More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_0052 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009637  MmarC7_0771  preprotein translocase subunit SecD  95.36 
 
 
388 aa  737  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0052  preprotein translocase subunit SecD  100 
 
 
388 aa  767  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1147  preprotein translocase subunit SecD  96.65 
 
 
388 aa  749  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0836  preprotein translocase subunit SecD  85.82 
 
 
388 aa  672  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1017  preprotein translocase subunit SecD  70.88 
 
 
391 aa  560  1e-158  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.562711  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0895  preprotein translocase subunit SecD  38.08 
 
 
558 aa  200  4e-50  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.433485  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0851  preprotein translocase subunit SecD  38.29 
 
 
566 aa  182  1e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3176  preprotein translocase subunit SecD  36.62 
 
 
484 aa  181  2e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1797  preprotein translocase subunit SecD  34.75 
 
 
486 aa  174  3e-42  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0601908  normal  0.730674 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1656  preprotein translocase subunit SecD  35.03 
 
 
485 aa  172  7e-42  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00710078  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1023  preprotein translocase subunit SecD  35.85 
 
 
507 aa  168  1e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0744  SecD/SecF/SecDF export membrane protein  32.81 
 
 
537 aa  168  2e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0280  preprotein translocase subunit SecD  35.39 
 
 
497 aa  142  8e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2707  preprotein translocase subunit SecD  42.71 
 
 
549 aa  141  2e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1322  preprotein translocase subunit SecD  31.19 
 
 
546 aa  141  2e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.776168  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1964  preprotein translocase subunit SecD  40.34 
 
 
529 aa  137  3e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.94592  normal  0.207837 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2689  preprotein translocase subunit SecD  39.59 
 
 
510 aa  136  6e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1425  preprotein translocase subunit SecD  29.75 
 
 
403 aa  123  5e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  2.90493e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1987  preprotein translocase subunit SecD  38.92 
 
 
564 aa  123  6e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000381338  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1123  preprotein translocase subunit SecD  28.07 
 
 
416 aa  119  7e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  3.01062e-07  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1272  preprotein translocase subunit SecD  27.05 
 
 
411 aa  117  4e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1356  preprotein translocase subunit SecD  29.72 
 
 
410 aa  112  9e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.066873  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1604  protein-export membrane protein SecD  27.86 
 
 
399 aa  111  2e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0444022  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1462  preprotein translocase subunit SecD  28.53 
 
 
411 aa  110  5e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  5.72302e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0625  preprotein translocase subunit SecD  27.61 
 
 
415 aa  108  1e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  4.18015e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2738  protein-export membrane protein SecD  27.79 
 
 
406 aa  108  2e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1691  protein-export membrane protein SecD  25.86 
 
 
461 aa  107  2e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0199339  normal  0.405053 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5077  preprotein translocase subunit SecD  25 
 
 
461 aa  105  1e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1028  preprotein translocase subunit SecD  25.45 
 
 
471 aa  104  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.016566 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1669  preprotein translocase subunit SecD  25.35 
 
 
413 aa  102  2e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  2.93049e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3618  protein-export membrane protein SecD  28.85 
 
 
735 aa  101  2e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  1.14723e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4539  protein-export membrane protein SecD  24.67 
 
 
470 aa  101  2e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.470079  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12260  protein-export membrane protein SecD  28.33 
 
 
403 aa  102  2e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  7.64404e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2884  preprotein translocase subunit SecD  24.08 
 
 
470 aa  100  6e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3212  preprotein translocase subunit SecD  24.08 
 
 
470 aa  100  6e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.718211  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3671  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  26.11 
 
 
853 aa  99.4  9e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0862684  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0142  preprotein translocase subunit SecD  24.94 
 
 
464 aa  98.6  2e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0536  protein-export membrane protein SecD  32.65 
 
 
441 aa  98.6  2e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  2.45038e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1769  protein-export membrane protein SecD  28.36 
 
 
512 aa  98.6  2e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1571  protein-export membrane protein SecD  27 
 
 
503 aa  95.1  2e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1453  preprotein translocase subunit SecD  25.75 
 
 
531 aa  94  4e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0996  preprotein translocase subunit SecD  27.44 
 
 
554 aa  92.8  9e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0904  protein-export membrane protein SecD  26.32 
 
 
445 aa  91.7  2e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  1.9832e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03171  Acriflavin resistance protein  27.27 
 
 
843 aa  91.7  2e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0026  preprotein translocase subunit SecD  27.84 
 
 
638 aa  90.5  5e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.943233  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2276  protein-export membrane protein SecD  25.29 
 
 
534 aa  90.1  5e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.394363  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0456  preprotein translocase subunit SecD  24.59 
 
 
554 aa  86.7  6e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.171448  normal  0.0964807 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2491  protein-export membrane protein SecD  25.41 
 
 
534 aa  86.7  6e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.743414  normal  0.128771 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2855  protein-export membrane protein SecD  25.36 
 
 
532 aa  86.7  7e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.20247 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1859  preprotein translocase subunit SecD  23.73 
 
 
554 aa  86.7  7e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.182959  normal  0.940484 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0033  preprotein translocase subunit SecD  27.06 
 
 
619 aa  86.3  9e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0444  preprotein translocase subunit SecD  24.05 
 
