000000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.771185  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5920  rhomboid family protein  31.54 
 
 		 197 aa  71.6  0.000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.144977  normal  0.337945 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0276  Rhomboid family protein  30.41 
 
 		 220 aa  71.6  0.000000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.285023  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4502  rhomboid family protein  38.69 
 
 		 212 aa  71.6  0.000000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2078  rhomboid family protein  29.41 
 
 		 226 aa  71.6  0.000000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.347543  normal  0.269308 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1609  rhomboid family protein  31.88 
 
 		 220 aa  71.2  0.00000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1249  rhomboid family protein  30.58 
 
 		 231 aa  71.2  0.00000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1220  Rhomboid family protein  32.92 
 
 		 228 aa  70.9  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.231981 
 
 
-
 
NC_003296  RS02331  hypothetical protein  32.35 
 
 		 197 aa  70.1  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00930848 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0025  peptidase, S54 (rhomboid) family protein  32.24 
 
 		 234 aa  70.5  0.00000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.777845 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0892  Rhomboid family protein  32.72 
 
 		 211 aa  69.7  0.00000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.736144  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1730  rhomboid family protein  32.89 
 
 		 222 aa  69.3  0.00000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0105821  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5548  Rhomboid family protein  28.89 
 
 		 198 aa  68.9  0.00000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0778424  normal  0.596503 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4665  rhomboid-like protein  28.96 
 
 		 285 aa  68.6  0.00000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.545556 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0916  rhomboid-like protein  31.02 
 
 		 223 aa  68.2  0.00000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2942  rhomboid family protein  31.7 
 
 		 231 aa  68.2  0.00000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00611341 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3526  Rhomboid family protein  29.41 
 
 		 232 aa  67.4  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1438  rhomboid family protein  28.65 
 
 		 342 aa  67.8  0.0000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2191  Rhomboid family protein  28.06 
 
 		 262 aa  67.4  0.0000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_6645  predicted protein  32.9 
 
 		 325 aa  67.4  0.0000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0872317 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0788  Rhomboid family protein  31.13 
 
 		 288 aa  66.6  0.0000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1367  Rhomboid family protein  32.18 
 
 		 205 aa  66.6  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.870184  normal  0.274757 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3064  Rhomboid family protein  30.49 
 
 		 219 aa  66.6  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1000  rhomboid family protein  31.06 
 
 		 247 aa  66.2  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0762405 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1657  rhomboid family protein  30.41 
 
 		 222 aa  66.6  0.0000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000107341  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1705  rhomboid family protein  28.65 
 
 		 342 aa  66.2  0.0000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.745116  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3096  rhomboid family protein  30.28 
 
 		 231 aa  66.2  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.654608 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3853  Rhomboid family protein  29.86 
 
 		 261 aa  65.9  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.629137 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0774  rhomboid family protein  27.67 
 
 		 360 aa  65.9  0.0000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1885  rhomboid family protein  27.85 
 
 		 246 aa  65.9  0.0000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0593974  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2337  rhomboid family protein  33.98 
 
 		 238 aa  65.9  0.0000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.218198  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1360  Rhomboid family protein  36.3 
 
 		 492 aa  65.9  0.0000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.165337  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1130  integral membrane protein  32.47 
 
 		 196 aa  65.9  0.0000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.283045  normal  0.0126937 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1446  rhomboid family protein  32.48 
 
 		 248 aa  65.5  0.0000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.154997  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1387  hypothetical protein  34.84 
 
 		 202 aa  65.9  0.0000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0256989  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1526  Rhomboid family protein  38.32 
 
 		 221 aa  65.1  0.0000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1300  Rhomboid family protein  31.65 
 
 		 239 aa  65.1  0.0000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3032  rhomboid-like protein  33.56 
 
 		 237 aa  65.1  0.0000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.646386  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0993  rhomboid family protein  30.29 
 
 		 541 aa  65.1  0.0000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0686  rhomboid family protein  30.1 
 
 		 231 aa  64.7  0.0000000009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0078809 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07075  rhomboid family protein  25.57 
 
 		 247 aa  64.7  0.0000000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0191  Rhomboid family protein  33.09 
 
 		 386 aa  64.7  0.0000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0851  rhomboid family protein  31.4 
 
 		 241 aa  64.3  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21960  uncharacterized membrane protein  28.35 
 
 		 267 aa  63.9  0.000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00559972  decreased coverage  0.002494 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2049  uncharacterized membrane protein  32.89 
 
 		 222 aa  64.3  0.000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0199  rhomboid family protein  28.29 
 
 		 232 aa  64.3  0.000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0957331  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6097  Rhomboid family protein  31.51 
 
 		 252 aa  63.9  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0830001 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3067  Rhomboid family protein  31.03 
 
 		 248 aa  63.5  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00769632  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13218  hypothetical protein  32.64 
 
 		 216 aa  63.5  0.000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0305  rhomboid-like protein  34.84 
 
 		 230 aa  63.5  0.000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5745  Rhomboid family protein  36.2 
 
 		 207 aa  63.9  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1317  rhomboid family protein  35.42 
 
 		 202 aa  63.5  0.000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.175415  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0277  Rhomboid family protein  34.05 
 
 		 293 aa  62.8  0.000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.499185  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0884  rhomboid family protein  29.88 
 
 		 233 aa  63.2  0.000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2900  rhomboid family protein  30.92 
 
 		 215 aa  63.2  0.000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.28632  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01372  rhomboid family protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G09150)  32.21 
 
 		 571 aa  62.8  0.000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0235  rhomboid family protein  38.96 
 
 		 190 aa  62.8  0.000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00614  hypothetical protein  40.96 
 
 		 625 aa  62.4  0.000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0260  rhomboid family protein  38.96 
 
 		 190 aa  62.8  0.000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0228  Rhomboid family protein  30.77 
 
 		 237 aa  62.4  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.844894  normal  0.611688 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0736  hypothetical protein  32.54 
 
 		 362 aa  62.4  0.000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>