More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_6315 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_4285  HpcH/HpaI aldolase  88.25 
 
 		 349 aa  634    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0181473  normal  0.111861 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4390  HpcH/HpaI aldolase  88.83 
 
 		 349 aa  640    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.345408  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1650  HpcH/HpaI aldolase  89.97 
 
 		 349 aa  637    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.806088  normal  0.193855 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3917  HpcH/HpaI aldolase  88.25 
 
 		 349 aa  634    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.243397 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7178  HpcH/HpaI aldolase  91.98 
 
 		 350 aa  663    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.102062  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6315  HpcH/HpaI aldolase  100 
 
 		 349 aa  702    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.185554  hitchhiker  0.008113 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3870  HpcH/HpaI aldolase  77.36 
 
 		 346 aa  572  1.0000000000000001e-162  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3098  HpcH/HpaI aldolase  73.07 
 
 		 371 aa  541  1e-153  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.136599  normal  0.227792 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4173  HpcH/HpaI aldolase  70.2 
 
 		 347 aa  516  1.0000000000000001e-145  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1328  HpcH/HpaI aldolase  68.97 
 
 		 350 aa  514  1.0000000000000001e-145  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.604771  hitchhiker  0.00231317 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0912  HpcH/HpaI aldolase  69.63 
 
 		 347 aa  512  1e-144  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.322098  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0731  HpcH/HpaI aldolase  69.91 
 
 		 349 aa  508  1e-143  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.629928 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4213  HpcH/HpaI aldolase  64.18 
 
 		 351 aa  471  1e-132  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.29064 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4393  HpcH/HpaI aldolase  62.29 
 
 		 363 aa  442  1e-123  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2805  HpcH/HpaI aldolase  61.25 
 
 		 355 aa  424  1e-118  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1739  citrate lyase, beta subunit, putative  40 
 
 		 320 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.000771015  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0217  citrate lyase  41.25 
 
 		 325 aa  220  3e-56  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.342299  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0799  citrate (pro-3S)-lyase  38.71 
 
 		 341 aa  214  1.9999999999999998e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.105286  normal  0.561941 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3165  Citryl-CoA lyase  40.13 
 
 		 320 aa  212  1e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2481  citrate (pro-3S)-lyase  41.36 
 
 		 379 aa  207  3e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.565353  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1771  beta subunit of citrate lyase  39.14 
 
 		 318 aa  206  7e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.508507  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0417  Citryl-CoA lyase  39.14 
 
 		 318 aa  206  7e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0471  citrate lyase  39.69 
 
 		 318 aa  205  9e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.750948  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1754  Citrate (pro-3S)-lyase  39.5 
 
 		 324 aa  204  2e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3050  citrate lyase subunit beta  40.88 
 
 		 318 aa  202  5e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3663  Citryl-CoA lyase  39.3 
 
 		 323 aa  200  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.144396  normal  0.0822593 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1802  citrate (pro-3S)-lyase  39.18 
 
 		 324 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.23047 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2138  Citrate (pro-3S)-lyase  39.18 
 
 		 324 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.845302  normal  0.238612 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6559  citrate (pro-3S)-lyase  39.81 
 
 		 323 aa  200  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.527752  normal  0.02273 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1719  Citrate (pro-3S)-lyase  40.32 
 
 		 325 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.412951 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7119  HpcH/HpaI aldolase  39.49 
 
 		 324 aa  196  5.000000000000001e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.574186  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3254  Citryl-CoA lyase  38.99 
 
 		 327 aa  191  1e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0663527  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5924  citrate (pro-3S)-lyase  38.71 
 
 		 325 aa  191  2e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.333382 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2490  citrate lyase  38.26 
 
 		 310 aa  190  4e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1078  citrate lyase  36.45 
 
 		 316 aa  181  2e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.132128  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0213  HpcH/HpaI aldolase  34.49 
 
 		 303 aa  170  4e-41  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.209563 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0830  citrate lyase  38.21 
 
 		 282 aa  170  4e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0807208  normal  0.0919126 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1580  Citryl-CoA lyase  33.33 
 
 		 303 aa  169  9e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.264708  hitchhiker  0.00335996 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1192  Citrate (pro-3S)-lyase  33.33 
 
 		 313 aa  153  5e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.151099  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4030  citrate (pro-3S)-lyase  33.02 
 
 		 316 aa  149  9e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.707323 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3004  citrate (pro-3S)-lyase  33.33 
 
 		 312 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.394153  normal  0.725704 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1137  Citrate (pro-3S)-lyase  33.75 
 
 		 317 aa  146  6e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2561  citrate (pro-3S)-lyase  32.91 
 
 		 331 aa  146  6e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.180481  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6909  citrate (pro-3S)-lyase  33.67 
 
 		 316 aa  144  2e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.692598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4534  Citryl-CoA lyase  33.23 
 
 		 321 aa  144  3e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.668521  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8404  Citrate (pro-3S)-lyase  32.69 
 
 		 313 aa  142  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.927075 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2166  citrate lyase  33.02 
 
 		 338 aa  141  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1777  Citrate (pro-3S)-lyase  33.55 
 
 		 312 aa  140  3e-32  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0669  Citryl-CoA lyase  34.97 
 
