151 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_0576 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_0576  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 74 aa  149  1e-35  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000016932  normal  0.922143 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0638  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 74 aa  149  1e-35  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000543981  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06250  predicted transcriptional regulator  41.38 
 
 		 256 aa  54.3  0.0000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2451  transcriptional regulator, XRE family  36.23 
 
 		 139 aa  53.1  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.0000925763  n/a   
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4494  putative phage repressor  38.89 
 
 		 231 aa  50.8  0.000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4293  transcriptional regulator, XRE family  43.55 
 
 		 239 aa  50.8  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05170  hypothetical protein  48.94 
 
 		 436 aa  49.7  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.602534  normal  0.439559 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1710  transcriptional regulator, XRE family  50.98 
 
 		 420 aa  49.3  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.371639  normal  0.199479 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1231  transcriptional regulator, XRE family  37.5 
 
 		 268 aa  48.5  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0892392  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1655  transcriptional regulator, XRE family  40.35 
 
 		 81 aa  48.5  0.00003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2457  transcriptional regulator, XRE family  38.33 
 
 		 380 aa  48.5  0.00003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_13  putative peptidase, S24-like  42.86 
 
 		 205 aa  48.5  0.00003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.568691  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2391  transcriptional regulator, XRE family  38.89 
 
 		 247 aa  48.1  0.00004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.274459 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6481  putative transcriptional regulator, XRE family  38.89 
 
 		 291 aa  48.1  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.787196  normal  0.247273 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00980  predicted transcriptional regulator  44 
 
 		 459 aa  47.8  0.00005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.224409  normal  0.709118 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1978  XRE family transcriptional regulator  44.9 
 
 		 183 aa  47.8  0.00006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1666  transcriptional regulator, XRE family  39.29 
 
 		 205 aa  47.4  0.00007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.130033  hitchhiker  0.00224482 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3344  XRE family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 125 aa  47.4  0.00008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3770  transcriptional regulator, XRE family  39.34 
 
 		 81 aa  47  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0099  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 178 aa  46.6  0.0001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1538  XRE family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 374 aa  46.6  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0692  XRE family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 74 aa  45.8  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.782082  normal  0.118291 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3015  putative prophage repressor  42 
 
 		 227 aa  46.2  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0292  XRE family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 63 aa  45.4  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1391  hypothetical protein  34 
 
 		 342 aa  45.4  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3051  XRE family transcriptional regulator  41.3 
 
 		 242 aa  46.2  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0338218  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3344  DNA-binding protein  41.3 
 
 		 374 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.455978  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3113  transcriptional regulator  41.3 
 
 		 374 aa  45.1  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.694615  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3019  DNA-binding protein; transcriptional regulator  41.3 
 
 		 374 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.28018  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6072  putative transcriptional regulator Cro/CI family  36.62 
 
 		 233 aa  45.1  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.406393 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0730  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 85 aa  45.4  0.0003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000239544  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1517  XRE family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 73 aa  45.1  0.0003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.449113  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18420  predicted transcriptional regulator  51.02 
 
 		 149 aa  45.1  0.0003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.189768  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3349  DNA-binding protein  41.3 
 
 		 374 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.166445  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3127  DNA-binding protein  41.3 
 
 		 374 aa  44.7  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.81107  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3373  DNA-binding protein  41.3 
 
 		 374 aa  44.7  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.645168  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5549  XRE family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 232 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.361846  hitchhiker  0.00439273 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3347  DNA-binding protein  41.3 
 
 		 374 aa  45.1  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0552  transcriptional regulator, XRE family  37.04 
 
 		 71 aa  45.1  0.0004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.162215  hitchhiker  0.0000852105 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3326  DNA-binding protein  39.13 
 
 		 374 aa  44.7  0.0005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1621  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 		 368 aa  44.3  0.0005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1719  XRE family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 65 aa  44.3  0.0006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25650  predicted transcriptional regulator  40.82 
 
 		 194 aa  43.9  0.0007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0878  transcriptional regulator, XRE family  39.58 
 
 		 97 aa  43.9  0.0007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0055  XRE family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 199 aa  43.9  0.0007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.672462 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4414  transcriptional regulator, XRE family  39.58 
 
 		 99 aa  43.9  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.514306 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0029  Cro/CI family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 67 aa  43.5  0.0009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.735967  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3288  transcriptional regulator, XRE family  36.84 
 
