73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_3141 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014212  Mesil_3141  Glucan 1,4-alpha-glucosidase  100 
 
 		 761 aa  1526    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.136567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0098  putative glucoamylase precursor  48.34 
 
 		 835 aa  642    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.519208 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0725  glucan 1,4-alpha-glucosidase  57.33 
 
 		 798 aa  806    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.928559 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2224  glycosyl hydrolase, family 15  46.32 
 
 		 786 aa  613  9.999999999999999e-175  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1878  Glucan 1,4-alpha-glucosidase  46.32 
 
 		 786 aa  613  9.999999999999999e-175  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3494  glucan 1,4-alpha-glucosidase  43.07 
 
 		 803 aa  577  1.0000000000000001e-163  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2590  glucan 1,4-alpha-glucosidase  42.7 
 
 		 802 aa  567  1e-160  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.767497  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0995  glucan 1,4-alpha-glucosidase  43.74 
 
 		 800 aa  545  1e-153  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.690706  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7572  glucan 1,4-alpha-glucosidase  40.2 
 
 		 801 aa  522  1e-146  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2807  glucan 1,4-alpha-glucosidase  37.62 
 
 		 814 aa  480  1e-134  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2108  Glucan 1,4-alpha-glucosidase  43.22 
 
 		 692 aa  442  9.999999999999999e-123  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.860324  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2482  glucan 1,4-alpha-glucosidase  43.36 
 
 		 681 aa  442  9.999999999999999e-123  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.40631  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3431  glucan 1,4-alpha-glucosidase  37.21 
 
 		 715 aa  369  1e-100  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.37344  normal  0.185198 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0200  putative glucan 1,4-alpha-glucosidase  31.97 
 
 		 882 aa  319  9e-86  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1658  putative amylase  31.97 
 
 		 881 aa  319  1e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0289  glycosy hydrolase family protein  31.84 
 
 		 882 aa  317  4e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0213  glucan 1,4- a-glucosidase  31.97 
 
 		 881 aa  310  6.999999999999999e-83  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7155  Glucodextranase N  33.09 
 
 		 1160 aa  298  4e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0849564  normal  0.457795 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2459  glucoamylase  28.52 
 
 		 847 aa  269  2e-70  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1924  glucan 1,4-alpha-glucosidase  28.65 
 
 		 837 aa  268  2e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1869  glucan 1,4-alpha-glucosidase  28.52 
 
 		 838 aa  267  5e-70  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1775  glucan 1,4-alpha-glucosidase  29.67 
 
 		 820 aa  267  5.999999999999999e-70  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.039992  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2109  glucan 1,4-alpha-glucosidase  28.83 
 
 		 838 aa  263  8e-69  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.185275 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4198  glucan 1,4-alpha-glucosidase  28.11 
 
 		 860 aa  258  2e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.116621 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1503  glycoside hydrolase 15-related  30.71 
 
 		 1592 aa  256  1.0000000000000001e-66  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.547945 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3146  glucan 1,4-alpha-glucosidase  28.55 
 
 		 808 aa  255  2.0000000000000002e-66  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2973  glucan 1,4-alpha-glucosidase  28.55 
 
 		 808 aa  255  2.0000000000000002e-66  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.590668 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2004  glucan 1,4-alpha-glucosidase  29.2 
 
 		 841 aa  254  3e-66  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2201  glucan 1,4-alpha-glucosidase  28.99 
 
 		 840 aa  253  8.000000000000001e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.402848  decreased coverage  0.000000736169 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1873  glucan 1,4-alpha-glucosidase  28.26 
 
 		 833 aa  253  1e-65  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000067547  normal  0.14602 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2453  glucan 1,4-alpha-glucosidase  27.78 
 
 		 858 aa  250  7e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2337  glucan 1,4-alpha-glucosidase  27.78 
 
 		 858 aa  250  7e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2010  Glucan 1,4-alpha-glucosidase  27.38 
 
 		 858 aa  248  4e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00769756  hitchhiker  0.000340276 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0600  glucan 1,4-alpha-glucosidase  28.28 
 
 		 803 aa  246  9.999999999999999e-64  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.782698  normal  0.698783 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1053  Glucan 1,4-alpha-glucosidase  29.82 
 
 		 1505 aa  246  1.9999999999999999e-63  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.498818  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1656  glucan 1,4-alpha-glucosidase  29.31 
 
