More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1782 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_1782  TPR repeat-containing protein  100 
 
 
467 aa  949    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  31.23 
 
 
1694 aa  196  6e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  27.75 
 
 
927 aa  190  4e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  29.09 
 
 
1276 aa  188  2e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  30.12 
 
 
4079 aa  184  3e-45  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  29.07 
 
 
543 aa  179  8e-44  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0011  hypothetical protein  28.39 
 
 
1138 aa  177  3e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.41301  normal  0.0644501 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0060  TPR repeat-containing protein  29.83 
 
 
562 aa  177  4e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0114  TPR repeat-containing protein  28.21 
 
 
602 aa  175  1.9999999999999998e-42  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.606428  normal  0.312557 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  27.62 
 
 
1979 aa  153  5e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0955  tetratricopeptide TPR_2  24.94 
 
 
635 aa  152  1e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.750671 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0629  TPR repeat-containing protein  25.92 
 
 
1049 aa  151  2e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2807  tetratricopeptide TPR_2  25.55 
 
 
576 aa  150  5e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2893  O-linked N-acetylglucosamine transferase  27.16 
 
 
397 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.272299 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  29.06 
 
 
465 aa  147  5e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3201  TPR repeat-containing protein  26.58 
 
 
955 aa  143  6e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0757905 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1312  TPR repeat-containing protein  28.64 
 
 
1069 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.530092  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  24.81 
 
 
878 aa  139  8.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0087  TPR repeat-containing protein  29.05 
 
 
366 aa  139  1e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0698  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.72 
 
 
784 aa  139  1e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1947  tetratricopeptide TPR_2  23.68 
 
 
564 aa  139  1e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0106408 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  26.08 
 
 
810 aa  137  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  22.49 
 
 
1056 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.95 
 
 
1056 aa  134  3e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4726  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  24.24 
 
 
730 aa  134  3e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.39 
 
 
818 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2953  TPR repeat-containing protein  22.89 
 
 
711 aa  132  1.0000000000000001e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0781794 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.12 
 
 
784 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0930  TPR repeat-containing protein  22.5 
 
 
329 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  28.62 
 
 
4489 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1552  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  24.4 
 
 
707 aa  130  6e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0225548 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.6 
 
 
1022 aa  130  6e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3049  TPR repeat-containing protein  23.79 
 
 
591 aa  127  6e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000157665  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2320  TPR repeat-containing protein  22.54 
 
 
617 aa  124  5e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2322  TPR repeat-containing protein  27.44 
 
 
935 aa  123  8e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0205826 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2318  tetratricopeptide protein  26.47 
 
 
573 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2406  tetratricopeptide TPR_2  27.64 
 
 
436 aa  120  7e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0280  TPR domain-containing protein  26.14 
 
 
1013 aa  119  9.999999999999999e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.416311 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  23.24 
 
 
988 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1699  TPR repeat-containing protein  21.73 
 
 
409 aa  117  3e-25  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.52405  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2212  TPR repeat-containing protein  26.37 
 
 
1276 aa  117  3e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.524691  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2680  peptidase S41  24.02 
 
 
745 aa  116  6.9999999999999995e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.20871  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1811  TPR repeat-containing protein  30.77 
 
 
523 aa  115  2.0000000000000002e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2895  O-linked N-acetylglucosamine transferase  25.24 
 
 
292 aa  114  3e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0140366 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2318  TPR repeat-containing protein  29.15 
 
 
245 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2005  TPR repeat-containing protein  27.03 
 
 
512 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.915591 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0213  TPR repeat-containing protein  20.49 
 
 
409 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0693  TPR repeat-containing protein  20.79 
 
 
395 aa  111  3e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0712051  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0901  TPR repeat-containing protein  21.41 
 
 
409 aa  111  4.0000000000000004e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0225  TPR repeat-containing protein  24.24 
 
 
414 aa  110  5e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3507  protein prenyltransferase, alpha subunit  28.06 
 
 
1007 aa  110  6e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.223985 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2321  TPR repeat-containing protein  21.9 
 
 
750 aa  109  9.000000000000001e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0675  TPR repeat-containing protein  27.58 
 
