More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_0213 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009637  MmarC7_1699  TPR repeat-containing protein  80.2 
 
 
409 aa  662  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.52405  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0213  TPR repeat-containing protein  100 
 
 
409 aa  806  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0901  TPR repeat-containing protein  78.87 
 
 
409 aa  646  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1518  TPR repeat-containing protein  42.89 
 
 
375 aa  330  3e-89  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.946116  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0114  TPR repeat-containing protein  32.6 
 
 
602 aa  202  7e-51  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.606428  normal  0.312557 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  32.96 
 
 
1694 aa  200  5e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  32.92 
 
 
543 aa  199  8e-50  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  30 
 
 
1276 aa  193  4e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0060  TPR repeat-containing protein  27.1 
 
 
562 aa  190  5e-47  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  30.53 
 
 
927 aa  186  4e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.68 
 
 
988 aa  176  8e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.68 
 
 
1056 aa  171  2e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  23.36 
 
 
818 aa  168  2e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2318  tetratricopeptide protein  32.63 
 
 
573 aa  166  5e-40  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  23.58 
 
 
784 aa  161  2e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.8 
 
 
1022 aa  160  5e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1552  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  29.3 
 
 
707 aa  158  2e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0225548 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.13 
 
 
1056 aa  155  9e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  26.63 
 
 
878 aa  154  2e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1356  beta-lactamase domain-containing protein  32.6 
 
 
833 aa  153  6e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2893  O-linked N-acetylglucosamine transferase  28.89 
 
 
397 aa  152  1e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.272299 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2807  tetratricopeptide TPR_2  27.93 
 
 
576 aa  147  5e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  25.19 
 
 
810 aa  146  6e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  23.92 
 
 
465 aa  145  8e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1653  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.16 
 
 
758 aa  145  1e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0930  TPR repeat-containing protein  29.08 
 
 
329 aa  145  1e-33  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  25.07 
 
 
4489 aa  145  2e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0698  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.05 
 
 
784 aa  144  3e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0840  TPR repeat-containing protein  25.82 
 
 
1371 aa  143  5e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0955  tetratricopeptide TPR_2  26.56 
 
 
635 aa  142  2e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.750671 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0675  TPR repeat-containing protein  30.38 
 
 
344 aa  140  4e-32  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  26.1 
 
 
4079 aa  140  6e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2953  TPR repeat-containing protein  25.19 
 
 
711 aa  139  7e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0781794 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28481  hypothetical protein  25.18 
 
 
462 aa  135  1e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2321  TPR repeat-containing protein  28.98 
 
 
750 aa  134  4e-30  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  25.92 
 
 
649 aa  132  1e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1603  TPR repeat-containing protein  27.65 
 
 
804 aa  132  1e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  25.23 
 
 
1094 aa  131  2e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  21.79 
 
 
1737 aa  131  3e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28721  hypothetical protein  25.86 
 
 
706 aa  129  7e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0280  TPR domain-containing protein  23.81 
 
 
1013 aa  129  9e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.416311 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2383  TPR repeat-containing protein  20.63 
 
 
1421 aa  129  1e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.823331 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  25.74 
 
 
1979 aa  129  1e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2005  TPR repeat-containing protein  32.63 
 
 
512 aa  128  2e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.915591 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1947  tetratricopeptide TPR_2  24.16 
 
 
564 aa  127  3e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0106408 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  25.39 
 
 
3035 aa  125  1e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28501  hypothetical protein  25.49 
 
 
706 aa  125  1e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0629  TPR repeat-containing protein  26.13 
 
 
1049 aa  125  2e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2606  tetratricopeptide TPR_2  23.12 
 
 
643 aa  123  7e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4726  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  26.67 
 
 
730 aa  122  1e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0783  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.22 
 
 
542 aa  121  2e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1065  TPR repeat-containing protein  20.29 
 
 
740 aa  120  6e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.761998  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2895  O-linked N-acetylglucosamine transferase  29.82 
 
 
292 aa  119  1e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0140366 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.56 
 