 		 318 aa  139  4.999999999999999e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4487  citrate (pro-3S)-lyase  35.74 
 
 		 318 aa  138  2e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0353068  normal  0.0397424 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2830  Citryl-CoA lyase  34.13 
 
 		 304 aa  136  5e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4000  citrate (pro-3S)-lyase  34.16 
 
 		 327 aa  136  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.689771  normal  0.269494 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3986  Citryl-CoA lyase  34.16 
 
 		 336 aa  136  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4060  citrate (pro-3S)-lyase  34.16 
 
 		 327 aa  136  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.548708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0723  Citryl-CoA lyase  34.27 
 
 		 318 aa  136  7.000000000000001e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0655305 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5195  Citrate (pro-3S)-lyase  31.55 
 
 		 315 aa  135  9.999999999999999e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.152568  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3189  citrate (pro-3S)-lyase  30.42 
 
 		 301 aa  130  3e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0128752  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2209  Citryl-CoA lyase  33.23 
 
 		 318 aa  130  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.759332  normal  0.498106 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0341  citryl-CoA lyase  33.12 
 
 		 318 aa  129  5.0000000000000004e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.5619  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7769  Citrate (pro-3S)-lyase  31.78 
 
 		 321 aa  125  8.000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4636  Citrate (pro-3S)-lyase  28.98 
 
 		 319 aa  125  2e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.512718  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04680  Citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  30.03 
 
 		 294 aa  119  9.999999999999999e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1621  Citryl-CoA lyase  26.75 
 
 		 284 aa  116  3.9999999999999997e-25  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0805  Citrate (pro-3S)-lyase  29.52 
 
 		 319 aa  114  2.0000000000000002e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4300  Citrate (pro-3S)-lyase  34.67 
 
 		 301 aa  110  3e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.097194  normal  0.524838 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0340  Citrate (pro-3S)-lyase  29.43 
 
 		 292 aa  106  5e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0023  Citrate (pro-3S)-lyase  29.43 
 
 		 292 aa  106  6e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1370  Citrate (pro-3S)-lyase  30.41 
 
 		 293 aa  105  1e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3086  Citryl-CoA lyase  29.13 
 
 		 295 aa  104  3e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000118565  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2534  Citryl-CoA lyase  31.56 
 
 		 274 aa  101  2e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.426943  normal  0.459191 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0816  Citryl-CoA lyase  29.65 
 
 		 287 aa  101  2e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.653692 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2963  citrate lyase acyl carrier protein  32.75 
 
 		 406 aa  100  3e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.265448  normal  0.540248 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0970  putative citrate lyase beta chain  28.25 
 
 		 285 aa  100  5e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1085  Citryl-CoA lyase  28.39 
 
 		 306 aa  99.8  6e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4171  Citryl-CoA lyase  29.35 
 
 		 305 aa  99.8  7e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00188553  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4179  citrate lyase  29.35 
 
 		 302 aa  99.4  9e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.129518  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2630  citrate (pro-3S)-lyase  28.25 
 
 		 285 aa  98.6  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0400  citrate lyase  29.23 
 
 		 298 aa  96.3  6e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.726359  normal  0.0212977 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0082  citrate (pro-3S)-lyase  28.16 
 
 		 285 aa  96.3  8e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0969  Citrate (pro-3S)-lyase  27.1 
 
 		 282 aa  95.5  1e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3169  citrate lyase, beta subunit  29.32 
 
 		 306 aa  94.7  2e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.386507  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2804  citrate lyase  28.71 
 
 		 313 aa  94.4  3e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2118  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  28.03 
 
 		 280 aa  94  3e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.397559 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1285  citryl-CoA lyase  28.01 
 
 		 302 aa  93.6  4e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2156  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  28.37 
 
 		 280 aa  93.6  5e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.928394  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2266  HpcH/HpaI aldolase  28.37 
 
 		 280 aa  93.6  5e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0232  Citryl-CoA lyase  28.81 
 
 		 292 aa  92.8  8e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00480  citrate lyase beta subunit  26.81 
 
 		 286 aa  92  1e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.842445  normal  0.42007 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2705  citrate lyase  29.93 
 
 		 296 aa  92  1e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3898  Citrate (pro-3S)-lyase  29.55 
 
 		 290 aa  92.4  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.107361  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0268  Citryl-CoA lyase  27.01 
 
 		 292 aa  91.7  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.283754  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3362  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  28.67 
 
 		 280 aa  90.5  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0977965  normal  0.788969 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3369  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  28.67 
 
 		 280 aa  90.5  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.988595  normal  0.440795 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3464  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  28.67 
 
 		 280 aa  90.5  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.761974  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3944  Citrate (pro-3S)-lyase  29.11 
 
 		 306 aa  90.5  4e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000538772 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3859  HpcH/HpaI aldolase  29.11 
 
 		 306 aa  89.7  6e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1164  citrate lyase, beta subunit  29.06 
 
 		 296 aa  90.1  6e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.421072  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3295  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  28.32 
 
 		 280 aa  89.4  8e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.820787 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1012  HpcH/HpaI aldolase  29.02 
 
 		 291 aa  89  1e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1188  Citryl-CoA lyase  28 
 
 		 292 aa  88.6  2e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>