 
344 aa  109  1e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1065  TPR repeat-containing protein  24.43 
 
 
740 aa  108  3e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.761998  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0774  tetratricopeptide TPR_2  23.11 
 
 
519 aa  107  3e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.169881  normal  0.452711 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1653  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 
466 aa  108  3e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2367  protein kinase  30.7 
 
 
623 aa  107  5e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4355  TPR repeat-containing protein  24.36 
 
 
1192 aa  106  7e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.862224  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  27.27 
 
 
3560 aa  106  8e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28481  hypothetical protein  22.22 
 
 
462 aa  106  9e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1449  tetratricopeptide TPR_2  29.15 
 
 
1067 aa  106  9e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  23.87 
 
 
1094 aa  105  1e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  23.37 
 
 
3172 aa  105  1e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0436  tetratricopeptide TPR_2  24.39 
 
 
1056 aa  105  1e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0755  TPR repeat-containing protein  28.15 
 
 
662 aa  105  2e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.466717  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0384  TPR repeat-containing protein  26.83 
 
 
279 aa  105  2e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.890218  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1518  TPR repeat-containing protein  22.46 
 
 
375 aa  105  2e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.946116  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3569  tetratricopeptide TPR_2  26.45 
 
 
314 aa  105  2e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  23.36 
 
 
3301 aa  104  3e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.93 
 
 
632 aa  103  5e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1019  TPR repeat-containing protein  25.75 
 
 
273 aa  103  9e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0035  TPR repeat-containing protein  24.26 
 
 
402 aa  102  1e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.446314  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2328  TPR repeat-containing protein  25.62 
 
 
363 aa  101  2e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.759887 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0471  TPR repeat-containing protein  27.19 
 
 
1297 aa  101  2e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0709  TPR repeat-containing protein  24.01 
 
 
465 aa  102  2e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2370  TPR repeat-containing protein  22.47 
 
 
425 aa  101  2e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00134041  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  21.51 
 
 
1737 aa  101  3e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0133  TPR repeat-containing protein  20.33 
 
 
393 aa  100  4e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.310931  normal  0.0473724 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4508  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.33 
 
 
836 aa  100  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.885776 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1603  TPR repeat-containing protein  25.53 
 
 
804 aa  100  5e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0996  TPR repeat-containing protein  25.18 
 
 
634 aa  100  8e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.325764  normal  0.0470836 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1796  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.21 
 
 
465 aa  99.8  9e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.769841  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4492  TPR repeat-containing protein  23.89 
 
 
605 aa  99.4  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0812  tetratricopeptide TPR_2  24.14 
 
 
452 aa  99.8  1e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.159009  normal  0.340374 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1770  TPR repeat-containing protein  22.79 
 
 
393 aa  98.6  2e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.452955  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0484  TPR repeat-containing protein  24.65 
 
 
435 aa  99  2e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2606  tetratricopeptide TPR_2  21.97 
 
 
643 aa  98.6  2e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0564  TPR repeat-containing protein  32.24 
 
 
202 aa  98.2  2e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.151741 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2065  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.69 
 
 
465 aa  97.8  3e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.145613  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2441  TPR repeat-containing protein  23.02 
 
 
687 aa  97.8  4e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0004983  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  25.81 
 
 
3035 aa  97.1  6e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0823  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.81 
 
 
296 aa  97.1  6e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0401477 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1451  TPR repeat-containing protein  30.48 
 
 
244 aa  96.7  7e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.346129  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1344  TPR repeat-containing protein  23.19 
 
 
471 aa  95.9  1e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.641665  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0329  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.9 
 
 
297 aa  95.1  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0336  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.9 
 
 
297 aa  95.1  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1657  TPR repeat-containing protein  23.24 
 
 
594 aa  95.1  3e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0658919  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1066  TPR repeat-containing protein  23.21 
 
 
747 aa  94.4  4e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2461  hypothetical protein  25 
 
 
398 aa  94  5e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.125521  normal  0.0258605 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5131  TPR repeat-containing protein  23.12 
 
 
361 aa  94  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000131061 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>