 		 817 aa  241  2.9999999999999997e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.159035  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26980  glucan 1,4-alpha-glucosidase  27.04 
 
 		 821 aa  225  2e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7156  Glucan 1,4-alpha-glucosidase  28.04 
 
 		 1132 aa  212  2e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0565327  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4086  glucan 1,4-alpha-glucosidase  28.34 
 
 		 777 aa  210  8e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2349  glucan 1,4-alpha-glucosidase  28.71 
 
 		 433 aa  145  2e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2348  glucan 1,4-alpha-glucosidase  25.52 
 
 		 430 aa  93.2  2e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1858  hypothetical protein  48.15 
 
 		 180 aa  80.1  0.0000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0683623  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1536  hypothetical protein  48.15 
 
 		 180 aa  80.1  0.0000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.438735  normal  0.0276141 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0301  glycoside hydrolase 15-related  22.44 
 
 		 621 aa  70.5  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.394812  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0709  glycoside hydrolase 15-related  24.07 
 
 		 647 aa  70.5  0.0000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1968  glycoside hydrolase 15-related protein  23.7 
 
 		 622 aa  67.8  0.0000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0090  glycoside hydrolase 15-related  25.54 
 
 		 604 aa  67.8  0.0000000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.33989  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0202  glycoside hydrolase 15-related protein  26.62 
 
 		 668 aa  67.8  0.0000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0537  glycoside hydrolase 15-related  22.78 
 
 		 621 aa  67  0.000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0228  glycoside hydrolase 15-related  22.59 
 
 		 611 aa  67  0.000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.159353  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3601  glycoside hydrolase 15-related  24.04 
 
 		 670 aa  66.2  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1382  glycoside hydrolase 15-related  22.5 
 
 		 621 aa  63.9  0.00000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.245584  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0431  glycoside hydrolase 15-related protein  27.5 
 
 		 650 aa  63.2  0.00000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0395513  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1787  glycoside hydrolase 15-related  23.18 
 
 		 644 aa  62.4  0.00000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.26438  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0438  glycoside hydrolase 15-related protein  24.86 
 
 		 647 aa  61.6  0.00000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.719432  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0335  glycoside hydrolase 15-related  22.36 
 
 		 644 aa  60.8  0.00000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2939  glycoside hydrolase 15-related  24.74 
 
 		 642 aa  58.5  0.0000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0165547  normal  0.604263 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0010  glycoside hydrolase 15-related  21.63 
 
 		 627 aa  58.5  0.0000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.148558  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1047  glycoside hydrolase 15-related  25.76 
 
 		 663 aa  58.5  0.0000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.425062  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1420  glycoside hydrolase 15-related  23.63 
 
 		 615 aa  58.9  0.0000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0134624 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0602  glycoside hydrolase 15-related  21.51 
 
 		 621 aa  57.8  0.0000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0526  glycoside hydrolase 15-related  21.72 
 
 		 645 aa  53.9  0.00001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0688  glycoside hydrolase 15-related protein  31.55 
 
 		 487 aa  53.9  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0389398  hitchhiker  0.0000253307 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1916  glucan 1,4-alpha-glucosidase  24.48 
 
 		 569 aa  52.4  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.370193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1626  glycoside hydrolase 15-related  24.17 
 
 		 622 aa  50.4  0.0001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0120463  normal  0.415513 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0651  glycoside hydrolase 15-like protein  31.3 
 
 		 602 aa  49.7  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0253524  hitchhiker  0.0000870842 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0277  glycoside hydrolase 15-related protein  22.83 
 
 		 615 aa  49.7  0.0002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.70107  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1503  glycoside hydrolase 15-related  23.53 
 
 		 649 aa  48.5  0.0005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.227839  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0540  glucoamylase  22.22 
 
 		 673 aa  48.1  0.0006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0734  glucoamylase and related glycosyl hydrolases  29.63 
 
 		 407 aa  46.2  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0649  glycoside hydrolase 15-related protein  38.24 
 
 		 610 aa  46.2  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31600  glycosyl hydrolase, glucoamylase  28.93 
 
 		 549 aa  46.2  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.618775  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0817  glycoside hydrolase 15-related protein  32.41 
 
 		 472 aa  44.7  0.007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.47489 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>