 
632 aa  119  1e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  28.75 
 
 
3560 aa  118  2e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1827  TPR repeat-containing protein  26.84 
 
 
761 aa  117  3e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0460239  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1657  TPR repeat-containing protein  25.06 
 
 
594 aa  117  3e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0658919  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0087  TPR repeat-containing protein  24.06 
 
 
366 aa  117  4e-25  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8213  TPR repeat-containing protein  26.69 
 
 
392 aa  117  5e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0720948  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0225  TPR repeat-containing protein  25.73 
 
 
414 aa  116  9e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1312  TPR repeat-containing protein  22.16 
 
 
1069 aa  115  1e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.530092  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0996  TPR repeat-containing protein  24.58 
 
 
634 aa  115  1e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.325764  normal  0.0470836 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1399  TPR repeat-containing protein  22.64 
 
 
450 aa  115  1e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0011  hypothetical protein  25.29 
 
 
1138 aa  115  2e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.41301  normal  0.0644501 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2441  TPR repeat-containing protein  27.46 
 
 
687 aa  115  2e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0004983  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  24.08 
 
 
887 aa  114  3e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  24.56 
 
 
3301 aa  112  8e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.42 
 
 
689 aa  112  9e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0301  TPR repeat-containing protein  25.38 
 
 
1827 aa  112  1e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2680  peptidase S41  26.23 
 
 
745 aa  112  1e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.20871  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1782  TPR repeat-containing protein  20.49 
 
 
467 aa  112  1e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0858  TPR repeat-containing protein  24.86 
 
 
589 aa  111  2e-23  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2370  TPR repeat-containing protein  29.55 
 
 
425 aa  112  2e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00134041  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2406  tetratricopeptide TPR_2  22.77 
 
 
436 aa  110  3e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2320  TPR repeat-containing protein  26.54 
 
 
617 aa  111  3e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1499  TPR repeat-containing protein  22.39 
 
 
486 aa  110  4e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.329638 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2328  TPR repeat-containing protein  21.62 
 
 
363 aa  108  2e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.759887 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4355  TPR repeat-containing protein  23.88 
 
 
1192 aa  108  2e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.862224  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  22.45 
 
 
626 aa  107  3e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3049  TPR repeat-containing protein  25.23 
 
 
591 aa  107  5e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  1.57665e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1449  tetratricopeptide TPR_2  23.97 
 
 
1067 aa  106  6e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.88 
 
 
2240 aa  107  6e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4492  TPR repeat-containing protein  20.73 
 
 
605 aa  106  7e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28711  hypothetical protein  29.02 
 
 
334 aa  106  8e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0471  TPR repeat-containing protein  25.94 
 
 
1297 aa  105  1e-21  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0384  TPR repeat-containing protein  25 
 
 
279 aa  105  1e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.890218  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3793  TPR repeat-containing protein  25.82 
 
 
428 aa  105  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.085128 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2439  TPR repeat-containing protein  24.24 
 
 
448 aa  104  2e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0207467  normal  0.980065 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3507  protein prenyltransferase, alpha subunit  26.32 
 
 
1007 aa  104  3e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.223985 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4159  TPR repeat-containing protein  24.52 
 
 
467 aa  104  3e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  4.642e-05 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2862  TPR repeat-containing protein  23.21 
 
 
448 aa  103  6e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.375816 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1342  TPR repeat-containing protein  30.28 
 
 
391 aa  103  7e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13031  TPR repeat-containing protein  24.66 
 
 
306 aa  103  8e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0823406 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7855  TPR domain-containing protein  20.79 
 
 
648 aa  102  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.126864 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0970  TPR domain-containing protein  22.29 
 
 
614 aa  101  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  22.29 
 
 
614 aa  101  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  22.29 
 
 
614 aa  101  2e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2656  TPR repeat-containing protein  23.35 
 
 
568 aa  101  2e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  1.62187e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  22.29 
 
 
626 aa  101  3e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  22.29 
 
 
614 aa  100  3e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>