More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_4871 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_4871  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 308 aa  613  9.999999999999999e-175  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.412804  normal  0.401729 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4441  transcriptional regulator, AraC family  39.6 
 
 		 300 aa  182  6e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.440571  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4074  helix-turn-helix domain-containing protein  39.6 
 
 		 300 aa  182  6e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4555  transcriptional regulator, AraC family  40.94 
 
 		 315 aa  179  7e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.897307 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2981  AraC family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 305 aa  92.4  9e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5000  AraC family transcriptional regulator  29.45 
 
 		 305 aa  90.9  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5860  AraC family transcriptional regulator  29.45 
 
 		 305 aa  90.9  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.499461  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1250  AraC family transcriptional regulator  44.04 
 
 		 263 aa  89.7  5e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4318  AraC family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 305 aa  88.6  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00219342 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4172  AraC family transcriptional regulator  27.73 
 
 		 295 aa  88.2  2e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0833223  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1148  transcriptional regulator, AraC family  33.08 
 
 		 309 aa  87.8  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0027  AraC family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 299 aa  86.7  5e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.618912  normal  0.0626425 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1853  transcriptional regulator, AraC family  31.31 
 
 		 294 aa  85.9  9e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.801816 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2369  transcriptional regulator  33.1 
 
 		 368 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2379  AraC family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 304 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0538221  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5245  AraC family transcriptional regulator  31.23 
 
 		 312 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2932  transcriptional regulator, AraC family  35.04 
 
 		 293 aa  84.3  0.000000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3417  AraC family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 299 aa  84.7  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.138414  normal  0.441033 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0134  AraC family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 322 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3869  AraC family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 304 aa  83.6  0.000000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5093  AraC family transcriptional regulator  27.46 
 
 		 301 aa  82.8  0.000000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.467029 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3244  AraC family transcriptional regulator  27.74 
 
 		 301 aa  82.8  0.000000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.432164 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3583  transcriptional regulator AraC family  36.09 
 
 		 293 aa  82.4  0.000000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2401  transcriptional regulator, AraC family  35.71 
 
 		 202 aa  82  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0168  AraC/XylS family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 287 aa  82  0.00000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000293268  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3361  helix-turn-helix domain-containing protein  44.32 
 
 		 160 aa  82  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3475  helix-turn-helix domain-containing protein  33.33 
 
 		 292 aa  80.5  0.00000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0085  transcriptional regulator, AraC family  33.96 
 
 		 296 aa  80.5  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0195711 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2139  helix-turn-helix domain-containing protein  37.27 
 
 		 294 aa  80.1  0.00000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.957349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4236  AraC family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 285 aa  79.7  0.00000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.457979 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1480  AraC family transcriptional regulator  32.16 
 
 		 306 aa  79.7  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.237942  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6349  AraC family transcriptional regulator  32.16 
 
 		 306 aa  79.7  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0502154  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7015  AraC family transcriptional regulator  32.16 
 
 		 306 aa  79.7  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0570551 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1980  AraC family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 293 aa  77.8  0.0000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.949603 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1318  AraC family transcriptional regulator  25.2 
 
 		 294 aa  77.4  0.0000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.761239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2634  AraC family transcriptional regulator  27.42 
 
 		 204 aa  77.8  0.0000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4153  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 309 aa  77  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.24804 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3329  hypothetical protein  36.81 
 
 		 298 aa  77.4  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.289343  normal  0.60626 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3162  AraC family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 285 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6135  transcriptional regulator, AraC family  33.59 
 
 		 305 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1980  RC149  32.76 
 
 		 308 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.421398  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1279  helix-turn-helix domain-containing protein  40.4 
 
 		 306 aa  77  0.0000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.665979 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0082  transcriptional regulator, AraC family  37.84 
 
 		 292 aa  77  0.0000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.628575  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0574  AraC family transcriptional regulator  37.96 
 
 		 311 aa  76.6  0.0000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0798057  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2326  transcriptional regulator, AraC family  38.38 
 
 		 295 aa  77  0.0000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0937352 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5694  AraC family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 319 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.730665  normal  0.260224 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0180  AraC family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 223 aa  76.3  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1673  AraC family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 314 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.310754 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0588  AraC family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 308 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0681  AraC family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 306 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1543  transcriptional regulator, AraC family  30.36 
 
 		 300 aa  76.3  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6717  transcriptional regulator, AraC family  34.33 
 