 		 135 aa  43.5  0.0009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2037  Cro/CI family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 358 aa  43.1  0.001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.64032  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0798  transcriptional regulator, XRE family  38.6 
 
 		 73 aa  43.5  0.001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0286273  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14260  Helix-turn-helix protein  33.33 
 
 		 291 aa  43.1  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0575  XRE family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 115 aa  43.1  0.001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000142648  normal  0.969931 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0637  XRE family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 115 aa  43.1  0.001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000152617  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2005  transcriptional regulator, XRE family  37.1 
 
 		 388 aa  43.5  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.445906  normal  0.114252 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2219  helix-turn-helix domain-containing protein  37.5 
 
 		 146 aa  43.5  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2984  helix-turn-helix domain protein  33.33 
 
 		 348 aa  42.7  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0858456  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1149  XRE family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 69 aa  43.1  0.001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1673  ABC transporter related  43.14 
 
 		 293 aa  43.1  0.001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000539653  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0398  XRE family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 244 aa  43.1  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0408  transcriptional regulator, XRE family  38.33 
 
 		 63 aa  43.1  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02617  hypothetical protein  48.21 
 
 		 315 aa  43.5  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0514  DNA-binding protein  42.55 
 
 		 328 aa  43.1  0.001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00329657 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3947  transcriptional regulator, XRE family  43.55 
 
 		 85 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4446  putative phage repressor  44 
 
 		 209 aa  43.5  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1881  DNA-binding protein  31.37 
 
 		 142 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0815  Cro/CI family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 71 aa  42.4  0.002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1982  Cro/CI family transcriptional regulator  41.3 
 
 		 359 aa  42.4  0.002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0234  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 108 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00111986  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1621  transcriptional regulator  30.77 
 
 		 146 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0060  DNA-binding protein  36.67 
 
 		 65 aa  42.4  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4734  XRE family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 82 aa  42.4  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.138063  normal  0.154831 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0762  XRE family transcriptional regulator  42 
 
 		 132 aa  42.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2731  XRE family transcriptional regulator  48.78 
 
 		 166 aa  42.7  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3268  transciptional regulator  42 
 
 		 229 aa  42.4  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000953974  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4900  hypothetical protein  37.7 
 
 		 105 aa  42.4  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.978216  normal  0.040659 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2878  transcriptional regulator, XRE family  29.73 
 
 		 322 aa  42.7  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00252317  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0918  XRE family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 229 aa  42.4  0.002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0000791351  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2421  helix-turn-helix domain-containing protein  42 
 
 		 132 aa  42.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.195917  normal  0.223738 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2593  transcriptional regulator  35.19 
 
 		 116 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0413  helix-turn-helix domain-containing protein  42 
 
 		 132 aa  42.4  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_67  hypothetical protein  39.66 
 
 		 72 aa  42.4  0.002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0397  XRE family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 67 aa  42.4  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000557711  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0407  helix-turn-helix domain-containing protein  37.7 
 
 		 67 aa  42.4  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000097753  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0658  XRE family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 95 aa  42.4  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3371  putative phage repressor  34.33 
 
 		 229 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000119805  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0970  Cro/CI family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 95 aa  42.4  0.002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0726306  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00900  predicted transcriptional regulator  44.68 
 
 		 369 aa  42.7  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.506264 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3495  putative phage repressor  34.33 
 
 		 229 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000058003  unclonable  0.00000889639 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6264  XRE family transcriptional regulator  55.88 
 
 		 188 aa  42.4  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.0000184029  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0777  XRE family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 83 aa  42.4  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000109093  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1286  transcriptional regulator, XRE family  41.3 
 
 		 197 aa  42.4  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0709374  normal  1 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0188  DNA-binding protein  33.33 
 
 		 108 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000978101  hitchhiker  1.67724e-41 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25890  predicted transcriptional regulator  37.5 
 
 		 272 aa  42.7  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2256  Cro/CI family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 104 aa  41.6  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.033693 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1120  DNA-binding protein  40 
 
 		 69 aa  42  0.003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3627  transcriptional regulator, XRE family  42.22 
 
 		 87 aa  41.6  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0189  XRE family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 65 aa  42  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3482  XRE family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 104 aa  41.6  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.411907  normal  0.584278 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0575  XRE family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 72 aa  42  0.003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0097  XRE family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 163 aa  41.6  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000770328  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>