 
554 aa  85.5  1e-15  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0562014  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1799  preprotein translocase subunit SecD  25.78 
 
 
533 aa  85.5  1e-15  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.127943  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1798  preprotein translocase subunit SecD  24.05 
 
 
554 aa  85.5  1e-15  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1769  preprotein translocase subunit SecD  26.22 
 
 
532 aa  85.5  1e-15  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.462584  normal  0.0130342 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0290  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  23.88 
 
 
849 aa  85.5  2e-15  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.870898 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4309  preprotein translocase subunit SecD  24.5 
 
 
535 aa  84.7  2e-15  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2732  preprotein translocase subunit SecD  25 
 
 
533 aa  85.1  2e-15  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.735593  normal  0.282861 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1490  preprotein translocase subunit SecD  32.3 
 
 
474 aa  84.3  3e-15  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1334  protein-export membrane protein SecD  23.89 
 
 
487 aa  84.3  4e-15  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.763605  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1908  preprotein translocase subunit SecD  22.86 
 
 
419 aa  84  4e-15  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.154062  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1084  preprotein translocase subunit SecD  24.63 
 
 
556 aa  84  4e-15  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.111435 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1416  preprotein translocase subunit SecD  23.8 
 
 
554 aa  84  4e-15  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.457453  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3036  preprotein translocase subunit SecD  24.72 
 
 
535 aa  83.6  5e-15  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2197  preprotein translocase subunit SecD  22.86 
 
 
419 aa  83.6  6e-15  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2776  preprotein translocase subunit SecD  25.99 
 
 
534 aa  82.8  8e-15  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.336703  normal  0.245371 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2188  protein-export membrane protein SecD  24.52 
 
 
534 aa  82.8  9e-15  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.521622  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1001  protein-export membrane protein SecD  24.07 
 
 
531 aa  82.8  9e-15  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.541747  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1471  protein-export membrane protein SecD  25.75 
 
 
740 aa  82.8  9e-15  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  hitchhiker  6.74169e-05 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2777  preprotein translocase subunit SecD  25.21 
 
 
533 aa  82.4  1e-14  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.626907  normal  0.768312 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0504  protein-export membrane protein SecD  22.94 
 
 
462 aa  82.8  1e-14  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  5.22922e-05  hitchhiker  0.000170526 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1285  protein-export membrane protein SecD  26.86 
 
 
423 aa  82.4  1e-14  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0952765  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0181  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  29.33 
 
 
844 aa  82.4  1e-14  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1284  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  26.1 
 
 
844 aa  82  2e-14  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3280  preprotein translocase subunit SecD  23.53 
 
 
625 aa  82  2e-14  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.527735  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3172  preprotein translocase subunit SecD  23.87 
 
 
533 aa  81.6  2e-14  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.881845  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0681  preprotein translocase subunit SecD  28.52 
 
 
531 aa  81.6  2e-14  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.565803  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1324  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  26.1 
 
 
845 aa  81.3  3e-14  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0375911  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0716  SecD/SecF family protein-export membrane protein  30.2 
 
 
734 aa  80.9  3e-14  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000203356  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1575  preprotein translocase subunit SecD  24.8 
 
 
521 aa  80.5  4e-14  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1116  protein-export membrane protein SecD  25.76 
 
 
500 aa  80.9  4e-14  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3824  protein-export membrane protein SecD  28.32 
 
 
656 aa  80.5  4e-14  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.221724  normal  0.729051 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1860  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  28.06 
 
 
844 aa  80.5  5e-14  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0333  preprotein translocase subunit SecD  27.25 
 
 
449 aa  80.5  5e-14  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000488895  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0007  preprotein translocase subunit SecD  27.95 
 
 
595 aa  80.1  7e-14  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.211478 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1279  preprotein translocase subunit SecD  25.64 
 
 
495 aa  80.1  7e-14  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.221382  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0012  preprotein translocase subunit SecD  25.3 
 
 
607 aa  79.7  7e-14  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000769208  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2658  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  24.58 
 
 
856 aa  79.7  8e-14  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3326  protein-export membrane protein SecD  23.61 
 
 
474 aa  79.3  1e-13  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1410  protein-export membrane protein SecD  28.41 
 
 
613 aa  79.3  1e-13  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.447303  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_275  protein-export membrane protein, preprotein translocase SecD subunit  26.61 
 
 
449 aa  79  1e-13  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  4.78055e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3982  protein-export membrane protein SecD  23.77 
 
 
468 aa  79.3  1e-13  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.728055 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0672  preprotein translocase subunit SecD  25.11 
 
 
586 aa  79.3  1e-13  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1309  protein-export membrane protein SecD  28.41 
 
 
613 aa  79.3  1e-13  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.198651  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2057  protein-export membrane protein SecD  23.66 
 
 
594 aa  78.6  2e-13  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1048  preprotein translocase subunit SecD  24.14 
 
 
526 aa  78.6  2e-13  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0321  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  23.03 
 
 
848 aa  78.2  2e-13  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.898839 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1715  protein-export membrane protein SecD  23.66 
 
 
594 aa  78.6  2e-13  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0878  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  26.48 
 
 
834 aa  78.2  2e-13  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.335263  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2540  protein-export membrane protein SecD  27.86 
 
 
613 aa  79  2e-13  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.712905  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>