 		 296 aa  76.3  0.0000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.121518  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2413  AraC family transcriptional regulator  36.29 
 
 		 305 aa  76.3  0.0000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001016  transcriptional regulator AraC/XylS family  39.33 
 
 		 270 aa  75.9  0.0000000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0540486  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7037  AraC family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 301 aa  75.9  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.283867  normal  0.289972 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07095  hypothetical protein  38.2 
 
 		 270 aa  75.9  0.0000000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6955  transcriptional regulator, AraC family  32.29 
 
 		 346 aa  75.9  0.0000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.737934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2830  helix-turn-helix domain-containing protein  36.36 
 
 		 291 aa  75.5  0.000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2054  two component transcriptional regulator, AraC family  39 
 
 		 1201 aa  75.1  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.695732  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4632  AraC family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 316 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.569454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3971  putative transcriptional regulator  33.81 
 
 		 272 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.347316  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1458  AraC family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 301 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29260  putative transcriptional regulator  34.27 
 
 		 297 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4732  helix-turn-helix domain-containing protein  32.67 
 
 		 293 aa  75.5  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0052536 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6370  AraC family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 301 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5827  AraC family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 302 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4587  AraC family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 291 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.213128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3164  two component AraC family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 544 aa  74.7  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0633186  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4978  transcriptional regulator, AraC family  28.02 
 
 		 318 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.327567  normal  0.11746 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5610  AraC family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 302 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00190409  normal  0.169642 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0859  AraC family transcriptional regulator  43.18 
 
 		 291 aa  73.9  0.000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.775109  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2134  AraC protein, arabinose-binding/dimerisation  30.77 
 
 		 306 aa  73.9  0.000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0479  AraC family transcriptional regulator  33.16 
 
 		 279 aa  73.9  0.000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00109362 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3063  helix-turn-helix domain-containing protein  44.87 
 
 		 306 aa  73.9  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.13528 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0608  AraC family transcriptional regulator  38.04 
 
 		 305 aa  73.6  0.000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4605  AraC family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 291 aa  73.2  0.000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1754  transcriptional regulator, AraC family  36.36 
 
 		 308 aa  73.2  0.000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3418  AraC family transcriptional regulator  44.16 
 
 		 97 aa  73.2  0.000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2463  transcriptional regulator, AraC family  39.09 
 
 		 162 aa  73.2  0.000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.400735  normal  0.926275 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6338  transcriptional regulator, AraC family  45.05 
 
 		 145 aa  73.2  0.000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4464  helix-turn-helix domain-containing protein  40.91 
 
 		 291 aa  72.8  0.000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0583  AraC family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 312 aa  72.4  0.000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.98908  normal  0.54842 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5827  helix-turn-helix domain-containing protein  37.84 
 
 		 316 aa  72.4  0.000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.112164  normal  0.283627 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1472  transcriptional regulator, AraC family  32.52 
 
 		 269 aa  72.4  0.000000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.462639  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3996  helix-turn-helix domain-containing protein  26.92 
 
 		 289 aa  72.4  0.000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5215  helix-turn-helix domain-containing protein  27.5 
 
 		 331 aa  72.4  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3070  helix-turn-helix domain-containing protein  40 
 
 		 131 aa  72  0.00000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.362329  normal  0.0397869 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0125  transcriptional regulator, AraC family  32.97 
 
 		 300 aa  72  0.00000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2413  transcriptional regulator, AraC family  34.56 
 
 		 322 aa  72  0.00000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.333457  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3089  helix-turn-helix domain-containing protein  26.83 
 
 		 297 aa  71.6  0.00000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.830597 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2058  transcriptional regulator, AraC family  32 
 
 		 286 aa  71.6  0.00000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6041  transcriptional regulator, AraC family  33.78 
 
 		 303 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.331066 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1225  AraC family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 249 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.615855  normal  0.0441463 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2224  AraC family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 278 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000575993  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42360  transcriptional regulator, AraC family  29.01 
 
 		 318 aa  71.2  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3689  AraC family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 303 aa  71.2  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3520  helix-turn-helix domain-containing protein  34.91 
 
 		 322 aa  71.2  0.00000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2300  AraC family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 274 aa  70.5  0.00000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.457981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2337  AraC family transcriptional regulator  38 
 
 		 289 aa  70.9  0.00000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000580503  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3159  AraC family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 296 aa  70.5  0.00000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>